Vapaa kuvaus

Aloituksia

273

Kommenttia

2386

  1. Tällainen+Gish+Gallop+-keskustelustrategia+[1]+on+jokseenkin+epäreilua,+koska+ei+kenelläkään+riitä+aika+ja+mielenkiinto+paneutua+perusteellisesti+kymmeniin+väitteisiin+yhdellä+kertaa.+Se+on+tietenkin+strategian+tarkoituskin,+jotta+kirjoittaja+voi+patsastella+kuviteltu+sädekehä+päänsä+päällä,+ja+taputtaa+itseään+olalle,+kun+vastapuoli+”ei+kykene”+vastaamaan+esitettyihin+argumentteihin.[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Gish_gallopOn+jokseenkin+käsittämätöntä,+että+Mortonin+demoni+estää+sinua+ymmärtämästä+niitä+jo+esitettyjä+täysin+loogisia+ja+luonnollisia+syitä,+jotka+ovat+johtaneet+ihmisten+sukusolujen+mutaatiofrekvenssin+kasvamiseen+suuremmaksi,+kuin+millään+muulla+tutkitulla+lajilla.+Lievästi+haitallisia+mutaatioita+alkoi+kertyä+eri+populaatioiden+geeniperimään+jo+tuhansia+vuosia+sitten,+kun+kasvaneiden+maatalousyhteiskuntien+kehitys+johti+kaupunkikulttuurien+syntyyn+ja+väestönkasvuun.+Teollisen+vallankumouksen+alkaminen+1700-luvulla+nosti+elinajanodotetta+huomattavasti,+ja+samaan+aikaan+lapsikuolleisuus+laski+radikaalisti.+Teollistumista+ja+väestönräjähdystä+seurasi+kasvanut+altistuminen+ympäristön+mutageeneille.+Muita+vaikuttavia+tekijöitä+yhtälössä+ovat+esim.+kehittynyt+lääketiede,+perhekoot+ja+sosiaalipolitiikka+yhdistettynä+siihen,+että+lapsia+hankitaan+yhä+vanhempina,+mikä+lisää+mutaatioiden+määrää+sekä+isän+että+äidin+puolelta+[2,3].+Nämä+kaikki+tekijät+yhdessä+aiheuttavat+sen,+että+yhä+useampi+ihminen,+sekä+lapset+että+aikuiset,+perii+ja+altistuu+yhä+useammin+mutaatioita+aiheuttaville+tekijöille+samalla,+kun+luonnonvalinnan+merkitys+neutralisoituu,+vaikkakaan+ei+kokonaan+katoa.+Selvimmin+tämä+on+havaittavissa+kehittyneissä+länsimaissa+sekä+niissä+maissa,+joissa+sosioekonomiset+tekijät+ovat+muokanneet+yhteiskunnista+tässä+suhteessa+samankaltaisia,+muusta+kulttuurista+riippumatta.+Ääripään+muodostavat+sitten+Islannin+kaltaiset+yhteiskunnat,+jotka+ovat+syntyneet+suhteellisen+pienestä+populaatioista,+ja+edelleen+jälkeläisiä+hankitaan+kohtuullisen+läheisten+sukulaisten+kanssa+ilman+kovin+merkittävää+vaihtelua+Islannin+ulkopuolelta.[2]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3548427/[3]+https://www.nature.com/articles/ncomms10486Kaikesta+tästä+huolimatta+luonnonvalinta+pitää+vielä+pintansa,+koska+synergistisen+luonteen+omaava+negatiivinen+epistaasi+johtaa+siihen,+ettei+kuorma+pääse+populaatiotasolla+kasvamaan+liian+suureksi,+vaikka+lukumääräisesti+yhä+useammat+yksilöt+siitä+tulevatkin+jollain+tasolla+kärsimään+tulevissa+sukupolvissa.Tietenkin+myös+havaintomenetelmien+ja+diagnostiikan+kehittyminen+selittää+mitä+suurimmissa+määrin+sitä,+että+uusia,+sairauksien+syntyyn+linkitettyjä,+mutaatioita+löydetään+niin+paljon.+Näin+kertoo+myös+oma+lähteesi,+jota+yritit+käyttää+vastaikkaista+näkemystä+edustavan+argumentin+puolestapuhujana.Lainaus:+”The+frequency+of+such+cases+has+risen+noticeably+in+recent+years,+as+advances+in+medicine+have+made+diagnoses+more+precise+and+thus+identifying+rare+diseases+has+become+easier.”Sinusta+siis+nämä+luonnolliset+tekijät+ovat+huonoja+selittämään+kasvavaa+mutaatiokuormaa,+ja+parempi+selitys+löytyy+siitä,+että+tulkintasi+mukaan+kaikkivaltias+suuttui+ja+kirosi+ihmiskunnan?En+todellakaan+ala+tuhlata+aikaani+vastaamalla+aivan+kaikkiin+väitteisiisi,+mutta+katsotaan+mallin+vuoksi+joitakin+niistä.”Informaatiokato+on+selvimmin+havaittavissa+diploideilla+eliöillä,+kuten+nisäkkäillä.”Ai+kuten+pampaviskatsarotalla+(Tympanoctomys+barrerae),+jonka+diploidinen+kromosomiluku+2n=102,+ja+tuo+nisäkkäiden+suurin+genomi+on+kehittynyt+vieläpä+evolutiisesti+ajatellen+hyvin+nopeasti+[4]?Lainaus:+”Taken+together,+these+results+provide+insights+into+the+origin+of+the+largest+mammalian+genome+and+support+that+1)+it+evolved+by+expansion+of+a+diverse+mosaic+of+repetitive+sequences,+and+2)+the+genomic+distribution+of+these+elements+is+not+uniform.”[4]+https://academic.oup.com/gbe/article/9/6/1711/3954029”Punaketulla+on+1500+proteiinia+koodaavaa+geeniä+vähemmän+kuin+esim.+sudella,+josta+se+todennäköisesti+on+varioitunut.”Punakettu+ei+varmuudella+ole+varioutunut+sudesta,+väite+on+idioottimainen+[5].[5]+https://en.wikipedia.org/wiki/Canidae#Phylogenetic_relationships”Mitä+enemmän+eliö+adaptoituu+muuttuviin+olosuhteisiin,+sitä+enemmän+se+kokee+geneettistä+rappeutumista.”Ai+niin+kuin+se+edellä+mainittu+jyrsijä,+joka+on+adaptoitunut+elämään+ääriolosuhteissa+suolatasangoilla+ja+käyttämään+ravinnokseen+erittäin+suolaisia+halofyyttejä,+ja+jonka+oli+mahdollistanut+genomin+ekspansio?”Vähitellen+genomin+GC-sisältö+muuttuu+AT-sisällöksi.”Ei+tule+tapahtumaan+populaatiotasolla,+sillä+evoluutio+on+nimenomaan+johtanut+pääsääntöisesti+G-C+vinoumaan,+koska+luonnonvalinta+on+suosinut+sitä+kolmen+vetysidoksen+johdosta+stabiilimpana+emäsparina+kuin+A-T+[6].+Äläkä+ala+nyt+saarnata+spontaanista+deaminaatiosta,+kun+et+sitäkään+kunnolla+ymmärrä.
  2. ”Muistakaa,+että+kaikissa+soluissamme+on+samat+DNA-sekvenssit+(neuroneja+ja+T-soluja+lukuunottamatta).”B-lymfosyyttejä,+kypsiä+punasoluja+ja+sukusoluja+lukuunottamatta+soluissamme+on+lähtökohtaisesti+sama+geneettinen+materiaali,+mutta+todellisuudessa+jo+varhaisessa+alkionkehityksessä+tapahtuu+satoja+somaattisia+mutaatioita,+joilla+voi+olla+vaikutusta+fenotyypin+kehittymiseen.+Somaattinen+mosaikismi+on+erityisen+merkille+pantavaa+aivojen+hyvin+aktiivissa+neurosoluissa+[3].[3]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5558435/pdf/nihms888777.pdf”Epigeneettiset+informaatiorakenteet+määrittelevät+solujen+erilaistumisohjelmat.”Suurelta+osin,+mutta+mitä+sitten?+Onko+väittänyt+jotain+muuta?+[4][4]+https://en.wikipedia.org/wiki/Cellular_differentiation”Siksi+epigeneettiset+informaatiorakenteet+määrittelevät+yksilön+ominaisuudet.”Virheellinen+analogia,+virheellinen+premissi+ja+virheellinen+todistelu”Tämä+informaatio+välitetään+RNA-molekyyleissä,+joita+on+siemennesteessä+tuhansia+erilaisia.”Ei+välitetä,+vaan+epigeneettinen+informaatio+välittyy+pääsääntöisesti+siittiösolujen+sisältämistä+molekyyliyhdisteistä+DNA-+ja+RNA-metyylitransferaasien,+histoni+metyylitransferaasien,+histoni+deasetylaasien+sekä+erilaisten+proteiinikompleksien+siirtäminä.+Siemennesteessä+solunulkoisten+vesikkeleiden+eli+eksosomien+kuljettamien+epigeneettisten+molekyyliyhdisteiden+todellisista+funktioista+esim.+alkionkehityksen+säätelyssä+emme+tiedä+vielä+juuri+mitään.”Jo+pelkästään+erilaisten+lncRNA-transkriptien+määrä+siemennesteessä+on+yli+20+000+eli+enemmän+kuin+meissä+on+proteiineja+koodaavia+geenejä.”Ei,+vaan+kypsyneistä+siittiösoluista+hiiriltä+on+löydetty+yli+20+000+lncRNA-transkriptiä,+ja+erilaisia+RNA-molekyylejä+on+löydetty+tuhansia,+joilla+on+lukemattomia+säätelytehtäviä+alkaen+jo+ennen+hedelmöitystä+[5,6].+Ja+mitä+ylipäätään+yrität+edes+argumentoida?+Sillä+ei+ole+mitään+merkitystä,+vaikka+erilasia+RNA-molekyylejä+ja+niiden+transkriptejä+olisi+satoja++miljardeja,+jos+ei+olisi+proteiineja+koodaavia+geenejä,+joiden+tuottamat+polypeptidit+ovat+kaiken+perusta.+Ja+ei,+en+edelleenkään+vähättele+mitään,+koska+monimutkaista+elämää+ei+olisi+ilman+geenien+säätelyjärjestelmiä,+mutta+yritä+sinäkin+ymmärtää+aina+oikea+konteksti+ja+viitekehys,+mihin+sijoitat+käsiteltävän+aiheen.[5]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5349675/[6]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5649092/
  3. ”Se+mikä+tässä+on+kaikkein+hauskinta,+on+se+että+solon+on+huomaamattaan+alkanut+todistaa+suunnittelun+ja+luomisen+puolesta+kertoessaan+itsekin+erittäin+monimutkaisista+solun+mekanismeista.”Miten+niin+huomaamattaan?+Ei+minulla+ole+ikinä+ollut+sellaista+harhaluuloa,+että+kehon+toiminnot+olisivat+solu-+ja+molekyylitasolla+jotenkin+suoraviivaisia+ja+yksinkertaisia.+Etkö+opettajana+oikeasti+ymmärrä,+ettei+peruskoulussa+tai+edes+lukiossa+voida+mennä+matematiikassa,+fysiikassa,+kemiassa+tai+biologiassa+hirveän+syvälisille+tasoille,+vaan+niistä+opetellaan+perusteita+ja+yksinkertaistettuja+kokonaisuuksia?+Ei+ole+mielekästä+tai+edes+käytännössä+mahdollista,+että+oppikirjat+olisivat+jokaisella+kurssilla+tuhat+sivuisia+järkäleitä.+Vai+mistä+ihmeestä+sinulle+on+syntynyt+sellainen+harhakäsitys,+ettei+edes+yliopistotasolla+ymmärrettäisi+asioiden+oikeaa+laitaa?+Vaikka+mekanismit+ovatkin+usein+varsin+monimutkaisia,+niin+suunnittelua+niissä+ei+ole+havaittavissa,+usein+jopa+päinvastoin.”Kiitos+solon,+sinusta+tulee+vielä+hyvä+kreationisti.+Voit+päästä+työparikseni,+kun+vielä+päivität+opintosi+ajan+tasalle+ja+lakkaat+käyttämästä+wikipediaa.”Kiitos+tarjouksesta,+mutta+taidan+jättää+väliin.+Sinun+tulisi+ymmärtää,+että+englanninkieliset+Wikipedian+artikkelit+ovat+pääsääntöisesti+aivan+ajan+tasalla+olevia,+ja+erittäin+käyttökelpoisia+tällaisessa+yhteydessä,+kunhan+hallitsee+lähdekritiikin.+Onko+sinulla+jotain+valitettavaa+esim.+tämän+artikkelin+suhteen+[1]?+[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Epigenetic_regulation_of_neurogenesisSitä+ei+voi+laskea+Wikipedian+heikkoudeksi,+etteivät+sen+artikkelit+tue+virheellisiä+käsityksiäsi.Miksi+sinä+uudelleen+laitoit+tuon+uutisen?+Vaikka+telegoninen+periytyminen+olsikin+hyönteisillä+tietyissä+olosuhteissa+mahdollista,+niin+edelleenkään+siitä+ei+ole+mitään+havaintoa+ihmisten+osalta,+ja+havaittu+periytymismuoto+ei+ole+edes+epigeneettinen.+Jos+telegoninen+periytyminen+on+tietyissä+tapauksissa+mahdollista,+niin+se+ei+kumoa+evoluutioteoriaa,+vaan+toimii+niche+tyylisenä+uniikkina+variaatiomuotona+[2].Lainaus:+”+By+the+same+token,+we+can+reject+an+epigenetic+(e.g.+DNA+methylation-based)+mechanism:+if+the+effect+of+male+condition+on+offspring+were+mediated+by+epigenetic+factors+associated+with+sperm+DNA,+then+the+effect+would+be+tied+to+fertilisation,+predicting+a+second+male+effect+but+no+first+male+effect+in+our+experiment.”Lainaus:+”Our+results+reveal+a+novel+type+of+transgenerational+effect+with+potential+implications+for+the+evolution+of+reproductive+strategies.”Lainaus:+”The+transgenerational+effect+we+observed+has+the+potential+to+play+a+unique+role+in+evolution+because+it+represents+a+distinct+source+of+variation+in+fitness.”[2]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4282758/”Solon+väheksyy+kaikkia+niitä+epigeneettisiä+mekanismeja,+joita+olen+palstalla+esitelly+jo+yli+kahden+vuoden+ajan.+Hän+pitää+kynsin+hampain+kiinni+populaatiogenetiikan+perusopeista+mutta+vähitellen+hän+on+alkanut+siirtää+maalitolppia+ja+kuten+huomaatte,+hänen+on+pakko+ottaa+epigenetiikka+vakavasti.”Tähän+vastattiin+jo+ylempänä,+mutta+vastaan+itsekin+lyhyesti+tähän+jatkuvaan+olkiukkoiluun.+En+ole+populaatiogenetiikkaan+suuntautunut,+vaan+nimenomaan+molekyyligenetiikkaan,+johon+epigenetiikan+tutkimus+kuuluu.+Et+ole+esitellyt+tai+opettanut+minulle+kertaakaan+mitään+uutta+asiaa,+mutta+minä+voin+todistaa+esitelleeni+ensimmäisen+kerran+ja+opettaneeni+sinulle+kymmeniä+sellaisia+mekanismeja+ja+prosesseja,+joista+virheellisesti+saarnaat+tänä+päivänä.+Kuten+jo+ylempänä+todettiin,+en+tietenkään+vähättele+epigeneettisiä+mekanismeja,+vaan+asetan+ne+kulloinkin+oikeaan+kontekstiin.
  4. ”Olet+kyllä+pihalla+kuin+lumiukko+ja+elät+1980-lukua+kuvitellen,+että+DNA:n+geenit+ovat+jonkinlaisia+kontrollereita.”Niinhän+ne+lukemattomissa+tapauksissa+ovatkin,+mutta+eivät+kaikissa,+ja+niiden+toimintaa+ja+ilmentymistä+kontrolloidaan+esim+DNA:n,+RNA:n,+proteiinien,+kemiallisten+markkereiden+(epigeneettiset+modifikaatiot),+eri+kompleksien+ja+signaloinnin+avulla.+Jos+aikuinen+ihminen+ei+ymmärrä,+ettei+tieteellistä+tietoa+voi+arpoa+oman+mielensä+mukaan+omiin+tarkoitusperiinsä,+niin+en+voi+auttaa.+Aihe+on+paljon+monimutkaisempi+ja+laajempi,+kuin+sinä+epigenetiikkahumalassasi+olet+ymmärtänyt.+Tässä+muutama+linkki,+joissa+käsitellään+mitä+kaikkea+esim.+kehityksen+kontrollointiin+sisältyy.[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Regulation_of_gene_expression+[2]+https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_regulatory_network[3]+https://en.wikipedia.org/wiki/Evo-devo_gene_toolkit[4]+https://en.wikipedia.org/wiki/Homeobox[5]+https://en.wikipedia.org/wiki/Hedgehog_signaling_pathwayJa+lisää[6]+https://en.wikipedia.org/wiki/Notch_signaling_pathway[7]+https://en.wikipedia.org/wiki/Homeotic_gene[8]+https://en.wikipedia.org/wiki/Hox_gene[9]+https://en.wikipedia.org/wiki/Pax_genes[10]+https://en.wikipedia.org/wiki/Cis-regulatory_element[11]+https://en.wikipedia.org/wiki/Transcription_factorjne...”Juuri+luin+tutkimuksesta,+jossa+havaittiin+jälleen+uusi+epigeneettinen+mekanismi,+joka+vaikuttaa+eliön+ominaisuuksiin.+Proteiiniperustainen+periytyminen+eli+kyse+on+prioneista.”Voi+herranjumala+sentään…+Kyseessä+on+katsausartikkeli,+joka+ei+siis+sisällä+uutta+alkuperäistä+tutkimusta,+vaan+siihen+on+koottu+laaja+katsaus+aiheen+historiasta+ja+nykytilasta.+Täysin+tuttua+asiaa.”Ja+lukaisepa+myös+siemennesteen+prioneista.+Luuletko,+että+nekin+ovat+ihan+sattumalta+siemennesteessä?+Missä+on+looginen+ajattelukykysi?”Looginen+ajattelukykyni+kertoo,+ettet+edelleenkään+ymmärrä+sanojen+oikeaa+kontekstia,+ja+ymmärrä+että+tutkimuksessa+kerrotaan+siittiösolujen+akrosomeissa+ja+sentrosomeissa+prionimuodossa+olevista+proteiineista,+jotka+voivat+toimia+mekanismina+epigeneettiselle+periytymiselle,+eikä+suinkaan+siemennesteessä+olevista+prioneista.”Mutta+kiva+sua+on+kouluttaa+solon.+Ehkä+joskus+ymmärrät,+että+olin+jälleen+oikeassa.”Hyvä,+että+minusta+on+jotain+iloa+sinullekin.PS+Arkikielessä+idiootilla+tarkoitetaan+yksinkertaisesti+henkilöä,+joka+toisen+mielestä+tekee+jotain+tyhmää+tai+ajattelematonta,+ja+juuri+sitä+kirjoituksesi+mielestäni+ovat.+En+tarkoita,+että+olisit+muussa+elämässäsi+tyhmä+tai+vähälahjainen,+puhun+vain+täällä+nähdyistä+kirjoituksista.
  5. ”Wikipedia+on+loukkaus+niitä+kohtaan,+jotka+ymmärtävät,+miten+solun+mekanismit+toimivat.”Sittenhän+Wikipedia+ei+loukkaa+sinua,+koska+et+niitä+ymmärrä.+Ei+se+kyllä+loukkaa+minuakaan,++koska+hallitsen+myös+lähdekritiikin.+Jos+osaat+lukea+ja+ymmärrät+lukemaasi,+niin+saatat+huomata,+että+käytin+Wikipediaa+osoittamaan+listauksen+tunnetuista+valeuutissivuistoista,+joista+yhteen+olit+turvautunut.+Tämän+lisäksi+käytin+Wikipedian+artikkelia,+jossa+käsitellään+rotu-käsitteen+ja+tieteellisen+rasismin+historiaa,+ja+osoitetaan+että+populaatiogeneetikot+ja+evoluutiobiologit+nimenomaan+vastustivat+ihmisen+rodullistamista,+ja+vaikuttivat+antropologien+asenteiden+muutokseen+1900-luvulla.”Tuosta+voit+lukea+miRNA-molekyylien+vaikutuksesta+epigeneettiseen+periytymiseen.+Kysy+sen+jälkeen+itseltäsi,+mikä+merkitrys+siemennesteen+ei-koodaavilla+RNA-molekyyleillä+on.”Niinpä+niin…+Tämä+tutkimus+ei+liittynyt+millään+tavalla+mikrokimerismiin+tai+telegoniaan,+eikä+se+edes+liittynyt+solunulkoisten+vesikkeleiden+siemenneesteessä+kuljettamiin+ncRNA-molekyyleihin,+joilla+voi+olla+potentiaalisia+säätelyfunktioita,+kuten+tässä+uudemmassa+tutkimuksessa+kerrotaan+[1].+PLOS+Genetics:in+artikkelin+julkaisun+aikaan+tätä+ei+vielä+edes+tiedetty,+vaan+tutkimus+kertoo+sukusolujen+mukana+epigeneettisesti+periytyvästä+ncRNA:sta,+joiden+siirrosta+seuraavalle+sukupolvelle+vastaavat+RNA-metyliitransferaasit.+Tämäkin+oli+silloin+kohtuullisen+uutta+tietoa.+Tällä+tavoin+periytyvällä+ncRNA:lla+on+aivan+eri+kaliiperin+vaikutus+alkionkehityksen+säätelytoiminnoissa,+kuin+eksosomien+mukana+kulkeutuvilla+molekyyleillä.Lainaus:+”In+order+to+be+heritable,+RNAs+must+be+present+within+gametes+of+males+or+females,+or+in+both.+Even+though+both+spermatozoa+and+ova+are+considered+transcriptionally+silent [20], [21],+several+studies+have+shown+that+a+complex+and+diverse+set+of+RNAs+is+present+in+germ+cells+of+both+sexes,+as+well+as+in+early+embryos.””Solon+käy+kuumana,+kun+totuus+alkaa+vähitellen+hänellekin+paljastua.+Siksi+hänellä+ei+ole+muuta+mahdollisuutta+kuin+räksyttää.”Voi+tätä+projisoinnin+määrää.+Minua+ärsyttää+vain+se,+että+aiheesta+juuri+mitään+ymmärtämätön+opettaja+kehtaa+uskonnollisen+ideologian+ajamana+härskisti+valehdella+ja+johtaa+päivittäin+tuhansia+ihmisiä+ympäri+maailmaa+harhaan+useilla+eri+foorumeilla.[1]+https://academic.oup.com/nar/article/42/11/7290/1440924Keskustelua+et+edes+yritä+käydä,+kunhan+saarnaat+osaamattomuuttasi.
  6. ”Voimme+lukea+useista+tapauksista,+joissa+esim.+valkoinen+pariskunta+on+saanut+tummaihoisen+lapsen+tai+päinvastoin.+Näissä+tapauksissa+naista+on+syytetty+pettämisestä,+vaikka+todellisuudessa+syynä+on+saattanut+olla+naisen+ex-kumppanin+jättämä+epigeneettinen+materiaali.”Harmi+vain+kannaltasi,+että+tuollaisesta+ei+ole+mitään+näyttöä.+Olen+sinulle+kertonut+useamman+todennäköisemmän+mekanismin,+jotka+ovat+voineet+kyseisen+kaltaiset+tilanteet+aiheuttaa,+mutta+ne+eivät+ole+sinulle+kelvanneet.”Vakavasti+otettavat+tiedemiehet+ovat+havainneet,+että+eliön+ominaisuudet+asetetaan+alkionkehityksessä+paikalleen+ei-koodaavien+RNA-molekyylien+toimesta...”Tämän+kappaleen+sisällön+olen+korjannut+jo+kymmeniä+kertoja.+Se+ei+ole+mitään+muuta,+kuin+epämääräinen+selostus,+jossa+sekoittuu+oikeat+asiat+täysin+keksittyihin+ja+väärin+ymmärrettyihin+asioihin.”Myös+ihonväri+periytyy+epigeneettisesti.+Linkitetystä+artikkelista+löytyvät+kertomukset+vahvistavat+tämän+tieteellisen+faktan.”En+löytänyt+vahvistusta,+joten+voitko+näyttää+tarkan+kohdan?+Ihonvärin+muodostuminen+on+polygeeninen+ominaisuus,+ja+geenien+toimintaa+ja+ilmentymistä+säädellään+usealla+eri+tasolla,+myös+epigeneettisellä.+Periytyvillä+epigeneettisillä+tekijöillä+ja+modifikaatioilla+on+oma+roolinsa+ihonvärin+muodostumisessa,+mutta+on+täysin+valheellista+ja+harhaanjohtavaa+väittää,+että+ihonväri+periytyisi+epigeneettisesti.”Populaatiogeneetikot+ja+evoluutiobiolgit+haluavat+ylläpitää+harhaa+siitä,+että+olisi+muka+olemassa+erilaisia+ihmisrotuja.”Keksitkö+tämän+omasta+päästäsi?+Todellisuudessa+nimenomaan+populaatiogenetiikan+tutkimukset+1900-luvulla+olivat+merkittävässä+osassa+kumoamaan+varhaisten+antropologien+päätelmiä,+jotka+synnyttivät+tieteellisen+rasismin+[3].Lainaus:+”New+studies+of culture and+the+fledgling+field+of population+genetics undermined+the+scientific+standing+of+racial+essentialism,+leading+race+anthropologists+to+revise+their+conclusions+about+the+sources+of+phenotypic+variation.”[3]+https://en.wikipedia.org/wiki/Race_(human_categorization)#Modern_scholarship”Todellisuudessa+kaikki+ihmiset+kuuluvat+yhteen+ja+samaan+Aadamin+rotuun,+jonka+Jumala+on+luonut.”Milloin+ja+missä+tämä+on+tapahtunut?
  7. ”Elämä+on+ihmeellistä+ja+periytymiseen+liittyvät+solun+mekanismit+huomattavasti+monimutkaisempia,+mitä+perinteinen+populaatiogenetiikka+haluaa+meidän+uskovan.”Mitä+sinä+populaatiogenetiikasta+tiedät,+et+yhtään+mitään.+Tämänkertainen+kirjoituksesi+ei+edes+juuri+raapaise+populaatiogenetiikan+pintaa,+vaan+pääosin+käsittelee+klassista+genetiikkaa+ja+molekyyligenetiikkaa,+johon+epigenetiikka+kuuluu.+Sinulla+on+täysin+harhainen+käsitys,+että+joku+tieteenala+kollektiivisesti+haluaisi+piilotella+todellista+monimutkaisuutta+jonkun+ideologisen+syyn+takia.+Sinä+olet+itse+se,+joka+on+plagioimalla+kehittänyt+hyvin+yksinkertaistetun+ja+järjettömän+mallin+solujen+mekanismeista.”Mikrokimerismi+(microchimerism,+telegony)+on+periytymiseen+liittyvä+ilmiö,+jota+vain+harvat+tiedemiehet+ovat+tutkineet,+koska+siihen+liittyvät+havainnot+romuttavat+evoluutioteorian+perusprinsiipit.”Olet+idiootti.+Fetaalinen+mikrokimerismi+ja+telegonia-hypoteesi+ovat+kaksi+eri+asiaa.+Fetaalinen+mikrokimerismi+on+todellinen+ilmiö,+ja+mikrokimeeristä+materiaalia+(DNA,+RNA+jne.)+tai+kokonaisia+soluja+voi+päätyä+toiseen+yksilöön+usealla+eri+tavalla.+Näitä+tapoja+ovat+esim.+lapselta+raskauden+aikana+istukan+lävitse+tapahtuva+transfuusio,+samoin+kuin+abortoituneelta+alkiolta,+vanhemmilta+sisaruksilta+äidillle+siirtynyttä+materiaalia+istukan+kautta+uuden+raskauden+aikana+tai+esim.+omalta+kaksoselta+siirtyvää+materiaalia.+Miten+tämä+liittyy+evoluutioteoriaan?”Tutkijat+ovat+havainneet,+että+eliön+jälkeläisillä+on+usein+sellaisia+ominaisuuksia,+jotka+eivät+ole+peräisin+ns.+biologiselta+(geneettiseltä)+isältä+vaan+äidin+ex-kumppaneilta.”Telegoniaa+on+nimenomaan+tutkittu+evoluutiobiologien+toimesta,+vaikka+sinä+kuvittelet+sen+olevan+jotenkin+lähtökohtaisesti+ongelmallinen.+Ei+sen+idea+ole+sinänsä+ongelmallinen+evoluutioteorialle,+ongelma+on+siinä,+ettei+sille+löydy+juurikaan+näyttöä.+Kärpästutkimuksista+on+saatu+jotain+viitteitä+telegonisesta+perinnöllisyydestä,+mutta+esim.+tunnetuin+artikkeli+aiheesta+Ecology+Letters+-julkaisussa+on+vedetty+pois.+Ja+siinäkin+tutkimuksessa+toisen+koiraan+siemennesteen+sisältämien+molekyyliyhdisteiden+(proteiineja,+RNA:ta)+oletettiin+säilyneen+aktiivisena+kahden+viikon+ajan,+ja+sekoittuneen+hedelmöityksen+aiheuttaneeseen,+toisen+koiraan,+siemennesteeseen.+Ja+sinä+kykenet+vetämään+tästä+varmuudella+sellaisen+johtopäätöksen,+että+tämä+on+yleinen+syy+selittämään+lasten+omiaisuuksia+ihmisillä?Kirjoitat+koko+ajan+päällekkäin+mikrokimerismistä+ja+telegoniasta,+ja+ensimmäiseksi+lähteeksesi+olet+valinnut+valeuutissivuston+[1],+joka+on+tarttunut+viime+kesänä+kiertämään+lähteneeseen+uutiseen+entisten+seksikumppaneiden+jättämästä+mikrokimeerisestä+materiaalista.+Harmi+vain+kannaltasi,+että+kyseessä+oli+uutisankka,+johon+ikävä+kyllä+useat+mediat+tarttuivat+[2].+Kyseessä+ei+ollut+mikään+uusi+tutkimus,+vaan+alkuperäisessä+uutisessa+viitattiin+vuonna+2012+julkaistuun+tutkimukseen,+jossa+ei+mainittu+sanallakaan+seksuaalista+kanssakäymistä+mahdolliseksi+syyksi+mikrokimeeriselle+materiaalille.+Vuonna+2005+eräs+tutkimus+spekuloi+myös+tällaisella+vaihtoehdolla,+mutta+mitään+vakuuttavaa+näyttöä+siitä+ei+ihmisillä+ole.[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/List_of_fake_news_websites[2]+https://www.snopes.com/women-retain-dna/
  8. Argumenttisi+on+jälleen+kerran+siis+vetoaminen+omaan+tietämättömyyteesi,+eli+mekanismin+täytyy+olla+suunniteltu,+koska+se+on+monimutkainen+etkä+sitä+ymmärrä?+Kun+sinulla+ei+ole+kattavia+pohjatietoja+molekyylibiologiasta+tai+toiminnallisesta+genomiikasta+ja+sen+osa-alueista,+niin+metsään+mennään+lähes+väkisin,+kun+yritetään+tehdä+syvempää+analyysia+populaariuutisten+pohjalta.Tällä+kertaa+virheet+alkavat+jo+otsikosta+ja+ensimmäisestä+lauseesta.+Eivät+transkriptiotekijät+mitään+ilmoita+tai+mainosta,+vaan+ne+edistävät+ja+ajavat+kromosomaalisen+arkkitehtuurin+ja+genomin+topologian+dynamiikkaa+uudelleen+organisoitumisessa,+ja+tämä+on+ollut+yleisellä+tasolla+jo+tiedossa.+Uutta+oli+se,+että+hyväksikäyttäen+vähän+aikaa+sitten+kehitettyä+uudelleenohjelmointiprotokollaa+tutkijat+pystyivät+selvittämään+yhteenkytkentöjä+usealla+arkkitehtuurisella+tasolla,+ja+yllättäen+havaittiin,+että+muuttuva+genomin+topologia+on+keskeinen+säätelytekijä+myös+solukohtalon+määräytymisessä,+eikä+pelkästään+vaikutin+geenien+ilmentymisessä,+kuten+aiemmin+oltiin+oletettu+[1].Naturen+artikkeli+on+maksumuurin+takana,+enkä+voi+sitä+tänne+linkittää,+mutta+tutkimuksesta+löytyy+myös+ilmainen+esijulkaisu,+joka+on+käytännössä+täysin+identtinen+nyt+julkaistun+version+kanssa.[1]+https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/04/30/132456.full.pdfPalaan+paremmalla+ajalla+tutkimuksen+tekniseen+puoleen,+jos+ROT+haluaa+aiheesta+jotain+väitellä,+vaikka+en+kerta+kaikkiaan+ymmärrä+miten+tämä+muka+tukisi+suunnittelua,+tai+ylipäätään+edes++kuuluisi+palstan+aiheeseen+millään+tavalla.+Eri+transkriptiotekijöitä+koodaavat+geenit,+niiden+sitoutumiskohtina+toimivat+vahvistaja-+ja+promoottorialueet+hotspotteineen,+kromatiinin+rakennetta+muovaavat+histonimodifikaatiot,+TAD+ja+LAD+-domeenit,+metylaatioprofiilit,+ncRNA:t+kuten+eRNA+ja+lukemattomat+muut+tässäkin+osallisena+olevat+tekijät+ovat+jatkuvasti+evoluution+kohteena,+ja+niiden+muutoksista+on+tehty+tuhansittain+tutkimuksia,+ja+olen+niitä+kymmenittäin+täällä+esitellyt.
  9. Tuli+niin+kiire+eilen+vastausta+kirjoittaessa,+että+unohdin+kokonaan+osoittaa+erään+asian+ROT:ille,+vaikka+en+hänen+viestiinsä+vastaakaan.+Kuten+yllä+kirjoitan,+voi+fenotyypin+plastisuuden+säätely+olla+joissain+tapauksissa+kokonaan+epigeneettisten+modifikaatioiden+aikaansaama+ilmiö,+mutta+välillä+tilanne+voi+olla+päinvastoin.Nopea+adaptoituminen+voi+syntyä+myös+muutoksista+kehitystä+ohjaavissa+prosesseissa.+Naturessa+muutama+kuukausi+sitten+julkaistussa+artikkelissa+esim.+osoitettiin,+kuinka+sienten+(samat+kasveilla+ja+eläimillä)+kehityksestä+osaltaan+vastaavissa+homeoboxgeeneissä+tapahtuvat+mutaatiot+voivat+aikaansaada+nopeita+ja+drmamaattisia+vaikutuksia+kohdegeenien+pysyvissä+ja+väliaikaisissa+ilmentymisprofiileissa+[1].Muutokset+ekspressioissa+johtuivat+muutuneiden+homeoottisten+transkriptiotekijöiden+uudenlaisesta+sitoutumisesta.+Tässä+tapauksessa+ei+siis+todennäköisesti+ollut+kyse+epigeneettisistä+tekijöistä,+vaan+geneettisistä+muutoksista.+Tämä+tarkoittaa+sitä,+että+periaatteessa+vastaava+lopputulos+voidaan+saavuttaa+useammalla+eri+tavalla,+ja+ROT:in+väitteet+siitä,+että+nopea+adaptoituminen+olisi+aina+ja+pelkästään+epigeneettinen+prosessi+on+yksinkertaisesti+valheellinen.+Lainaus:+”Dramatic+phenotypic+changes+have+been+observed+in+studies+of+developmental+mutants,+affecting+growth+and+dispersal.+Many+of+the+underlying+genetic+changes+involved+regulatory+structures,+such+as+the+HOX+gene+cluster+found+in+almost+all+metazoans+and+homeobox+genes+found+in+fungi,+plants+and+animals.”Lainaus:+”The+hierarchical+genetic+regulatory+control+of+developmental+traits+provides+an+avenue+for+rapid+phenotypic+evolution+by+few+mutations.”Lainaus:+”In+both+species,+multicellular+forms+arose+by+developmental+changes,+which+were+due+to+mutations+in+a+transcription+factor+in+one+of+the+species,+consistent+with+a+well-known+mode+of+developmental+evolution.”Ja+tässä+ROT:ia+eniten+suututtava+lainaus.Lainaus:+”Three+characteristics+indicate+that+the+phenotypic+differences+are+most+likely+genetic,+not+epigenetic.”[1]+https://www.nature.com/articles/s41598-017-16229-0Saa+nyt+nähdä,+että+pysyvätkö+nuo+lainaukset+tuossa.
  10. Jos+muuntelu+tapahtuu+populaation+seuraaville+sukupolville+periytyvissä+ominaisuuksissa,+niin+se+on+määritelmällisesti+evoluutiota.+Vaikka+kyse+olisi+puhtaasti+fenotyypin+plastisuudesta,+niin+miten+kuvittelet+sen+käytännössä+tapahtuvan?+Kuiskaako+Jumala+sirkulle,+että+kasvata+suurempi+nokka,+kun+minä+tarjoan+sinulle+tällaisia+siemeniä,+ja+sirkku+kasvattaa?+No+ei.Tällaiseen+fenotyypin+plastisuuteen,+eli+genotyypin+kykyyn+ilmaista+erilaisia+ilmiasuja+muuttuvien+ympäristötekijöiden+johdosta,+liitty+aina+muutoksia+periytyvissä+ominaisuuksissa.+Ne+eivät+välttämättä+ole+geneettisiä+muutoksia,+vaan+kuten+on+jo+kerrottu+ne+voivat+olla+myös+epigeneettisiä+modifikaatioita.+Muuttuvat+ympäristötekijät+voivat+esim.+laukaista+de+novo+metylaatioprofiilien+syntymistä+aktivoituvien+DNMT-metyylitransferaasien+vaikutuksella.+Nämä+modifikaatiot+voivat+sitten+säädellä+esim.+DLK1+ja+HMGA2+kaltaisten+geenien+ilmentymistä,+joilla+on+suora+vaikutus+nokan+morfologiaan.Tämä+ei+ole+mikään+automaattinen+mekanismi,+vaan+yksilöt+reagoivat+eri+tavoin+ympäristötekijöiden+vaikutukseen,+jos+edes+reagoivat.+Luonnonvalinta+toimii+aivan+samalla+tavoin+epigeneettisten+modifikaatioiden+kohdalla,+kuin+se+toimii+erilaisten+geneettisten+muutosten+kanssa.+Ne+yksilöt,+joilla++on+suurin+potentiaali+fenotyypin+plastisuuteen+muuttuvissa+olosuhteissa,+saavat+myös+keskimääräisesti+enemmän+jälkeläisiä,+ja+stabiilit+metylaatioprofiilit+periytyvät+myös+niiden+jälkeläisille+muuttaen+geenien+ilmentymisprofiilia.Toinen+kysymys+edelleen+on+se,+että+missä+määrin+fenotyypin+plastisuuden+epigeneettisellä+säätelyllä+on+ollut+merkitystä+biodiversiteetin+evoluutiossa.+Evoluutiota+se+joka+tapauksessa+määritelmällisesti+on,+ja+voi+johtaa+sopeutumiseen+muuttuvissa+olosuhteissa.+Kun+nyt+tämän+tiedät,+niin+osaatko+enää+perustella,+että+millä+logiikalla+sirkkujen+nokkien+morfologiset+muutokset+eivät+olisi+määritelmällisesti+evoluutiota?
  11. ”Ymmärrätkö+lainkaan,+palstan+harhaanjohtaja,+kuinka+suurta+osaa+genomista+käytetään+lncRNA-transkriptien+rakentamiseen?+Niitä+kun+ei+kopioida+suoraviivaisesti+DNA:sta.”No,+ncRNA+muodostaa+noin+98%+transkriptomista,+ja+lncRNA-transkriptejä+voi+syntyä+geenien+läheisyydestä,+intrageenisistä+alueista,+päällekkäisistä+DNA-juosteista,+pseudogeeneistä,+SINE-elementeistä+(kaikki+DNA:ta)+jne.,+mutta+mitä+tällä+nyt+on+merkitystä+minkään+asian+suhteen?+Edelleen+FANTOM-projekti+on+löytänyt+alle+30+000+lncRNA-transkriptiä,+ja+sellaisen+keskipituus+on+n.+1000+nukleotidia,+eli+lncRNA-transkriptien+osuus+genomin+koosta+on+alle+prosentti.”Ja+tiedätkö+sitäkään,+että+osa+lncRNA-molekyyleistä+käy+läpi+vaihtoehtoisen+silmukointiproseduurin?”Tiedän.+Tiedätkö+sinä,+kuinka+moni+syntyneistä+transkripti-isoformeista+on+funktionaalinen?”Ja+ymmärrätkö+reppana+sitäkään,+että+osa+lncRNA-molekyyleistä+jopa+koodaa+proteiineja.”Ymmärrän+toki,+olenhan+tälläkin+palstalla+kirjoittanut+lncRNA:sta+syntyvistä+pienen+avoimen+lukukehyksen+de+novo+geeneistä+ensimmäisen+kerran+n.+kolme+ja+puoli+vuotta+sitten.+Olen+sinullekin+niistä+kertonut,+ja+maininnut+että+koodatuilla+polypeptideillä+voi+olla+myös+funktioita,+koska+luonnonvalinta+näyttää+niitä+suosivan,+toisin+kuin+suurta+osaa+lncRNA-transkripteistä.+Itse+olet+tämän+kiistänyt,+joten+onko+ääni+kellossa+muuttunut?+Sehän+olisi+hienoa,+jos+ymmärtäisit+miten+uutta+geneettistä+informaatiota+voi+syntyä+uusien+funktionaalisten+proteiinien+muodossa.+Toki+on+myös+löydetty+kaksoisfunktion+omaavia+lncRNA-transkriptejä,+joiden+sisällä+on+pieni+avoin+lukukehys,+joka+kooda+proteiiniksi+laskostuvia+polypeptidejä,+kuten+SPAR-proteiini.”Sulla+on+paljon+oppimista,+pikku+solon.”On+tietenkin,+niin+kuin+kaikilla,+mutta+ei+sinulta.”Ja+tapasi+on+aina+se,+että+viet+keskustelun+pois+varsinaiselta+pääasialta.”Tämä+on+taas+jotain+aivan+käsittämätöntä+projisointia.”+Ymmärrätkö+mitään+lncRNA-molekyylien+ja+histonien+epigeneettisten+markkerien+välisestä+yhteydestä?”Aika+paljonkin,+ja+varmuudella+enemmän+kuin+sinä,+mutta+ymmärrätkö+sinä,+että+lncRNA:lla+on+muitakin+funktioita,+kuin+olla+osana+erilaisissa+kromatiinin+modifikaatioissa+[1]?[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Long_non-coding_RNA#Functions”Tai+tiedätkö+raukka+edes,+mitä+tarkoitetaan+4D-genomilla?”Riippuu+asiayhteydestä,+mutta+sinä+taidat+tarkoittaa+kromatiinin+moniulotteista+järjestäytymistä?”Näytä+vielä+lopuksi+tieteellinen+malli,+joka+todistaa,+miten+nuo+mekanismit+olisivat+voineet+kehittyä.”Vaihtoehtoinen+silmukointi+on+voinut+kehittyä+näin+[2].+Tässä+histonimodifikaatioiden+alkuperästä+ja+evoluutiosta+[3],+ja+tässä+epigenomin+evoluutiosta+[4].+Ja+tässä+vielä+miten+lncRNA+on+voinut+kehittyä+vahvistaja-RNA:sta+(eRNA)+[5].+Voistiko+sinä+puolestasi+näyttää+minulle,+miten+Jumala+takoi+ne+muutama+tuhat+vuotta+sitten?[2]+http://cshperspectives.cshlp.org/content/6/6/a016071[3]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5429095/[4]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5721340/[5]+http://www.cell.com/trends/genetics/fulltext/S0168-9525(17)30122-1+Voit+haukkua+minua+niin+paljon+kuin+sielu+sietää,+mutta+voisit+lopettaa+nämä+mahtipontiset+olkiukkoilusi,+mitä+tämäkin+avaus+tyylipuhtaasti+edustaa.
  12. Etkö+sinä+aikuinen+ihminen+itse+huomaa,+kuinka+säälittävän+lapsellinen+olet?++Toimiiko+ajattelusi+oikeasti+kuin+pikkulapsella?Kirjoitin+toiseen+ketjuun+seuraavaa:+"Lukumääräisesti+näin+on,+mutta+nukleotidien+määrä+on+proteiineja+koodaavien+geenien+osalta+lähes+kaksinkertainen,+joten+emästen+määrää+vertaamalla+huomattavasti+suurempi+osa+genomista+rakentuu+proteiineja+koodaavista+geeneistä+kuin+lncRNA-transkipteistä,+joista+merkittävä+osa+on+vieläpä+toimimattomia.+Ja+ei,+tämä+ei+tarkoita,+että+vähättelisin+millään+tavalla+lncRNA:n+merkitystä,+jota+aina+kuvittelet,+kun+ajatukesenkulkusi+on+ala-asteikäisen+tasolla.+Kerroin+vain,+että+geneettisen+eron+vertaaminen+sellaisesta+osasta+genomia,+joka+muodostaa+alle+prosentin+kokonaisuudesta,+ja+josta+suuri+osa+on+voimakkaan+valinnan+kohteena+jatkuvasti,+on+jokseenkin+epärehellistä+toimintaa.+"Muuhun+sekasotkuusi+puuttuminen+on+täysin+hyödytöntä,+ja+tehty+jo+kymmeniä+kertoja.
  13. ”lncRNA-transkriptien+määrä+ihmisen+genomissa+on+suurempi+kuin+proteiinien+koodaamiseen+käytettävien+DNA-jaksojen+määrä.”Lukumääräisesti+näin+on,+mutta+nukleotidien+määrä+on+proteiineja+koodaavien+geenien+osalta+lähes+kaksinkertainen,+joten+emästen+määrää+vertaamalla+huomattavasti+suurempi+osa+genomista+rakentuu+proteiineja+koodaavista+geeneistä+kuin+lncRNA-transkipteistä,+joista+merkittävä+osa+on+vieläpä+toimimattomia.+Ja+ei,+tämä+ei+tarkoita,+että+vähättelisin+millään+tavalla+lncRNA:n+merkitystä,+jota+aina+kuvittelet,+kun+ajatukesenkulkusi+on+ala-asteikäisen+tasolla.+Kerroin+vain,+että+geneettisen+eron+vertaaminen+sellaisesta+osasta+genomia,+joka+muodostaa+alle+prosentin+kokonaisuudesta,+ja+josta+suuri+osa+on+voimakkaan+valinnan+kohteena+jatkuvasti,+on+jokseenkin+epärehellistä+toimintaa.”Ihminen+ei+voi+käyttää+mitään+simpanssin+elintä+eikä+edes+verensiirto+simpanssilta+ihmiselle+toimi.+Sen+sijaan+ihminen+voi+käyttää+sian+verta,+sydäntä,+munuaista+jne.+Yhtälailla+ihmiseen+sopii+delfiinin+tai+lampaan+sydän.”Miksi+sinä+valehtelet?+Simpanssin+ja+ihmisen+ABO-+ja+Rh-antigeenit+ovat+käytännössä+identtiset,+ja+muutkin+pinta-antigeenit+ovat+lähempänä+ihmistä,+kuin+millään+muulla+eläimellä.+Ongelmia+ksenotransplantaatiossa+ihmisen+ja+simpanssin+välillä+aiheutuisi+pääasiassa+siitä+syystä,+että+esim.+simpanssin+sydän+on+liian+pieni+ihmiselle.+Sika+on+tuotantoeläimenä+paljon+”eettisempi”+vaihtoehto,+ja+riittävän+samankaltainen+meidän+kanssamme.+Sekä+simpanssien+että+sikojen+perimää+pitäisi+kuitenkin+editoida+esim.+CRISP/Cas9+tekniikalla,+jos+niistä+haluttaisiin+turvallisia+luovuttaja-eläimiä.+Cas9-nukleaasin+pitäisi+leikata+ainakin+PtERV:t+ja+CERV:t+simpansseilta+ja+PERV:t+sioilta,+ja+inaktivoida+haitalliset+antigeenit.+Mitä+kauemmas+fylogeniassa+edetään,+sitä+enemmän+editointia+antigeenien+osalta+tarvittaisiin.+Mistä+lasten+satuluontokirjasta+sinä+tietosi+oikein+kaivat?”Solon+on+palstan+epärehellisin+eksyttäjä.”Voi+tätä+tahattoman+ironian+määrää...
  14. Eikö+tämä+ole+käyty+jo+tarpeeksi+monta+kertaa+lävitse?+Kerroin+jo+silloin+kaksi+ja+puoli+vuotta+sitten,+että+DNA-metylaatiolla+on+todennäköinen+roolinsa+darwininsirkkujen+morfologisissa+muutoksissa,+ja+myöhemmin+tästä+on+saatu+lisänäyttöä+useissa+tutkimuksissa.+Olen+ylipäätään+aina+todennut+sinulle,+että+periytyvät+epigeneettiset+modifikaatiot+voivat+mahdollisesti+olla+hyvin+nopea+vaste+eri+ympäristötekijöiden+aiheuttamaan+valintapaineeseen.+Nuo+epigeneettiset+modifikaatiot+pystyvät+lisäämään+fenotyypin+plastisuutta,+eli+genotyypin+kykyä+ilmaista+erilaisia+ilmiasuja.+Tässä+ei+ole+mitään+ongelmaa+kenelläkään.+Eri+asia+on+sitten+se,+että+kuinka+suuri+tai+pieni+rooli+periytyvillä+epigeneettisillä+modifikaatiolla+on+ollut+biodiversiteetin+evoluutiossa.+Tätä+ei+tiedä+vielä+kukaan.Sinulle+sen+sijaan+tuntuu+olevan+ongelma+sen+asian+kanssa,+ettei+mikään+linkittämäsi+lähde+allekirjoita+esittämiäsi+johtopäätöksiä.+Forbesin+uutinen+keskittyy+tutkimukseen,+jossa+tutkittiin+saman+lajin+eri+elinympäristöissä+eläviä+kantoja+[1].+Tutkimuksessa+ei+löydetty+suuria+kopioluvun+muutoksia+(CNV),+mutta+muita+geneettisiä+variantteja,+kuten+yhden+emäksen+monimuotoisuutta+(SNP),+ei+tässä+yhteydessä+edes+etsitty.+Tutkimuksessa+kuitenkin+kerrotaan+kahdesta+vastikään+julkaistusta+tutkimuksesta,+joissa+löydettiin+useita+geneettisiä+variantteja,+esim.+muutoksia+DLK1+ja+HMGA2+geeneissä,+joiden+tiedetään+osaltaan+vastaavan+nokan+kasvun+kehityksestä.[1]+https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12862-017-1025-9#Sec15Tässä+tapauksessa,+jossa+tutkittiin+saman+lajin+eri+kantoja,+joiden+asuinalueiden+erot+ovat+syntyneet+viimeisten+60+vuoden+kuluessa,+on+kuitenkin+varsin+mahdollista,+kuten+tutkijatkin+esittävät,+että+syntyneet+morfologiset+muutokset+ovat+peräisin+lähinnä+muuttuneista+metylaatioprofiileista,+jotka+johtavat+geenien+ilmentymisen+epigeneettisen+säätelyn+muuttumiseen.+Adaptoituminen+pitkässä+juoksussa+tapahtuu+yleisesti+ottaen+sekä+geneettisellä+että+epigeneettisellä+tasolla,+vaikka+pelkkä+epigeneettisen+säätelyn+muutos+voikin+mahdollisesti+toimia+ensivasteena+muuttuviin+elinolosuhteisiin+tietyissä+tilanteissa.+Viesti+on+hyvä+lopettaa+lainaukseen+tutkimuksesta,+johon+tällä+kertaa+yritit+vedota.Lainaus:+”In+addition+to+genetic+variation,+epigenetic+variation+-+such+as+differential+DNA+methylation+-+may+exist+between+natural+populations+living+under+different+environmental+conditions...these+results+are+consistent+with+a+potential+role+of+epigenetic+variation+in+rapid+adaptation+to+changing+environments.+Future+studies+are+needed+to+determine+what+effects+DMR+have+on+phenotypes,+and+to+what+extent+these+methylation+patterns+may+play+a+role+in+evolution.”Yksityiskohtiin+en+jaksa+tässä+puuttua.
  15. "Nobel-palkittu+kemisti+kumoaa+evoluutiouskovaisten+väitteet+RNA:n+kehittymisestä+ennen+DNA:ta."Osaatko+sinä+lukea?+Ensinnäkin+Jack+W.+Szostak+ei+ole+kemisti+vaan+biokemisti+ja+geneetiikko,+ja++toisekseen+hän+ei+ole+kummonnut+mitään+”evoluutiouskovaisten”+väitteitä+RNA:n+kehittymisestä+ennen+DNA:ta.+Kyse+on+siitä,+että+Szostakin+laboratorio+julkaisi+Nature+Chemistry:ssä+artikkelin,+jossa+kerrottiin+argiinirikkaiden+peptidien+voivan+katalysoida+ei-entsymaattista+RNA-templaattien+kopioitumista+alkumaapallon+olosuhteissa.+Szostakin+oman+laboratorion+jäsen+itse+huomasi+myöhemmin+virheet+koejärjestelyssä,+ja+laboratorio+pyysi+itse+Naturelta+artikkelin+poisvetämistä.+Muut+eivät+olleet+tätä+huomanneet.Kyseiseen+onglemaan+on+esitetty+useita+erilaisia+vaihtoehtoja,+mutta+täysin+toimivaa+mallia+ei+ole+löydetty.+Itse+pidän+esimerkiksi+lukemani+perusteella+nykyisin+todennäköisempänä+jonkinlaista+peptidi-esiRNA-maailmaa+kuin+suoraa+RNA-maailmaa,+koska+tähän+viittavat+useat+tuoreet+tutkimukset,+mutta+ei+Szostakin+tutkimaa+RNA-maailmaa+ole+vielä+missään+tapauksessa+kuopattu."Varmasti+noloa,+toteavat+tutkijat,+jotka+olivat+tehneet+vakavan+tulkintavirheen+tutkimuksissaan+eivätkä+kyenneet+toistamaan+omia+tutkimuksiaan.+(Yli+puolet+ns.+tieteellisen+tutkimuksen+tekijöistä+ei+kykene+toistamaan+edes+omia+tutkimuksiaan.)"Harmittaa+varmasti,+kun+ratkaisua+ei+löytynytkään+kyseiseen+ongelmaan,+mutta+näitä+sattuu+välillä.+Onneksi+tiede+on+itseään+korjaava.+Olen+täysin+tietoinen+laaja+keskustelua+herättäneestä+”toistettavuuskriisistä”,+mutta+voisit+lukea+siitä+tehtyjä+analyysejä+kohu-uutisten+sijaan.+Olet+ymmärtänyt+senkin+asian+väärin.+Ja+vaikka+kuvittelisimmekin,+että+70%+tuotettuista+tutkimuksista+olisi+kokonaan+virheellisiä,+mitä+ne+eivät+tietenkään+oikeasti+ole,+niin+miten+sinä+onneton+kuvittelet+olevasi+jotenkin+pätevä+arvioimaan+mitkä+niistä+sitten+olisivat+valideja?+Eikö+sinun+logiikallasi+70%+myös+epigenetiikkaa+koskevista+tutkimuksista+olisi+virheellisisä?++Millä+menetelmällä+poimit+rusinat+pullasta?"Näin+putosi+pohja+pois+evoluutiouskovaisten+väitteiltä,+joiden+mukaan+elämä+olisi+saanut+alkunsa+RNA:sta."Perustele!+Tässä+kävi+vain+ilmi,+ettei+ei-entsymaattinen+kopioituminen+todennäköisesti+voinutkaan+tapahtua+argiinirikkaiden+peptidien+toimesta.+"Nature+on+esimerkki+pseudotieteellisestä+instanssista,+joka+julkaisee+täysin+epätieteellistä+roskaa.+"Olet+täysin+sekaisin.+Oma+lähteesikin,+joka+on+huomiohakuinen+”tabloid-julkaisu”,+kertoo+että+tapaus+oli+vasta+toinen+Nature+Chemistry:ssä+yli+kahdeksan+vuoden+aikana."Ja+vähintään+yhtä+noloa+paljastus+on+tämän+palstan+evoluutiouskoville,+jotka+ovat+menneinä+vuosina+käyttäneet+ko.+tutkimusta+argumenttina+ja+todisteena+evoluutiolle."Mitä+sinä+raukka+taas+sekoilet?+Tutkimus+julkaistiin+vuonna+2016,+ja+olen+melko+varma+ettei+kukaan+palstalla+ole+yrittänyt+todistella+evoluutiota+sillä,+että+argiinirikkaat+peptidit+voisivat+katalysoida+ei-entsymaattista+RNA-templaatin+kopioitumista+alkumaapallon+olosuhteissa,+kun+se+ei+liity+millään+tavalla+biologiseen+evoluutioon,+vaan+elämän+synnyn+kemiallisiin+prosesseihin.
  16. "Tutkimuksesi+eivät+todista+mitään."https://www.areiopagi.fi/2016/06/tieteen-taantumus/Saatko+paljon+tyydytystä+siitä,+että+esiinnyt+toisena+kirjoittajana?+”Toistettavuuskriisi”+on+jossain+määrin+todellinen+ongelma+tieteen+tuottamisessa,+mutta+sen+syyt+ovat+hyvin+pitkälle+tiedossa,+samoin+kuin+keinot+muutoksen+aikaansaamiseksi+lukuisten+osatekijöiden+osalta.+Kokonaan+sitä+ei+saada+ikinä+korjattua,+ei+ainakaan+niin+kauan,+kuin+ihminen+on+se+taho,+joka+opettaa,+valvoo+ja+tekee+tutkimusta.Toinen+asia+on+sitten+se,+kuinka+paljon+painoarvoa+haluaa+antaa+ekumeeniselle+konservatiivijulkaisulle+(First+Things),+josta+William+A.+Wilsonin+kirjoitus+oli+käännetty+Areiopagi-sivustolle.+Se+on+yleisessä+tiedossa,+että+kummatkin+julkaisut+suorastaan+vihaavat+naturalismia+ja+tieteellistä+maailmankuvaa,+ja+ottavat+kaiken+ilon+irti+ja+vähän+enemmänkin+silloin,+kun+niiden+vastustamiseen+paikka+avautuu.Mutta+jos+nyt+oletetaan,+että+Wilson+olisi+täysin+oikeassa+kritiikissään+(mitä+hän+ei+ole),+niin+olisi+älyllisesti+rehellistä+pitää+ROT:n+esittämää+29,8%+todennäköisemmin+virheellisenä,+koska+se+perustuu+uudenlaisen+työkalun+käyttöön,+jonka+käytöstä+ei+ole+olemassa+kattavaa+määrää+dataa+ja+sen+pohjalta+tehtyjä+tarkistuksia.+Minisian+57%+ja+simpanssin+72%+taas+perustuvat+samaan,+jo+pitkään+käytettyyn+menetelmään,+jonka+toiminnan+muuttujat+tunnetaan+hyvin.+Se+kuinka+tarkka+kyseinen+menetelmä+on+todellisuudessa+kuvaamaan+lncRNA:n+merkittävää+homologiaa+on+toissijaista,+vain+sillä+on+merkitystä+että+kyseiset+luvut+ovat+vertailukelpoisia+tässä+tapauksessa.+Trollauksesi+ei+siis+osunut+maaliin.
  17. ”En+usko+että+kukaan+on+aiemmin+edes+kuullut+"suoliliepeestä+eriytyvistä+liikkuvista+orgaaneista,+joilla+on+funktio+saaliin+tainnuttamisessa"+yms+yms.”Se+ei+ole+yllätävää+ettet+sinä+mitään+tiedä+ja+takerrut+epäolennaisuuksiin,+mutta+sillä+ei+ole+asian+kanssa+mitään+tekemistä.+Pointti+siinä+oli,+että+evoluutio+tapahtuu+pääsääntöisesti+muokkaamalla+jo+olemassa+olevia+erilaisia+geneettisiä+säätelyelementtejä,+koodaavia+geenejä+ja+meioottisesti+stabiileja+epigeneettisiä+modofikaatioita,+jotka+kasvattavat+kvalitatiivista+geneettistä+informaatiota.ROT+kieroilijana+on+tämän+takia+keksinyt+kieltää+jo+olemassa+olevan+informaation+hyödyntämisen+esimerkkinä+evoluutiosta+ja+väittää+informaation+ainoastaan+häviävän.+Tästä+syystä+olen+poiminut+hänelle+sellaisia+tapauksia,+joissa+ei+ole+mitään+rationaalista+mahdollisuutta+kiistää+uusien+funktionaalisten+rakenteiden+syntyyn+vaikuttaneita+avoimen+lukukehyksen+de+novo+geenejä,+jotka+syntyvät+ja+rakentuvat+todistetusti+toimimattomista+DNA-sekvenssin+osista+ja+lisäävät+kaikilla+relevanteilla+määrittelyillä+kvalitatiivisesti+uutta+geneettistä+informaatiota.+Vastaukseni+pääpointti+oli+tietenkin+se,+että+ROT+ei+ollut+ymmärtänyt+tutkimuksen+käsitelleen+homoploidista+hybridilajiutumista,+joka+on+selkärankaisilla+hyvin+harvinaista,+eikä+liittynyt+oikeastaan+millään+tavoin+niihin+epigeneettisiin+mekanismeihin,+joilla+oikeastikin+voi+olla+roolinsa+ns.+”normaaleissa”+lajiutumisissa.+Jos+ylipäätään+olet+tosissasi,+niin+projisointisi+on+surkuhupaisaa.+Vastaukseni+ovat+tosiaan+usein+melko+pitkiä,+mutta+se+johtuu+siitä,+että+vastaan+täsmällisesti+ja+tutkimuksiin+perustuen+niihin+väitteisiin+ja+kysymyksiin+joita+on+esitetty.+Sinäkin+kirjoitat+usein+pitkiä+vastauksia,+mutta+niiden+sisällön+informaatioanti+on+olematon.+Jaarittelet+omahyväistä+kyökkifilosofiaa.