solon1

Vapaa kuvaus

Aloituksia

273

Kommenttia

2386

  1. En+oikein+jaksa+ymmärtää,+että+miksi+te+lähdette+toistuvasti+mukaan+tällaiseen+jankkaukseen.+Kun+itse+huomasin+kenestä+kirjoittajasta+on+kyse,+jätin+suosiolla+keskustelun+siihen+paikkaan.+Hänellähän+on+tapana+tehdä+abstrakteja+ja+monitulkintaisia+väitteitä+ja+kysymyksiä,+jotka+muut+kirjoittajat+luonnollisesti+oletettavat+koskevan+konkreettisesti+käsillä+olevaa+asiaa.+Keskustelu+etetenee+siitä+sitten+aina+samalla+kaavalla,+eli+toiset+argumentoivat+sen+todellisen+aiheen+ja+todellisuuden+havaintojen+mukaan,+ja+kyseinen+kirjoittaja+sen+puolesta+mitä+hän+juuri+itse+on+milläkin+asialla+tarkoittanut.+Jos+keskustelun+aiheena+olisi+vaikkapa+varallisuuden+kasvu,+niin+toinen+voisi+kertoa+kuinka+hänen+varallisuutensa+on+esim.+kymmenkertaistunut+viimeisen+50+vuoden+aikana,+mutta+kyseinen+kirjoittaja+voisi+esittää+että+kokonaisvarallisuus+on+varmasti+pienetynyt.+Reaalimaailmassa+olisi+helppoa+todeta,+että+varallisuus+on+kasvanut,+mutta+kyseisen+kirjoittaja+olikin+tarkoittanut,+että+henkilö+on+varmasti+kuluttanut+kyseisenä+aikana+varallisuuttaan+kokonaisuutena+enemmän,+kuin+sen+yhteenlaskettu+rahallinen+arvo+juuri+tällä+hetkellä+on,+puhumattakaan+siitä+mitä+se+lähtötilanteessa+oli.+Keskustelusta+ei+tule+hedelmällistä.En+ole+aivan+varma+tekeekö+kyseinen+kirjoittaja+tätä+täysin+tahallaan,+mutta+hänen+kanssaan+keskustelussa+sillä+ei+näytä+olevan+merkitystä+mikä+on+itse+asian+kannalta+todellisuudessa+tärkeää,+vaan+vain+se+hänen+oma+näkemyksensä+merkitsee.+Tämä+avaus+koski+sitä+miten+geneettinen+informaatio,+eli+se+organismin+geneettinen+muuntelupotentiaali,+joka+on+geneettisen+koodin+emäsjärjestyksessä,+voi+kvalitatiivisesti+kasvaa.+Osoitin+tämän+esittelemällä+erilaisia+mekanismeja+toimintaperiaatteineen,+jotka+rakentavat+uusia+tominnallisia+rakenteita,+eli+lisäävät+sitä+geneettistä+muuntelupotentiaalia.+Tästä+lähtökohdasta+on+jokseenkin+yhdentekevää+edes+keskustella+siitä,+että+voimmeko+joillain+määritelmillä+esittää+erilaisia+näkemyksiä+geneettisen+informaation+kokonaismäärästä.Ei+minulla+ole+minkäänlaisia+valtuuksia+rajoittaa+keskustelua,+enkä+sitä+edes+halua,+mutta+ketjujen+muuttuminen+lukukelvottomaksi+jankkaukseksi+voi+joissain+tilanteissä+turhauttaa.+Onnekseni+tässä+ketjussa+asiani+oli+lähinnä+avauksessa,+eikä+se+hukkunut+keskelle+loputonta+jankkausta,+kuten+monille+kirjoittajille+on+varmasti+käynyt+muissa+ketjuissa.
  2. Lähteet:[1]+ks.+James+V.+Kohl[2]+https://www.topuniversities.com/university-rankings/university-subject-rankings/2016/biological-sciences[3]+https://en.wikipedia.org/wiki/Günter_P._Wagner[4]+http://campuspress.yale.edu/wagner/publications/[5]+http://www.nature.com/articles/s41559-017-0072[6]+https://fi.wikipedia.org/wiki/Tiedejulkaisu#Artikkelit
  3. ROT+väittää,+että+kirjoitan+pelkkää+pseudotieteellistä+potaskaa,+joka+ei+edusta+vakavasti+otettavien+tutkijoiden+moderneja+näkemyksiä.+Jokainen+biologiaa+oikeasti+edes+jollain+tasolla+ymmärtävä+toki+näkee,+ettei+tämä+väite+pidä+paikkaansa,+mutta+eteen+tuli+niin+mehukas+tilanne+omahyväisesti+pönkittää+omaa+egoani,+että+käytän+sen+röyhkeästi+hyödykseni+vetoamalla+auktoriteetteihin.Kyseinen+kirjoittaja+ei+ole+koskaan+suostunut+yksilöimään+niitä+vakavasti+otettavia+tutkijoita,+mutta+ainakin+niihin+aiemmin+kuului+mitä+ilmeisemmin+eräs+laboratorioteknikko[1],+joka+ei+ole+julkaissut+yhtäkään+vertaisarvioiutua+artikkelia+epigenetiikasta+ja+geenien+säätelyverkostoista.+Hänen+mielestään+Günter+P.+Wagner+ei+varmastikaan+kuulu+noihin+tutkijoihin,+mutta+tutustutaanpa+herraan+hiukan.+Hän+johtaa+yhdessä+maailman+arvostetuimmassa+biologian+tutkimustyötä+tekevässä+yliopistossa+(Yale)+ekologian+ja+evoluutiobiologian+osastoa+ja+omaa+nimeään+kantavaa+laboratoriota.+Wagner+on+geneetikko+ja+evoluutiobiologi,+ja+yksi+maailman+johtavia+tutkijoita+uusien+toimintojen+ja+rakenteiden+evoluution+tutkimuksessa+evolutiivisen+kehitysbiologian+saralla.+Tämän+palkitun+tutkijan+laboratorion+pääpaino+on+geenien+säätelyverkostojen+tutkimuksessa+ja+evoluutiossa.+Hän+on+tutkinut+epigeneettistä+säätelyä+osana+tuota+säätelyverkostoa+90-luvun+alusta+saakka.+[2,3,4]Wagnerilta+ilmestyi+muutama+päivä+sitten+katsausartikkeli*+maailman+arvostetuimmassa+tiedejulkaisussa,+Naturessa,+jossa+hän+kuvaa+tämän+hetken+parasta+ymmärrystä+uusien+toiminnallisten+rakenteiden+evoluutiosta.+Silmiinpistävää+tuossa+artikkelissa+oli+se,+että+siinä+käsiteltiin+kyseistä+aihetta+juuri+samasta+näkökulmasta+ja+samoja+mekanismeja+painottaen+kuin+minä+tässä+avauksessa,+tosin+luonnollisesti+vielä+tarkemmin+ja+asiantuntevammin.+Tämän+voi+jokainen+todeta+itse+vertaamalla+tätä+avausta+kyseiseen+artikkeliin.[5]+Todellisuudessahan+jokainen+palstan+lukija+tietää,+ettei+sellaisia+vakavasti+otettavia+tutkijoita+ole+olemassa,+jotka+tukisivat+ROTin+näkemystä+evoluution+mekanismien+puuttumisesta+ja+epigeneettisen+säätelyn+autuaaksi+tekevästä+voimasta,+koska+hänen+käyttämänsä+tieteelliset+lähteet+poikkeuksetta+kumoavat+hänen+omat+johtopäätökset.+Evoluutiolla+todellakin+on+mekanismeja,+vaikka+ROT+kuinka+vääristelisi+väärinymmärtämiään+tekstejä+päivittäin+hamaan+loppuun+saakka.Pahoittelen+omahyväistä+kirjoitusta,+mutta+itselleni+merkitsee+aika+paljon,+että+oppi+on+mennyt+perille+ja+muodostamani+käsitys+kokonaisuuksista+vastaa+hyvin+maailman+johtaviin+tutkijoihin+kuuluvan+henkilön+näkemystä+aiheesta.*Review on+laaja,+tavallisesti+useiden+kymmenien+sivujen+mittainen+artikkeli,+jossa+joku+arvostettu+tutkija+tekee+tavallisesti+tiedelehden+toimituksen+pyynnöstä+(invited+review)+yhteenvedon+edustamansa+tutkimusalan+tuloksista.+Review-artikkelit+eivät+esittele+uutta+tietoa+vaan+tarjoavat+tehokkaan+tietopaketin,+jonka+perusteella+on+mahdollista+saada+kuva+koko+alasta+ja+sen+kehityksestä.[6]
  4. ”Eksyttäjä+ja+valehtelija!+Sammakko+on+tetraploidi+eli+sillä+on+neljä+kertaa+enemmän+kromosomeja+kuin+esim.+nisäkkäillä.”Jos+ymmärtäisit+genetiikasta+yhtään+mitään,+tajuaisit+ettei+lauseessasi+ole+mitään+järkeä.+Suurimmalla+osalla+sammakoista+on+diploidinen+kromosomisto+ja+vaihtelu+on+välillä+18-36+kromosomia.+Afrikankynsisammakon+allotetraploidinen+kromosomisto+on+syntynyt+hybridisaation+seurauksena,+ja+sinä+pyysit+esimerkkiä+siitä,+että+kromosomeja+tulee+eliöön+lisää+siten,+ettei+se+johda+sairauteen.+Sait+jälleen+kerran+sellaisen.+Tietenkin+sammakoiden+ja+nisäkkäiden+kromosomeista+löytyy+yhteisiä+konservotuneita+segmenttejä,+mutta+en+ymmärrä+mitä+ihmettä+tarkoittaa,+että+tietyllä+tetraploidilla+sammakolla+olisi+neljä+kertaa+enemmän+kromosomeja+kuin+nisäkkäillä?+Istukkanisäkkäiden+kromosomimäärä+vaihtelee+välillä+6-112,+vaikka+niiden+yhteisen+kantamuodon+karyotyyppi+on+ollut+välillä+44-50.+[1]+”Tuossakin+esimerkissä+geenihäviö+johti+kromosomaaliseen+materiaalin+uudelleenjärjestelyyn.”Tämä+on+täysin+järjetön+harhakuvitelma,+jonka+olet+kehittänyt+vaihtoehtoisessa+todellisuudessasi,+ja+kyseinen+sammakko+on+vieläpä+elinvoimainen+ja+pelkästään+lihansyöjä,+joten+sekoilusi+kaikkiruokaisuuteen+ajautumisesta+kumoutuu+samalla.+Sinä+olet+todistetusti+eksyttäjä+ja+valehtelija.[1]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4031395/
  5. "Näytä,+että+kromosomeja+tulee+eliöön+lisää+siten+että+se+ei+johda+sairauteen."Ei+kukaan+jaksa+enää+sinun+pelleilyäsi+ja+denialistista+juoksuttamistasi.+Sinulle+on+näytetty+sekä+lukuisia+fissiotapahtumia+että+koko+genomin+duplikaatioista+seuranneita+polyploidisia+kromosomistoja.+Tässä+esim.+sammakko,+jonka+kromosomimäärä+on+2n = 36,+kun+sitä+vanhemmilla+sukulaislajeilla+kromosomimäärä++on+2n = 20.http://www.nature.com/nature/journal/v538/n7625/full/nature19840.html
  6. Olet+luonut+oman+vaihtoehtoisen+biologian,+onneksi+olkoon!+Viestisi+on+yhtä+sekasotkua+ja+argumentaatiovirhettä+höystettynä+biologian+terminologialla.
  7. Avauksessasi+ei+ole+oikeastaan+mitään+järkeä.+Olet+niin+pihalla+kaikesta,+etkä+ota+opiksesi+mistään,+ettei+pitkien+ja+asiallisten+vastausten+antamisesta+ole+mitään+hyötyä.+”Palstan+pahin+eksyttäjä+solon1+esitteli+useita+pseudotieteellisiä+lähteitä,+joiden+mukaan+evoluutio+lisäisi+rakenteellista+ja+toiminnallista+monimutkaisuutta+geneettisen+uudelleenjärjestelyn+seurauksena.”Jos+esim.+Nature,+Science,+PNAS+ja+Cell,+jotka+ovat+kaikki+kuuden+maailman+arvostetuimman+ja+siteeratuimman+tiedejulkaisun+joukossa,+ovat+mielestäsi+pseudotieteellisiä+lähteitä,+niin+mistä+niitä+oikeita+lähteitä+sitten+löytää?++”Massiivisesta+geenihäviöstä+johtuvat+koko+genomin+duplikaatiot+olivat+erittäin+tärkeitä+evolutiivisia+tapahtumia.”Kai+tässä+on+kyse+ajatuskatkoksesta,+sillä+ethän+sinäkään+mitään+näin+tyhmää+voisi+kirjoittaa,+ethän?+Todellisuudessa+tuo+menee+tietenkin+toisinpäin.+Koko+genomin+duplikaatiota+seuraa+yleensä+miljoonien+vuosien+kuluessa+tapahtuvaa+voimakasta+uudelleen+organisoitumista,+jolloin+hyödyttömistä+duplikaateista+voi+suurin+osa+kadota.+http://www.pnas.org/content/112/48/14918.full.pdfKun+olet+väärinkäsittänyt+ja+sekoittanut+mielessäsi+taas+kaiken,+niin+lukaisepa+mitä+nuo+otsikossasi+mainitut+asiat+oikeasti+tarkoittavat.https://en.wikipedia.org/wiki/Neofunctionalizationhttps://en.wikipedia.org/wiki/SubfunctionalizationMinulla+oli+kyllä+tarkoitus+kirjoittaa+myös+geenihäviöiden+kautta+tapahtuvasta+evoluutiosta+omassa+avauksessani,+mutta+en+sitten+enää+jaksanut.+Se+todellakin+on+yksi+mekanismi+evoluutiolle,+vaikka+sinä+et+sitä+ymmärrä.+Morfologisia+muutoksia,+joihin+geenihäviöt+ovat+vaikuttaaneet,+ovat+esim.+käärmeiden+ja+valaiden+jalkojen+surkastumiset,+luolakalojen+silmät,+merineulojen+erikoiset+rakenteet+jne.+Siinä+olet+oikeassa,+että+genomi+”pyrkii”+energiatehokuuteen,+ja+tästä+syystä+vaikkapa+ihmisillä+ei+toimi+enää+geenit+munan+ruskuaisen+tai+C-vitamiinin+tuottamiseen,+koska+molemmat+ovat,+tosin+eri+syistä,+ihmiselle+nykyisin+tarpeettomia+ja+energian+tuhlausta,+vaikka+ne+genomista+on+edelleen+tunnistettavissa.+Olemassaolostammekin+saamme+kiittää+geenihäviötä,+koska+voimakkaamman+ja+suuremman+leukalihakstiston+kasvusta+vastannut+geeni+on+meillä+rikkoutunut,+toisin+kuin+muilla+ihmisapinoilla,+ja+se+osaltaan+mahdollisti+suurempien+aivojen+kehityksen.Evoluutiota+tapahtuu+siis+sekä+lisäämällä+ja+muuttamalla+että+poistamalla,+koska+kaikilla+on+vaikutksensa+fenotyypin+muutoksiin+ja+näin+ollen+luonnonvalinnan+alaiseen+sopeutumiseen+muuttuvissa+elinolosuhteissa.
  8. ”Millä+taas+jatkoit,+kummallisesti+kaikki+lähteet+puuttuivat:”Olisihan+tuohon+kappaleeseen+voinut+tosiaan+lisätä+lähteitä,+kun+ei+voi+olettaa,+että+uusien+geenien+syntytavat+olisivat+kaikille+ennestään+tuttuja.+Tässä+on+esitelty+11+erilaista+syntytapaa.http://www.nature.com/nrg/journal/v14/n9/box/nrg3521_BX1.html”Jotain+on,+jolle+jotain+tapahtuu:+Duplikaatio+on+kahdentumista,+siirto+on+siirtoa,+sekoittuminen+on+sekoittumista,+eivätkä+"lisää+biologista+informaatiota".”Lopetit+lainauksen+siihen+kohtaan,+jonka+jälleen+kerroin+miten+informaatio+lisääntyy+millä+tahansa+kriteerillä+mitattuna.+Yritän+selventää+kirjoittamaani+käyttämällä+analogiana+moottorin+virittämistä,+vaikka+se+onkin+osittain+virheellinen+analogia.+Moottoria+voidaan+virittää+muokkaamalla+vanhoja+rakenteita,+kuten+säätämällä+sytytystä,+suurentamalla+iskutilavuutta,+nostamalla+puristussuhdetta+tai+vaikka+jyrkentämällä+nokka-akselia.+Jos+tämä+ei+riitä,+voidaan+jälkikäteen+asentaa+turboahdin+ja+vaikka+ilokaasujärjestelmä,+jotka+vaativat+muokkausta+myös+jo+olemassa+olevissa+järjestelmissä.”Samalla+tavalla"+evoluutio+muokkaa+jo+olemassa+olevia+rakenteita,+jotka+”hienosäätävät”+toimintoja+ja+auttavat+sopetumaan+muuttuviin+olosuhteisiin,+mutta+aina+välillä+evoluutio+”lisää”+myös+täysin+uusia+rakenteita.+Ja+avauksessani+kerroin+lähteineen,+kuinka+nämä+uudet+rakenteet+ovat+syntyneet.+Jos+tämä+selvennys+ei+riitä,+niin+voisitko+kertoa+miten+ymmärrät+geneettisen+infrormaation+ja+mikä+olisi+sinusta+riittävä+esimerkki+sen+lisääntymisestä?
  9. Asia+on+juuri+näin.+Ja+jotta+ROT+ei+kuitenkaan+jäisi+siihen+kuvitelmaan+ettei+meillä+olisi+vastauksia,+niin+tässä+ne+ovat.https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-016-3064-9http://www.pnas.org/content/113/20/E2784.fullhttp://jcb.rupress.org/content/194/2/165Tuossakaan+bakteerissa+ei+ole+yhtään+mitään+mystistä.
  10. Koska+kreationistit+eivät+ymmärrä+geneettisen+informaation+luonnetta,+jätin+rekombinaation+avauksessa+sivuun+ja+esittelin+sellaisia+mekanismeja,+joissa+informaatio+täysin+selvästi+lisääntyy.+Etkö+lukenut+avausta?
  11. "No+ottakaahan+rauhallisesti..."Vähättelystäsi+huolimatta+et+kyennyt+kuin+sanahelinään,+ad+hominem+arumentaatioon+ja+valehteluun+ilman+yhtäkään+todellista+vasta-argumenttia.
  12. Lähteet:[1]+http://keskustelu.suomi24.fi/t/14776869/ainoa-tieteellinen-tapa-todistaa-evoluutioteoria[2]+https://fi.wikipedia.org/wiki/Rekombinaatio[3]+http://www.nature.com/articles/ncomms10397[4]+http://www.pnas.org/content/111/16/5932.full[5]+http://genome.cshlp.org/content/24/11/1830.full[6]+https://www.researchgate.net/publication/232535356_Real-Time_Evolution_of_New_Genes_by_Innovation_Amplification_and_Divergence[7]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4391638/[8]+http://rstb.royalsocietypublishing.org/content/370/1678/20140332[9]+https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12862-016-0683-3[10]+http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1534580715005195[11]+http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(14)01105-X[12]+http://genome.cshlp.org/content/24/12/1977.full?sid=15dc3aee-f01f-46fd-a051-0ab57f7340f1[13]+http://www.nature.com/articles/s41559-017-0093[14]+http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/evo.12684/full[15]+http://www.pnas.org/content/112/3/803.full[16]+https://en.wikipedia.org/wiki/Nearly_neutral_theory_of_molecular_evolution
  13. Uusien+rakenteiden+syntyyn+ei+kuitenkaan+aina+tarvita+uusia+geenejä,+vaan+yleisempi+mekanismi+on+konservoituneiden+säätelyaluiden+ja+muiden+geneettisten+elementtien+muuntelun+aiheuttamat+muutokset+geeniverkostojen+ilmentymisen+säätelyssä+alkionkehityksen+eri+vaiheissa.+Banaanikärpäselle+(D.melanogaster)+ja+yhdelle+sen+alaryhmälle+(D.yakuba)+on+kehittynyt+täysin+uusi+ulkoinen+genitaalirakenne,+josta+löytyy+eri+haaroista+useita+erilaisia+variaatioita.+Koukkumaisen+ulokkeen+funktio+on+ohjata+parittelun+aikana+sukuelimet+oikein+tarraamalla+peräpään+rakenteisiin.+Rakenne+on+kehittynyt+HOX-geeni+Abd-B:n+säätelemän+geeniverkoston,+jolla+on+useita+toimintoja+alkionkehityksen+eri+vaiheissa,+lukuisista+geneettisistä+muutoksista+eri+transkriptiotekijöiden+sitoutumiskohdissa+sekä+promoottori-+että+vahvistaja-alueilla.+Tässä+evoluutio+on+“hyödyntänyt”+jo+olemassa+olevan+geneettisen+säätelyverkoston+komponentteja,+mikä+on+mahdollistanut+uuden+toiminnallisen+rakenteen+synnyn.[10]Palstalla+juuri+tällä+hetkellä+kovan+keskustelun+alla+olevat+transposoituvat+elementit+voivat+tarjota+alustan+suurille+toiminnallisille+rakennemuutoksille.+Istukallisten+nisäkkäiden+evoluutiossa+niillä+on+ollut+ratkaiseva+rooli,+kun+tuhansia+toisten+elinten+ja+kudosten+kehityksestä+vastanneita+promoottori-+ja+vahvistaja-alueita+cis-säätelyelementteineen+on+siirtynyt+kopioina+toisiin+kohtiin+genomia.+Nämä+ovat+synnyttäneet+uusia+geenien+ilmentymisen+säätelyverkostoja,+jotka+ovat+saaneet+aikaan+muun+muassa+äiti-sikiö+signaalivuorovaikutuksen,+sikiön+immuunitoleranssin,+solutyypin+identiteetin+muodostumisen+desidualisaatiossa,+jossa+kohdun+limakalvo+rakentuu+raskaudenajan+katokalvoksi+ja+useita+muita+kohdun+kehitykseen+ja+raskauteen+liittyviä+tekijöitä.[11]+Suunniteltua+mekanismia+tästä+ei+saa+tekemälläkään,+koska+transposonit+voivat+jopa+“huijata”+niiden+liikkumista+vastaan+kehittyneitä+PIWI-+ja+KRAB-sinkkisormiproteiineja+tuottamalla+piRNA:ksi+“naamioitua”+lncRNA:ta,+jotta+ainakin+osa+elementistä+pysyisi+mobiilina.[12]Aivan+samalla+tavoin+erilaiset+tunnetut+siirtymät+uusien+taksonien+synnyssä+ovat+olleet+pitkälle+erilaisten+geneettisten+elementtien+ja+säätelyverkostojen+uudelleen+organisoitumisia.+Esim.+nisäkkäiden+välikorvan+kuuloluut+ovat+kehittyneet+matelijoiden+yhdestä+kuuloluusta+TGF-β+-kasvutekijää+koodaavan+geenin+säätelysignaalien+muutoksista.[13]+Lintujen+nokka+on+kehittynyt+puolestaan+matelijoiden+kuonosta+geenien+ilmentymistä+alkionkehityksessä+säätelevien+verkostojen+muutoksista.[14].+Maalle+siirtyneiden+tetrapodien+raajat+kehittyivät+evistä+HOX-geeniklustereiden+ohjaamien+säätelyelementtien+muutoksista.[15]+Listaa+voisi+jatkaa+vaikka+kuinka+pitkään,+mutta+sen+perimmäisen+periaatteen+luulisi+tulleen+jo+selväksi,+eli+evoluutio+“hyödyntää”+suurelta+osin+jo+olemassa+olevia+rakenteita+ja+säätelyverkostoja.+Pyörää+ei+tarvitse+keksiä+joka+kerta+uudestaan.Evoluutiolla+on+lukuisia+muitakin+mekanismeja,+mutta+en+jaksa+tähän+hätään+enempää+kirjoittaa.+Esittelemäni+tapaukset+kuitenkin+osoittavat+jo+useita+erilaisia+mekanismeja,+jotka+kuvaavat+ROTin+vaatimaa+rakenteellisen+ja+toiminnallisen+monimutkaisuuden+lisääntymistä.+ROTille+tiedoksi,+että+käytännössä+kaikissa+esimerkeissäni+myös+epigeneettisillä+säätelytekijöillä+on+ollut+suurempi+tai+pienempi+roolinsa,+mutta+epigeneettinen+säätely+ei+ole+ainoa+säätelyn+muoto,+vaikka+sitä+tutkitaankin+yhä+enemmän+cis-säätelyn+rinnalla,+eikä+se+yksinään+kykene+selittämään+kuin+pienen+osan+erilaisista+fenotyypin+variaatioista.
  14. Aina+välillä+on+hyvä+pitää+taukoa+:)+Eipä+tuohon+loppuun+ole+paljon+mitään+lisättävää.
  15. "Loistavia+kommentteja+-+olet+selvästikin+perehtynyt+aiheeseen+syvällisesti.+Oletko+mahdollisesti+biologi+ammatiltasi+-+jos+sopii+kysyä?"Ammatiltani+olen+juristi,+mutta+pitkäaikaisen+kiinnostuksen+ja+intohimon+luonnontieteitä+kohtaan+ajamana+päädyin+muutama+vuosi+sitten+opiskelemaan+biologiaa.+LuK-tutkinnon+sain+suoritettua+viime+syksynä+ja+maisteriohjelmassa+keskityn+pääasiassa+molekyyligenetiikkaan.
  16. Lähteet:[1]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4627079/[2]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5137436/[3]+https://en.wikipedia.org/wiki/Thymine-DNA_glycosylase[4]+http://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(11)00482-X?_returnURL=http://linkinghub.elsevier.com/retrieve/pii/S009286741100482X?showall=true[5]+https://en.wikipedia.org/wiki/CpG_site[6]+https://en.wikipedia.org/wiki/Epigenetics#Medicine[7]+https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_methylation[8]+https://en.wikipedia.org/wiki/DNA_methyltransferase#Mammalian[9]+http://journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0028104[10]+https://www.researchgate.net/publication/232535356_Real-Time_Evolution_of_New_Genes_by_Innovation_Amplification_and_Divergence[11]+http://genome.cshlp.org/content/24/11/1830[12]+http://www.pnas.org/content/111/16/5932.full[13]+http://www.pnas.org/content/107/50/21593.full[14]+http://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1004884[15]+http://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(14)01105-X
  17. Jatkan+aihetta+hiukan+tässä+ketjussa,+koska+utti+on+tehnyt+hyvää+työtä,+enkä+halua+turhaa+nostaa+ROTin+aiheesta+tekemiä+höpinöitä+enempää+esille.+Aloitetaan+sytosiinin+spontaanista+deaminaatiosta,+jonka+ROT+väittää+olevan+suunniteltu+mekanismi,+koska+jos+kyseessä+on+metyloitunut+emäs,+eivät+glykosylaasientsyymit+pyri+hänen+mukaansa+korjaamaan+syntyvää+emäsparivirhettä.+Tämä+ei+pidä+paikkaansa,+koska+tymiini-DNA-glykosylaasi+on+kehittynyt+ennaltaehkäisemään+C>T+transitiota,+joka+voi+syntyä+GT-emäsparivirheen+seurauksena,+pyrkimällä+poistamaan+tymiini+jo+tässä+vaiheessa.+[1,2,3]+Mitä+järkeä+olisi+suunnitella+mekanismi,+joka+pyrkii+estämään+oman+toimintansa?+CG-dinukleotidien+muodostamien+toistojaksojen+luonteesta+johtuen+tymiinin+poisto+ei+ole+nisäkkäillä+yhtä+tehokas,+kuin+jotkin+toiset+emäksen+korjaukset.+CpG-saarekkeissa+ei+ole+mitään+suunnitelmallisuutta+havaittavissa,+vaan+ne+ovat+ymmärrettävissä+evoluutiohistorian+kautta.+[4,5]Yiipäätään+tämä+epigeneettisten+tekijöiden+ylikorostaminen+muka+suunniteltuina+mekanismeina+on+vailla+minkäänlaista+pohjaa.+Noilla+tekijöillä+on+merkittävä+roolinsa+hyvin+monenlaisissa+tapahtumissa,+joista+ROT+korostaa+aina+vain+niiden+”positiivisia”+vaikutuksia+ja+samalla+syyttää+DNA-sekvenessejä+kaikesta+”negatiivisesta”,+vaikka+todellisuudessa+kyse+on+niiden+yhteistoiminnasta+ja+ennemminkin+usein+toisinpäin,+esim.+lukemattomat+sairaudet+johtuvat+epigeneettisen+säätelyn+virheistä.+[6]Pureudutaan+sitten+vielä+syvemmälle+ROTin+väitteiden+taustalle.+Tärkein+epigeneettinen+säätelymekanismi+on+DNA-metylaatio,+jossa+DNA-metyylitranferaasientsyymit+katalysoivat+metyyliryhmien+siirtoa+nukleotidin+emäksiin+(eukaryooteilla+käytännössä+sytosiiniin).+[7]+Ihmisillä,+kuten+muillakin+nisäkkäillä,+on+kolme+erilaista+aktiivista+DNA-metyylitransferaasia,+jotka+ovat+DNMT1,+DNMT3A+ja+DNMT3B.+[8]+Näiden+alkuperä+on+DNMT2-geenissä,+joka+koodaa+RNA-metyylitransferaasia.+DNMT1,+DNMT3A+ja+DNMT3B+ovat+siis+syntyneet+kyseisen+geenin+duplikaattien+mutatoitumisen+seurauksena.+Tästä+voimme+tehdä+vain+sen+johtopäätöksen+ettei+DNA-metylaation+taustalla+ole+ihmisillä+suunnittelua,+vaan+pääosin+satunnaisia+mutaatioita+ja+luonnonvalintaa.+[9]++Tässä+vaiheessa+ROT+todennäköisesti+kiistää+duplikaattien+evoluution+mahdollistavan+mekanismin+olemassaolon,+mutta+todellisuudessa+niitä+on+löydetty+jo+useampia.+[10,11,12]+Ja+viimeisenä+parkaisuna+kuuluu+yleensä+se+väite,+että+vaikka+mutaatioita+tapahtuu,+eivät+ne+kuitenkaan+voi+lisätä+geneettistä+informaatioita,+mutta+tämä+ei+tietenkään+yksinkertaisesti+pidä+paikkaansa.+[13,14,15]
  18. "Evoluutioteoria+on+aikamme+suurin+valhe."Mutta+eihän+tälläkään+kirjoituksella+ole+oikeastaan+mitään+tekemistä+evoluutiotoerian+kanssa.+Avauksesi+käsittelee+solufysiologian,+kehitysbiologian+ja+genetiikan+aivan+perusteita,+ja+sinä+kuvittelet+niissä+taas+olevan+jotain+ihmeellistä+salattua+tietoa.+En+edes+jaksa+puuttua+asiavirheisiin.+https://en.wikipedia.org/wiki/Cellular_differentiationhttps://en.wikipedia.org/wiki/Epigenetics_in_stem-cell_differentiation
  19. Älä+sinä+vaivaa+päätäsi+näillä+asioilla.
  20. "Jokainen+voi+nyt+päätellä,+ovatko+geenisekvenssit+syynä+turkin+väriin+ja+kuviointiin."Tietenkin+ovat,+mutta+epigeneettiset+modifikaatiot+voivat+säädellä+joissain+tapauksissa+turkin+väriin+vaikuttavia+koodaavia+geenejä,+jolloin+erilaisia+fenotyyppejä+voi+ilmaantua.+Kukaan+ei+ole+tätä+ikinä+kieltänyt+ja+kaikille+on+selvää,+että+geenejä+säädellään+usealla+eri+tavalla.+Edellisen+aloituksen+raitojen+taustalla+oli+kuitenkin+erilainen+säätely+johtuen+mutaatioista+säätelyalueella,+ja+tämä+selvisi+siitä+tutkimuksesta.http://www.nature.com/articles/nature20109.epdf?referrer_access_token=Ed3SQZZDhbeL3wqjbgbBBtRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0P1lfwspCMgNC7WTXQPjtal3rGYIzcrwpygD1S3SfF_dj_g7ZXlzILTmkuoCDLzmikSA4ulr3aDz4nhsYjxfU_Tar4OEj3KHW7-w_zGtbaJ1TCDhs3yB484oRyV4r6SJMgLfITsOg-ng-rOjjHBnw7V1II6RMXkYQQJK_RTSV2QlqDExvnz32Lab2zL93xfbQi2L-5edlc3sR8bQBH-0K37dZjzGYEHtbEfB8y1NEkLIw==&tracking_referrer=www.the-scientist.comMitä+sinä+yrität+tarkalleen+ottaen+argumentoida?
    21. 12 / 120
TietosuojaselosteKäyttöehdotEvästeasetuksetSäännöt