Ribosomien alkuperästä ja evoluutiosta

Toisessa tutkimuksessa selvitettiin, kuinka ribosomi kokoaa itsensä. Tutkimuksessa selvisi, ettei proteiinin ja RNA:n muodostamat kompleksit olekaan staattisia vaan dynaamisia, ja ne muodostavat uusia sidoksia ja kiinnityskohtia seuraaville proteiineille biokemianlainalaisuuksia seuraten.

"Using a "computational microscope," the team compared data from their FRET experiments with an all-atom simulation of the protein and RNA interaction. Their analysis revealed that the S4 protein and the 16S ribosomal RNA were a surprisingly "dynamic duo," Ha said. The protein constrained the RNA somewhat, but still allowed it to undulate and change its conformation"

“The team found that the S4 protein tends to bind to the RNA when the RNA takes on an unusual conformation – one not seen in the fully assembled ribosome. This was a surprise, since scientists generally assume that ribosomal proteins lock RNA into its final, three-dimensional shape."

"We found that the S4 and RNA complex is not static," Ha said. "It actually is dynamic and that dynamism is likely to allow binding of the next protein" in the sequence of ribosome assembly."

"Once the S4 binds, it induces other conformational changes that allow the binding sites for other proteins to appear," he said. "So the binding site for the third protein doesn't appear until after the second protein is there."

Kolmannessa tutkimuksessa tutkijat osoittivat, kuinka ribosomien ydin on samanlainen kaikella elämällä. Elämän monimutkaistuessa ribosomi kehittyy kerroksittain siten, etteivät aikaisemmat toiminnot vahingoitu, vaan uusi toiminnallinen kerros muodostuu vanhan toimivan päälle. Kääntämällä prosessin ajallisesti toiseen suuntaan, he onnistuivat mallintamalla selvittämään, minkälaisia ensimmäiset ribosomit ovat mahdollisesti olleet.

"We have worked out on a fine level of detail how the ribosome originated and evolved."

“In the new study, Williams and Research Scientist Anton Petrov compared three-dimensional structures of ribosomes from a variety of species of varying biological complexity, including humans, yeast, bacteria and archaea. The researchers found distinct fingerprints in the ribosomes where new structures were added to the ribosomal surface without altering the pre-existing core."

"Additions to the ribosome cause insertion fingerprints. Much like a botanist can carve back twigs and branches on a tree to learn about its growth and age, Petrov and Williams show how segments were continually added to the ribosome without changing the underlying structure. The research team extrapolated the process backwards in time to generate models of simple, primordial ribosomes."

"We learned some of the rules of the ribosome, that evolution can change the ribosome as long as it does not mess with its core," Williams said. "Evolution can add things on, but it can't change what was already there."

Tuli taas niin pitkä avaus, etten aivan kaikkea tähän nyt jaksa laittaa, mutta voin jatkaa keskustelua epäselviksi jääneistä asioista. Aivan kaikkea ei toki ribosomeista tiedetä, mutta sen kehittyminen ja olemassaolo kuitenkaan näytä evoluutiolle mahdoton tehtävä olleen, kuten kreationistit esittävät.

Kerrotaan vielä sekin, että synteettisiä ribosomin valmistuksessa ollaan jo pitkällä.

"We can mimic nature and create ribosomes the way nature has evolved to do it, where all the processes are co-activated at the same time," said Jewett, who led the research along with Church. "Our approach is a one-pot synthesis scheme in which we toss genes encoding ribosomal RNA, natural ribosomal proteins, and additional enzymes of an E. coli cell together in a test tube, and this leads to the construction of a ribosome."

http://phys.org/news/2014-06-evolution-life-revealed.html

http://phys.org/news/2014-06-biologists-link-production-protein-factories.html#inlRlv

http://phys.org/news/2014-02-advanced-techniques-yield-insights-ribosome.html#inlRlv

http://phys.org/news/2013-06-mimicking-cells-ribosomes.html

Vähän ajattelinkin, ettei Torpalla tai muilla kreationisteilla ole aiheeseen mitään sanottavaa. Ei se mitään, jatkan muista aiheista.

Ihan hienoahan se on että Luojan töitä tutkitaan ja solun mekanismeja selvitetään.

Mutta jos nyt kuitenkin otetaan suhteellisuudentaju mukaan asiaan niin kyllähän todellisuus on edelleenkin se että kaikkein alkeellisinkin elämänmuoto on käsittämättömän monimutkaista biotekniikkaa, josta toimivatkin lukijaribosomit ovat vain pienenpieni osatekijä. Ja toimimattomat ribosomin kaltaiset osaset eivät edes kuulu soluun. Joten vielä ollaan ikuisuuksien päässä spontaanisynnystä.

Siis alkeellisinkin löydetty solu on tutkijoiden mielestä edelleenkin suihkukonetta monimutkaisempi, joten ensin täytyy tietenkin ilmaantua sattumalta se helpompi asia, eli suihkari ja sitten se monimutkaisempi asia, eli spontaanisyntyalkusolu.