Human Proteome Folding - Phase 2

Käännös (englanti > suomi)Näytä latinisaatio
Projekti, joka alkoi Institute for Systems Biology, ja nyt jatkuu New Yorkin yliopiston Biologian laitos ja tietojenkäsittelytieteen laitos, tulee tarkentaa käyttämällä Rosetta ohjelmiston tila, jonka osuus suurempi Atomic yksityiskohdat, rakenteet johtuvat ensimmäisen vaiheen hankkeen. Tavoitteena on ensimmäisessä vaiheessa oli ymmärtää proteiinien toimintaa. Tavoitteena on toinen vaihe on lisätä päätöslauselman ennusteita valita osajoukko ihmisen proteiinista. Parempi tarkkuus on tärkeää, että hakemusten määrä, mukaan lukien mutta ei rajoittuen virtuaalisia seulonta huumeiden tavoitteiden telakka menettelyjen ja proteiinien suunnittelu. Suorittamalla muutama hyvin tutkittu proteiinien on World Community Grid (kuten proteiineja hiiva), toinen vaihe on myös auttaa parantamaan tietämystä fysiikan proteiinien rakenteeseen ja edistää state-of-the-art in proteiinien rakenteen ennustamiseen . Tämä myös auttaa Rosetta GNU kehittää ohjelmistoja ja luotettavuutta sen ennusteita.

HPF2 keskitytään ihmisen erittyvän proteiinin (proteiinien veressä ja välien solut). Nämä proteiinit voivat olla tärkeitä signaling solujen välillä ja ovat usein keskeisiä merkkejä diagnoosin. Nämä proteiinit ovat myös päätyneet ne ovat hyödyllisiä huumeiden (kun syntetisoitu ja antanut lääkäri ihmisille, joilla ei ole proteiineja). Esimerkkejä ihmisen erittyy proteiineja muuttui hoito ovat insuliini ja ihmisen kasvuhormonia. Ymmärtäminen tehtävä ihmisen erittyvät proteiinit voivat auttaa tutkijoita löytämään proteiinien toiminta tuntemattomien toimivat veren ja muiden interstitiaalinen nesteitä.

Hankkeessa keskitytään keskeisten erittyy taudinaiheuttajien proteiineja. Vaikka vielä hyvin varhaisessa suunnittelun eri vaiheissa, HPF2 todennäköisesti keskitytään Plasmodium, taudinaiheuttajia, joka aiheuttaa malariaa. Tutkijat toivovat, että resoluutio rakenne ennusteita proteiineja, malaria erittää toimii bioinformatiikan infrastruktuuri, tutkijoille, jotka työskentelevät ahkerasti ympäri maailmaa ymmärtämään monimutkaista vuorovaikutusta ihmisten koneet ja malarialoisen. Vaikka on olemassa joitakin Silver Bullets, ja biologia on yksi monimutkaisia aiheita maan päällä, tutkijat uskovat, että tämä työ auttaa sitä ymmärtämään osia host-taudinaiheuttajan vuorovaikutus tai ainakin sen osista. Tutkijat myöntävät päätelmät resurssina tiedeyhteisölle ja sitten työtä yhteisön kanssa visualisoinnin avulla ja jalostuksessa tiedot. Tämän ymmärtäminen voisi olla perusta toimia.

http://fi.wikipedia.org/wiki/Human_Proteome_Folding_Project

Pääasia on selvittää tarkemmin ihmisen ja patogeeniproteiinien rakennekaavioita ja toiseksi kehittää Rosetta-ohjelmiston kykyä ennustaa rakenteita yhä tarkemmin.