Faktaa pistemutaatioista ja epigenetiikasta

Tietääköhän piippelitruutti mitä ovat geenialleelit?

No ei. Sinun solujesi dna on samanlainen kaikissa kudoksissasi. Mutta tietysti jokaisella ihmisellä on perimässään tullut yhdistelmä äitinsä ja isänsä geenejä.

Vaikka toki jokaisen ihmisen DNA on hyvin samankaltainen. Epigeeniset markkerit genomin tulkinnassa kuitenkin nykytekniikalla jo erotetaan.

Mutta mistä nämä eri himisten erilaiset geenialleelit ovat tulleet, kun premissisi on että kaikki ihmiset ovat periytyneet yhdestä ihmisestä ja hänen kloonistaan, ja yleisesti ottaen mutaatiot johtavat solun kuolemaan?

Nimi_Ja_Merkki kirjoitti:

Mutta mistä nämä eri himisten erilaiset geenialleelit ovat tulleet, kun premissisi on että kaikki ihmiset ovat periytyneet yhdestä ihmisestä ja hänen kloonistaan, ja yleisesti ottaen mutaatiot johtavat solun kuolemaan?

Lue lisää

En ole kloonista puhunut mitään.

Lajityypin geenialleelien erot johtunevat vakiintuneista epigeneettisistä muutoksista. Paramutaatiot lienevät näiden nimi. Tätä tutkitaan paraikaa ympäri maailman ja on tieteelle sen verran uusi asia, että toistaiseksi täytyy vaan todeta, ettemme tiedä. Mutta seurataan ja tutkitaan.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

En ole kloonista puhunut mitään.

Lajityypin geenialleelien erot johtunevat vakiintuneista epigeneettisistä muutoksista. Paramutaatiot lienevät näiden nimi. Tätä tutkitaan paraikaa ympäri maailman ja on tieteelle sen verran uusi asia, että toistaiseksi täytyy vaan todeta, ettemme tiedä. Mutta seurataan ja tutkitaan.

Lue lisää

Sivistin äsken itseäni tiedolla, että Sanger-sekvensointi on yleisimmin käytetty DNA-sekvensointimenetelmä.

https://en.wikipedia.org/wiki/Sanger_sequencing

Selitäpä meille, miksi tämä menetelmä antaa mielestäsi vääriä tuloksia sekvenssistä.

<>

Koita nyt viimein tajuta termit joita viljelet.

Wikipedia määrittelee mutaation ytimekkäästi: "Mutaatio on satunnainen muutos organismin perimäaineksen DNA:n tai joskus RNA:n nukleotidijärjestyksessä"

Sen sijaan epigenetiikka määritellään: "Epigeneettinen periytyminen tarkoittaa perinnöllisen tiedon siirtoa solun tai eliön jälkeläiselle ilman, että perinnöllinen tieto on koodattuna DNA:n tai RNA:n sekvenssiin." (Wikipedia)

Pistemutaatiot ovat siis mutaatioita ja mutaatiot eivät ole epigenetiikkaa. Kuinka vaikeaa peruskäsitteiden ymmärtäminen voi olla?

Epäjumalienkieltäjä kirjoitti:

<>

Koita nyt viimein tajuta termit joita viljelet.

Wikipedia määrittelee mutaation ytimekkäästi: "Mutaatio on satunnainen muutos organismin perimäaineksen DNA:n tai joskus RNA:n nukleotidijärjestyksessä"

Sen sijaan epigenetiikka määritellään: "Epigeneettinen periytyminen tarkoittaa perinnöllisen tiedon siirtoa solun tai eliön jälkeläiselle ilman, että perinnöllinen tieto on koodattuna DNA:n tai RNA:n sekvenssiin." (Wikipedia)

Pistemutaatiot ovat siis mutaatioita ja mutaatiot eivät ole epigenetiikkaa. Kuinka vaikeaa peruskäsitteiden ymmärtäminen voi olla?

Lue lisää

The modified base 5-methylcytosine (5mC) is well-known epigenetic mark that can regulate transcription of the genome. Since 2009 three further modified bases have been detected in the mammalian genome. These are the TET-enzyme generated bases; 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5fC) and 5-carboxylcytosine (5caC).

Spontaneous deamination of 5-methylcytosine results in thymine and ammonia. This is the most common single nucleotide mutation. In DNA, this reaction can be corrected by the enzyme thymine-DNA glycosylase prior to passage of the replication fork, which would fix the cytosine to thymine point mutation in one of the two daughter strands.

Sytosiinistä tymiiniksi pistemutaatio. DNA-metylaation aikaansaama. Puhdasta epigenetiikkaa.

Se on argumentti, joka ratkaisee.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

En ole kloonista puhunut mitään.

Lajityypin geenialleelien erot johtunevat vakiintuneista epigeneettisistä muutoksista. Paramutaatiot lienevät näiden nimi. Tätä tutkitaan paraikaa ympäri maailman ja on tieteelle sen verran uusi asia, että toistaiseksi täytyy vaan todeta, ettemme tiedä. Mutta seurataan ja tutkitaan.

Lue lisää

>>En ole kloonista puhunut mitään.<<
Raamattusi puhuu.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

The modified base 5-methylcytosine (5mC) is well-known epigenetic mark that can regulate transcription of the genome. Since 2009 three further modified bases have been detected in the mammalian genome. These are the TET-enzyme generated bases; 5-hydroxymethylcytosine (5hmC), 5-formylcytosine (5fC) and 5-carboxylcytosine (5caC).

Spontaneous deamination of 5-methylcytosine results in thymine and ammonia. This is the most common single nucleotide mutation. In DNA, this reaction can be corrected by the enzyme thymine-DNA glycosylase prior to passage of the replication fork, which would fix the cytosine to thymine point mutation in one of the two daughter strands.

Sytosiinistä tymiiniksi pistemutaatio. DNA-metylaation aikaansaama. Puhdasta epigenetiikkaa.

Se on argumentti, joka ratkaisee.

Lue lisää

"Se on argumentti, joka ratkaisee."

Aivan. Voisit ihan yhtä hyvin väittää että kuu on juustoa, koska sinusta kuu näyttää juustolta. Ja olet löytänyt netistä tekstiä hakusanoilla "kuu" ja "juusto".

Todellisuudessa olet uskonnolla pällinsä sekoittanut henkilö, jonka älykkyys ei selvästikään riitä käsittelemään genetiikkaa ja sen termistöä.

Epigeneettinen periytyminen on muuta kuin geenien välityksellä tapahtuvaa periytymistä. Siihen nähden on kummallista että jauhat sontaa geneettistä sekvensseistä. Argumenttisi on siis sontaa alusta loppuun.

Epäjumalienkieltäjä kirjoitti:

<>

Koita nyt viimein tajuta termit joita viljelet.

Wikipedia määrittelee mutaation ytimekkäästi: "Mutaatio on satunnainen muutos organismin perimäaineksen DNA:n tai joskus RNA:n nukleotidijärjestyksessä"

Sen sijaan epigenetiikka määritellään: "Epigeneettinen periytyminen tarkoittaa perinnöllisen tiedon siirtoa solun tai eliön jälkeläiselle ilman, että perinnöllinen tieto on koodattuna DNA:n tai RNA:n sekvenssiin." (Wikipedia)

Pistemutaatiot ovat siis mutaatioita ja mutaatiot eivät ole epigenetiikkaa. Kuinka vaikeaa peruskäsitteiden ymmärtäminen voi olla?

Lue lisää

Siksi että Sepis on vajakki.

TBitT-on-Sepis-vajakki kirjoitti:

Siksi että Sepis on vajakki.

Miks Sepis ois yhtäkkiä vuosien jälkeen alkanu maanisesti postaileen tiedeuutisia, vaikkaki päin peetä ymmärrettynä ja kirjottaan eri tyylillä? Ihan eri tyyli musta, vaikka samoja maneereja on kaikilla kretuilla ja niitä esittävillä trolleilla.

No Draamatunhan muskeleilla se käy vallan helpostikin.
Onko jokin oikein tai väärin on sivuseikka kunhan sen pystyy selittämään Kirjoitusten kautta.

Käännöstaitulkinta kirjoitti:

No Draamatunhan muskeleilla se käy vallan helpostikin.
Onko jokin oikein tai väärin on sivuseikka kunhan sen pystyy selittämään Kirjoitusten kautta.

Käytin kyllä ihan puhtaasti tieteellisiä kirjoituksia ja poikkeuksellisesti hieman Wikipediaa.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

Käytin kyllä ihan puhtaasti tieteellisiä kirjoituksia ja poikkeuksellisesti hieman Wikipediaa.

Joo, ja käytit niitä väärin. Et vaan osaa, kun olet fiksannut nuppisi heti lähtökohtaisesti väärin ja et kykene fiksaatiostasi toipumaan (a.k.a. pois oppimaan).

jooppajoo kirjoitti:

Joo, ja käytit niitä väärin. Et vaan osaa, kun olet fiksannut nuppisi heti lähtökohtaisesti väärin ja et kykene fiksaatiostasi toipumaan (a.k.a. pois oppimaan).

Evot ei osaa käyttää mitään oikein!

Kiitos, tuota tietoa etsinkin. Termiä epimutation on siis käytetty väärin siten, että sillä olisi muka jotain tekemistä DNA-mutaatioiden kanssa.
Epimutaatio liittyy epigenetiikkaan ja se on oleellinen mekanismi eliöiden adaptoitumisessa. Ja se on periytyvä mutta myös palautuva ominaisuus.

Ja mitä tulee tuohon hiustyypin muutokseen, niin kyseessä oli epigeneettisiin tekijöihin liittyvä muutos. Ei pistemutaatio. Mekanismi tapahtui vaan eri tavalla, kuin olin ounastellut, eli aminohappojen vaihtumisen takia. Tämän myönnän.
Mutta olin oikeassa alusta lähtien siinä, että hiustyypin muuttumisen taustalla olivat epigeneettiset tekijät. RNA mediated amino acid subsitution.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

Kiitos, tuota tietoa etsinkin. Termiä epimutation on siis käytetty väärin siten, että sillä olisi muka jotain tekemistä DNA-mutaatioiden kanssa.
Epimutaatio liittyy epigenetiikkaan ja se on oleellinen mekanismi eliöiden adaptoitumisessa. Ja se on periytyvä mutta myös palautuva ominaisuus.

Ja mitä tulee tuohon hiustyypin muutokseen, niin kyseessä oli epigeneettisiin tekijöihin liittyvä muutos. Ei pistemutaatio. Mekanismi tapahtui vaan eri tavalla, kuin olin ounastellut, eli aminohappojen vaihtumisen takia. Tämän myönnän.
Mutta olin oikeassa alusta lähtien siinä, että hiustyypin muuttumisen taustalla olivat epigeneettiset tekijät. RNA mediated amino acid subsitution.

Lue lisää

Hiustyypin muutos on muuten suoraan kytköksissä tuohon EDAR370A - geenialleeliin, mikä oli osoitettu tuossa hiirikokeessa (jossa siirrettiin hiireen tuo geenialleeli). Pistemutaatio, jonka seurauksena proteiinissa vaihtui kohdassa 370 valiini analiiniksi. Totta kyllä, että geenin transkriptioon liittyy RNA, mutta sillä ei ollut tässä tapauksessa mitään epigenetiikkaan luettavaa vaikutusta, vaan kyseessä on ollut aivan normaali geenin koodaama proteiini.

Et siis edelleenkään ymmärrä geeneistä, geenien ekspressoitumisesta, transkriptaasista etkä muistakaan genetiikkaan ja geenin toimintaan liityviä asioita. Tämä on käynyt jo selväksi. Opettele perusasiat ensiksi, sillä kompurointisi on kyllä noloa.

Noh, hupiahan tästä on ollut seurauksena.

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

Kiitos, tuota tietoa etsinkin. Termiä epimutation on siis käytetty väärin siten, että sillä olisi muka jotain tekemistä DNA-mutaatioiden kanssa.
Epimutaatio liittyy epigenetiikkaan ja se on oleellinen mekanismi eliöiden adaptoitumisessa. Ja se on periytyvä mutta myös palautuva ominaisuus.

Ja mitä tulee tuohon hiustyypin muutokseen, niin kyseessä oli epigeneettisiin tekijöihin liittyvä muutos. Ei pistemutaatio. Mekanismi tapahtui vaan eri tavalla, kuin olin ounastellut, eli aminohappojen vaihtumisen takia. Tämän myönnän.
Mutta olin oikeassa alusta lähtien siinä, että hiustyypin muuttumisen taustalla olivat epigeneettiset tekijät. RNA mediated amino acid subsitution.

Lue lisää

”Ei mikään. Todistin toisessa ketjussa, että hiustyypin muutoksen takana olivat epigeneettiset tekijät.”

Et tietenkään todistanut. Tutkimusraportti osoittaa päivänselvästi, että muutoksen takana on ollut pistemutaatio.

”This mode of action was previously proposed based on the observation that 370A can potentiate NFκB signaling in vitro (Bryk et al., 2008; Mou et al., 2008) and a clinical case report in which 370A was associated with reduced severity of Hypohidrotic Ectodermal Dysplasia caused by an EDA missense mutation (Cluzeau et al., 2012). The hair phenotype of 370A animals is consistent with this model, as is the increase in eccrine gland number and mammary gland branching.”

Ja tämä malli osoitettiin myös kokeellisesti oikeaksi.

"The DDs of mouse and human EDAR are identical in sequence, with mice natively expressing the 370V allele (Figure 2A). To construct 370A knock-in mice, we used homologous recombination in embryonic stem cells to introduce the T1326C point mutation into the endogenous murine Edar locus resulting in V370A substitution in the encoded protein (Figures 2B, S6). 370A mice were born at expected Mendelian ratios, appeared healthy, and did not exhibit altered fertility or longevity compared to wildtype littermates (Figure 2C and data not shown)."

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3575602/

”Se oli perusväittämäni ja siinä olin täysin oikeassa. Jos ette vielä ymmärrä sitä, että aminohappojen vaihtuminen on epigeneettisten tekijöiden aikaansaama muutos, niin se on teidän omaa tietämättömyyttänne. Seuraa viimeisimpiä tutkimustuloksia.”

Sinulla ei ole esitää yhtäkään vertaisarvioitua tutkimusta tämän väitteen tueksi. Tämä johtuu siitä, ettei Kohl itsekään osaa esitää mekanismia väitteilleen, vaan hän kieroilee kreationisteille tyypilliseen tapaan ja käytää vakiintuneita termejä harhaanjohtavasti. ”RNA-mediated amino acid substitutions” ei tarkoita oikeastaan yhtään mitään. Genetiikassa ”amino acid substitution” tarkoittaa mutaation aiheuttamaa muutosta DNA sekvenssissä.

”In genetics, substitution is a type of mutation due to replacement of one nucleotide in a DNA sequence by another nucleotide or replacement of one amino acid in a protein by another amino acid.”

http://ghr.nlm.nih.gov/glossary=substitution

Tästä on myös saatu kokeellista näyttöä useissa tutkimuksissa.

”Due to the unstable property of SaALDC at low pH conditions that needed in brewing process, site-directed mutagenesis was proposed for improving the acidic stability of SaALDC. Homology comparative modeling analysis showed that the mutation (K52D) gave rise to the negative-electrostatic potential on the surface of protein while the numbers of hydrogen bonds between the mutation site (N43D) and the around residues increased. Taken together the effect of mutation N43D-K52D, recombinant SaALDCN43D-K52D showed dramatically improved acidic stability with prolonged half-life of 3.5 h (compared to the WT of 1.5 h) at pH 4.0.”

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25543264

Lukuisissa kommenttiosioissa, joihin Kohl on spämmännyt malliaan, on osoitettu, että hän puhuu todellisuudessa vaihtoehtoisesta silmukoinnista, jossa samasta geenistä voidaan silmukoinnin avulla luoda erilaisia mRNA-molekyylejä ja siten erilaisia proteiineja. Eksonit ovat aina samassa järjestyksessä kuin esi-mRNA:ssa, vaikka silmukoinnin lopputuotteet voivat olla erilaisia. Kohl siis selvästi puhuu mallissaan vaihtoehtoisesta silmukoinnista, mutta hän käyttää virheellisesti/erehdyttääkseen termiä ” RNA-mediated amino acid substitutions”, jotta saisi linkitettyä RNA:n aminohappojen epigeneettiseen muuttamiseen, vaikka sellaista mekanismia ei todellisuudessa ole. Tämä on sitä pseudotiedettä.

Vaikka kirjoitat välillä näennäisesti tieteellisen oloista tekstiä, paistaa silti asiaa edes vähän ymmärtävälle, ettet oikeasti ole sisäistänyt ja ymmärtänyt aivan perusasioita ja käsitteitä. Teet aivan kummallisia ja päättömiä virheitä, jotka eivät voi olla vahinkoja, ja sitten kuvittelet että muiden tulisi ottaa sinut aivan vakavissaan.

Niiden "pieleenmenevien termien" myötä menee se asiasisältökin.
Mutta eihän hän muuten kretionisti olisikaan.

"Ihmisellä pistemutaatioita tapahtuu 50-100 sukupolvea kohti."

Ja huomasitko, että The-Bible-is-the_Truth väittää näin "Yleisesti ottaen voidaan sanoa, että pistemutaatio on aina vakava virhe dna:n kopioinnissa ja johtaa yleensä solun kuolemaan." Todellisuudessa niistä ylivoimaisesti suurin osa neutraaleja, kuten voimme suoraan havaita ihmisistä. Harvallapa meistä on haitallinen tai letaali uusi mutaatio.

Ei mikään. Todistin toisessa ketjussa, että hiustyypin muutoksen takana olivat epigeneettiset tekijät.
Se oli perusväittämäni ja siinä olin täysin oikeassa. Jos ette vielä ymmärrä sitä, että aminohappojen vaihtuminen on epigeneettisten tekijöiden aikaansaama muutos, niin se on teidän omaa tietämättömyyttänne. Seuraa viimeisimpiä tutkimustuloksia.

Hakusanat: RNA amino acid epigenetic

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

Ei mikään. Todistin toisessa ketjussa, että hiustyypin muutoksen takana olivat epigeneettiset tekijät.
Se oli perusväittämäni ja siinä olin täysin oikeassa. Jos ette vielä ymmärrä sitä, että aminohappojen vaihtuminen on epigeneettisten tekijöiden aikaansaama muutos, niin se on teidän omaa tietämättömyyttänne. Seuraa viimeisimpiä tutkimustuloksia.

Hakusanat: RNA amino acid epigenetic

Lue lisää

"Todistin toisessa ketjussa, että hiustyypin muutoksen takana olivat epigeneettiset tekijät."

Et todistanut. Osoitit vain, ettet ymmärrä a) englantia, b) genejä ja c) genetiikkaa.

http://www.caesar.de/1395.html

Tuosta voi jokainen lukaista, että aminohappojen vaihdos kytkeytyy epigenetiikkaan.

MOT

The-Bible-is-the_Truth kirjoitti:

http://www.caesar.de/1395.html

Tuosta voi jokainen lukaista, että aminohappojen vaihdos kytkeytyy epigenetiikkaan.

MOT

Lue lisää

Tämä keskustelu on mahdotonta, kun et ymmärrä perusasioista mitään. Etkö jo ymmärrä, että kodonit koodaavat aminohappoja, joista proteiinit rakentuvat? Kirjoituksistasi saa sen kuvan, että kuvittelet DNA:n tai RNA:n rakentuvan aminohapoista, joissa sitten muutos tapahtuu, vai mitä ihmettä oikein tarkoitat tuolla aminohappojen vaihdoksella? Kerro myös se mekanismi, joka tämän mielestäsi saa aikaan? Me muut kyllä ymmärrämme, että "substitution" tarkoittaa juuri sitä, mitä se vakiintuneen käsityksen mukaan genetiikassa tarkoittaa, ja myös sen, että se se saa aikaan, että muuttunut geeni koodaa sellaista proteiinia, jossa yksi aminohappo on vaihtunut toiseksi.

”In genetics, substitution is a type of mutation due to replacement of one nucleotide in a DNA sequence by another nucleotide or replacement of one amino acid in a protein by another amino acid.”

Erilaiset epigeneettiset modifikaatiot liittyvät kyllä erilaisiin säätelytekijöihin ja ilmentymiin, mutta tähän ne eivät liity.

Piippelitruutti on niin kova karkaamaan paikalta ja avaa aivan saman asian ympäriltä uusia avauksia. Nostanpa tämän taas esille ketjuhierarkiassa, kun piippelitruutti ei näytä näitä lukevan saati ymmärtävän puhumattakaan oppimisesta.