Vapaa kuvaus

Aloituksia

725

Kommenttia

3861

  1. 1986
  2. Baramiinit+olivat+ns.+basaaleja+lajeja.+Niillä+on+erinomainen+kyky+ylläpitää+genominsa+eheyttä.+Arkkiin+otettiin+siis+basaaleja+lajeja.+Hyvä+esimerkki+on+susi.+Sen+genomi+ei+juurikaan+ole+kärsinyt+tuhansien+vuosien+aikana,+mutta+siitä+varioituneet+koiraeläimet+ovat+enemmän+tai+vähemmän+rappeutuneet.
  3. Kuten+jo+tiedämme,+ihmisen+genomissa+on+vain+noin+19'000+proteiinien+koodaamiseen+käytettävää+DNA-jaksoa,+mikä+on+vähemmän+kuin+yhdellä+pienimmistä+monisoluisista+eliöistä,+sukkulamadolla+(C.+Elegans,+koko+n.+1+mm).+Erilaisia+proteiineja+kehossamme+on+tuoreimpien+tutkimusten+mukaan+jopa+n.+kuusi+miljoonaa.+Onko+DNA:ssa+alueita,+jotka+säätelevät+sitä,+miten+solu+lukee+proteiinien+koodaamiseen+käytettäviä+jaksoja?ENCODE+-projekti+v.+2008-2102+kartoitti+järjestelmällisesti+koko+ihmisen+genomin+liittyen+transkriptioon,+transkriptiotekijöiden+yhteyteen,+kromatiinin+rakenteeseen+ja+histonien+modifikaatioihin.+Projekti+löysi+80,4%:lle+genomistamme+biokemialliseen+aktiivisuuteen+viittavaa+toiminnallisuutta+nimenomaan+proteiinien+koodaamiseen+käytettävien+jaksojen+ulkopuolella.+Vaikka+näinkin+suurelle+osalle+DNA:ta+löydettiin+toiminnallisuutta,+eivät+johtavat+evoluutiobiologit+suostuneet+uskomaan,+että+kyseinen+osa+olisi+hyödyllistä.+Mm.+PZ+Myers+useissa+kirjoituksissaan+väheksyy+ENCODE-projektin+tuloksia.+Myöhempi+tutkimus+on+havainnut,+miten+solu+käyttää+koodaamatonta+aluetta+moniin+eri+tarkoituksiin:1.+Dr+John+Stamatoyannopoulos+Washingtonin+yliopistosta+toteaa,+että+Encode+paljasti+genomissamme+olevan+40+miljoonaa+erilaista+kytkintä+(epigeneettisiä+kytkimiä),+jotka+säätelevät+ja+kontrolloivat+näitä+geenejä+(proteiineja+koodaavat+jaksot).+Tutkijoiden+mukaan+tuo+ENCODEN+löytämä+alue+on+eräänlainen+käyttöjärjestelmä.+Se+on+siis+selkeästi+sekä+hyödyllistä+että+toiminnallista,+eikä+missään+tapauksessa+mitään+roskaa+tai+tilkettä.2.+ENCODE+-projekti+jätti+selvittämättä,+mihin+solu+käyttää+ns.+STR+(Short+Tandem+Repeat)+jaksoja.+Kyse+on+lyhyistä+toistuvista+DNA-jaksoista,+jotka+näyttävät+pikemmin+kirjoitusvirheiltä+tai+kohinalta.+Tutkijat+ovat+kuitenkin+havainneet,+että+STR-jaksot+ovat+erittäin+tärkeitä+säätelyelementtejä+genomissamme+ja+vaikuttavat+n.+10-15+prosenttisesti+ihmisten+välisiin+eroavaisuuksiin+(niiden+metylaatiotasot).3.+Siirtyvät+elementit+(transposable+elements+LINEs,+SINEs,+ERVs+ja+DNA-transposonit)+on+kaikki+todettu+erittäin+tärkeiksi+ja+hyödyllisiksi.+Niillä+on+useita+eri+tehtäviä.+Solu+rakentaa+niistä+tyypillisesti+koodaamattomia+RNA+molekyylejä,+kuten+lncRNA-,+microRNA-,+siRNA-+ja+piRNA-molekyylejä.4.+Heterokromatiini+on+kromosomissa+olevaa+tiukaksi+pakattua+DNA:ta.+Vasta+äskettäin+on+alkanut+selvitä,+että+solun+mekanismit+rekrytoivat+'ambulansseja'+eli+kaksijalkaisia+myosiini-moottoriproteiineja+kuljettamaan+heterokromatiinissa+olevia+vaurioituneita+DNA+jaksoja+korjattaviksi+tumahuokoskompleksin+äärelle.+Solu+siis+yrittää+korjata+myös+virheellistä,+varastoitua+DNA:ta.Johtopäätelmä:+Solu+kykenee+muokkaamaan+DNA:ta+monin+eri+tavoin+joko+yhdistelemällä+jaksoja+tai+korjaamalla+jo+vaurioituneita+jaksoja.+DNA+on+solulle+passiivista+tietovarantoa,+jota+se+käyttää+rakentaakseen+toiminnallisia+RNA-molekyylejä.+DNA:n+passiivisesta+luonteesta+johtuen+solussa+ei+ole+mitään+turhaa+tai+tilkitsevää+DNA:ta,+vaan+kaikki+on+hyödyllistä.+Kyse+on+tietovarastosta,+poolista,+josta+solu+etsii+käyttötarkoitukseen+soveltuvia+jaksoja+useiden+ohjausmekanismien+avulla.+Mutaatiokuorma+on+niin+suurta,+että+solu+ei+kykene+kaikkia+virheitä+korjaamaan.+Epigeneettisten+mekanismien+häiriöt+ja+heikentynyt+toimintakyky+johtavat+siihen,+että+solu+ei+kykene+ryhmittelemään+vaurioitunutta+DNA:ta+kromosomien+päihin+telomeereihin.+Kromosomit+yhdistyvät+ja+niiden+kokonaismäärä+laskee.https://dornsife.usc.edu/news/stories/2830/cells-send-damaged-junk-dna-to-the-emergency-room-for-repair/
  4. https://www.rt.com/news/175844-human-genome-junk-dna/Ja+vielä+2017+julkaistiin+tutkimuksia,+joiden+mukaan+75%+ihmisen+genomista+on+roskaa.Nykytutkimuksen+mukaan+ei+ole+roska-dna:ta,+koska+DNA+on+passiivista,+mutta+dynaamista+informaatiota.+Tämäkin+asia+on+käyty+läpi+varmaan+kymmeniä+kertoja+tässä+ryhmässä,+mutta+kekek-kekek+kyselee+aina+vaan+samoja+asioita.+Onko+oppimiskyvyssäsi+ongelmia?