Esimerkki passiivisesta DNA:sta. Kampelatutkijan koulutusta.

Esim. ATP-entsyymin tuotantoon solu lukee ATP6V1B1-jaksoa, josta se valmistaa seitsemää erilaista silmukointivarianttia. Tiettyä silmukointivarianttia modifioimalla (vaihtoehtoinen silmukointi sekä RNA-editointi) se rakentaa valmiin mRNA:n, joka käännetään proteiiniksi. Kysymys kuuluu: Missä ovat valmistusohjeet tuon mRNA:n rakentamiseksi? Samaa DNA:ta kun käytetään useiden muidenkin RNA-molekyylien valmistamiseksi.

DNA on optimaalisesti järjesteltyä kielellistä informaatiota, jota lukemalla solu voi valmistaa pre-mRNA-molekyylin. Tätä modifioidaan monin eri tavoin ennen kuin valmis mRNA päästetään käännösprosessiin varsinaista proteiinia varten.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mistä kohdasta genomia transkriptio alkaa, niin jonkinlainen aloituskohta transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii aloituskohtana.

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, mihin transkriptio päättyy, niin jonkinlainen lopetusmarkkeri transkriptiolle on oltava. Kerro Kampelatutkija, mikä toimii lopetuskohtana. Mihin DNA:n lukeminen päättyy?

Jotta solun RNA-polymeraasi tietäisi, kuinka aktiivisesti ko. DNA-jaksoa luetaan, niin tällekin löytyy ohjaus. Mikä säätelee transkription vahvuutta eli aktiivisuutta.

Toisinaan transkriptiota tulee hillitä. Mitkä tekijät säätelevät tätä mekanismia?

https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Summary?g=ENSG00000116039;r=2:70935900-70965431

Vinkkejä, joilla pääset tiedonhaun alkuun:

transcription factor, promoter, enhancer, suppressor, methylation, CpG, epigenetic, microRNA

14

101

    Vastaukset 14

    Anonyymi (Kirjaudu / Rekisteröidy)
    5000
    • Tässä yksi esimerkki siitä, miten hermostoon liittyvät tapahtumat ohjaavat DNA:n lukemista transkriptioon. Kyse on siis aivotoiminnasta, muistista ja oppimisesta.

      https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5846851/

      Kerro Kampelatutkija, mikä on CH3, eli metyyliryhmä ja mitkä mekanismit ohjaavat niiden sitoutumista oikeille paikoilleen. Ja kuinka paljon CH3-ryhmien sijainti vaikuttaa proteiinituotantoon (transkription aloitus/lopetuskohtaan, vahvistukseen ja hillitsemiseen, vaihtoehtoiseen silmukointiin ja RNA-editointiin)?

    • Anonyymi

      Ja tämä todistaa sen että juuri sinun jumalasi olisi olemassa ja vielä luonut jotain miten?

      On se kumma ettei teissä kretuissa ole edes niin älykkäitä ihmisiä että osaisivat edes kirjoittaa oikeasta aiheesta oikealla palstalla... :(

    • Anonyymi

      Kampelatutkija voittanut jokaisen teidän debatin hölmö..

    • Geeni koostuu säätelyalueesta ja RNA:ta koodittavasta alueesta. Geenin luenta RNA:ksi tapahtuu RNA-polymeraasin toimesta. Alkaessaan geenin luennan RNA-polymeraasi sitoutuu koodittavan alueen eteen. Säätelyalue säätelee sitä, kuinka usein RNA-polymeraasi lukee geenin. Säätelyalueita sijaitsee lähellä RNA-synteesin aloituskohtaa (promoottori) tai etäämmällä RNA-synteesin aloituskohdasta (tehostajajaksot). Geeniä säätelevät DNA:han sitoutuvat säätelyproteiinit (mm. estäjäproteiini l. repressori, transkriptiotekijä). Osaa geeneistä luetaan kaikissa olosuhteissa (ylläpitogeenit), osaa vain tietyissä tilanteissa tai solutyypeissä. Bakteereille tyypillisiä rakenteita ovat geeniryhmät eli operonit, jossa useita geenejä on ryhmittynyt yhden säätelyalueen perään. Tumallisten organismien geenit muodostuvat paloista, eksoneista, joiden välissä on ei-koodittavia introneita. RNA-synteesin jälkeen intronit silmukoidaan pois ja eksonit yhdistetään. Tämä mahdollistaa vaihtoehtoisen silmukoinnin, eli yksi geeni voi tuottaa useita erilaisia proteiineja. Bakteereilla DNA ja ribosomit sijaitsevat solulimassa, joten proteiinisynteesi voi käynnistyä jo transkription aikana. Tumallisilla organismeilla lähetti-RNA:n transkriptio ja silmukointi tapahtuvat tumassa, minkä jälkeen lähetti-RNA kuljetetaan solulimaan proteiinisynteesiä varten.

      Tämä Helsingin yliopiston molekyylibiotieteiden koulutusohjelman pääsykoeen mallivastaus tarjoaa vastaukset kyselyvimmaasi. On aina mukava olla avuksi kun haluat kouluttautua molekyylibiologian alalla.

      https://www.helsinki.fi/sites/default/files/atoms/files/by_2015_molekyylibiotiede_valintakoe_mallivastaus_tehtava1.pdf

      • Anonyymi

        Pitäisikö hänelle vielä kertoa pääsykoeopiskelun aloitusta edeltävät perustiedot geenin aloitus- ja lopetuskohdista. Meuhkaa aloituksessa niistä kuin yksin olisi keksinyt tuonkin asian.


      • Kerro ensin, mikä on promoottori. En päästä sinua tentistä läpi, ennen kuin vastaat kysymyksiin oikein ja mekanismi tulee selvitetyksi kaikille lukijoille.


      • Anonyymi

        Onko tämä nyt ymmärrettävä näin?
        ROT, joka on opastanut oman väitteensä mukaan mikrobiologian tutkijoita oikeaan tulkintaan genomin toiminnasta, pitää molekyylibiologian koulutusohjelman pääsykoekysymyksiä vaikeina haasteina... ja samalla hän pitää itseään vähintäänkin huippututkijoiden veroisena ja ainakin osin parempana asiantuntijana.

        Siis pääsykoekysymyksiä...Haloo. Onko ROT:lla enää ketään kotona?


      • Kerro, mitä ovat transkriptiotekijät ja mitkä tekijät ja mekanismit vaikuttavat niiden sitoutumiseen transkription aloitus- ja lopetuskohtiin.


      • Anonyymi
        RaamattuOnTotuus kirjoitti:

        Kerro ensin, mikä on promoottori. En päästä sinua tentistä läpi, ennen kuin vastaat kysymyksiin oikein ja mekanismi tulee selvitetyksi kaikille lukijoille.

        Mistä tentistä? Sinä et pääsisi läpi edes pääsykokeista. Se on edellytys sille, että pääsisit ensimmäiseen tenttiisi.

        Promoottorin on DNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin sitoutumiskohta, josta RNA-synteesi yleensä alkaa


      • Joudut siis käyttämään jo melko iäkästä ja tiedoiltaan vanhentunutta yliopiston pääsykokeen mallivastausta, koska raukka et itse kykene kertomaan, miten transkriptiota säädellään. Olihan tämä toki arvattavissa.


      • Anonyymi kirjoitti:

        Mistä tentistä? Sinä et pääsisi läpi edes pääsykokeista. Se on edellytys sille, että pääsisit ensimmäiseen tenttiisi.

        Promoottorin on DNA:sta riippuvaisen RNA-polymeraasin sitoutumiskohta, josta RNA-synteesi yleensä alkaa

        Kerro, mikä on promoottori. Mistä se rakentuu ja koostuu? Voiko promoottorin rakenne ja paikka vauhtua?


      • Anonyymi
        RaamattuOnTotuus kirjoitti:

        Joudut siis käyttämään jo melko iäkästä ja tiedoiltaan vanhentunutta yliopiston pääsykokeen mallivastausta, koska raukka et itse kykene kertomaan, miten transkriptiota säädellään. Olihan tämä toki arvattavissa.

        Vastaus oli vain osoitus siitä, miten alkeellisella tasolla kysymyksesi ovat. Tuo tietotaso vaaditaan ennen kuin pääsee edes aloittamaan molekyylibiologian opintoja.
        Mutta ethän sinä raukka tajunnut satiiria. Siltu uskot kykeneväsi neuvomaan huipuututkijoita.

        Noloa ROT noloa.


    • Ei vaan tule oikeaa vastausta. Pitänee tehdä aiheesta uusi aloitus ja näyttää, miten pihalla Kampelatutkija on.

      • Anonyymi

        Olet ottanut nekkuusi joka ainoassa aloituksessa, mihin kampelantutkkija on vastannut.

        Ps.
        DNA sanelee fenotyypin rajat.
        Informaatio voi lisääntyä.
        Evoluution mekanimsi tunnetaan.
        Genomin rappeutuminen ei ole ollut primäärinen tekijä ainoassakaan sukupuutossa.
        Ihmissuku on yli 200 000 vuotta vanha.
        Nooan tulva on uskonnollinen satu.
        Puhuvia aaseja on vain kaatumaseurojen puhujalavoilla.


    Ketjusta on poistettu 0 sääntöjenvastaista viestiä.

    Luetuimmat keskustelut

    1. Ampuminen kylpylässä

      Onko vornasen timbe käynyt hiukan kylpemässä vai mikä tämä ampumatapaus on kylpylässä? Tuntuu aika villi meno olevan naa
      Naantali
      74
      1650
    2. Naantalin kylpylän ampujat

      Oli somppumatuja. Nyt mennään. Suomi on ruotsi.
      Maailman menoa
      20
      1124
    3. Kemijärvellä vesionnettomuus

      Pitkänsillan ja taiteilijanniemen välillä nähty henkilön painuvan veden alle. Mitä on tapahtunut? Onko vesihiisi taas as
      Kemijärvi
      32
      1063
    4. Hei, voitko kuunnella

      Voisitko auttaa minua selvittämään asioita? En halua ajaa sinua hulluuteen kanssani, en sitoa sinua, en esittää vaatimu
      Ikävä
      133
      871
    5. Joku porukka lähtenyt täältä

      Ihmeen hiljainen on palsta nyt. Yleensä tänne tulvii aloituksia yms, mutta nyt on kyllä erikoisen hiljaista.
      Ikävä
      189
      806
    6. Miten yrität

      Vielä saada kaivattusi?
      Ikävä
      64
      684
    7. Olipa yllätys

      Kuten hyvin moni tiesi/arvasi että valetta alusta loppuun toi *olemme ystäviä* satu. Instassaan käsi kädessä kuva kertoo
      Kotimaiset julkkisjuorut
      191
      607
    8. On todella ikävää

      Todella ikävää, että asiat ovat menneet tällaisiksi. Tämä ei ollut missään vaiheessa tarkoitukseni. Olen tehnyt virheit
      Ikävä
      79
      598
    9. Tuletko tänään

      Jos soitan? Niin... tuletko?🖤
      Ikävä
      48
      528
    10. 69
      510
    11. Ottanet yhteyttä

      Facebookissa,jos on jotain asiaa.Miehelle! T.M-nainen.
      Ikävä
      55
      507
    12. Se kun olit pitkästä aikaa silmieni edessä

      Oli kyllä sykähdyttävää. Tiedätkö, mikä laittaa minut ikävöimään sinua? Kun palautan mieleeni valtavan ihanan olemuksen,
      Ikävä
      32
      498
    13. Muutto auto hakee sut tänään!

      Tein sulle oman huoneen! mieheltä naiselle
      Ikävä
      57
      485
    14. Oletteko koskaan torjuneet kaivattuanne?

      Minä olen, kun en silloin tajunnut vielä ihastuneeni. Yritin paikata tapahtunutta, mutta ei onnistunut enää.
      Ikävä
      25
      457
    15. Kai sä mies ymmärrät..

      ..ettet jättänyt vaihtoahtoa. Tottakai toivon vielä, että pystyisit toimimaan niin että asiat korjaantuisivat. Vahvast
      Ikävä
      28
      422
    16. Jos kaivattusi olisi

      Vieressäsi niin mitä tekisit?
      Ikävä
      40
      417
    17. En tiedä mitä sanoa

      Siksi en vastannut😔
      Ikävä
      33
      413
    18. Kiinni jäit

      Ei olisi uskonut sinusta
      Ikävä
      16
      399
    19. Päivän galluppi

      Minkälainen ehkäisy sinkkupalstalaisilla käytössä?
      Sinkut
      82
      398
    20. En usko et enää

      Uskaltaisit irl mitään
      Ikävä
      37
      396
    Aihe