Combinatorics Of Words

Tuli tuollainenkin kurssi käytyä, ja olisi huvittavaa tietää missä määrin sillä on sovelluksia genetiikkaan ja evoluutioteoriaan DNA:n kirjoituksen rakenteen selvittämisessä.

Opetettiin mm. tunnistamaan mikä sanajoukko on koodi, eli missä sanojen yhdistelmät ovat yksikäsitteisesti palautettavissa joukon sanojen yhdistelmäksi.

Esimerkiksi X={a,ab,bab} ei ole koodi, koska vaikka (ab)(ab)=abab=(a)(bab), eli abab:lle kaksi eri esitystä.

Sensijaan X={a,ba,bb} on koodi, mikä näkyy luettaessa tutkittavaa sanaa alusta.
Jos seuraavaksi kirjaimeksi tulee a, niin a seuraava X:n sana, koska muista saataisiin b.
Jos taas seuraava kirjain on b ja sitten tulee a, niin ba on ainoa, joka antaa molempiin kohtiin oikein.
Oli helppo nähdä koodiksi X, sillä se oli prefix, eli mikään sen sana ei ollut toisen alku, mutta muunlaisia koodejakin on.

Professori Karhumäki sanoi, että ainakin tiettyjen genetiikan algoritmien tehokkaaksi todistaminen perustuu COW:n tuloksiin.

Osaako Mr K.A.T. tai TuttuMies sanoa mitään?
3200
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 3

Vanhimmat

Olen nähnyt juttua että joittenkin virusten koodi on tehokkaasti pakattua koska se koodi EI ole yksikäsitteistä vaan voidaan lukea päällekkäin monella tavalla. Jopa toiseen suuntaan (~palindromi).
Eli abab -> a(bab) ja (ab)(ab) ja näille kaikille neljälle RNA-ketjulle/proteiinille a,ab, bab on viruksella käyttöö..(joillain jopa 'ba' käy)
Tässä 'a' kuvaa isompaa proteiinia koodaava rimpsua..eli puhuin RNA/DNA/proteiinitasolla.
(Ehkä ylemmällä tasolla kuin sulla?)

Väittääkö COW että koodi {a,ab,bb} on tehokkaampi kuin ei-koodi {a,ba,bab} ? Ehkä tehokkuutta voi olla monenlaista..?

Äänestä
  • varsinaisesti juurikaan käsitelty näitä tehokkuuskysymyksiä.
    Ehkä koodausteoriassa sitten, mutta se tulee vasta ensi keväänä.

    Äänestä

Eipä oikein ällini riitä kommentoimaan mitään yksityiskohtaista.

Äänestä

Kommentoi aloitusta


Big Bang kirjoitti:

Tuli tuollainenkin kurssi käytyä, ja olisi huvittavaa tietää missä määrin sillä on sovelluksia genetiikkaan ja evoluutioteoriaan DNA:n kirjoituksen rakenteen selvittämisessä.

Opetettiin mm. tunnistamaan mikä sanajoukko on koodi, eli missä sanojen yhdistelmät ovat yksikäsitteisesti palautettavissa joukon sanojen yhdistelmäksi.

Esimerkiksi X={a,ab,bab} ei ole koodi, koska vaikka (ab)(ab)=abab=(a)(bab), eli abab:lle kaksi eri esitystä.

Sensijaan X={a,ba,bb} on koodi, mikä näkyy luettaessa tutkittavaa sanaa alusta.
Jos seuraavaksi kirjaimeksi tulee a, niin a seuraava X:n sana, koska muista saataisiin b.
Jos taas seuraava kirjain on b ja sitten tulee a, niin ba on ainoa, joka antaa molempiin kohtiin oikein.
Oli helppo nähdä koodiksi X, sillä se oli prefix, eli mikään sen sana ei ollut toisen alku, mutta muunlaisia koodejakin on.

Professori Karhumäki sanoi, että ainakin tiettyjen genetiikan algoritmien tehokkaaksi todistaminen perustuu COW:n tuloksiin.

Osaako Mr K.A.T. tai TuttuMies sanoa mitään?

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu