DNA:n nopea hajoaminen solun kuoltua

https://insidedna.me/tutorials/view/Analysis-ancient-DNA-samples-using-mapDamage

Lainaus: "If not hold in proper conditions (i.e. -20 °C or colder) – DNA rapidly degrades, its fragments become shorter and some bases disappear due to random hydrolyzes. Moreover, some bases turn into others bases due to deamination process. Methylated cytosine transforms into thymine and adenine – into hypoxanthine, resulting in wrong sequencing reads. Because of this features analysis of ancient DNA is particularly tricky."

Oma kommentti: DNA hajoaa todella nopeasti. Väitteet miljoonia vuosia vanhasta DNA:sta ovat hölynpölyä. Muutama esimerkki pseudotieteestä:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8505978
"We report here the extraction of DNA from a 120-135-million-year-old weevil (Nemonychidae, Coleoptera) found in Lebanese amber, PCR amplification of segments of the 18S rRNA gene and the internal transcribed spacer, and the corresponding nucleotide sequences of their 315- and 226-base-pair fragments, respectively."

http://news.nationalgeographic.com/news/2013/06/130626-ancient-dna-oldest-sequenced-horse-paleontology-science/
"Samples from a horse leg bone more than 700,000 years old have yielded the oldest full genome known to date."

http://www.economist.com/news/science-and-technology/21590874-how-remnants-dinosaur-tissue-have-survived-millions-years-life
"Now researchers have come up with an explanation for how these tissues were preserved for millions of years, which just might make it possible to extract some elements of prehistoric DNA."


Joidenkin arvioiden mukaan DNA:n puoliintumisaika on 521 vuotta. Tämä tarkoittaa, että 1042 vuoden kuluttua DNA:ta on jäljellä vain 1/4. 5210 vuoden kuluttua DNA on jo käytännössä lukukelvotonta, koska sitä on jäljellä vain 1/1024.

Tulee myös huomata, että solun kuoltua genomin sytosiiniemäkset alkavat metyloitua nopeasti ja vaihtua tymiiniksi tai adeniiniksi, jolloin virhetulkintojen mahdollisuus kasvaa huomattavasti.

Kaikki fossiileista sekvensoitu DNA on itseasiassa varsin nuorta.
18530
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 18

Vanhimmat

DNA:n+hajoaminen+on+vahvasti+riippuvainen+ympäristöstä,+jossa+fossiili+on.+Pääbon+kirja+Neanderdahlilainen+käsittelee+aihetta+jonkin+verran.+"Joidenkin+arvioiden+mukaan+DNA:n+puoliintumisaika+on+521+vuotta.+"Ja+tutkimus,+jossa+tuo+todettiin+kertoo+myös+seuraavaa:+"Tutkijat+ennustavat,+että+optimaalisissakin+olosuhteissa+(-5+C)+kaikki+nukleotidien+väliset+sidokset+olisivat+hajonneet+viimeistään+6.8+milj.+vuoden+kuluttua.+DNA+hajoaa+lukukelvottamaksi+kuitenkin+jo+paljon+aikaisemmin,+eli+n.+1.5+milj.+vuoden+jälkeen.+Tutkijat+havaitsivat+lisäksi,+että+luiden+ikä+selitti+vain+n.+40+%+DNA:n+hajoamisasteen+vaihteluista.+Muita+hajoamisasteeseen+vaikuttavia+tekijöitä+ovat+näytteen+säilytystapa,+maan+koostumus+sekä+vuodenaika,+jolloin+eläin+on+kuollut."""Kaikki+fossiileista+sekvensoitu+DNA+on+itseasiassa+varsin+nuorta."Onko+sinun+mielestäsi+1,5+miljoonaa+vuotta+"varsin+nuorta"?+Vasta+silloin+DNA+alkaa+olla+lukukelvotonta.+Neanderdahlin+DNA+on+sekvensoitu+Pääbon+ryhmän+toimesta+ja+nuorimmatkin+neanderdahl-fossiilit+ovat+yli+30+000+vuoden+takaa.+Pääbon+ryhmän+työtä+ei+kukaan+asiantuntija+ole+kyseenalaistanut+ja+onhan+kymmenistä+tuhansista+vuosista+matkaa+yli+miljoonaan+vuoteen.+Ketä+luulet+vakuuttavasi+valehtelullasi?

Äänestä
  • Aloittaja

    Tyypillistä+evolutionistin+kehäpäätelmää.+On+useita+tutkimuksia,+joiden+mukaan+DNA:n+puoliintumisaika+on+noin+500+vuotta.+Silloin+on+helppo+laskea,+että+5000+vuoden+kuluttua+DNA:ta+on+jäljellä+noin+tuhannesosa.+Vaikea+sellaista+sekvenssiä+on+lukea.+Mutaan+hautautuneiden+eläinten+dna+saattaa+olla+hieman+paremmin+säilynyt+ja+tämä+selittää+sen,+miksi+jopa+dinosaurusten+luista+on+saatu+pieniä+pätkiä+dna:ta+talteen.+Neanderthalinihmisen+DNA+on+sekvensoitu+ja+mielenkiintoista+on,+että+niiden+genomi+on+99.84%:sti+yhdenmukainen+nykyihmisen+kanssa+populaatiotasolla.+Ne+olivat+siis+tavallisia+ihmisiä+ja+todennäköisesti+ennen+Nooan+tulvaa+elänyt+sukupolvi.

    Äänestä

  • Et sitten perinteiseen tapaasi taaskaan huolella lukenut tai ymmärtänyt omaa lähdettäsi. Vallan surkuhupaisaa, joskin viihdyttävää.

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    Tyypillistä+evolutionistin+kehäpäätelmää.+On+useita+tutkimuksia,+joiden+mukaan+DNA:n+puoliintumisaika+on+noin+500+vuotta.+Silloin+on+helppo+laskea,+että+5000+vuoden+kuluttua+DNA:ta+on+jäljellä+noin+tuhannesosa.+Vaikea+sellaista+sekvenssiä+on+lukea.+Mutaan+hautautuneiden+eläinten+dna+saattaa+olla+hieman+paremmin+säilynyt+ja+tämä+selittää+sen,+miksi+jopa+dinosaurusten+luista+on+saatu+pieniä+pätkiä+dna:ta+talteen.+Neanderthalinihmisen+DNA+on+sekvensoitu+ja+mielenkiintoista+on,+että+niiden+genomi+on+99.84%:sti+yhdenmukainen+nykyihmisen+kanssa+populaatiotasolla.+Ne+olivat+siis+tavallisia+ihmisiä+ja+todennäköisesti+ennen+Nooan+tulvaa+elänyt+sukupolvi.

    Dinojen+luista+on+uskottu+saadun+DNA-pätkiä,+mutta+artikkeli,+jossa+todettiin+DNA:n+puoliintumisaika,+kertoi+sen+olevan+mahdotonta.+Dinojen+fossiileista+löytynyt+DNA+on+osoitettu+kontaminaatioksi.+Missään+tapauksessa+niin+vanhaa+DNA:ta+ei+voi+löytyä.Ja+kuten+artikkelissa+todettiin,+aika+määrittää+DNA:n+hajoamisesta+vain+n.+40+%.Etkö+itse+lainkaan+lue+artikkeleja+joista+tietosi+haet,+vai+etkä+ymmärrä+niitä?Vaikka+neanderdahlilaisen+genomi+on+hyvin+lähellä+omaamme,+on+se+helposti+erotettavissa+nykyihmisen+genomista.+Meillä+on+Neanderdahlin+geenejä+n.+2+-+4+%+pois+lukien+Afrikan+väestö,+jolta+kyseiset+geenit+puuttuvat.+Neanderdahl+ei+ollut+edeltäjämme,+vaan+samaan+aikaan+elänyt+nykyihmisen+sisarlaji.+"Vaikka+nykyihmisen+ja+neandertalinihmisen+genomit+ovat+99,84-pro-senttisesti+identtiset+(Gibbons,+2010),+voitiin+silti+löytää+useita+geenialueita,+jotka+ovat+muuttuneet+tai+kehittyneet+omassa+lajissamme+sen+jälkeen,+kun+esimuotomme+erkanivat+neandertalinih-misen+linjasta.+"https://www.google.fi/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=4&cad=rja&uact=8&ved=0ahUKEwjR59GKsq_OAhUC8ywKHQ5UCiAQFgguMAM&url=http://ojs.tsv.fi/index.php/tt/article/viewFile/3633/3403&usg=AFQjCNHr4_aqdRT0RrbVACCaK9F39LSRqQ

    Äänestä

  • Siis kuka valehtelee ja mitä tyhmä. Lulemine nluulemisen päälle ei oikein vakuuta.

    Näytä tutkimusfaktat tyhmä.

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    Tyypillistä+evolutionistin+kehäpäätelmää.+On+useita+tutkimuksia,+joiden+mukaan+DNA:n+puoliintumisaika+on+noin+500+vuotta.+Silloin+on+helppo+laskea,+että+5000+vuoden+kuluttua+DNA:ta+on+jäljellä+noin+tuhannesosa.+Vaikea+sellaista+sekvenssiä+on+lukea.+Mutaan+hautautuneiden+eläinten+dna+saattaa+olla+hieman+paremmin+säilynyt+ja+tämä+selittää+sen,+miksi+jopa+dinosaurusten+luista+on+saatu+pieniä+pätkiä+dna:ta+talteen.+Neanderthalinihmisen+DNA+on+sekvensoitu+ja+mielenkiintoista+on,+että+niiden+genomi+on+99.84%:sti+yhdenmukainen+nykyihmisen+kanssa+populaatiotasolla.+Ne+olivat+siis+tavallisia+ihmisiä+ja+todennäköisesti+ennen+Nooan+tulvaa+elänyt+sukupolvi.

    Laskelmassasi on yksi järjetön oletus:

    "Silloin on helppo laskea, että 5000 vuoden kuluttua DNA:ta on jäljellä noin tuhannesosa."

    Niin olisi, jos tutkittavissa olisi vain yksi DNA-sekvenssi. Pienessäkin fossiilijäänteessä voi kuitenkin olla miljoonia soluja, joista jokaisessa identtinen DNA. Pääbon kirja kuvaa elävästi, miten niiistä tietoa luetaan.

    1Äänestä

  • Aloittaja

    ymmärrätkö-lukemasi kirjoitti:

    Dinojen+luista+on+uskottu+saadun+DNA-pätkiä,+mutta+artikkeli,+jossa+todettiin+DNA:n+puoliintumisaika,+kertoi+sen+olevan+mahdotonta.+Dinojen+fossiileista+löytynyt+DNA+on+osoitettu+kontaminaatioksi.+Missään+tapauksessa+niin+vanhaa+DNA:ta+ei+voi+löytyä.Ja+kuten+artikkelissa+todettiin,+aika+määrittää+DNA:n+hajoamisesta+vain+n.+40+%.Etkö+itse+lainkaan+lue+artikkeleja+joista+tietosi+haet,+vai+etkä+ymmärrä+niitä?Vaikka+neanderdahlilaisen+genomi+on+hyvin+lähellä+omaamme,+on+se+helposti+erotettavissa+nykyihmisen+genomista.+Meillä+on+Neanderdahlin+geenejä+n.+2+-+4+%+pois+lukien+Afrikan+väestö,+jolta+kyseiset+geenit+puuttuvat.+Neanderdahl+ei+ollut+edeltäjämme,+vaan+samaan+aikaan+elänyt+nykyihmisen+sisarlaji.+"Vaikka+nykyihmisen+ja+neandertalinihmisen+genomit+ovat+99,84-pro-senttisesti+identtiset+(Gibbons,+2010),+voitiin+silti+löytää+useita+geenialueita,+jotka+ovat+muuttuneet+tai+kehittyneet+omassa+lajissamme+sen+jälkeen,+kun+esimuotomme+erkanivat+neandertalinih-misen+linjasta.+"https://www.google.fi/url?sa=t&rct=j&q=&esrc=s&source=web&cd=4&cad=rja&uact=8&ved=0ahUKEwjR59GKsq_OAhUC8ywKHQ5UCiAQFgguMAM&url=http://ojs.tsv.fi/index.php/tt/article/viewFile/3633/3403&usg=AFQjCNHr4_aqdRT0RrbVACCaK9F39LSRqQ

    Nykyihmisen ja Neandertalinihmisen eroavaisuudet johtuvat vain epigeneettisistä tekijöistä. Erot morfologiassa selittynevät erityyppisellä ravinnolla.
    http://www.reuters.com/article/us-science-neanderthals-dna-idUSBREA3G1XD20140417
    Opi jotain epigenetiikasta, niin saatat ymmärtää, mitä tarkoittaa DNA switch.

    Ja vuonna 1994 Scott Woodward kollegoineen sai talteen DNA:ta dinosauruksen luusta, jonka väitettiin olevan 80 miljoonaa vuotta vanhaa:

    http://www.nytimes.com/1994/11/18/us/a-scientist-says-he-has-isolated-dinosaur-dna.html

    DNA:n hajoaminen alkaa kaikissa soluissa eliön kuoltua.
    http://askjohnmackay.com/dna-lifespan-what-is-it-what-happens-as-dna-degrades-can-it-last-millions-of-years/

    Evoluutioteoria on pseudotiedettä.

    Äänestä

  • RaamattuOnTotuus kirjoitti:

    Nykyihmisen ja Neandertalinihmisen eroavaisuudet johtuvat vain epigeneettisistä tekijöistä. Erot morfologiassa selittynevät erityyppisellä ravinnolla.
    http://www.reuters.com/article/us-science-neanderthals-dna-idUSBREA3G1XD20140417
    Opi jotain epigenetiikasta, niin saatat ymmärtää, mitä tarkoittaa DNA switch.

    Ja vuonna 1994 Scott Woodward kollegoineen sai talteen DNA:ta dinosauruksen luusta, jonka väitettiin olevan 80 miljoonaa vuotta vanhaa:

    http://www.nytimes.com/1994/11/18/us/a-scientist-says-he-has-isolated-dinosaur-dna.html

    DNA:n hajoaminen alkaa kaikissa soluissa eliön kuoltua.
    http://askjohnmackay.com/dna-lifespan-what-is-it-what-happens-as-dna-degrades-can-it-last-millions-of-years/

    Evoluutioteoria on pseudotiedettä.

    "Ja vuonna 1994 Scott Woodward kollegoineen sai talteen DNA:ta dinosauruksen luusta, jonka väitettiin olevan 80 miljoonaa vuotta vanhaa:"

    Kyllä. Ryhmä löysi ilmeisesti luuta kontaminoineen bakteerin genomin. Näitä miljoonien vuosien ikäisiä genomeja putkahteli yhteen aikaan paljonkin, kuten Pääbon kirjasta ilmeni. Pääbon ryhmä jopa todisti erään tutkimuksen varmuudella kontaminoituneeksi. Suuri osa tutkijoista ei silloinkaan uskonut löytöihin ja nyt vielä vähemmän.

    Väite, että erot johtuvat epigenetiikasta on naurettava. Epigeneettiset muutokset pysyvät kenties pari sukupolvea, ei kymmeniä- tai satojatuhansia vuosia, kuten neanderdahlit lajina.

    Evoluutioteoria on vahvaa tiedettä. Kreationismi on uskonnollista hourailua.

    Äänestä

  • tieteenharrastaja kirjoitti:

    Laskelmassasi on yksi järjetön oletus:

    "Silloin on helppo laskea, että 5000 vuoden kuluttua DNA:ta on jäljellä noin tuhannesosa."

    Niin olisi, jos tutkittavissa olisi vain yksi DNA-sekvenssi. Pienessäkin fossiilijäänteessä voi kuitenkin olla miljoonia soluja, joista jokaisessa identtinen DNA. Pääbon kirja kuvaa elävästi, miten niiistä tietoa luetaan.

    Juuri tuota ROT ei selvästikään tajua, ja veikkaan ettei tule antamaan kommenttiisi vastinetta, vaan jatkaa vain päätöntä valehteluaan.

    Äänestä

  • Täytyy hänen tuommoiset asiat tajuta. Varmaan lukee kommentit, joissa häntä huomautetaan vääristelyistään. Enemmän mielestäni on kyse siitä, että hän jättää, kuten sanoit, kiusalliset asiat kommentoimatta. Tyypillinen epärehellinen kretu siis.

    Äänestä

  • Nimi_Ja_Merkki kirjoitti:

    Täytyy hänen tuommoiset asiat tajuta. Varmaan lukee kommentit, joissa häntä huomautetaan vääristelyistään. Enemmän mielestäni on kyse siitä, että hän jättää, kuten sanoit, kiusalliset asiat kommentoimatta. Tyypillinen epärehellinen kretu siis.

    Totta kyllä että viimeistään nämä luettuaan pitäisi tajuta.

    Joten, jos ei kommenttia kuulu, todettakoon että olet oikeassa.

    Äänestä

  • kyssäri kirjoitti:

    Siis kuka valehtelee ja mitä tyhmä. Lulemine nluulemisen päälle ei oikein vakuuta.

    Näytä tutkimusfaktat tyhmä.

    Luepa Svante Pääbon kirja "Neandertailainen". Siellä on sinulle faktaa.

    Äänestä

Hyvä avaus. Kiitos.

Olen itsekin mielessäni ihmetellyt ja joskus tällä palstalla maininnutkin siitä että jos olisi kyse evoluutiosta jossa jokaisen solun kuuluisi evoluutioteoria mukaan ajatella ennenkaikkea omaa etuaan ja omaa selviytymistään niin kuitenkin näyttää siltä että monen solut kuolevat eli hajoavat veljiensä hyväksi heidän ravinnoksi.
Eihän tässä selkeässä havainnoidussa tapahtumasarjassa ole mitään evoluuttista järkeä yksilön etuja tarkasteltaessa,

Näemme tässä että eliökunta toimii täysin päinvastoin kuin hellenistinen evoluutio-uskomus.

Siis Darwinistinen.... tosin se on sama asia. Se on sikäli sama asia ettei nykyinen evoluutioteoria ole yhtään sen tieteellisempi kuin tuo antiikinkaan teoria, tgodisteet puuttuvat yhä ja koska olen enemmän kuin 50 v. seurannut tätä alaa niin voin sanoe että en usko ikinä löytyvän yhtä ainoaa hitaan evoluuton todistetta.

Sopii googlata aiheesta vähän muutakin kuin alan viihdfeleffoja, tyhmät.

Äänestä
  • "...jos olisi kyse evoluutiosta jossa jokaisen solun kuuluisi evoluutioteoria mukaan ajatella ennenkaikkea omaa etuaan... "
    Tuossa oli aivopieru, joka kertookin suunnilleen kaiken evoluutioteorian ymmärtämisestäsi. Olet seurannut 50 vuotta alaa, etkä ymmärrä siitä edes alkeita. On mennyt sekin aika totaalisesti hukkaan ja nyt taitaakin jo dementia tunkea pahasti päälle.

    Evoluution todisteet ovat moninaiset ja kattavat. Kukaan ammattibiologi ei aseta evoluution olemassaoloa kyseenalaiseksi. Vain yksityiskohdista kiistellään.

    Äänestä

Tässähän se taas nähdään. Evoluutio nojaa sokealle uskolle eikä tieteellisille havainnoille kuten KreAITOnismi.

Jyri & RoT taas osoittaa palstalla evokeille kaapin paikan ja pistää evokeille luut kurkkuun kerta toisensa jälkeen.

Äänestä
  • Et sitten sinäkään nihilisti malttanut olla kantamatta homeista korttasi valmiiksi sortuneeseen kekoon.

    Äänestä

Ja kappas, taas kretupellet vinkuvat että todellisuudessa on virhe, kun se ei omaan harhaan sovikaan...

Äänestä

Kommentoi aloitusta


RaamattuOnTotuus kirjoitti:

https://insidedna.me/tutorials/view/Analysis-ancient-DNA-samples-using-mapDamage

Lainaus: "If not hold in proper conditions (i.e. -20 °C or colder) – DNA rapidly degrades, its fragments become shorter and some bases disappear due to random hydrolyzes. Moreover, some bases turn into others bases due to deamination process. Methylated cytosine transforms into thymine and adenine – into hypoxanthine, resulting in wrong sequencing reads. Because of this features analysis of ancient DNA is particularly tricky."

Oma kommentti: DNA hajoaa todella nopeasti. Väitteet miljoonia vuosia vanhasta DNA:sta ovat hölynpölyä. Muutama esimerkki pseudotieteestä:

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/8505978
"We report here the extraction of DNA from a 120-135-million-year-old weevil (Nemonychidae, Coleoptera) found in Lebanese amber, PCR amplification of segments of the 18S rRNA gene and the internal transcribed spacer, and the corresponding nucleotide sequences of their 315- and 226-base-pair fragments, respectively."

http://news.nationalgeographic.com/news/2013/06/130626-ancient-dna-oldest-sequenced-horse-paleontology-science/
"Samples from a horse leg bone more than 700,000 years old have yielded the oldest full genome known to date."

http://www.economist.com/news/science-and-technology/21590874-how-remnants-dinosaur-tissue-have-survived-millions-years-life
"Now researchers have come up with an explanation for how these tissues were preserved for millions of years, which just might make it possible to extract some elements of prehistoric DNA."


Joidenkin arvioiden mukaan DNA:n puoliintumisaika on 521 vuotta. Tämä tarkoittaa, että 1042 vuoden kuluttua DNA:ta on jäljellä vain 1/4. 5210 vuoden kuluttua DNA on jo käytännössä lukukelvotonta, koska sitä on jäljellä vain 1/1024.

Tulee myös huomata, että solun kuoltua genomin sytosiiniemäkset alkavat metyloitua nopeasti ja vaihtua tymiiniksi tai adeniiniksi, jolloin virhetulkintojen mahdollisuus kasvaa huomattavasti.

Kaikki fossiileista sekvensoitu DNA on itseasiassa varsin nuorta.

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu