Valikko
Aloita keskustelu
Hae sivustolta
Kirjaudu sisään
Keskustelu
Viihde
Alennuskoodit
Black Friday 2024
Lainaa
Treffit
Säännöt
Chat
Keskustelu24
profiilit
solon1
profiilit
solon1
solon1
Vapaa kuvaus
Aloituksia
273
Kommenttia
2386
Uusimmat aloitukset
Suosituimmat aloitukset
Uusimmat kommentit
Tekstissä+viitatut+lähteet+ja+muutama+ylimääräinen+lisäys:
[1]+http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1365-2958.1992.tb01364.x/full
[2]+https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-00599454/document
[3]+http://jcb.rupress.org/content/194/2/165
[4]+https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-3064-9
[5]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4097194/
[6]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4380680/
[7]+http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1046/j.1365-2958.1997.6262002.x/pdf
[8]+http://www.pnas.org/content/113/20/E2784.full
Ja+ylimääräisiä:
https://en.wikipedia.org/wiki/Histidine_kinase
https://en.wikipedia.org/wiki/Two-component_regulatory_system
http://mmbr.asm.org/content/70/4/910.full
27.05.2017 19:51
Ja+jälleen+osoitus+siitä,+ettei+ROTilla+ole+mitään+pohjatietoja+molekyylibiologiasta,+solufysiologiasta+tai+solujen+viestinnästä.+Signaalitransduktioiden+olemassaolo+on+tunnettu+jo+vuosikymmeniä+ja+ympäristöstä+informaatiota+välittävät+kahden+komponentin+systeemitkin+on+tunnettu+jo+pari-kolmekymmentä+vuotta+(NarQ+löydettiin+1992).+Bakteerien+olfaktorinen+aisti+muiden+aistien+rinnalle+löydettiin+pian+seitsemän+vuotta+sitten.+Uutta+tutkimuksessa+oli+atomitason+kuvaus+tuon+mekanismin+toiminnasta,+josta+ei+ollut+täysin+yksityiskohtaista+tietoa,+ja+tämä+uusi+tutkimus+voi+johtaa+parhaimmassa+tapauksessa+antibiootteja+korvaaviin+lääkemuotoihin.[1,2]
”Mekanismi+perustuu+kahteen+komponenttiin;+solukalvon+ulkopuoliseen+proteiinikinaasiin,+joka+ottaa+vastaan+elinympäristön+molekyylisignaaleja+sekä+sisäiseen+signaalinkäsittelijään,+joka+edelleen+välittää+informaation+eteenpäin,+jotta+bakteeri+kytkisi+tarvittavat+geenit+päälle+tai+jopa+rakentaisi+geneettisiä+rekombinaatioita+adaptoitumisen+onnistumiseksi.”
Kahden+komponentin+signaalireitit+voivat+orkestroida+hyvin+hienostuneita+ja+monimutkaisia+vasteita,+muitakin+kuin+geenien+ilmentymisen+säätelyyn+liittyviä+tekijöitä,+mutta+mitä+tarkoitat+niiden+kyvyllä+rakentaa+geneettisiä+rekombinaatioita+adaptoitumisen+onnistumiseksi?+Jos+tunnet+lainkaan+genetiikan+termistöä+niin+tiedät,+että+geneettisellä+rekombinaatiolla+tarkoitetaan+eri+yksilöistä+peräisin+olevan+geneettisen+materiaalin+yhdistymistä+yhdessä+yksilössä,+ja+bakteerien+tapauksessa+tämä+voi+tapahtua+transformaation,+transduktion+tai+konjugaation+kautta.+Miten+juuri+olfaktorisen+aistin+taustalla+oleva,+yksi+lukuisista,+signaalireiteistä+itsessään+vaikuttaa+geneettisen+rekombinaation+syntyyn?+Geneettinen+rekombinaatio+on+kyllä+usein+uuden+signaalireitin+synnyn+taustalla,+mutta+sinä+ilmeisesti+väität+syy-seuraussuhteiden+olevan+toisinpäin?
”Uskomaton+mekanismi,+joka+todistaa+suunnittelusta+ja+menee+samaan+kategoriaan+MO-1+-bakteerin+seitsemän+planeettavaihteistolla+synkronoidun+ionivirtausmoottorin+kanssa.+Havainto+auttaa+ymmärtämään,+että+bakteerien+geneettiset+muutokset+eivät+perustu+satunnaisiin+mutaatioihin,+vaan+suunniteltuihin+mekanismeihin,+jotka+käsittelevät+signaaleja+ja+välittävät+niitä+eteenpäin.”
Aika+hauskoja+nämä+sinun+”uskomattomat”+mekanismit,+jotka+mukamas+todistavat+suunnittelusta,+kun+sen+paremmin+magneettisiin+bakteereihin+kuuluvan+MO-1+-bakteerin+bakteerimoottorissa+kuin+näissä+kahden+komponentin+signaalisysteemeissä+ei+ole+mitään+siihen+viittaavaa,+vaan+ne+tiedetään+evoluution+mekanismeilla+syntyneiksi.+Magneettisten+bakteerien+moottoreista+ja+flagellien+kehittymisestä+voi+lukea+näistä+tutkimuksista.[3,4,8]+Noiden+erilasten+signaalisysteemien+taas+tiedetään+syntyvän+sekä+duplikaatioita+seuranneista+kasautuneista+pistemutaatioista+että+horisontaalisen+(lateraalinen)+geeninsiirron+seurauksena.[5,6]+Kahden+komponentin+signaalivälityksessä+sensoriproteiinina+toimiva+histidiinikinaasi+on+kehittynyt+tietystä+ATPaasi+superperheestä+(GHKL).
Ylipäätään+tämä+olfaktorisen+aistin+tarkoitus+ei+ole+edistää+adaptoitumista,+vaan+se+on+itsessään+adaptaatio.+Evolutiivinen+valintapaine+on+johtanut+siihen,+että+niille+on+kehittynyt+tuon+signaalisysteemin+kautta+kyky+vastata+erilaisiin+uhkiin+ja+tilanteisiin+muodostamalla+tarvittaessa+biofilmejä.
”Havainto+bakteerin+hajuaistista+on+myös+evolutionisteille+kiusallinen,+koska+heillä+on+jälleen+uusi+muna-kana+-ongelma:+kumpi+kehittyi+ensin,+reseptori+molekyylisignaalien+vastaanottamiseksi+vai+sisäinen+signaalinkäsittelijä?”
Edelleenkään+tämä+ei+ole+mikään+uusi+asia,+vaikka+sinä+et+tästä+ollut+kuullutkaan+ja+luit+uutisen+huonosti.+Kummatkin+komponentit,+sensoriproteiini+ja+vasteensäätelijäproteiini,+muodostuvat+kahdesta+domeenista,+ja+näille+on+löydettävissä+homologisia+vastinneita+varhaisemmista+proteiinikomplekseista+ja+proteiiniperheistä.+Kokeellisesti+on+esim.+osoitettu,+kuinka+NarX+sensoriproteiini,+joka+vastaa+normaalisti+vain+nitraattiin,+koki+ligandin+sitoutumiskohdassa+yhden+pistemutaation,+jossa+lysiini+vaihtui+isoleusiiniin.+Tämän+seurauksena+NarX+alkoi+toimia+enemmän+NarQ:n+tavoin+ja+vastasi+nitraatin+ohella+myös+nitriittiin.[7]
Ja+kuten+jälleen+huomaamme,+kiusallista+tämä+on+vain+ROTille+itselleen.
27.05.2017 19:50
”Jotta+evolutiivinen+selostus+olisi+uskottava,+pitäisi+kaikista+geneettisistä+välivaiheista+löytyä+kelpoisuutta+edistävä+versio+ja+vieläpä+niin+että+kelpoisuutta+lisäävien+välivaiheiden+ero+on+enintään+kaksi+mutaatiota.”
Tämä+ei+taas+perustu+mihinkään.+Tai+perustuu+se+siihen,+että+Leisola+on+toitottanut+Beheltä,+Dembskiltä,+Gaugerilta+ja+Axelta+lainaamiaan+väitteitä+parikymmentä+vuotta,+mutta+järkeä+niissä+ei+juurikaan+ole.+Todellisuudessa+molekyylievoluutio+voi+olla+lähes+neutraalia,+mutta+toisaalta+esim.+uusia+funktionaalisia+entsyymejä+voi+syntyä+jopa+viiden+peräkkäisen+muutatioiden+sarjasta.+
”Mutta+tämäkään+ei+riitä.+Punarinnan+pitää+ymmärtää+käyttää+näkemäänsä+kvanttikemiallinen+molekyylikompassi+suunnistukseen.+Tämä+vaatii+kvanttikompassiin+sopivat+mutaatiot+sunnistuslogiikkaan+aivoissa.”
Samaa+tyhjää+lätinää.+Flavoproteiineihin+kuuluvat+kryptokromit+ovat+hyvin+konservoituneita+sekä+kasveilla+että+eläimillä+ja+niillä+on+säätelytehtäviä+muun+muassa+sirkadiaanisessa+säätelyssä+(vuorokausirytmi).+Silmän+verkkokalvon+fotoreseptoreissa+sinivaloon+reagoivina+niissä+ei+ole+tarvinnut+tapahtua+kuin+”viritystä”+niiden+toimintaa+säätelevissä+signaalimolekyyleissä,+joka+on+vaikuttanut+atomien+ja+molekyylien+kemialliseen+vuorovaikutukseen+mikä+taas+on+johtanut+luonnonlaeista+seuraavan+kvantti-ilmiön+optimoitumiseen.+Ette+jostain+syystä+kykene+näkemään+kuin+teleologisia+prosesseja+kaiken+taustalla.
”Sellaista+tutkimusta,+jossa+sekä+suunnistulogiikkaan+että+kvanttimagneetiin+sopivat+ja+aina+kelpoisuutta+edistävät+mutaatiot+askele+askeleelta+osoitettaisiin,+saamme+odottaa+kauan.”
Niin+varmasti+saadaankin+odottaa,+koska+sellaisen+odottaminen+perustuu+vain+sinun+Leisolalta+oppimiisi+väärinkäsityksiin.
”Sitä+ennen+kysymyksessä+on+uskon+asia,+josta+on+viisasta+sanoa+"...+etten+sitä+tässä+enempää+avaa..."
Tässä+ei+ole+kysymys+uskosta,+vaan+sekä+kyseisestä+asiasta+tiedetystä+yhdistettynä+muista+tutkimusta+saatuun+tietoon+että+niiden+yhdistämisestä+seuraaviin+loogisiin+päätelmiin.+Älykäs+suunnittelija+teleologisine+prosesseineen+ei+ole+minkäänlainen+samalla+viivalla+oleva+näkemys.
”Joidenkin+lintujen+on+havaittu+kalibroivan+kompassinsa+aamulla+auringon+noustessa.+Kun+lintua+on+silloin+pidetään+keinotekoisessa+magneettikentässä,+lintu+lentää+koko+päivän+väärään+suuntaan.+Tämänkin+ominaisuuden+on+pitänyt+syntyä+sattumalta+ja+kehittyä+vähitellen.”
Ajattelusi+on+täysin+solmussa.
17.05.2017 19:07
Kokeillaan+jättää+lähteitä.
[1]+https://fi.wikipedia.org/wiki/Aukkojen_jumala#Muuta_aiheesta
[2]+https://en.wikipedia.org/wiki/Quantum_biology
[3]+https://www.newscientist.com/article/mg20927963-000-quantum-states-last-longer-in-birds-eyes/
[4]+https://en.wikipedia.org/wiki/CIDNP#Radical_pair_mechanism
[5]+http://www.pnas.org/content/113/17/4634.full
[6]+https://www.nature.com/articles/ncomms7173
17.05.2017 10:54
Tuo+blogitekstin+loppukaneetti+on+jälleen+ROTilta+oppikirjamainen+esimerkki+henkilökohtaisen+epäuskon+argumentista.[1]+Voin+toki+olla+väärässäkin,+mutta+nähdyn+perusteella+rohkenen+olettaa,+ettei+ROTilla+ole+kovin+laajaa+tietopohjaa+kvanttimekaniikan+ilmiöistä,+laskennallisesta+ja+teoreettisesta+kemiasta+tai+kvanttibiologiasta+ylipäätänsä,+jonka+alaan+kyseinen+vuonna+2011+julkaistu+tutkimus+kuului.[2,3]+
Koska+ROT+ei+itse+ilmeisesti+tuonut+tätä+täällä+esille,+eikä+hän+näemmä+ole+täällä+esittämässä+mitään+väitteitä+aiheesta,+niin+en+jaksa+kovin+syvällisesti+ruotia+kyseistä+aihetta.+Yleisellä+tasolla+voin+todeta,+että+lintujen+navigointi-+ja+suunnituskyky+perustuu+useisiin+eri+aistinjärjestelmiin.+Kyseinen+tutkimus+käsitteli+lintujen+kykyä+aistia+ja+havainnoida+maan+magneettikentän+muutoksia.+Tämä+tapahtuu+sinivalon+osuessa+verkkokalvon+kryptokromi-proteiinien+muodostamaan+pigmenttiin,+joka+tuottaa+tällöin+kemiallisia+radikaaleja+jotka+toimivat+paramagneettisesti.[4]+Mekanismi+saa+aikaan+kvanttilomittumisen+elektronien+spin-tilaan,+ja+koherentti+kvanttitila+voi+kestää+jopa+100+µs+(mikrosekuntia),+kun+luonnossa+koherenssin+kestossa+puhutaan+yleensä+korkeintaan+muutamista+mikrosekunneista.
Blogissaan+ROTilla+oli+oikeastaan+vain+yksi+argumentin+poikanen,+eli+hän+hämmästeli+kuinka+ohjaamattomat+prosessit+olisivat+voineet+saada+aikaan+mekanismin,+joka+päihittää+hiuppututkijoiden+aikaansaannokset+laboratorio-olosuhteissa.+Ja+kun+hän+ei+sitä+kyennyt+ymmärtämään,+niin+johtopäätös+oli+tietenkin+älykäs+suunnittelu+ja+luominen.+Viime+vuonna+kuitenkin+ilmestyi+tutkimus,+jossa+esitettiin+useita+tapoja,+joiden+avulla+sellainen+radikaali-pari+mekanismi+joka+mahdollistaa+elektronien+spin-tilan+pitkäkestoisen+koherenssin,+on+voinut+syntyä+evoluutiolla.+Ja+kuinka+ollakaan,+tuon+mekanismin+kehittymisen+taustalla+on+muun+muassa+satunnaisia+mutaatiota+esim.+flaviiniadeniinidinukleotidi+(FAD)+kofaktorin+tuotantoa+säätelevissä+proteiinisekvensseissä.[5]+Mekanismin+toiminta+ja+sen+mahdollinen+evoluutio+on+sen+verran+monimutkainen+asia,+etten+sitä+tässä+enempää+avaa.+Lisätutkimuksia+aiheesta+toki+vielä+tarvitaan,+mutta+on+täysin+selvää,+ettei+tämäkään+asia+vaadi+mitään+magiaa+ja+suunnittelua,+vaan+kyseessä+on+evoluution+tuotos.
Ai+niin,+se+toinen+osa+ROTin+hämmästelystä+unohtui.+Tuolloin+vuonna+2011+tutkjat+olivat+todellakin+luontoa+jäljessä+mitä+tulee+kvanttitilan+ylläpitämiseen,+eli+tutkijat+onnistuivat+tuohon+aikaan+parhaimmillaan+säilyttämään+lomittumisen+80+µs+kun+punarinnoilla+se+kesti+100+µs.+Kreationisteille+on+toki+tyypillistä+sellainen+ajattelu,+että+juuri+tällä+hetkellä+olemme+kaiken+edistyksen+huipulla,+emmekä+kykene+enää+mitään+parantamaan.+Tuosta+tutkimuksesta+kului+n.+neljä+vuotta,+kun+tutkijat+onnistuivat+kasvattamaan+koherentin+kvanttitilan+keston+200+µs.[6]
17.05.2017 10:48
"Otapa+selvää+ihmisen+siemennesteessä+olevien+lncRNA-molekyylien+määrä+ja+vertaa+niiden+samankaltaisuutta+simpansseihin.+Ei+merkkiäkään+evoluutiosta.”
Tässä+pitää+huomioida+ensinnäkin+se,+että+”sperm”+tarkoittaa+suomeksi+sekä+siittiöitä+että+siemennestettä,+ja+tutkimuksesta+pitää+aina+päätellä+oikea+konteksti.+LncRNA:ta+kulkeutuu+tietenkin+niin+siittiöiden+kuin+myös+siemennesteen+kuljetusvesikkeleiden+mukana,+ja+erilaisten+lncRNA-transkriptien+määrä+on+tuhansia.+Osa+niistä+on+konservoituneita,+mutta+suurimman+osan+ilmentymisprofiili+on+erilainen.+Kun+huomioidaan+niiden+funktio+alkionkehityksen+ja+hedelmällisyyden+säätelyssä,+niin+eroavaisuudet+lajien+välillä+on+itsestään+selvä+välttämättömyys.+Ilmentymisprofiili+on+kuitenkin+sitä+yhtenevämpi,+mitä+läheisempää+sukua+kyseiset+lajit+ovat.+Me+nimenomaan+näemme+evoluutiota+noissa+lncRNA-transkripteissä.
”Höpöhöpö.+PiRNA:t+saavat+alkunsa+lncRNA-molekyyleistä+ja+niiden+tehtävä+on+vaimentaa+genomiset+parasiitit,+jotka+ovat+seurausta+vaihtoehtoisessa+silmukointimekanismissa+käytetyistä+genomisista+elementeistä.”
PiRNA:n+biogeneesi+tapahtuu+pitkästä+yksijuosteisesta+esiaste-RNA:sta,+joskus+myös+lncRNA:sta,+ainakin+kahta+geneettisesti+ja+mekaanisesti+erilaista+reittiä+pitkin.+Toinen+reitti+rakentaa+suoraan+valmista+piRNA:ta+yhden+nukleaasientsyymin+avulla,+ja+evolutiivisesti+vanhempi+reitti+välivaiheen+kautta+eksoribonukleaasia+hyödyntäen.[1]+Transposoituvan+elementin+syntyminen+vaihtoehtoisen+silmukoinnin+seurauksena+on+äärimmäisen+harvinaista,+ja+todellisuudessa+useita+muita+yleisempiä+mekanismeja+on+ehdotettu.+Kuten+itsekin+toteat,+ne+ovat+genomisia+parasiitteja+eli+itsekkäitä+elementtejä.+Isännän+kannalta+elintärkeät+niille+kehittyneet+säätelymekanismit+ovat+oppikirjamainen+malliesimerkki+genomisesta+koevoluutiosta,+jossa+valintapaine+on+ajanut+ne+välttämättömään+symbioosiin.
[1]+https://www.nature.com/nature/journal/v539/n7630/full/nature20162.html
”Suunniteltu+mekanismi.+Jos+transposonin+vaimennus+epäonnistuu+tai+häiriintyy,+on+tiedossa+ongelmia.”
Ei+selvästikään+ole,+vaan+koevoluution+aikaansaama+kompromissi.+Yleisimmin+transposonien+säätelyn+häiriintyminen+johtaa+ongelmiin,+mutta+se+voi+todistetutusti+johtaa+myös+laajamittaiseen+evoluutioon.[2]+
[2]+http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(14)01105-X
”Solon1+on+palstan+pahin+eksyttäjä.”
Taas+projisoit+omaa+käytöstäsi+ja+syytät+minua+ilman+mitään+näyttöä.+Tuollainen+defenssien+aktivoituminen+kertoo+vain+siitä,+että+koet+alitajuisesti+vääristelyjesi+olevan+heikoilla+kantimilla+ja+uhattuna.
27.04.2017 10:36
"Oletko+muuten+perehtynyt+paremmin+ns.+decoy+RNA:han+ja+miten+merkittävän+osan+lncRNA:sta+voisi+olettaa+toimivan+sellaisessa+käyttötarkoituksessa?”
Ei+siitä+eläinten+osalta+ole+ihan+hirveästi+kymmenen+vuoden+aika+kirjoitettu+(eläimillä+mekanismi+löydettiin+2007),+enkä+ole+kovin+moneen+tutkimukseen+tutustunut.+Yliopistolla+asia+ei+ole+tainnut+vielä+kertaakaan+tulla+vastaan.+Kasveilla+vastaava+mekanismi+on+tunnettu+jo+pidempään+ja+sillä+on+selkeä+vaikutus+ilmentymisen+säätelyssä,+mutta+eläinten+osalta+sen+merkityksestä+on+vielä+jonkin+verran+epäselvyyttä.+Tästä+syystä+on+vielä+tässä+vaiheessa+melkoisen+hankalaa+edes+tehdä+oletuksia+siitä,+kuinka+suuri+osa+lncRNA:sta+voisi+toimia+kilpailevana+endogeenisena+RNA:na+(ceRNA).[1]
”LncRNA+tuollaisessa+käyttökohteessa+kun+olisi+kretujen+suunnittelukuvitelmien+kannalta+jokseenkin+kieroa+suunnittelua+:).+”
Suunnilleen+kuukausi+sitten,+kun+keskustelua+käytiin+transposoneista,+totesin+ROTille+ettei+niistä+saa+suunniteltua+mekanismia+oikein+tekemälläkään,+koska+noiden+elementtien+sisältämät+lncRNA:t+voivat+mahdollisesti+toimia+vastaavasti,+eli+osa+lncRNA:sta+”naamioituu+piRNA:ksi”+ja+houkuttelee+PIWI-proteiinit+sitoutumaan+itseensä,+jotta+merkityksellisiä+osia+ei+hiljennettäisi+vaan+ne+säilyisivät+mobiileina.+Joku+ilkeämpi+saattaisi+kutsua+tuollaista+skitsofreeniseksi+suunnitteluksi.+Eipä+kuulunut+ROTin+suunnalta+mitään+kommenttia.[2]
[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Competing_endogenous_RNA_(CeRNA)
[2]+http://genome.cshlp.org/content/24/12/1977.full?sid=15dc3aee-f01f-46fd-a051-0ab57f7340f1
Jospa+nuo+lähteet+saisivat+nyt+olla+tuossa+välissä.
26.04.2017 23:00
Konservoituminen+on+ilmeisesti+minulle+hankala+sana+kirjoitettavaksi...
26.04.2017 19:35
Kokeillaan,+jos+muutama+lähde+säilyisi.
[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Long_non-coding_RNA#Conservation
[2]+https://genomebiology.biomedcentral.com/articles/10.1186/s13059-016-0880-9
[3]+https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2164-15-845
26.04.2017 19:32
”Pitkien+ei-koodaavien+RNA-molekyylien+samankaltaisuus+ihmisen+ja+simpanssin+välillä+on+niin+olematon,+että+evoluutioteoria+menettää+viimeisetkin+uskottavuuden+rippeensä+jokaisen+kohdalla,+joka+tämän+kuulee.”
Miksi+kuvittelet,+että+ihmiset+olisivat+niin+tyhmiä?+Kuten+sinulle+on+jo+kerrottu,+osa+lncRNA-transkripteistä+on+voimakkaan+valinnan+kohteena+eli+ne+kokevat+nopeaa+adaptiivista+evoluutiota,+ja+toisaalta+osa+on+ilmeisen+toimimatonta.[1]+Yritä+arvata,+että+mihin+nuo+kummatkin+johtavat+konservoitumisen+kannalta?+Ja+todellisuudessahan+evolutiivinen+konsevoituminen+ihmisten+ja+simpanssien+lncRNA:n+kesken+on+edelleen+havaittavissa+syntenian+ja+sekvenssihomologian+muodossa+(tapahtuneista+substituutioista+huolimatta+tunnistettavissa),+mutta+niiden+molekulaarinen+säätely+ja+ilmentymiskuviot+ovat+jo+hyvin+erilaisia,+eli+ne+toimivat+nykyisin+suurelta+osin+eri+tavoin.+[2]+Toki+myös+täysin+konsevoituneita+alueita+on+löydetty+lncRNA:sta,+jotka+on+todellisuudessa+oikeastaan+mahdotonta+selittää+muulla+kuin+yhteisellä+kantamuodolla.
Toisaalta+voisit+miettiä+sitäkin,+että+vaikka+kaikki+vajaat+28000+ihmiseltä+löydettyä+lncRNA-transkriptiä+toimisivat+täysin+eri+tavoin+kuin+simpansseilla+(todellisuudessa+merkittävä+osa+niistä+on+toimimattomia),+niin+mitä+se+tarkoittaisi+suhteutettuna+koko+genomiin+ja+meidän+väliseen+geneettiseen+eroavaisuuteen.+Ihmisen+yhden+lncRNA-transkriptin+keskimääräinen+pituus+on+noin+1000+nukleotidia[3],+joten+jaksojen+yheispituus+on+noin+28+miljoonaa+emästä.+Ja+kun+ihmisen+genomi+käsittää+vähän+yli+kolme+miljardia+emäsparia,+niin+löydettyjen+lncRNA-transkriptien+osuus+on+selvästi+alle+prosentti+koko+genomista.+LncRNA:n+erot+toki+muodostavat+merkittävän+osan+meidän+välisestä+geneettisestä+erostamme,+mutta+tuosta+voit+havannoida+sen+suuruusluokan.
Joten+johtuikohan+evoluutioteorian+uskottavuuden+kyseenalaistuminen+jälleen+kerran+vain+onnettomasta+kokonaisuuksien+hahmottamiskyvystäsi?
26.04.2017 19:31
Päivän+suurin...
25.04.2017 11:11
Tässä+sitten+olisi+muutama+artikkeli+sisäistettäväksi.
siRNA+https://en.wikipedia.org/wiki/Small_interfering_RNA
piRNA+https://en.wikipedia.org/wiki/Piwi-interacting_RNA
lncRNA+https://en.wikipedia.org/wiki/Long_non-coding_RNA
RNA-interferenssi+https://en.wikipedia.org/wiki/RNA_interference
RNA-polymeraasi+https://en.wikipedia.org/wiki/RNA_polymerase
RdDM+https://en.wikipedia.org/wiki/RNA-Directed_DNA_Methylation
Ja+viimeisenä+muttei+todellakaan+vähäisimpä+vaihtoehtoinen+silmukointi
https://en.wikipedia.org/wiki/Alternative_splicing
+Onnea+oppimiseen!
25.04.2017 10:50
”Näin+toimii+ateisti.+Hän+ei+yritäkään+kommentoida+tieteellisesti,+eli+tuomalla+lisäarvoa+keskusteluun+ja+perustelemalla+omia+näkökantojaan+esimerkiksi+tieteellisellä+tutkimuksella+tai+todellisuuden+havainnoilla.+Sen+sijaan+hän+alkaa+profiloida+keskustelukumppaniaan,+väheksymään+tätä+ja+heittelemään+ad+hominem+-argumentteja.”
Ja+taas+tulee+tätä+samaa+projisointia.+Olen+kirjoittanut+kymmeniä,+ellen+jopa+satoja+koko+vastauskentän+täyttäviä+tekstejä+käsitellessäni+sinun+väitteitäsi,+ja+tekstisisällöstä+varmastikin+80-90%+on+yleensä+tieteellisen+tiedon+referointia.+Tästä+seuraa+käytännössä+aina+se,+että+joko+pakenet+keskustelusta,+syytät+minua+valehtelijaksi+ja+eksyttäjäksi+ilman+mitään+näyttöä+tai+sitten+rakennat+olkiukon[1],+joka+ei+vastaa+millään+tavoin+minun+väitteitäni+ja+hyökkäät+sitä+vastaan,+kuten+tässäkin+aloituksessa+olet+tehnyt.
Sen+toteaminen,+että+sinulta+puuttuvat+sekä+muodollinen+kompetenssi+että+jatkuvasti+tekemiesi+virheiden+perusteella+hyvin+ilmeisesti+myös+todellinen+kompetenssi,+ei+ole+ad+hominem+-argumentti,+koska+se+on+keskustelun+aiheen+kannalta+merkityksellistä.+Osa+kirjoituksistani+toki+täyttää+erilaisten+argumentaatiovirheiden+kriteerit.
Kysyn+jälleen+kerran,+että+mitä+muuta+tähän+avaukseen+olisi+pitänyt+vastata,+kuin+todeta+johdannon+sisältämä+selkeä+valheellinen+väittämä?+Kirjoituksesi+on+jälleen+kerran,+ikävä+kyllä,+täynnä+puutteita,+epätarkkuuksia,+asiavirheitä+sekä+virheellisiä+oletuksia+ja+päätelmiä.+Ei+minulla+ole+aikaa+tai+kiinnostusta+kirjoittaa+useita+kymmeniä+tuhansia+merkkejä+pitkää+ja+useita+tunteja+vievää+vastausta,+jonka+se+vaatisi+jos+haluaisin+yksityiskohtaisesti+analysoida+koko+kirjoituksesi.+
Kun+joka+tapauksessa+käytät+osan+ajastasi+tietoa+etsien,+niin+tee+meille+kaikille+palvelus,+ja+lue+seuraavat+Wikipedian+artikkelit,+jos+ne+tässä+säilyvät+edes+hetken,+oikein+ajatuksen+kanssa+lävitse,+niin+voit+verrata+kirjoittamaasi+siihen+mitä+niistä+oikeasti+kokonaisuutena+tiedetään.+Eivät+artikkelit+tietenkään+aivan+kaikkea+kata,+mutta+pääpiirteissään+ne+sisältävät+kaiken+olennaisimman+tiedon.+Älä+huoli,+artikkelit+sisältävät+myös+paljon+epigenetiikkaa.
Ja+jos+se+ei+vielä+tullut+selväksi,+niin+yksikään+biologi+tai+muuten+aiheesta+perillä+oleva+ei+voisi+tänä+päivänä+ikinä+väheksyä+koodaamattomien+RNA-molekyylien+ja+niiden+toimintaan+liittyvien+muiden+tekijöiden+merkitystä,+enkä+minäkään+ole+sitä+tehnyt.
[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Straw_man
Tuo+sisältä+varalta,+jos+et+oikeasti+tiedä+mitä+olkiukkoilu+tarkoittaa.
25.04.2017 10:48
Ei+voi+kuin+suu+auki+hämmästellä,+kuinka+harhaiseksi+kreationistin+mieli+voi+muuttua.+Jos+tämä+ketju+joskus+vuosien+päästä+ponnahtaa+esille,+niin+merkittäköön+pöytäkirjaan,+että+kyseessä+on+jälleen+puhdas+olkiukkoilu.+Asian+oikean+laidan+voi+tarkistaa+tästä+keskustelusta,+jonka+seurauksena+ROT+tämän+vuodatuksensa+kyhäsi.
http://keskustelu.suomi24.fi/t/14825846/evolutionistit-ovat-hukassa-mutaatioidensa-kanssa
24.04.2017 18:21
Lähteet:+osa+2
[6]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2702308/
[7]+http://www.bionews.org.uk/page_762065.asp
[8]+https://en.wikipedia.org/wiki/Genome-wide_association_study
[9]+https://en.wikipedia.org/wiki/Genome-wide_complex_trait_analysis
[10]+https://en.wikipedia.org/wiki/Missing_heritability_problem
24.04.2017 18:13
”Ja+taas+jäi+solon1+kiinni+valehtelusta,+harhaanjohtamisesta+ja+väärän+tiedon+levittämisestä.”
Et+selvästikään+kykene+enää+muuhun,+kuin+projisoimaan+omaa+käytöstäsi+minuun.+No,+sellaiseen+se+liiallinen+defenssien+aktivoituminen+johtaa.+Mitä+et+ymmärtänyt+seuraavasta+lauseesta?
->Tutkitusti+miRNA:lla+on+lukuisia+välitys-+ja+säätelytehtäviä+alkionkehityksen+eri+vaiheissa,+mutta+yritä+nyt+hyvä+mies+olla+tunkematta+sitä+aina+aivan+joka+paikkaan.+
Linkissäsi+kerrotaan,+kuinka+miRNA-molekyylejä+voidaan+muun+muassa+hyödyntää+erilaistuneiden+somaattisten+solujen+uudelleenohjelmointiin+pluripotenteiksi+kantasoluiksi,+esim.+vahvistamalla+fibroblastien+retroviraalista+ohjelmointia.+Ylipäätään+niillä+on+suuri+rooli+alkion+kantasolujen+erilaistumisessa+ja+toisaalta+keinotekoisesti+tuotettujen+eli+indusoitujen+pluripotenttien+kantasolujen+uudelleenohjelmoinnissa.
+Esim.+lisääntynyt+m6A+RNA-metylaatio,+jota+miRNA:t+säätelevät,+voi+edistää+pluripotenttien+kantasolujen+uudelleenohjautumista,+mutta+siitähän+toistuvassa+väitteessäsi+ei+ole+ikinä+ollut+kyse.+Gametogeneesissä+ja+varhaisessa+alkiokehityksessä+tapahtuvissa++udelleenohjelmoinneissa+poistetut+epigeneettiset+markkerit+eivät+välity+miRNA-molekyylien+välityksellä,+vaan+juuri+sillä+tavoin+kuin+ylempänä+kerroin.+Et+taaskaan+ymmärrä+kokonaisuuksia+ja+oikeaa+kontekstia.+
”Ja+lisää...+”
En+löytänyt+koko+tutkimuksesta+mainintaa,+jonka+mukaan+kuljetusvesikkeleiden+mukana+kulkeutuvat+miRNA-molekyylit+osallistuisivat+poistettujen+epigeneettisten+markereiden+välittämiseen+uudelleenohjelmoinnissa.+Monta+muuta+säätely-+ja+välitystoimintoa+oli+kyllä+mainittu.+
”Kerropa+solon1,+jos+nyt+asioista+mitään+ymmärrät,+miksi+siemennesteessä+on+tuhansia+erilaisia+RNA-molekyylejä?+Luulet+varmaan,+ettei+niilläkään+ole+mitään+funktiota?”
Siksi+tietenkin,+koska+ne+säätelevät+hedelmällisyyttä,+osallistuvat+useisiin+tehtäviin+alkionkehityksessä+ja+vaikuttavat+muutenkin+lukemattomiiin+muihin+prosesseihin+tapahtumista+ennen+hedelmöitystä+aina+pitkälle+lapsen+kehityskaaren+erilaisiin+toimintoihin.+Eikö+sinun+mielesi+enää+oikeasti+kerro,+että+nyt+rakennat+olkiukkoa,+jolla+ei+ole+mitään+tekemistä+toisen+todellisten+väitteiden+kanssa?
24.04.2017 18:10
”Tutkijat+olivat+suorastaan+järkyttyneitä+havaitessaan,+että+saman+geenin+puuttuminen+eri+alkioilla+johti+joka+kerralla+aivan+erityyppisiin+kehityksellisin+häiriöihin+vaikka+hiirialkioiden+geneettinen+tausta+oli+identtinen.”
Tutkijat+osasivat+odottaa+jossain+määrin+mutanttialkioiden+fenotyyppien+monimuotoisuutta,+koska+seulontamenetelmässä+käytettiin+vain+yhtä+aikapistettä,+ja+geenien+todennäköinen+pleiotrooppinen+[1]+vaikutus+oli+tiedossa.+Yllättävää+ja+huomiota+herättävää+oli+se,+että+lähes+kaikki+fenotyypit+ilmenivät+puutteellisesti.+Tutkijat+spekuloivat,+että+fenotyypin+monimuotoisuuteen+vaikuttavien+syy-seuraussuhteiden+taustalla+on+vielä+tuntemattomia+stokastisia+komponentteja.[2]+Millä+logiikalla+tämä+viittaisi+siihen,+että+taustalla+on+älykäs+suunnittelu?
”Tätä+on+populaatiogenetiikka+pahimmillaan.”
Tämä+oli+kyllä+kehitysbiologian+alaan+kuuluva+tutkimus,+jossa+nykyisin+tietenkin+hyödynnetään+myös+geeniteknisiä+menetelmiä.+Mutta+mistäpä+sinä+sen+tietäisit,+että+mistä+tutkimusalasta+milloinkin+on+kyse.+James+kohlilta+suoraan+plagioimasi+viha+populaatiogenetiikkaa+kohtaan+on+suorastaan+säälittävää.+Kohlin+kohdalla+katkeruus+on+ymmärrettävämpää,+koska+hänestä+ei+ikinä+tullut+geneetikkoa,+vaikka+yrittääkin+epätoivoisesti+mestaroida+kyseisellä+alalla,+eivätkä+oikeat+geneetikot+hyväksy+hänen+pseudotieteellisiä+näkemyksiään.
”Tutkijat+eivät+ottaneet+huomioon+seuraavia+tieteellisiä+faktoja:
-+Biologista+informaatiota+on+ainakin+kolmea+eri+tyyppiä:+digitaalista,+analogista+ja+metadataa
-+Alkion+geenit+eivät+ohjaa+alkionkehitystä+ennen+kuin+ne+on+epigeneettisesti+uudelleenohjelmoitu+miRNA-molekyylien+välittämällä+informaatiolla.+
-+Geenisekvenssit+eivät+sanele+ominaisuuksia.”
Tämä+on+taas+jotain+aivan+käsittämättömän+typerää+ja+harhaista+kirjoitusta.+Kuka+on+niin+hullu,+että+kuvittelee+Sanger-+ja+Francis+Crick-instituuttien+huipputukijoiden+olevan+tietämättömiä+yhtään++mistään+relevantista+tekijästä+liittyen+alkionkehitykseen?[3,4]+Esim.+tutkimuksen+pääkirjoittajan,+Timothy+Mohunin,+johtama+laboratorio+on+erikoistunut+alkionkehityksen+geenien+ilmentymisen+säätelyyn+ja+solujen+erilaistumiseen+sydämen+kehityksessä.[5]+Mutta+ei,+eivät+he+mitään+ymmärrä,+vaan+apua+tarvitaan+suomalaiselta+hakukoneelle+epigenetiikkaa+pakonomaisesti+syöttävältä+amatööriltä.
Uudelleenohjelmointi+ei+sitä+paitsi+tapahdu+miRNA:n+välityksellä,+vaan+uudelleenohjelmoinnissa+DNA-metylaatio+tapahtuu+DNA-metyylitransferaasien+ja+histonimodifikaatiot+histoni+metyylitransferaasien,+histoni+deasetylaasien+sekä+erilaisten+proteiinikompleksien+välityksellä.[6]+Kyse+on+siis+vahvasti+geneettisen+ja+epigeneettisen+säätelyn+yhteistoimintaa.+Tutkitusti+miRNA:lla+on+lukuisia+välitys-+ja+säätelytehtäviä+alkionkehityksen+eri+vaiheissa,+mutta+yritä+nyt+hyvä+mies+olla+tunkematta+sitä+aina+aivan+joka+paikkaan.
Väärinkäsityksesi+on+varmastikin+syntynyt+siitä,+kun+muutama+kuukausi+sitten+teit+avauksen+aiheesta,+jossa+tutkijat+olivat+uudelleenohjelmoineet+kantasoluja+totipotenteiksi+soluiksi+poistamalla+tietyn+miRNA-molekyylin+(miR-34a).[7]
”Tutkijat+eivät+siis+kyenneet+osoittamaan,+että+kokonaisten+geenien+puuttuminen+olisi+vaikuttanut+tiettyihin+ominaisuuksiin,+joten+miten+ihmeessä+evolutionistit+kuvittelevat,+että+pistemutaatiot+vaikuttaisivat+tiettyihin+ominaisuuksiin?+Evolutionisteilla+on+vakava+puuttuvan+perimän+ongelma+(Missing+heritability+problem).”
Sinulle+tulee+ehkä+yllätyksenä,+mutta+aivan+kaikki+ominaisuudet+eivät+kuitenkaan+ole+polygeenisiä+eivätkä+vastaavasti+kaikki+geenit+ole+pleiotrooppisia.+Puuttuvan+perimän+ongelma+on+koskenut+yhden+nukleotidin+monimuotoisuuden+(SNP)+kaltaisia+variantteja+ja+niiden+linkittämistä+tiettyihin+ominaisuuksiin+ja+sairauksiin.+
Osasyynä+hankalaan+havainnointiin+voi+olla+epigeneettisillä+säätelytekijöillä,+dominassipoikkeamilla+ja+epistaasilla,+mutta+todennäköisimmin+ongelma+on+ollut+käytetyissä+menetelmissä.+Genomilaajuinen+yhteistutkimus-menetelmä+(GWAS)[8]+voidaan+kalibroida+GCTA-tilastointimenetelmää[9]+hyödyntäen+ja+havaita+SNP:den+puuttuva+perinnöllisyys.+Tutkittujen+ominaisuuksien+yllättävän+korkeasta+polygeenisyydestä+johtuen+otanta+on+ollut+liian+pientä+ja+GWAS-analyysiä+on+tehty+siksi+puutteellisesta+datasta.[10]+Et+taida+loppupeleissä+edes+ymmärtää,+mistä+koko+asiassa+on+kyse.
24.04.2017 12:09
”Defenssimekanismit+selittävät+varmastikin+paljon+mutta+niiden+kauttakaan+on+vaikea+ymmärtää+miten+ROT+voisi+kuvitella+kirjoittavansa+totuudenmukaisesti,+kun+valehtelee+jatkuvasti+myös+ristiin+itsensä+kanssa,+pahimmillaan+peräkkäisissä+viesteissä,+ja+jää+siitä+jatkuvasti+todistetusti+kiinni,+eikä+edes+yritä+korjata+asioita.+Ihan+itsestäänselvyyksien+jatkuva+pakoilu+on+kanssa+varsin+vaikea+selittää+millään+muulla+kuin+tahallisella+epärehellisyydellä.”
Vaikeahan+sitä+on+ymmärtää,+mutta+lähtökohtaisesti+en+haluaisi+ajatella,+että+kyseisen+kaltaisesta+älyllisestä+epärehellisyydestä+väkisinkin+seuraava+patologinen+valehtelu+johtuisi+esim.+narsistisesta+persoonallisuushäiriöstä,+vaan+mieluummin+niistä+defensseistä+ja+kognitiivisista+vinoumista+kuten+ylivertaisuus-+ja+vahvistusvinouma.+Hänellä+ei+kuitenkaan+taida+olla+mitään+sen+kummempia+taloudellisia+intressejä+tuon+julistamisen+taustalla,+jolloin+jonkinlainen+formaali+rationaalisuuskaan+taustavaikuttimena+ei+oikein+tule+kyseeseen.
23.04.2017 15:32
Voi+luoja...
23.04.2017 13:37
Mitä+tuohon+pitäisi+vastata?+Pitäisikö+käydä+tuo+vähän+sinnepäin,+täynnä+epätarkkuuksia+ja+puutteita+vilisevä+ämätöörimäinen+johdanto+rivi+riviltä+lävitse?+Vai+haluatko,+että+sinulle+väännetään+rautalangasta+miksi+loppukaneettisi+on+idioottimainen+ja+tyylipuhdas+olkiukko?
23.04.2017 13:32
10 / 120