Onko Raamattu koodattu DNA:han?

Voiko? Lataa skripti sivuiltani ja tarkista itse, sitä varten minä sen kirjoitin.

Mielenkiintoinen hypoteesi. Lataa skripti minun sivuiltani ja tarkista itse, löytyykö tuo dokumentti DNA:sta. Sitä varten minä olen sen kirjoittanut.

Ja miten se Raamattu ja sana siihen koodattaisiin, kun on todistettavasti se on vain ihmisen luoma oppinnormisto vuosisatojen ja vuosituhansien aikana, jota on aina muuteltu kenenkin ihmisen mielen mukaan erilaisissa tilanteissa ja välillä toisia laitettu kirkonkiroukseenkin.

mitentulimieleenkin kirjoitti:

Ja miten se Raamattu ja sana siihen koodattaisiin, kun on todistettavasti se on vain ihmisen luoma oppinnormisto vuosisatojen ja vuosituhansien aikana, jota on aina muuteltu kenenkin ihmisen mielen mukaan erilaisissa tilanteissa ja välillä toisia laitettu kirkonkiroukseenkin.

Lue lisää

No fundamentalistien mielestä Raamattu on Jumalan kirjoittama, joten toki Jumala olisi voinut Raamatun koodata DNA:han.

Kristitty.net kirjoitti:

No fundamentalistien mielestä Raamattu on Jumalan kirjoittama, joten toki Jumala olisi voinut Raamatun koodata DNA:han.

Koodiahan olisi pitänyt korjata koko ajan kuten jokainen raamatun lukija on nähnyt. Mikä versio olisi koodissa?

dikduk kirjoitti:

Koodiahan olisi pitänyt korjata koko ajan kuten jokainen raamatun lukija on nähnyt. Mikä versio olisi koodissa?

Montako eri versioita on Raamatun alkutekstistä? Montako varianttia on ensimmäisen Mooseksen kirjan ensimmäisessä viidessa jakeessa, ei ainuttakaan.

Kristitty.net kirjoitti:

Montako eri versioita on Raamatun alkutekstistä? Montako varianttia on ensimmäisen Mooseksen kirjan ensimmäisessä viidessa jakeessa, ei ainuttakaan.

Mikä sitten on kunkin esim. juuri kunkin heprealaisen raamatun kirjan alkuteksti? Tiedämme että redaktioita on ollut eivätkä nykytekstit ole edes Qumranin tekstien kanssa yhtäpitävät ja että se traditio jonka mukaan tekstejä nyt kopioidaan on melko uusi, oppineiden toisen temppelin lopun aikoihin päättämä . Varmaan on myös paljon tekstejä tai niiden osia jotka ovat säilyneet sellaisenaan kirjoitusajankohdasta lähtien.

dikduk kirjoitti:

Mikä sitten on kunkin esim. juuri kunkin heprealaisen raamatun kirjan alkuteksti? Tiedämme että redaktioita on ollut eivätkä nykytekstit ole edes Qumranin tekstien kanssa yhtäpitävät ja että se traditio jonka mukaan tekstejä nyt kopioidaan on melko uusi, oppineiden toisen temppelin lopun aikoihin päättämä . Varmaan on myös paljon tekstejä tai niiden osia jotka ovat säilyneet sellaisenaan kirjoitusajankohdasta lähtien.

Lue lisää

Raamatun ensimmäiset viisi jaetta, joita minä etsin DNA:sta, eivät poikkea mitenkään eri käsikirjoituksissa.

Et ole ymmärtänyt kuinka algoritmini toimii. En ole ennalta valinnut mitään kirjaimia, nuo kirjaimet jotka ovat sivuillani ovat vain esimerkki. Algoritmi etsii ja täyttää kirjaimia vastaamaan kodoneita kun se lukee DNA:ta kodoni kerrallaan. Tutki tuota kirjoittamaani skriptiä, tuo algoritmi ei ole ollenkaan hankala.

Kristitty.net kirjoitti:

Et ole ymmärtänyt kuinka algoritmini toimii. En ole ennalta valinnut mitään kirjaimia, nuo kirjaimet jotka ovat sivuillani ovat vain esimerkki. Algoritmi etsii ja täyttää kirjaimia vastaamaan kodoneita kun se lukee DNA:ta kodoni kerrallaan. Tutki tuota kirjoittamaani skriptiä, tuo algoritmi ei ole ollenkaan hankala.

Lue lisää

Toimiiko ohjelma siis seuraavalla tavalla? Otetaan esimerkiksi "bereshit". Ensin otetaan DNA-tiedostosta ensimmäinen yksikkö ja annetaan sille arvo "b", sitten toinen ja sille arvo "e", sitten kolmas ja sille arvo "r", sitten tuleekin neljäs, jonka pitäisi olla sama kuin toinen eli "e": jos näin on, jatketaan eteenpäin samalla tavalla; jos näin ei ole, kirjataan tulos (3 perättäistä kirjainta) ja aloitetaan prosessi uudestaan aloittaen tällä kertaa DNA-tiedoston toisesta yksiköstä eli siitä, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "e"; toisella kierroksella tämä toinen yksikkö saakin arvon "b", ja kolmas yksikkö, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "r", saa toisella kierroksella arvon "e". Näinkö se toimii?

Koska DNA-yksikköjä on enemmän kuin kirjaimia, olisi kai mahdollista, että yhdellä kirjaimella on useampia DNA-vastineita. Onko tämä otettu huomioon?

herrens_tiggare kirjoitti:

Toimiiko ohjelma siis seuraavalla tavalla? Otetaan esimerkiksi "bereshit". Ensin otetaan DNA-tiedostosta ensimmäinen yksikkö ja annetaan sille arvo "b", sitten toinen ja sille arvo "e", sitten kolmas ja sille arvo "r", sitten tuleekin neljäs, jonka pitäisi olla sama kuin toinen eli "e": jos näin on, jatketaan eteenpäin samalla tavalla; jos näin ei ole, kirjataan tulos (3 perättäistä kirjainta) ja aloitetaan prosessi uudestaan aloittaen tällä kertaa DNA-tiedoston toisesta yksiköstä eli siitä, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "e"; toisella kierroksella tämä toinen yksikkö saakin arvon "b", ja kolmas yksikkö, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "r", saa toisella kierroksella arvon "e". Näinkö se toimii?

Koska DNA-yksikköjä on enemmän kuin kirjaimia, olisi kai mahdollista, että yhdellä kirjaimella on useampia DNA-vastineita. Onko tämä otettu huomioon?

Lue lisää

Hepreaa kirjoitetaan vain konsonantein, vokalisaatio ei aina ole edes selvä, heprea myös kehittyi ja muuttui sinä aikana kun heprealaiseen Raamattuun päätyneitä tekstejä kirjoitettiin. Sen koko kirjaimistokin vaihtui, tuli lainasanoja ja uusia ilmauksia itse hepreaan ja tiedämme että nykytekstit eroavat jo esim Qumranin teksteistä ja myös tiedetään että on ollut siitäkin poikkeavia tekstiversioita - joten mikä versio koodataan? Entä niistä tarinoista joista on kaksi tai kolme eri versiota Raamatussa?

herrens_tiggare kirjoitti:

Toimiiko ohjelma siis seuraavalla tavalla? Otetaan esimerkiksi "bereshit". Ensin otetaan DNA-tiedostosta ensimmäinen yksikkö ja annetaan sille arvo "b", sitten toinen ja sille arvo "e", sitten kolmas ja sille arvo "r", sitten tuleekin neljäs, jonka pitäisi olla sama kuin toinen eli "e": jos näin on, jatketaan eteenpäin samalla tavalla; jos näin ei ole, kirjataan tulos (3 perättäistä kirjainta) ja aloitetaan prosessi uudestaan aloittaen tällä kertaa DNA-tiedoston toisesta yksiköstä eli siitä, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "e"; toisella kierroksella tämä toinen yksikkö saakin arvon "b", ja kolmas yksikkö, joka ensimmäisellä kierroksella sai arvon "r", saa toisella kierroksella arvon "e". Näinkö se toimii?

Koska DNA-yksikköjä on enemmän kuin kirjaimia, olisi kai mahdollista, että yhdellä kirjaimella on useampia DNA-vastineita. Onko tämä otettu huomioon?

Lue lisää

Kyllä toimii juuri noin. Otetaan esimerkki. Tässä on yksi rivi ihmisen DNA:ta:
GGT CTC GAG GAA AGG AAG GGG CAA GGT GTT TAA AAA TCA GGA ATC CTG GTT TGG AAA TTC
Ja teksti jota etsimme, on Raamatun ensimmäinen jae, translitteroituna hepreasta:
BRAEYI BRA ALHYO AI HEMYO VAT HARW

Algoritmi lukee ensimmäisen kodinin, GGT ja antaa sille arvon B. CTC saa arvon R, GAG on A, GAA on E, AGG on Y, AAG on I, GGG on B, CAA on R, GGT löytyy jo taulukosta ja sen arvo B joka ei vastaa seuraava kirjainta joka olisi A, joten tuo pätkä ei koodaa Raamatun ensimmäistä jaetta.

Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni, aivan kuten DNA:ssa useampi koodoni koodaa useampaa aminohappoa.

Kristitty.net kirjoitti:

Kyllä toimii juuri noin. Otetaan esimerkki. Tässä on yksi rivi ihmisen DNA:ta:
GGT CTC GAG GAA AGG AAG GGG CAA GGT GTT TAA AAA TCA GGA ATC CTG GTT TGG AAA TTC
Ja teksti jota etsimme, on Raamatun ensimmäinen jae, translitteroituna hepreasta:
BRAEYI BRA ALHYO AI HEMYO VAT HARW

Algoritmi lukee ensimmäisen kodinin, GGT ja antaa sille arvon B. CTC saa arvon R, GAG on A, GAA on E, AGG on Y, AAG on I, GGG on B, CAA on R, GGT löytyy jo taulukosta ja sen arvo B joka ei vastaa seuraava kirjainta joka olisi A, joten tuo pätkä ei koodaa Raamatun ensimmäistä jaetta.

Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni, aivan kuten DNA:ssa useampi koodoni koodaa useampaa aminohappoa.

Lue lisää

Ja tuon pätkän jälkeen algoritmi siirtyy yhden emäsparin eteen päin, niin että seuraava koodoni on GTC ja niin edelleen, läpi koko ihmisen DNA:n.

dikduk kirjoitti:

Hepreaa kirjoitetaan vain konsonantein, vokalisaatio ei aina ole edes selvä, heprea myös kehittyi ja muuttui sinä aikana kun heprealaiseen Raamattuun päätyneitä tekstejä kirjoitettiin. Sen koko kirjaimistokin vaihtui, tuli lainasanoja ja uusia ilmauksia itse hepreaan ja tiedämme että nykytekstit eroavat jo esim Qumranin teksteistä ja myös tiedetään että on ollut siitäkin poikkeavia tekstiversioita - joten mikä versio koodataan? Entä niistä tarinoista joista on kaksi tai kolme eri versiota Raamatussa?

Lue lisää

Ja minun algoritmini etsii pelkästään heprean konsonantteja. Koska olen aloittelija en saanut heprean aakkosia toimimaan oikein, joten translitteroin heprean aakkoset latinalaiseen aakostoon.

Kristitty.net kirjoitti:

Ja minun algoritmini etsii pelkästään heprean konsonantteja. Koska olen aloittelija en saanut heprean aakkosia toimimaan oikein, joten translitteroin heprean aakkoset latinalaiseen aakostoon.

Lue lisää

Siiten kun edistyt koodamisessa, minkä version kustakin tekstistä koodaat?

dikduk kirjoitti:

Siiten kun edistyt koodamisessa, minkä version kustakin tekstistä koodaat?

Miten niin minkä version? On vain yksi alkukieli. Ensimmäisissä viidessa jakeessa ei ole ainuttakaan varianttia. kuten käy ilmi kriittisestä laitoksesta, kaikki käsikirjoitukset ovat identtisiä. Jos tutkin Raamattua pidemmälle, varmaankin käytän masoreettista tekstiä.

Kristitty.net kirjoitti:

Ja tuon pätkän jälkeen algoritmi siirtyy yhden emäsparin eteen päin, niin että seuraava koodoni on GTC ja niin edelleen, läpi koko ihmisen DNA:n.

Oletko ottanut mitenkään huomioon ihmisen genomiin ilmaantuvia mutaatioita, vai oletatko, että nämä pätkät olisivat niin konservoituneita, etteivät ne sisältäisi mutaatioita? Lisäksi, olettaisitko, että koko Raamattu olisi koodattuna genomiin, vai ainoastaan osa? Kolmanneksi piti jo aiemmin kysyä, että mistä kohtaa genomia olet aloittanut hakemisen ja mihin suuntaan?

Kristitty.net kirjoitti:

Miten niin minkä version? On vain yksi alkukieli. Ensimmäisissä viidessa jakeessa ei ole ainuttakaan varianttia. kuten käy ilmi kriittisestä laitoksesta, kaikki käsikirjoitukset ovat identtisiä. Jos tutkin Raamattua pidemmälle, varmaankin käytän masoreettista tekstiä.

Lue lisää

On kaksi alkukieltä, toinen on aramea ja joudut kuitenkin jos koodaat koko Raamatun päättämään mikä niistä tekstivariaatiosta joita raamatussa on, on se oikea koska ne poikkeavat toisistaan. Masoreettinen teksti ei ole alkuperäisin, jo Qumrankin poikkeaa siitä .

YksiBioinformaatikko kirjoitti:

Oletko ottanut mitenkään huomioon ihmisen genomiin ilmaantuvia mutaatioita, vai oletatko, että nämä pätkät olisivat niin konservoituneita, etteivät ne sisältäisi mutaatioita? Lisäksi, olettaisitko, että koko Raamattu olisi koodattuna genomiin, vai ainoastaan osa? Kolmanneksi piti jo aiemmin kysyä, että mistä kohtaa genomia olet aloittanut hakemisen ja mihin suuntaan?

Lue lisää

En ole ottanut huomioon mutaatioita. Jos Jumala on piilottanut Raamatun tekstin ihmisen DNA:han, olettaisin, että hän olisi tehnyt sen hyvin konservoituneisiin pätkiin. Olen aloittanut tiedostosta Homo_sapiens.GRCh38.dna.chromosome.1.fa täältä ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-92/fasta/homo_sapiens/dna/ Minulla ei ole hajuakaan mikä kohta tarkalleen se on ihmisen DNA:ssa, mutta nähdäkseni sillä ei ole mitään merkitystä.

Olen aloittanut lukemalla tiedostoa etuperin. Kun olen saanut koko genomin skannattua, toistan kokeen seuraavaksi takaperin.

Tietysti kaikkivaltias Jumala olisi voinut koodata koko Raamatun. Se olisi täydellisen varma keino todistaa, että DNA on Jumalan luoma ja että Raamattu on Jumalan sanaa. Kuitenkin tässä vaiheessa etsin ainoastaan viittä ensimmäistä Raamatun jaetta. Jos ne löytyvät DNA:sta, se todistaisi kiistatta, että ne eivät ole siellä sattumalta. Todennäköisyys Raaamatun viiden ensimmäisen jakeen ilmestyä sattumalta on 1 : 27^198, naurettavan tähtitieteellisen suuri luku, vertailun vuoksi universumissa on vain noin 10^80 atomia.

dikduk kirjoitti:

On kaksi alkukieltä, toinen on aramea ja joudut kuitenkin jos koodaat koko Raamatun päättämään mikä niistä tekstivariaatiosta joita raamatussa on, on se oikea koska ne poikkeavat toisistaan. Masoreettinen teksti ei ole alkuperäisin, jo Qumrankin poikkeaa siitä .

Lue lisää

Qumran ei poikkea ainoankaan kirjamen osalta ensimmäisen viiden jakeen kohdalla. Kun olen saanut ensimmäiset viisi jaetta etsittyä, murehdin vasta sitten siitä mitä käsikirjoitusta käytän. Toki Raamatusta on pätkiä myös arameaksi, mutta sillä ei ole mitään merkitystä, koska molemmat kielet käyttävät tismalleen samoja aakkosia.

Kristitty.net kirjoitti:

Kyllä toimii juuri noin. Otetaan esimerkki. Tässä on yksi rivi ihmisen DNA:ta:
GGT CTC GAG GAA AGG AAG GGG CAA GGT GTT TAA AAA TCA GGA ATC CTG GTT TGG AAA TTC
Ja teksti jota etsimme, on Raamatun ensimmäinen jae, translitteroituna hepreasta:
BRAEYI BRA ALHYO AI HEMYO VAT HARW

Algoritmi lukee ensimmäisen kodinin, GGT ja antaa sille arvon B. CTC saa arvon R, GAG on A, GAA on E, AGG on Y, AAG on I, GGG on B, CAA on R, GGT löytyy jo taulukosta ja sen arvo B joka ei vastaa seuraava kirjainta joka olisi A, joten tuo pätkä ei koodaa Raamatun ensimmäistä jaetta.

Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni, aivan kuten DNA:ssa useampi koodoni koodaa useampaa aminohappoa.

Lue lisää

"Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni"

Ohjelma siis tarpeen vaatiessa antaa kullekin kirjaimelle aina uuden DNA-vastineen, kunnes vapaana olevat DNA-yksiköt loppuvat? Bereshit-esimerkissä "e" saisi siten kaksi eri DNA-vastinetta ja ohjelma löytäisi kuin löytäisikin DNA-tiedostosta sanan bereshit jo ensi yrittämällä? Periaatteessa olisi siis mahdollista, että ohjelma antaa pelkästään e-kirjaimelle niin paljon eri DNA-vastineita, ettei DNA-yksikköjä jää tarpeeksi jäljelle muita kirjaimia varten (jos nimittäin etsittävä merkkipätkä sisältäisi aivan poikkeuksellisen paljon e-kirjainta, esim. "eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeem eeeeel eeeeeeeeeeeeeeeeeeeek eeeeeeeeet eö": merkkipätkässä on 60 e:tä ja 5 muuta kirjainta; on siten mahdollista, että viimeiselle, ö-kirjaimelle, ei enää ole tarjolla DNA-vastineita, koska erilaisia DNA-yksikköjä on kaiken kaikkiaan tarjolla 64)?

Entä jos DNA-tiedostossa olisi syystä tai toisesta "kirjoitusvirhe"? Oletetaan, että DNA-tiedoston neljäs yksikkö on virheellinen, niin että tiedostossa ei lue "bereshit bara elohim", vaan "berrshit bara elohim". Virheitäkin sisältävää tekstiä voitaisiin pitää Jumalan signeerauksena, mutta ohjelma ei tällaista kirjoitusvirheellistä signeerausta löytäisi. Lisäksi ensi kertaa virheen kohdatessaan ohjelma antaisi DNA-yksikölle väärän arvon.

Ohjelman pitäisi ehkä jättää tietty määrä virheitä huomiotta. Määrä riippuisi etsittävän tekstin pituudesta. Mikä tahansa teksti sietää kyllä aika paljonkin krjiotusvirhietä. Mutta virheiden pitää jakautua verrattain tasaisesti: ainakin jokaisen yksittäisen virkkeen pitää olla ymmärrettävissä. Toisaalta jos DNA-tiedostosta pystyisi lukemaan koko Genesiksen lukuun ottamatta vaikkapa lukua 22, joka olisi jostain syystä kauttaaltaan niin virheellinen, ettei siitä saisi mitään tolkkua, voitaisiin tämä massiivinen virhekasaumakin painaa villaisella, jos kaikki muut luvut olisivat ymmärrettävissä. Ohjelman pitäisi siis pystyä ohittamaan myös tällaiset virheet.

On kuitenkin aika vaikea määritellä, kuinka paljon ja millaisia virheitä sallitaan. Missä menee se raja, jonka tuolla puolen jokin teksti lakkaa olemasta ymmärrettävä? Mitään tarkkaa rajaa ei tietysti ole, koska paljon riippuu tulkitsijasta. Minä esimerkiksi pystyn lukemaan ja ymmärtämään helposti varsin turmeltunuttakin suomea, koska osaan suomea erinomaisesti. Mutta esimerkiksi kreikkaa osaan niin huonosti, että jo muutama virhe lyhyessä kreikankielisessä tekstissä voi riittää siihen, etten saa kyseisestä tekstinpätkästä mitään tolkkua. Mutta jos kreikankielinen teksti onkin minulle entuudestaan tuttu, kuten esimerkiksi monet UT:n tekstit ovat, tekstissä olevat virheet eivät estä minua ymmärtämästä sitä. Vaikka teksti olisi pahoinkin turmeltunut, pystyn "ymmärtämään" sen, koska tiedän, mitä siinä pitäisi lukea. Samoin voisi olla mahdollista nähdä DNA-tiedostossa tekstiä, jota siinä "pitäisi olla", mutta ei todellisuudessa ole.

Kristitty.net kirjoitti:

En ole ottanut huomioon mutaatioita. Jos Jumala on piilottanut Raamatun tekstin ihmisen DNA:han, olettaisin, että hän olisi tehnyt sen hyvin konservoituneisiin pätkiin. Olen aloittanut tiedostosta Homo_sapiens.GRCh38.dna.chromosome.1.fa täältä ftp://ftp.ensembl.org/pub/release-92/fasta/homo_sapiens/dna/ Minulla ei ole hajuakaan mikä kohta tarkalleen se on ihmisen DNA:ssa, mutta nähdäkseni sillä ei ole mitään merkitystä.

Olen aloittanut lukemalla tiedostoa etuperin. Kun olen saanut koko genomin skannattua, toistan kokeen seuraavaksi takaperin.

Tietysti kaikkivaltias Jumala olisi voinut koodata koko Raamatun. Se olisi täydellisen varma keino todistaa, että DNA on Jumalan luoma ja että Raamattu on Jumalan sanaa. Kuitenkin tässä vaiheessa etsin ainoastaan viittä ensimmäistä Raamatun jaetta. Jos ne löytyvät DNA:sta, se todistaisi kiistatta, että ne eivät ole siellä sattumalta. Todennäköisyys Raaamatun viiden ensimmäisen jakeen ilmestyä sattumalta on 1 : 27^198, naurettavan tähtitieteellisen suuri luku, vertailun vuoksi universumissa on vain noin 10^80 atomia.

Lue lisää

Tuo on kromosomi, joka on numeroitu 1:ksi. Jokainen kromosomi on oma yksikkönsä, joten ei käytännössä voida sanoa tuon olevan missään tietyssä kohtaan genomia.

Pikaisesti vilkaisin päivitettyjä tuloksiasi, ja toistaiseksi näyttää siltä, ettei Raamatun tekstiä olisi löytynyt ainakaan tilastollisesti merkitsevästi enemmän kuin muitakaan käyttämiäsi tekstejä. (Tämä perustuu vain pikaiseen tarkasteluun, ei tilastoanalyysiin löydetyistä perättäisistä merkeistä suhteutettuna luettuun nukleotidimäärään)

herrens_tiggare kirjoitti:

"Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni"

Ohjelma siis tarpeen vaatiessa antaa kullekin kirjaimelle aina uuden DNA-vastineen, kunnes vapaana olevat DNA-yksiköt loppuvat? Bereshit-esimerkissä "e" saisi siten kaksi eri DNA-vastinetta ja ohjelma löytäisi kuin löytäisikin DNA-tiedostosta sanan bereshit jo ensi yrittämällä? Periaatteessa olisi siis mahdollista, että ohjelma antaa pelkästään e-kirjaimelle niin paljon eri DNA-vastineita, ettei DNA-yksikköjä jää tarpeeksi jäljelle muita kirjaimia varten (jos nimittäin etsittävä merkkipätkä sisältäisi aivan poikkeuksellisen paljon e-kirjainta, esim. "eeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeeem eeeeel eeeeeeeeeeeeeeeeeeeek eeeeeeeeet eö": merkkipätkässä on 60 e:tä ja 5 muuta kirjainta; on siten mahdollista, että viimeiselle, ö-kirjaimelle, ei enää ole tarjolla DNA-vastineita, koska erilaisia DNA-yksikköjä on kaiken kaikkiaan tarjolla 64)?

Entä jos DNA-tiedostossa olisi syystä tai toisesta "kirjoitusvirhe"? Oletetaan, että DNA-tiedoston neljäs yksikkö on virheellinen, niin että tiedostossa ei lue "bereshit bara elohim", vaan "berrshit bara elohim". Virheitäkin sisältävää tekstiä voitaisiin pitää Jumalan signeerauksena, mutta ohjelma ei tällaista kirjoitusvirheellistä signeerausta löytäisi. Lisäksi ensi kertaa virheen kohdatessaan ohjelma antaisi DNA-yksikölle väärän arvon.

Ohjelman pitäisi ehkä jättää tietty määrä virheitä huomiotta. Määrä riippuisi etsittävän tekstin pituudesta. Mikä tahansa teksti sietää kyllä aika paljonkin krjiotusvirhietä. Mutta virheiden pitää jakautua verrattain tasaisesti: ainakin jokaisen yksittäisen virkkeen pitää olla ymmärrettävissä. Toisaalta jos DNA-tiedostosta pystyisi lukemaan koko Genesiksen lukuun ottamatta vaikkapa lukua 22, joka olisi jostain syystä kauttaaltaan niin virheellinen, ettei siitä saisi mitään tolkkua, voitaisiin tämä massiivinen virhekasaumakin painaa villaisella, jos kaikki muut luvut olisivat ymmärrettävissä. Ohjelman pitäisi siis pystyä ohittamaan myös tällaiset virheet.

On kuitenkin aika vaikea määritellä, kuinka paljon ja millaisia virheitä sallitaan. Missä menee se raja, jonka tuolla puolen jokin teksti lakkaa olemasta ymmärrettävä? Mitään tarkkaa rajaa ei tietysti ole, koska paljon riippuu tulkitsijasta. Minä esimerkiksi pystyn lukemaan ja ymmärtämään helposti varsin turmeltunuttakin suomea, koska osaan suomea erinomaisesti. Mutta esimerkiksi kreikkaa osaan niin huonosti, että jo muutama virhe lyhyessä kreikankielisessä tekstissä voi riittää siihen, etten saa kyseisestä tekstinpätkästä mitään tolkkua. Mutta jos kreikankielinen teksti onkin minulle entuudestaan tuttu, kuten esimerkiksi monet UT:n tekstit ovat, tekstissä olevat virheet eivät estä minua ymmärtämästä sitä. Vaikka teksti olisi pahoinkin turmeltunut, pystyn "ymmärtämään" sen, koska tiedän, mitä siinä pitäisi lukea. Samoin voisi olla mahdollista nähdä DNA-tiedostossa tekstiä, jota siinä "pitäisi olla", mutta ei todellisuudessa ole.

Lue lisää

Olet ymmärtänyt algoritmini toiminnan oikein. Jos sille antaa etsittäväksi merkkijonon "AAAAAAAA..." se väittää aina löytäneensä tismalleen yhtä pitkän pätkän, tämä siksi että jokainen 64:stä kodonista koodaisi kirjaimen "A".

Suurin puute ohjelmassani on juurikin se, että se ei salli yhtään virheitä. Virheitä sallivan algoritmin koodaaminen olisi haastavaa, mutta ei mahdotonta. Olen kuitenkin aloittelija enkä tässä vaiheessa aio paneutua siihen. Kuitenkin jos ensimmäiset viisi jaetta löytyvät virheettömästi, se olisi jo täysin varma merkki siitä, että nuo jakeet on Raamattuun koodattu, eikä se voisi olla siellä sattumalta.

Ohjelmani myös poistaa kaikki välilyönnit ja muut merkit. Olen olettanut täysin mielivaltaisesti, että Jumala ei olisi koodannut välilyöntejä tai muita merkkejä. Tämä on oletus joka ei perustu yhtään mihinkään. Kolmen emäsparin kodoneilla mahdollisia merkkejä on 64, joten sinne sopisivat aivan hyvin myös pistee, välilyönnit ja muut merkit. Kunhan olen saanut koko genomin skannattua etsin seuraavaksi myös välimerkkien kera ja sitten koko genomi takaperin. Raksutettavaa siis riittää minun vanhalla tietokoneellani. Onhan tämä hullua, mutta ihmisellä täytyy olla harrastuksia.

Olen myös olettanut, että Jumala olisi käyttänyt samaa koodausta kuin proteiini synteesissä, eli että kolmen emäsparin koodonit koodaavat merkkejä. Yhtä hyvin Jumala olisi saattanut käyttää binäärikoodausta, niin että A ja T ovat 0, C ja G ovat 1 tai toisin päin. Tätäkin voisi pohtia ja tutkia.

YksiBioinformaatikko kirjoitti:

Tuo on kromosomi, joka on numeroitu 1:ksi. Jokainen kromosomi on oma yksikkönsä, joten ei käytännössä voida sanoa tuon olevan missään tietyssä kohtaan genomia.

Pikaisesti vilkaisin päivitettyjä tuloksiasi, ja toistaiseksi näyttää siltä, ettei Raamatun tekstiä olisi löytynyt ainakaan tilastollisesti merkitsevästi enemmän kuin muitakaan käyttämiäsi tekstejä. (Tämä perustuu vain pikaiseen tarkasteluun, ei tilastoanalyysiin löydetyistä perättäisistä merkeistä suhteutettuna luettuun nukleotidimäärään)

Lue lisää

Toistaiseksi Raamatun ensimmäisestä jakeesta on löytynyt 45 merkkiä ja vertailuaineistosta Lorem ipsum johtaa 42 merkillä. Raamatusta on toki löytynyt pidempi pätkä, mutta ei tilastollisesti mitenkään merkittävästi pidempi, joten mitään aihetta hurraamiseen ei vielä ole. Raamattua olen skannannut tähän mennessä 1.2 biljoonaa emäsparia mutta vertailuaineistoja vain yhden tiedoston verran eli noin 250 miljoonaa emäsparia.

Kristitty.net kirjoitti:

Olet ymmärtänyt algoritmini toiminnan oikein. Jos sille antaa etsittäväksi merkkijonon "AAAAAAAA..." se väittää aina löytäneensä tismalleen yhtä pitkän pätkän, tämä siksi että jokainen 64:stä kodonista koodaisi kirjaimen "A".

Suurin puute ohjelmassani on juurikin se, että se ei salli yhtään virheitä. Virheitä sallivan algoritmin koodaaminen olisi haastavaa, mutta ei mahdotonta. Olen kuitenkin aloittelija enkä tässä vaiheessa aio paneutua siihen. Kuitenkin jos ensimmäiset viisi jaetta löytyvät virheettömästi, se olisi jo täysin varma merkki siitä, että nuo jakeet on Raamattuun koodattu, eikä se voisi olla siellä sattumalta.

Ohjelmani myös poistaa kaikki välilyönnit ja muut merkit. Olen olettanut täysin mielivaltaisesti, että Jumala ei olisi koodannut välilyöntejä tai muita merkkejä. Tämä on oletus joka ei perustu yhtään mihinkään. Kolmen emäsparin kodoneilla mahdollisia merkkejä on 64, joten sinne sopisivat aivan hyvin myös pistee, välilyönnit ja muut merkit. Kunhan olen saanut koko genomin skannattua etsin seuraavaksi myös välimerkkien kera ja sitten koko genomi takaperin. Raksutettavaa siis riittää minun vanhalla tietokoneellani. Onhan tämä hullua, mutta ihmisellä täytyy olla harrastuksia.

Olen myös olettanut, että Jumala olisi käyttänyt samaa koodausta kuin proteiini synteesissä, eli että kolmen emäsparin koodonit koodaavat merkkejä. Yhtä hyvin Jumala olisi saattanut käyttää binäärikoodausta, niin että A ja T ovat 0, C ja G ovat 1 tai toisin päin. Tätäkin voisi pohtia ja tutkia.

Lue lisää

Jos oletettaisiin, että Jumala olisi käyttänyt triplettejä koodaukseen, eikö tällöin olisi oletettavampaa, että mikäli Raamattu löytyisi perimästä, se löytyisi aminohapposekvenssistä? Tämä olisi yksiselitteisempi. Ongelmaksi tosin tällöin muodostuu se, että geneettinen koodi koodaa vain 20 aminohappoa, joskin tämä ongelma on vain tapauksissa, joissa kieli sisältää useamman kuin 20 merkkiä.

Kristitty.net kirjoitti:

Toistaiseksi Raamatun ensimmäisestä jakeesta on löytynyt 45 merkkiä ja vertailuaineistosta Lorem ipsum johtaa 42 merkillä. Raamatusta on toki löytynyt pidempi pätkä, mutta ei tilastollisesti mitenkään merkittävästi pidempi, joten mitään aihetta hurraamiseen ei vielä ole. Raamattua olen skannannut tähän mennessä 1.2 biljoonaa emäsparia mutta vertailuaineistoja vain yhden tiedoston verran eli noin 250 miljoonaa emäsparia.

Lue lisää

Mutta näissä on otettava huomioon myös skannatun sekvenssin koko, joka Raamatussa näytti olevan toistaiseksi ~10-kertainen. Lopullisen suhdeluvun saa vasta, kun kaikki nukleotidit on luettu kaikkien tekstien osalta.

Tämä seuraava on taas vain pilkun viilausta, mutta suomenkielen biljoona on englanniksi trillion, ja billion on miljardi, eli suomenkielessä tulee 1000-kertainen virhe tuossa.

YksiBioinformaatikko kirjoitti:

Mutta näissä on otettava huomioon myös skannatun sekvenssin koko, joka Raamatussa näytti olevan toistaiseksi ~10-kertainen. Lopullisen suhdeluvun saa vasta, kun kaikki nukleotidit on luettu kaikkien tekstien osalta.

Tämä seuraava on taas vain pilkun viilausta, mutta suomenkielen biljoona on englanniksi trillion, ja billion on miljardi, eli suomenkielessä tulee 1000-kertainen virhe tuossa.

Lue lisää

Jos Jumala on käyttänyt triplettejä, sillä ei ole minun nähdäkseni ole mitään väliä, mitä nuo tripletit tekevät DNA:ssa, koodaavatko ne proteiineja vai ei. Raamatun voisi piilottaa mihin tahansa DNA:ssa.

Eli siis nettisivuillani on oikein, ihmisen perimässä on 3,000,000,000 eli siis englanniksi billion emäsparia. Eli siis suomeksi kuuluu sanoa, että ihmisen perimässä on 3 miljardia emäsparia.

Kristitty.net kirjoitti:

Jos Jumala on käyttänyt triplettejä, sillä ei ole minun nähdäkseni ole mitään väliä, mitä nuo tripletit tekevät DNA:ssa, koodaavatko ne proteiineja vai ei. Raamatun voisi piilottaa mihin tahansa DNA:ssa.

Eli siis nettisivuillani on oikein, ihmisen perimässä on 3,000,000,000 eli siis englanniksi billion emäsparia. Eli siis suomeksi kuuluu sanoa, että ihmisen perimässä on 3 miljardia emäsparia.

Lue lisää

Sinänsä ei olisi mitään väliä, tästä olen samaa mieltä. Mutta olisi johdonmukaisempaa, ja ehkä vakuuttavampaakin, jos samat tripletit, jotka koodaavat tiettyjä aminohappoja, koodaisivat samaan tapaan aina tiettyä kirjainta. En ole vielä katsonut tarkemmin, että miten skriptisi on määritellyt kirjaimet tripletteihin, ja verrannut niitä aminohappoja koodaaviin tripletteihin. Johdonmukaista olisi, jos tripletti TAC, joka koodaa metioniinia ja toimii transkription aloituskohtana, koodaisi myös aakkosten ensimmäistä kirjainta. Blogisi perusteella TAC:lle ei ole löytynyt toistaiseksi mitään kirjainta.

Nettisivullasi oli oikein, sillä tämä oli kirjoitettu englanniksi, virhe tuli vain tuossa edellisessä viestissä. Kuten sanoin, tämä oli vain pilkunviilausta ja virhekäännösten oikomista, jos muualle kirjoitat suomeksi asiasta. Minulla ei ollut mitään vaikeuksia ymmärtää, että mitä tässä tarkoitettiin.

YksiBioinformaatikko kirjoitti:

Sinänsä ei olisi mitään väliä, tästä olen samaa mieltä. Mutta olisi johdonmukaisempaa, ja ehkä vakuuttavampaakin, jos samat tripletit, jotka koodaavat tiettyjä aminohappoja, koodaisivat samaan tapaan aina tiettyä kirjainta. En ole vielä katsonut tarkemmin, että miten skriptisi on määritellyt kirjaimet tripletteihin, ja verrannut niitä aminohappoja koodaaviin tripletteihin. Johdonmukaista olisi, jos tripletti TAC, joka koodaa metioniinia ja toimii transkription aloituskohtana, koodaisi myös aakkosten ensimmäistä kirjainta. Blogisi perusteella TAC:lle ei ole löytynyt toistaiseksi mitään kirjainta.

Nettisivullasi oli oikein, sillä tämä oli kirjoitettu englanniksi, virhe tuli vain tuossa edellisessä viestissä. Kuten sanoin, tämä oli vain pilkunviilausta ja virhekäännösten oikomista, jos muualle kirjoitat suomeksi asiasta. Minulla ei ollut mitään vaikeuksia ymmärtää, että mitä tässä tarkoitettiin.

Lue lisää

Siis tuo algoritmihan aina aloittaessaa uuden kierroksen tyhjentää tuon koodoni taulukon ja aloittaa uudestaan määrittelemään mikä koodoni koodaa mitäkin kirjainta. Idea minulle tähän projektiin tuli siitä havainnosta, että hepreassa on 22 kirjainta ja tuossa koodoni taulukossa on 20 aminohappoa ja aloitus sekä lopetus koodonit, yhteensä 22. https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table Mutta todellisuudessa hepreassa on 22 konsonantin lisäksi 5 sofit muotoa kirjaimista, kun kirjain on sanan lopussa. Eli siis aivan yksi yhteen koodaus ei olisi mahdollinen. Tietysti voisin etsiä tekstiä yksinkertaisemmassa muodossa, että haen vain noita 22 heprean aakkosta. Jos ne vastaisivat koodonin taulukon aminohappoja, se olisi metka "yhteensattuma". Mutta tämä on melkoista arvailua, että miten Jumala olisi Raamatun DNA:han koodannut. Hän on voinut tehdä sen monella eri tavalla.

Kristitty.net kirjoitti:

Siis tuo algoritmihan aina aloittaessaa uuden kierroksen tyhjentää tuon koodoni taulukon ja aloittaa uudestaan määrittelemään mikä koodoni koodaa mitäkin kirjainta. Idea minulle tähän projektiin tuli siitä havainnosta, että hepreassa on 22 kirjainta ja tuossa koodoni taulukossa on 20 aminohappoa ja aloitus sekä lopetus koodonit, yhteensä 22. https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table Mutta todellisuudessa hepreassa on 22 konsonantin lisäksi 5 sofit muotoa kirjaimista, kun kirjain on sanan lopussa. Eli siis aivan yksi yhteen koodaus ei olisi mahdollinen. Tietysti voisin etsiä tekstiä yksinkertaisemmassa muodossa, että haen vain noita 22 heprean aakkosta. Jos ne vastaisivat koodonin taulukon aminohappoja, se olisi metka "yhteensattuma". Mutta tämä on melkoista arvailua, että miten Jumala olisi Raamatun DNA:han koodannut. Hän on voinut tehdä sen monella eri tavalla.

Lue lisää

Tuo nollaaminen tuskin aiheuttaa mitään häiriötä, joskin se todennäköisesti tekee jo löydetyistä pätkistä siansaksaa uudella kierroksella löydetyillä kirjaimilla. Ehkä taustalle voisi rakentaa jonkinlaisen algoritmin, joka ei olisi aivan yhtä bruteforce, vaan käyttäisi jonkinlaista sumeaa logiikkaa tai äänestyskäyttäytymistä, jossa algoritmi tarkistelee todennäköisyyttä, että oikea kirjain olisi valittu. Nythän, jos olen oikein ymmärtänyt, tripletti on lukittu, kun se ensimmäisen kerran löytyy (ennen nollaamista). Tämä ehdotus todennäköisesti moninkertaistaisi ohjelman monimutkaisuuden, ja vaatisi ehkä enemmän kuin vain harrastelijan tekemään tämän.

Kodoni-taulukossa on itseasiassa vain 21 vaihtoehtoa, mukaanlukien aloitus- ja lopetuskodonit, sillä aloituskodoni ja metioniini ovat yksi ja sama.

Kristitty.net kirjoitti:

Siis tuo algoritmihan aina aloittaessaa uuden kierroksen tyhjentää tuon koodoni taulukon ja aloittaa uudestaan määrittelemään mikä koodoni koodaa mitäkin kirjainta. Idea minulle tähän projektiin tuli siitä havainnosta, että hepreassa on 22 kirjainta ja tuossa koodoni taulukossa on 20 aminohappoa ja aloitus sekä lopetus koodonit, yhteensä 22. https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_codon_table Mutta todellisuudessa hepreassa on 22 konsonantin lisäksi 5 sofit muotoa kirjaimista, kun kirjain on sanan lopussa. Eli siis aivan yksi yhteen koodaus ei olisi mahdollinen. Tietysti voisin etsiä tekstiä yksinkertaisemmassa muodossa, että haen vain noita 22 heprean aakkosta. Jos ne vastaisivat koodonin taulukon aminohappoja, se olisi metka "yhteensattuma". Mutta tämä on melkoista arvailua, että miten Jumala olisi Raamatun DNA:han koodannut. Hän on voinut tehdä sen monella eri tavalla.

Lue lisää

Lisätääs tämä vielä tuohon edelliseen.

"Hän on voinut tehdä sen monella eri tavalla."

Tämä olisi toki mahdollisuus, mutta olisiko tämä oletettavaa, jos tämä haluaisi koodaamalla Raamatun DNA:n osoittaa olevansa olemassa. Johdonmukaisuus tällaisessa olisi oletettavampaa kuin satunnaisuus. Jos Jumala olisi kaikkivoipa, ei tämä tapa olisi ongelma eikä mikään.

Kristitty.net kirjoitti:

Kyllä toimii juuri noin. Otetaan esimerkki. Tässä on yksi rivi ihmisen DNA:ta:
GGT CTC GAG GAA AGG AAG GGG CAA GGT GTT TAA AAA TCA GGA ATC CTG GTT TGG AAA TTC
Ja teksti jota etsimme, on Raamatun ensimmäinen jae, translitteroituna hepreasta:
BRAEYI BRA ALHYO AI HEMYO VAT HARW

Algoritmi lukee ensimmäisen kodinin, GGT ja antaa sille arvon B. CTC saa arvon R, GAG on A, GAA on E, AGG on Y, AAG on I, GGG on B, CAA on R, GGT löytyy jo taulukosta ja sen arvo B joka ei vastaa seuraava kirjainta joka olisi A, joten tuo pätkä ei koodaa Raamatun ensimmäistä jaetta.

Tietysti tämä ottaa huomioon, että koodoneita on 64 ja heprean aakkosia sofit muodot mukaan lukien 27. Joten samaa kirjainta voi koodata useampi koodoni, aivan kuten DNA:ssa useampi koodoni koodaa useampaa aminohappoa.

Lue lisää

Ei sofit muoto ole erillinen kirjain, vaan joissakin kirjaimissa sen kirjoitusmuoto muuttuu jos kirjain on sanan lopussa, eikä sofitia edes ollut paleohepreassa, eli vanhimmassa kirjoituksessa.

dikduk kirjoitti:

Ei sofit muoto ole erillinen kirjain, vaan joissakin kirjaimissa sen kirjoitusmuoto muuttuu jos kirjain on sanan lopussa, eikä sofitia edes ollut paleohepreassa, eli vanhimmassa kirjoituksessa.

Lue lisää

Koska sofit muotoja ei ollut paleohepreassa, haen nyt tuota Raamattua DNA:sta vain 22 heprean aakkosella.

YksiBioinformaatikko kirjoitti:

Tuo nollaaminen tuskin aiheuttaa mitään häiriötä, joskin se todennäköisesti tekee jo löydetyistä pätkistä siansaksaa uudella kierroksella löydetyillä kirjaimilla. Ehkä taustalle voisi rakentaa jonkinlaisen algoritmin, joka ei olisi aivan yhtä bruteforce, vaan käyttäisi jonkinlaista sumeaa logiikkaa tai äänestyskäyttäytymistä, jossa algoritmi tarkistelee todennäköisyyttä, että oikea kirjain olisi valittu. Nythän, jos olen oikein ymmärtänyt, tripletti on lukittu, kun se ensimmäisen kerran löytyy (ennen nollaamista). Tämä ehdotus todennäköisesti moninkertaistaisi ohjelman monimutkaisuuden, ja vaatisi ehkä enemmän kuin vain harrastelijan tekemään tämän.

Kodoni-taulukossa on itseasiassa vain 21 vaihtoehtoa, mukaanlukien aloitus- ja lopetuskodonit, sillä aloituskodoni ja metioniini ovat yksi ja sama.

Lue lisää

>> Kodoni-taulukossa on itseasiassa vain 21 vaihtoehtoa, mukaanlukien aloitus- ja lopetuskodonit, sillä aloituskodoni ja metioniini ovat yksi ja sama. <<

Aivan oikein. Se siitä teoriasta, että heprean aakkosia on 22 ja aminohappoja 22. Ei ihan täsmää. Mutta silti, etsin nyt heprean 22 aakkosella noita jakeita Raamatusta, koska paleohepreassa ei sofit muotoja ollut.

Tietysti heprealla, kielellä jolla hän loi maailman ja kirjoitti Vanhan testamentin. Jotkut sanovat, että heprea on pyhä kieli.

Kristitty.net kirjoitti:

Tietysti heprealla, kielellä jolla hän loi maailman ja kirjoitti Vanhan testamentin. Jotkut sanovat, että heprea on pyhä kieli.

Millä perustelella ajattelet että jos on kaikkivaltias luoja niin hän on käyttänyt jotain tulevan yhden ihmislajin tiettyä tulevaa kieltä maailmaa luodessaan?

dikduk kirjoitti:

Millä perustelella ajattelet että jos on kaikkivaltias luoja niin hän on käyttänyt jotain tulevan yhden ihmislajin tiettyä tulevaa kieltä maailmaa luodessaan?

Jotkut sanovat, että heprea on pyhä kieli ja että Jumala on luonut maailman heprean kielellä. Siksi oletukseni on, että jos Jumala on koodannut Raamatun DNA:han, hän olisi tehnyt sen Raamatun alkukielellä hepreaksi, eikä jollain myöhemmällä käännöksellä. Mutta toki skriptilläni voi etsiä mitä tahansa muutakin kieltä.

Kun osaat PERLillä merkkijonoja käsitellä ja varmaan muutakin käytä se taito johonkin hyödylliseen.

a-teisti kirjoitti:

Kun osaat PERLillä merkkijonoja käsitellä ja varmaan muutakin käytä se taito johonkin hyödylliseen.

Voi kiitos kauniista palautteesta. Eiköhän se ole oma asiani, mihin aikani käytän. Mitä pahaa on uteliaisuudessa? Voit käyttää minun skriptiä ja testata onko Jallu koodattuna DNA:han.

Unohtui lainausmerkit. Jokainen voi itse kokeilla kirjoittamaani skriptiä, se ei löydä mitä tahansa tekstiä DNA:sta.