Vapaa kuvaus

Aloituksia

273

Kommenttia

2386

  1. Ajattelin aluksi tehdä uuden avauksen, mutta koska uusikin avaus olisi koskenut koppisiemenisten evoluutiota, niin päätin kirjoittaa tähän vanhaan ketjuun.

    Tutkijat ovat sekvensoineet Amborella pensaskasvin genomin, ja se paljastaa mielenkiintoisia lisätietoja varsinaisten kukkakasvien evoluutiohistoriasta. Amborellan on jo aikaisempien geneettisten tutkimusten perusteella tiedetty kuuluvan haaraan, joka on hyvin lähellä kaikkien koppisiemenisten viimeistä yhteistä kantamuotoa.

    "The sole survivor of the oldest line of flowering plants, Amborella is the last witness of the great biological success these plants have had over millions of years. The sequencing of its genome, which was just published in the journal Science, can help better understand the evolution of these plants, which has led to an incredible diversity of more than 300,000 species identified today."

    Kansainvälinen tutkijaryhmä havaitsi, että Amborellan gemoni on läpikäynyt kahdentumisen noin 200 miljoonaa vuotta sitten, ja muun muassa tätä tietoa hyödyntäen he kykenevät rakentamaan fylogenian kaikille kukkakasveille.

    "The sequencing of its genome helped the researchers reconstruct that of the common ancestor of all flowering plants, showing that the latter saw its genome double approximately 200 million years ago. In other words, its DNA was "duplicated," which is to say completely copied, until it numbered 14,000 encoding genes. This molecular mechanism, called "duplication," is one of the engines of evolution. Among these 14,000 encoding genes, many evolved over geological time, to provide flowering plants with new functions, such as the ability of seeds to store nutrient reserves. This work shows that the doubling of the genome of their common ancestor then helped flowering plants to achieve the incredible diversity of the more than 300,000 species observed today."

    Toinen tutkimus Amborellasta paljasti mielenkiintoisen tiedon. Amborellalta löydettiin koko mitokondriaalisen genomin horisontaalinen siirto, jota aikaisemmin on havaittu vain yksittäisten geenien osalta. Tämä herättää uusia kysymyksiä, koska mekanismia ei vielä oikein tunneta, mutta tutkijat pitävät uusista haasteista ja asioiden selvittämisestä.

    "Another major discovery, also published in Science: the IRD researchers contributed to finding in Amborella a highly original transfer mechanism from other plant species with so-called "mitochondrial" genomes. Mitochondrial DNA or "mtDNA," is distinct from the DNA contained in the cell nucleus. This special DNA helps trace the maternal line in the phylogenetic trees of species. Therefore, population geneticists often study it. The researchers sequenced that of Amborella, showing that it integrated the DNA of six other species, including other flowering plants that appeared after the New Caledonian shrub. Such "horizontal" transfers, also called species-to-species without passing through sexual reproduction, had already been found for isolated single genes. But this was the first time that researchers observed this mechanism on the scale of entire mitochondrial genomes! In this same study, the researchers proposed a model to explain this singular phenomenon, which is still not well understood."

    http://www.sciencedaily.com/releases/2014/04/140404085645.htm

    Kreationisteille vielä varoitus rusinat pullasta logiikan käytöstä. Kreationistien geenitutkijat, kuten esimerkiksi Robert Carter, on perustellut ihmisten polveutumisen Eevasta nimenomaan mtDNA:n perusteella (tosin virheellisesti). Jos siis uskotte mtDNA:n todistavan ihmisten polveutumisen yhdestä kantamuodosta (Eeva), niin samalla logiikalla teidän pitäisi hyväksyä koppisiemenisten kukkakasvien polveutuminen jostain Amborellan kaltaisesta (tai siitä). Tämä vain tarkoittaa yksinkertaisesti sitä, että makroevoluutiota tapahtuu. Ettehän te sentään väitä, että kaikki nykyiset kukkakasvit ovat samaa lajia? Vai väittättekö te, että Nooalla oli arkissa yksi kukkaruukku, jossa kasvoi kaunis kukka ja kaikki kukkivat kasvit ovat rappeutuneet siitä?
  2. Lässyn lässyn...
  3. "Erityisen kiinnostavia ne eivät ole kyllä silloinkaan, koska ne eivät lainkaan selitä lajien alkuperää. Sen selittää luomisoppi."

    Evoluutioteoria selitää onnistuneesti kaiken nykyisen elämän olevan peräisin yhteisestä kantamuodosta. Tuosta viimeisestä yhteisestä kantamuodosta käytetään nimitystä LUCA tai LUA, mutta pitää muistaa ettei sen oleteta olleen ainoa elämänmuoto siihen aikaan, mutta kaikki nykyinen elämä on peräisin siitä. Tämä on jo periaatteessa tieteellinen fakta, vaikka kreationistit kovasti yrittävätkin väittää vastaan.

    http://en.wikipedia.org/wiki/Last_universal_ancestor

    http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0069924

    "Eri lajien välillä? Luulevatko evotutkijat, että virukset rikkovat lajirajoja ja synnyttävät sekasikiöitä ja lopulta kenties ihmisen? Onko tämä uusi selitys välimuotojen puuttumiselle?"

    Et taas ymmärrä yhtään mitään. Yleisellä tasolla voidaan sanoa, että eri lajien välisiä sukulaissuhteita voidaan tarkastella virusten jättämistä geneettisen materiaalin jäämistä. Tässä tutkimuksessa havaittiin, että kantasolujen pluripotentisuus, eli solun kyky erilaistua miksi tahansa kudokseksi lukuun ottamatta ekstraembryonaalista kudosta, on hyvin todennäköisesti peräisin muinaisesta virustartunnasta, eli tässä tapauksessa tietty DNA-HERV-H on siitä vastuussa.

    Sitä ei vielä tiedetä, että mikä on johtanut tällaiseen adaptaatioon tai onko mutaatioden seurauksena alkuperäinen funktio esimerkiksi hävinnyt evoluutiossa, mutta näyttää siltä, että nykyisin ihmisen kehittyminen ja ylipäätään elämä olisi mahdotonta ilman tuota muinaista virustartuntaa. Siinäpä selittämistä älykkäälle suunnittelulle.
  4. "Solon1 osannee aiheeseen paremmin perehtyneenä ja tulevana evoluutio-tutkijana antaa kattavamman ja yksityiskohtaisemman analyysin tästä uudesta tutkimustuloksesta :)"

    En minä oikein tästä uudesta tutkimuksesta vielä osaa muuta sanoa kuin että se on selvä jatkumo aikaisemmille tutkimuksille ja erittäin mielenkiintoinen:) Kuten jo itsekin totesit, niin lääketieteen kannalta lisääntyvällä ymmärryksellämme on hyvin merkittäviä mahdollisuuksia. Tämäkin tutkimus on ENCODE-projektin jatkumoa, joka edelleen paljastaa proteiinia koodaamattomasta genomin osasta yhä tarkempia yksityiskohtia.

    Transposoituvilla elementeillä, tarkemmin sanottuna "hyppivillä geeneillä" eli transposoneilla on löydetty merkittäviä säätelytehtäviä, joista kreationistit ovat olleet innoissaan, vaikkakin täysin turhaa. Viimeaikaiset tutkimukset ovat kohdistuneet varsinkin lincRNA:han (long intergenic noncoding RNA). Endogeeniset retrovirukset ovat yksi "hyppivien geenien" luokka ja niillä on havaittu vaikutuksia lincRNA:ssa. ERV toimii yleisesti lincRNA:ssa aloitus jaksona.

    Avauksessa mainittu HERVH on yhdenlainen ERV "perhe", joka todella näyttäisi olevan vastuussa siitä osaa lincRNA:ta, joka säätelee kanstasolujen kehitystä nisäkkäillä. ERV:t, jotka ovat havaitusti muinaisia virustartuntoja, näyttäisivät todellakin toimivan "moottoreina" RNA:n koodaamien geenien evoluutiolle.

    Mahdollisten väärinkäsityksien takia tarkennan, että ERV:n oma genomi koostuu RNA:sta, jonka se kopioi isäntäsolun DNA:han käänteiskopioijaentsyymin avulla.

    SINE ja LINE -jaksot, ERV:t, sytokromi-C ja monet muutkin geenimarkkerit todistavat täysin vastaansanomattomasti evoluutiosta, vaikka jyrtsi tuleekin kohta tähän jotain valehtelemaan.
  5. Kappas, kolme vuotta vanha avaus näkee taas päivänvalon. Korjataan avauksessa ollut typo, eli mitkä korvataan jotka relatiivipronominilla. Multinikin puuhat näyttävät edelleen samalta, ei muuta kommentoitavaa.