Vaihtoehtoisen silmukoinnin epigeneettinen säätely

Kampelatutkija yritti epätoivoisesti eilen väittää, että DNA sanelee eliöiden ruumiinkaavan, eli ns. body plan:in. Hän käytti esimerkissään Hedelmäkärpästen Pax6 -geeniä, jota hän ilmeisesti edelleen pitää silmägeeninä, eli silmän rakenteen sanelevana geeninä. Oikaisin hänen räpellyksensä kertomalla, että todellisuudessa Pax6 on proteiini, joka toimii ns. transkriptiotekijänä sitoutuen epigeneettisiin informaatiomarkkereihin, eli metylaatioprofiileihin. Solu ei tuota ainuttakaan proteiinia ilman epigeneettistä ohjausta, ei myöskään Pax6-transkriptiotekijää.

Pax6-proteiini on myös vaihtoehtoisen silmukoinnin tuote, eli sitä ei koodata suoraan periaatteella DNA --> RNA --> Proteiini vaan DNA:sta transkriptoitua pre-mRNA:ta modifioidaan epigeneettisillä ohjausrakenteilla siten, että solu kykenee tuottamaan vaadittua proteiinia. On siis pseudotieteelistä väittää, että DNA sanelisi body plan:in. Ottakoon Kampelatutkija nyt opiksi virheistään.

Seuraavaksi hieman tarkempaa tietoa vaihtoehtoisesta silmukoinnista. Korjataan samalla toinenkin Kampelatutkijan virheellinen väite. Hän nimittäin väitti, että 40-60% ihmisen proteiineja koodaavista geeneistä kävisi läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin. Todellisuudessä luku on reilusti yli 90%, nykytietämyksen mukaan peräti 95%. Oikea ilmaisu mekanismille on kuitenkin se, että n. 95% proteiinien koodaamiseen luettavasta DNA:sta käy läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin pre-mRNA-tasolla.

No nyt varsinaiseen asiaan. On aika tutkia, mitkä tekijät ohjaavat ja säätelevät vaihtoehtoista silmukointia. Käyttäkäämme apunamme tieteellistä tutkimusta vuodelta 2018:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6325479/

Tutkimuksessa todetaan seuraavasti liittyen vaihtoehtoista silmukointia ohjaaviin mekanismeihin ja tekijöihin:

"Alternative splicing (AS) serves as an additional regulatory process for gene expression after transcription, and it generates distinct mRNA species, and even noncoding RNAs (ncRNAs), from one primary transcript. Generally, AS can be coupled with transcription and subjected to epigenetic regulation, such as DNA methylation and histone modifications. In addition, ncRNAs, especially long noncoding RNAs (lncRNAs), can be generated from AS and function as splicing factors (“interactors” or “hijackers”) in AS. Recently, RNA modifications, such as the RNA N6-methyladenosine (m6A) modification, have been found to regulate AS. In this review, we summarize recent achievements related to the epigenetic regulation of AS."

Nykytutkimuksen mukaan vaihtoehtoista silmukointia ohjaavat ja säätelevät puhtaasti epigeneettiset tekijät ja mekanismit, eli DNA:n metylaatioprofiilit (vahvistajat, hiljentäjät ja promoottorit), histonien epigeneettiset MARKKERIT sekä koodaamattomat RNA-molekyylit, joita tuotetaan mm. vaihtoehtoisen silmukoinnin sivutuotteena.

Epigeneettisiin informaatioprofiileihin vaikuttavat puolestaan ravinto, ilmasto, stressitekijät, ympäristömyrkyt, aistiärsykkeet jne. Eliöissä tapahtuvat muutokset eivät siis perustu satunnaisiin mutaatioihin ja kuviteltuun valintaan vaan suunniteltuihin mekanismeihin, jotta muuttuviin ympäristöolosuhteisiin olisi eliöiden mahdollista adaptoitua nopeasti ja tehokkaasti. Epigeneettiset modifikaatiot ovat myös palautuvia, mikäli eliössä ei ole tapahtunut kovin paljon informaatiohäviötä. Muutos ei ole evoluutiota vaan vaihtoehtoisten biologisten ohjelmien päälle/pois -kytkentää.

20

65

    Vastaukset

    Anonyymi (Kirjaudu / Rekisteröidy)
    5000
    • Anonyymi

      Luonnonvalinnan kohteena ovat suoranaisesti eliöiden ilmiasut, ja vain välillisesti eliöiden ilmiasun aiheuttavat perinnölliset mekanismit.

    • Anonyymi

      Ja luominen tuli taas todistetuksi ties monettako kertaa? Montako kertaa se pitää todistaa että se on viimeinkin totta?

      • Anonyymi

        Alan tulla siihen johtopäätökseen että luomisesta ei ole mitään todisteita, ja siksi kretut pelkäävät puhua siitä.

        Yrittävät hämätä epätoivoisesti kaikkia puhumalla evoluutiosta, mutta siinäkin näyttävät epäonnistuvan kun ei näytä olevan tarpeeksi tietoa :(


      • Anonyymi

        Rotilla on aivan väärä paikka "todistelulle", Ei muuta kuin Maailman johtaville Yliopistoille Luennoimaan, niin napsahtaa Nobelpalkinto!!! Sitten juhlimme Rotia oikein porukalla Noobelista!!


    • Lähtökohtaisesti olettaisin että rotti ei taaskaan tiedä yhtään mitään asiasta vaan plaginoi saarnansa joltakin amerikan ihmemaan saarnamieheltä...

    • Anonyymi

      Kampelatutkija joutuu koko aika korjaamaan sinun virheitä ja et silti opi, sinulla on paha oppimisvaikeus

    • Anonyymi

      "Solu ei tuota ainuttakaan proteiinia ilman epigeneettistä ohjausta, ei myöskään Pax6-transkriptiotekijää. "
      Ei myöskään ilman DNAta.

      Luonnonvalinta on havaittavissa jo siinä, että monissa eliölajeissa jopa 50 % jälkeläisistä menehtyy ennen kuin ne ovat sukukypsiä.

    • "vaan DNA:sta transkriptoitua pre-mRNA:ta modifioidaan epigeneettisillä ohjausrakenteilla siten, että solu kykenee tuottamaan vaadittua proteiinia."

      Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan. Tätä olen yrittänyt opettaa sinulle jo kohta vuoden verran. Tässä on kyse juuri niistä signaalimolekyyleistä, joista sinulla ei ole mitään havaintoa.

      "The control of alternative RNA splicing is performed by a complex network of signaling molecules that respond to a wide range of intracellular and extracellular signals. "

      • Anonyymi

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        "Milloin opit?"

        Milloin sinä opit ettei tämäkään todista luomista mitenkään?


      • Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Silmukoinnin ohjaus, silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia. Koodiin vaikuttaa myös epigenetiikka koska kyseessä on kahden tai useamman geeninsäätelyketju. Suomeksi sanottuna geeni tuottaa signaalimolekyylejä, joilla säädellään toisten geenien ilmentymistä.

        Olet täysin väärässä DNA:n merkityksestä. Silmukoinnin koodi on periytyvää. Epigenetiikasta olet osittain oikeassa, mutta ympäristön vaikutuksella on merkitystä oikeastaan vain poikkeamissa. Ihmisestä tulee ihminen DNA:n ohjaamana, ei siksi että äiti syö tai ei syö maustekurkumaa jne.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Epigeenisyys on siis mielestäsi täysin riippuvaista ravinnon sisältämistä metyyliryhmistä.

        Mitä tapahtuisi epigeenisyydelle tilanteessa, jossa ravinto ei sisältäisi yhtään metyyliryhmiä, verrattuna tilanteeseen, jossa ravinto sisältäisi maksimaalisen määrän metyyliryhmiä (miten paljon se nyt sitten mahtaa ollakaan)?


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        //Ja ne epigeneettiset ohjausrakenteet perustuvat DNA:aan.//

        Ja taas meni väärin. DNA ei tuota metyyliryhmiä eikä histonien epigeneettisiä markkereita. Ne saadaan ravinnosta. Niiden paikalleenviemisestä huolehtivat tietyt entsyymit, jotka ovat proteiineja ja joita ei tuoteta ilman epigeneettistä ohjausta.

        Milloin opit?

        Milloin sinä opit ettei epigeneettisillä markkereilla tee mitään ilman cis-säätelyalueita jotka ovat DNA sekvenssejä?

        https://en.wikipedia.org/wiki/Cis-regulatory_element


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        Milloin sinä opit ettei epigeneettisillä markkereilla tee mitään ilman cis-säätelyalueita jotka ovat DNA sekvenssejä?

        https://en.wikipedia.org/wiki/Cis-regulatory_element

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation


      • Anonyymi
        Kampelatutkija kirjoitti:

        Silmukoinnin ohjaus, silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia. Koodiin vaikuttaa myös epigenetiikka koska kyseessä on kahden tai useamman geeninsäätelyketju. Suomeksi sanottuna geeni tuottaa signaalimolekyylejä, joilla säädellään toisten geenien ilmentymistä.

        Olet täysin väärässä DNA:n merkityksestä. Silmukoinnin koodi on periytyvää. Epigenetiikasta olet osittain oikeassa, mutta ympäristön vaikutuksella on merkitystä oikeastaan vain poikkeamissa. Ihmisestä tulee ihminen DNA:n ohjaamana, ei siksi että äiti syö tai ei syö maustekurkumaa jne.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/

        //silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia.//

        Ja taas väärin. Silmukointikoodiin vaikuttavat monet epigeneettiset informaatiorakenteet, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset markkerit ja koodaamattomien RNA-molekyylien välittämä epigeneettinen informaatio.

        Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä.


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        Epigeenisyys on siis mielestäsi täysin riippuvaista ravinnon sisältämistä metyyliryhmistä.

        Mitä tapahtuisi epigeenisyydelle tilanteessa, jossa ravinto ei sisältäisi yhtään metyyliryhmiä, verrattuna tilanteeseen, jossa ravinto sisältäisi maksimaalisen määrän metyyliryhmiä (miten paljon se nyt sitten mahtaa ollakaan)?

        Saamme raaka-aineet epigeneettisiä merkintöjä varten ravinnosta, mutta niiden paikalleenasettumiseen vaikuttavat useat ympäristötekijät. Tämä mahdollistaa nopean ja tehokkaan adaptoitumisen muuttuvassa ympäristössä.


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation

        Hakusanat:

        Why do people laugh at creationists


      • Anonyymi kirjoitti:

        //silmukointikoodi on DNA:ssa olevaa perinnöllistä koodia.//

        Ja taas väärin. Silmukointikoodiin vaikuttavat monet epigeneettiset informaatiorakenteet, kuten DNA:n metylaatioprofiilit, histonien epigeneettiset markkerit ja koodaamattomien RNA-molekyylien välittämä epigeneettinen informaatio.

        Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä.

        "Heittelet omia juttujasi randomisti päästä ja kuvittelet, ettei kukaan tarkista niitä."

        No enpä heittele. Kommentti perustui lainaukseen tästästä tutkimuksesta. Avainsanat "splicing genetic code, genetic elements, epigenetic properties. Ilman DNA:ta ei olisi olemassa myöskään epigeneettisiä ominaisuuksia.

        ” Therefore, our goals are to decipher the extended splicing (epi)genetic code compiling not only the genetic elements but also the epigenetic properties, to understand how they interplay with each another in regulating AS and contributing to various biological processes, such as development and disease progress.”

        https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5716079/


      • Anonyymi
        Anonyymi kirjoitti:

        No juurihan kerroin näistä. Tärkeimmät ovat vahvistajat (enhancers), promoottorit (promoters) ja vaimentajat (silencers). Nämä ovat METYLOITUNEITA DNA:n alueita, eli epigeneettiset informaatioprofiilit tarvitaan DNA:n päälle, ennen kuin en säätelevät yhtään mitään.

        Milloin opit?

        Hakusanat:

        enhancer methylation
        promoter methylation
        silencer methylation

        "Milloin opit?"

        Milloin ite? Ei ne ole mitään metyloituneita alueita vaan tietyt sekvenssit omaavia DNA jaksoja joiden osia metyloidaan ja demetyloidaan.


    • Anonyymi

      Kukahan täällä on se epätoivoinen väittäjä? Olet todistanut luomisen jo monta kertaa, miksi edelleen jauhat asiaa?

    Ketjusta on poistettu 0 sääntöjenvastaista viestiä.

    Luetuimmat keskustelut

    1. Tykkään sinusta ikuisesti

      Olet niin mukava ja ihana ihminen rakas. ❤️
      Ikävä
      17
      5006
    2. Kirjoita yhdellä sanalla

      Joku meihin liittyvä asia, mitä muut ei tiedä. Sen jälkeen laitan sulle wappiviestin
      Ikävä
      218
      2686
    3. Minä häviän tämän taistelun

      Ikä tekee tehtävänsä. En enää miellytä silmääsi.
      Ikävä
      30
      1820
    4. Onko muita oman polkunsa kulkijoita

      Jotka ei oikein pärjää kenenkään kanssa eli on niin omat ajatukset ja omat mielenkiinnon kohteet yms. On tavallaan sella
      Iisalmi
      34
      1775
    5. Olet hyvin erilainen

      Herkempi, ajattelevaisempi. Toisaalta taas hyvin varma siitä mitä haluat. Et anna yhtään periksi. Osaat myös ilkeillä ja
      Ikävä
      73
      1707
    6. Minua nainen harmittaa, että en pääse sun rahoihin käsiksi

      En pysty myöskään pilaamaan elämääsi niin kauan kun sulla on fuck off pääomaa. Harmittaa myös etten tiedä kuinka paljon
      Ikävä
      30
      1608
    7. Hyvää Joulua mies!

      Toivottavasti kaikki on hyvin siellä. Anteeksi että olen hieman lisännyt taakkaasi ymmärtämättä kunnolla tilannettasi, o
      Ikävä
      64
      1237
    8. Mikä älykkäissä naisissa pelottaa?

      Miksei heitä uskalla lähestyä?
      Ikävä
      153
      1187
    9. Sydän karrella

      Jos yritän olla niin rehellinen kuin pystyn paljastamatta mitään tärkeää. Ensiksi mä huomasin sun tuijottavan mua. Ihme
      Ihastuminen
      8
      1164
    10. Toivoisin etten jännittäisi

      niin kauheasti. Hassua tässä on se, että en varmaan olisi niin ihastunut sinuun, jos et olisi niin älykäs, ja henkisesti
      Ikävä
      43
      974
    Aihe