Nimimerkki The_Raven kehotti minua opettelemaan evo-devon alkeet, joten tässäpä hieman analyysiä.
The_Raven: "Opettele ensin evo-devon alkeet niin sitten voimme jatkaa keskustelua....Pax6 geeni on hyvä todiste tästä, se on ihmisellä, hiirellä, ahvenella ja banaanikärpäsellä täsmälleen samanlainen ja säätele samalla tavalla silmän kehitystä niin kyllä kai ihmisen ja banaanikärpäsen erot pitää selittää evoluutiolla, ei millään lajiutumisella, muuntelulla tai vastaavalla kreationistien olkiukolla."
Alkeet:
PAX6:een liittyvä ymmärrys on syventynyt merkittävästi sitten 1990-luvun, jolloin evo-devo-ajattelu (evolutionary developmental biology) nousi keskeiseksi paradigmaksi. Tuolloin PAX6-geeniä alettiin pitää "evo-devo-työkalupakin" arkkityyppinä, koska sen laaja konservoituneisuus eri eläinlajeilla (esim. hyönteisillä ja selkärankaisilla) ja rooli silmän kehityksessä herättivät suurta huomiota.
PAX6 ja alkuperäinen evo-devo -näkemys
1990-luvun evo-devo-näkemyksessä PAX6 nähtiin:
- yhtenä master control -geeninä, joka ohjaa silmän kehitystä lähes kaikilla eläinlajeilla
- osoituksena siitä, että kehityksen perusohjelma on syvästi konservoitunut eläinkunnassa.
Tätä näkemystä käytettiin tukemaan ajatusta, että pienet säätelymuutokset samoissa geeneissä voivat tuottaa valtavan fenotyyppisen monimuotoisuuden evoluution aikana.
Nykyinen ymmärrys: silmukointivarianttien merkitys
Sittemmin tutkimus on osoittanut, että PAX6:n vaihtoehtoinen silmukointi tuottaa useita isoformeja, jotka toimivat eri tavoin eri kudoksissa ja kehitysvaiheissa. Tärkeimpiä näistä ovat:
- PAX6 (klassinen isoformi): yleinen transkriptiotekijä useissa kudoksissa.
- PAX6(5a): vaihtoehtoinen isoformi, jossa eksoni 5a lisää 14 aminohappoa paired domain -alueelle → muuttaa DNA-sitoutumiskykyä ja kohdegeenien valintaa.
- PAX6ΔPD ja muut harvinaisemmat variantit, joilla on mahdollisesti dominant-negative-vaikutuksia tai kudosspesifisiä funktioita.
Näitä vaihtoehtoisia transkripteja ei tunnettu vielä 1990-luvun alussa, vaan niiden merkitys on selvinnyt vähitellen viimeisten kahden vuosikymmenen aikana funktionaalisten ja transkriptomiikkaan perustuvien analyysien kautta.
Miten tämä muuttaa evo-devo -tulkintaa?
Evo-devo yksinkertaisti liikaa:
→ PAX6 ei ole vain yksi säätelygeeni, vaan se on transkriptiovarianttien verkosto, joka tuottaa useita biologisia rooleja kudos- ja lajispesifisesti. Säätely perustuu epigeneettisiin mekanismeihin.
Fenotyyppinen diversiteetti (muuntelu) ei välttämättä edellytä uuden geenin syntyä, vaan voi syntyä myös:
- vaihtoehtoisesta silmukoinnista
- lncRNA-välitteisestä säätelystä (esim. PAX6-AS1)
- epigeneettisistä tekijöistä (esim. kromatiinirakenteen säätely PAX6-lokusalueella).
Sama geeni (PAX6) voi ajaa hyvin erilaisia kehitysohjelmia silmässä, aivokuoressa, haimassa tai nenäontelossa – ei pelkästään "silmän rakentajana".
Yhteenveto
1990-luvulla PAX6 nähtiin yksinkertaisena "master gene" -työkaluna, mutta nykyään se ymmärretään monitasoisena säätely-yksikkönä, jonka vaihtoehtoiset silmukointivariantit, säätelyelementit ja epigeneettiset vuorovaikutukset ohjaavat useita kehityksellisiä prosesseja.
Tämä monimuotoisuus ei ollut tiedossa evo-devo-ajattelun syntyaikoina, ja nykyisin puhutaan yhä enemmän transkriptiovariantti- ja epigeneettisestä kehitysbiologiasta, ei vain geenien vertailusta lajien välillä.
Hakusanat niille, jotka haluavat tarkistaa näiden tietojen paikkansapitävyyden:
pax6 transcription factor epigenetic
pax6 alternative splicing
pax6 lncRNA regulation
Evo-devon alkeet
3
368
Vastaukset
Olisiko siis The_Raven:in aika päivittää opinnot tälle vuosituhannelle? Voin auttaa sinua tiedonhaussa.
- Anonyymi
Hahaha vai luulet sinä muka opettajasi jotain, kun et osaa edes kirjoittaa oikeasta aiheesta oikealla palstalle. Olet hieman yksinkertainen mutta huvittava kun luulet tietäväsi asiasta jotain. :D
Ketjusta on poistettu 0 sääntöjenvastaista viestiä.
Luetuimmat keskustelut
- 87965
- 55712
Huonoja uutisia-nyt lähtee höyrylaivat
https://www.ita-savo.fi/ Konkurssiin meni tämäkin yritys. Raja kiinni ja venäläiset turistit puuttuvat. Täällä menee pe35594Ei näytä hyvältä
Kyllä nyt Ähtäriä viedään vesikelkalla. Neuvotteliat untuvikkoja kaikki. Mikko tietty tapansa mukaan loikki puheenjohtaj39536- 31459
- 34437
Älä itke rakas.
Tunnen sun kyyneleet silmissäni. Kaikki tulee menemään hyvin. Loppu häämöttää jo...46423Jos vielä toivot...mies...
Saisinpa jonkun merkin sinulta, jos vielä odotat 📝➡️📱 Rohkeus on mennyt jos seurustelet vaikka nykyisin. En halua häi41419Olet hurmaava
Olet paras mies, joka on tullut vastaan. Sinussa on jotakin, mitä muissa ei ole. En vaan tiedä, mikä on oikein sinun su14411Dina on valittu virkaan Rovaniemelle
Kemijärven kaupunginjohtaja on pyrkinyt pois Kemijärveltä ja näyttää että näin tulee käymään.25408
