BOA:lle

Heippa!
Liittyen tähän artikkeliin:
http://www.bio.psu.edu/People/Faculty/Nei/Lab/2005-glaz ko-etal.pdf

ja erikoisesti sen taulukkoon 4, minulle jäi jotain epäselvää aiemmassa keskustelussa.

Olen alle pyrkinyt laskemaan, mitkä ovat olleet taulukon absoluuttiset proteiinien lukumäärät. Eli pikkaisen ovat karsineet joitakin proteiineja pois siitä 127, ehkä?
(.... on täytemerkki, että kohdistuisi tähän jotenkin oikein)

. . . . . . . . . . .         yhtenevyys      
kategoria..   100%.   99%..   98%.. < 98%   
..............   kpl....   kpl...   kpl..   kpl...   KPL YHT.
entsyymi...   5,0..   11,0.   6,0..   8,0..   30,0
signalointi.   10,0.   19,0   13,0.   18,0.   60,1
siirtoprot....   5,0..   3,0..   1,0..   0,0..   9,0
muita........   2,0...   3,0..   3,0..   14,0.   22,0
yht.........   22,0.   36,0.   23,0.   40,0.   121,0

Niin se epäselvyys liittyy sitten tähän kohtaan:
[in Table 4 for different categories. It is clear that signal transduction is highly conserved, whereas transporter proteins are least conserved.]

Minusta asia ei ole aineiston pohjalta ollenkaan "clear", vaan päinvastaiset johtopäätökset olisivat ilmeisemmät. Vikahan voi olla rivien sekaantumissa tms.

Toinen on sitten tuo, että miksi taulukkoon 4 on otettu vain 22 täysin yhtenevää proteiinia 25:stä, ja miksi kokonaismäärää on supistettu 121:een 127:stä.

Kyse voi olla minunkin väärinkäsitysestä tms., mutta jos virhe on sinustakin ilmeinen, voisitko kenties kysyä tekijöiltä syytä moiseen. Osaisit varmaan muotoilla kysymyksen asiantuntevammin kuin minä.
2248
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 2

Vanhimmat
Aloittaja

Oletan BOA:n lukeneen tämän. Hänen vastaamattomuudestaan ei voine vetää kovin pitkiä johtopäätöksiä.

Edelleen menen olettamaan, ettei BOA ole aikonutkaan kysyä epäselvää kohtaa kirjoittajilta.

Eipä tässä muuta tällä kertaa, saas nähdä, päästäänkö vielä joskus palaamaan aiheeseen.

Äänestä

Kommentoi aloitusta


old_profile_3668 kirjoitti:

Heippa!
Liittyen tähän artikkeliin:
http://www.bio.psu.edu/People/Faculty/Nei/Lab/2005-glaz ko-etal.pdf

ja erikoisesti sen taulukkoon 4, minulle jäi jotain epäselvää aiemmassa keskustelussa.

Olen alle pyrkinyt laskemaan, mitkä ovat olleet taulukon absoluuttiset proteiinien lukumäärät. Eli pikkaisen ovat karsineet joitakin proteiineja pois siitä 127, ehkä?
(.... on täytemerkki, että kohdistuisi tähän jotenkin oikein)

. . . . . . . . . . .         yhtenevyys      
kategoria..   100%.   99%..   98%.. < 98%   
..............   kpl....   kpl...   kpl..   kpl...   KPL YHT.
entsyymi...   5,0..   11,0.   6,0..   8,0..   30,0
signalointi.   10,0.   19,0   13,0.   18,0.   60,1
siirtoprot....   5,0..   3,0..   1,0..   0,0..   9,0
muita........   2,0...   3,0..   3,0..   14,0.   22,0
yht.........   22,0.   36,0.   23,0.   40,0.   121,0

Niin se epäselvyys liittyy sitten tähän kohtaan:
[in Table 4 for different categories. It is clear that signal transduction is highly conserved, whereas transporter proteins are least conserved.]

Minusta asia ei ole aineiston pohjalta ollenkaan "clear", vaan päinvastaiset johtopäätökset olisivat ilmeisemmät. Vikahan voi olla rivien sekaantumissa tms.

Toinen on sitten tuo, että miksi taulukkoon 4 on otettu vain 22 täysin yhtenevää proteiinia 25:stä, ja miksi kokonaismäärää on supistettu 121:een 127:stä.

Kyse voi olla minunkin väärinkäsitysestä tms., mutta jos virhe on sinustakin ilmeinen, voisitko kenties kysyä tekijöiltä syytä moiseen. Osaisit varmaan muotoilla kysymyksen asiantuntevammin kuin minä.

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu