Pitkät ei-koodaavat RNA:t todistavat: Ihminen ja simpanssi eivät ole sukua

Pitkillä ei-koodaavilla RNA-molekyyleillä (lncRNA) on ratkaisevia tehtäviä useissa solun prosesseissa. Niillä on merkittävä rooli mm. epigeneettisessä uudelleenohjelmoinnissa, jonka solu tarvitsee kyetäkseen erilaistumaan ja toimimaan kudostyyppisessä tehtävässään. Jos haluamme verrata eliöiden mahdollisia sukulaisuussuhteita, eli mihin lajityyppiin eliö kuuluu, tulee meidän verrata näitä lncRNA-molekyylejä. Solu rakentaa niitä käyttämällä vaihtoehtoista silmukointia, eli DNA:sta ei löydy valmiita geenijaksoja näiden monimutkaisten RNA-molekyylien valmistukseen.

Ennen kuin vertaamme ihmisen ja simpanssin lncRNA-molekyylejä, on syytä osoittaa, millaisia tehtäviä tieteellinen tutkimus on löytänyt näille monimutkaisille RNA-molekyyleille:

1. Solujen erilaistumisen säätely

https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fgene.2020.00277/full

Excerpt: "Pluripotent stem cells have broad applications in regenerative medicine and offer ideal models for understanding the biological process of embryonic development and specific diseases. Studies suggest that the self-renewal and multi-lineage differentiation of stem cells are regulated by a complex network consisting of transcription factors, chromatin regulators, signaling factors, and non-coding RNAs. It is of great interest to identify RNA regulatory factors that determine the fate of stem cells. Long non-coding RNA (lncRNA), a class of non-coding RNAs with more than 200 bp in length, has been shown to act as essential epigenetic regulators of stem cell pluripotency and specific lineage commitment. In this review, we focus on recent research progress related to the function and epigenetic mechanisms of lncRNA in determining the fate of stem cells, particularly pluripotency maintenance and lineage-specific differentiation."

2. Kudostyypin säätely

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8143134/

Excerpt: "Long non-coding RNAs (lncRNAs) are a large class of gene transcripts that do not code proteins; however, their functions are largely unknown and many new lncRNAs are yet to be discovered. Taking advantage of our previously developed, super-fast, novel lncRNA discovery pipeline, UClncR, and rich resources of GTEx RNA-seq data, we performed systematic novel lincRNA discovery for over 8000 samples across 30 tissue types. We conducted novel detection for each major tissue type first and then consolidated the novel discoveries from all tissue types. These novel lincRNAs were profiled and analyzed along with known genes to identify tissue-specific genes in 30 major human tissue types. Thirteen sub-brain regions were also analyzed in a similar manner. Our analysis revealed thousands to tens of thousands of novel lincRNAs for each tissue type. These lincRNAs could define each tissue type’s identity and demonstrated their reliability and tissue-specific expression."

3. Elinten muodon ja koon säätely

https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589555920301117

Excerpt: "Long non-coding RNAs (lncRNAs) are important biological mediators that regulate numerous cellular processes. New experimental evidence suggests that lncRNAs play essential roles in liver development, and normal liver physiology"

4. Eliöiden ruumiinkaavan eli ns. body plan:in säätely:

https://academic.oup.com/mbe/article/32/9/2367/1030095

Excerpt: "A high diversity of transiently expressed lncRNAs also was present during the first 24 h of metamorphosis, when the larval body plan is being resculpted into the juvenile/adult body plan. Finally, the number of expressed lncRNAs increased at the establishment of the juvenile body plan and in the adult."

Ihmisessä on havaittu toimivan yli 172 000 ERILAISTA lncRNA-molekyyliä. (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5753287/)

Simpanssilla erilaisia lncRNA-molekyylejä on laskettu olevan vain n. 18 600. (https://academic.oup.com/nar/article/44/D1/D203/2503065?login=false)

Ihmisessä on siis yli YHDEKSÄN kertaa enemmän toiminnallisia lncRNA-molekyylejä kuin simpanssissa. Tutkimus myöntää, että lncRNA:t ovat heikosti konservoituneita, eli nuo simpanssin 18 600 lncRNA:ta ovat vieläpä hyvin erilaisia ihmisen lncRNA:iin verrattuna.

Tieteellinen tutkimus osoittaa siis selvästi, että emme ole evolutiivista sukua simpansseille. Diploideilla eliöillä kromosomifuusiot eivät johda lncRNA-transkriptien määrän kasvuun, joten voimme unohtaa evolutionistien väitteet kromosomifuusion aiheuttamasta evoluutiosta ihmisen ja simpanssin kantamuodon kohdalla.

https://sciencerefutesevolution.blogspot.com/2023/08/huge-differences-between-humanchimp.html