solon1

Vapaa kuvaus

Aloituksia

273

Kommenttia

2386

  1. ”Tutkijat+ovat+havainneet+Galapagossaarten+sirkkuja+tutkiessaan,+että+lajiutuminen+voi+tapahtua+hämmästyttävän+nopeasti,+eli+jopa+parissa+sukupolvessa.+Havainto+vahvistaa+kaiken,+mistä+olen+kirjoittanut+tällä+palstalla+viimeisen+parin+vuoden+aikana.”Havainto+ei+liity+oikeastaan+millään+tavoin+parin+viimeisen+vuoden+aikana+kirjoittamaasi.+Epigeneettisten+markkeidein+variaatiot+voivat+kyllä+olla+luonnonvalinnan+kohteena+ja+olla+joissain+tapauksissa+laukaiseva+tekijä+lajiutumisprosessissa+[1],+mutta+tästä+ei+nyt+ollut+kyse.+Tässä+tapauksessa+kyse+oli+homoploidisesta+hypridilajiutumisesta,+jossa+kahden+lajin+risteymästä+syntyy+elinvoimainen+populaatio,+joka+ei+enää+risteydy+kantalajiensa+kanssa+ja+johtaa+uuden+lajin+syntyyn.+Uutta+tässä+oli+oikeastaan+vain+se,+että+nyt+tutkijat+ovat+olleet+havainnoimassa+koko+prosessin+ensimmäisistä+yksilöistä+lähtien.[1]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26837057Homoploidiassa+määritelmällisesti+tuman+kromosomimäärä+ei+kasva,+toisin+kuin+polypoidiassa,+vaikka+todellisuudessa+homoploidisessa+hypridilajitumisessa+on+havaittu+myös+yksittäisiä+kromosomien+fissioita+ja+fuusiota+[2].+Lisääntymisisolaatio+johtuu+näissä+tapauksissa+meioottisessa+rekombinaatiossa+syntyneen+mosaiikkiperimän+vaikutuksesta+esim.+pariutumiskäyttäytymiseen,+ja+joissain+tapauksissa+kromosomien+segregaation+muutoksista,+jota+tietenkin+epigeneettiset+tekijät+osaltaan+kontrolloivat.[2]+http://rspb.royalsocietypublishing.org/content/282/1807/20150157Vaikka+tällainen+lajiutuminen+ei+ole+eläimilläkään+aivan+niin+harvinainen+kuin+joskus+oletettiin+[3],+niin+silti+se+on+selkärankaisilla+melko+poikkeuksellista,+varsinkin+maanisäkkäiden+osalta.+Hypridejä+kyllä+syntyy,+mutta+vaikka+ne+eivät+olisikaan+steriilejä,+niin+syntyneistä+yksilöistä+kehittyy+varsin+harvoin+uusi+elinvoimainen+populaatio.+Sen+lisäksi+ettet+ole+tällaisesta+lajiutumisesta+ikinä+kirjoittanut+riviäkään,+ei+se+edes+harvinaisuudestaan+johtuen+mitenkään+selitä+tai+tue+väitettyä+nopeaa+biodiversiteetin+syntyä.[3]+https://www.nature.com/articles/hdy20177”Evoluutiolle+ei+kuitenkaan+ole+olemassa+ainuttakaan+mekanismia,+koska+kaikki+eliöissä+tapahtuva+muutos+perustuu+olemassaolevaan+informaatioon+tai+sen+häviämiseen.”Unohditko+esim.+Nematostella+vectensisksen,+jonka+nematosomien+kehityksessä+ratkaisevassa+asemassa+olivat+avoimen+lukukehyksen+koodaavat+de+novo+geenit,+joille+ei+löydy+vastaavaa+sekvenssihomologiaa+mistään?+Ne+ovat++suoliliepeestä+eriytyviä+ja+muutamasta+solutyypistä+rakentuvia+vapaasti+ruoansulatusontelossa+liikkuvia+orgaanieja,+joilla+on+funktio+saaliin+tainnuttamisessa,+kehittyvän+alkion+suojaamisessa+ja+immuunijärjestelmässä+[4].+Eli+ne+ovat+uusia+toiminnallisia+rakenteita,+joiden+synty+ei+perustu+suoraan+olemassa+olevan+informaation+muokkaukseen+tai+informaation+häviämiseen.Lainaus:+”Since+nematosomes+are+restricted+only+to+the+genus+Nematostella+(i.e.,+they+have+no+phylogenetic+homologs)+and+they+are+found+only+in+adult+polyps+(i.e.,+they+have+no+serial+homologs),+these+unique+structures+are+an+unequivocal+example+of+a+phenotypic/tissue-level+novelty+[36, 37]...Despite+the+small+number+of+cell+types+they+contain,+nematosomes+are+distinct+among+tissues,+both+functionally+and+molecularly.”[4]+https://bmcevolbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12862-016-0683-3Todellisuudessa+evoluutio+on+prosessina+paljon+dynaamisempi+ja+kompleksisempi+kuin+vielä+muutamia+vuosikymmeniä+sitten+osattiin+aavistakaan,+ja+erilaisista+sopeutumiseen+ja+lajiutumiseen+johtavista+mekanismeista+on+pikemminkin+runsaudenpulaa.+Tiivistelmäsi+väitteitä+en+jaksa+yksityiskohtaisesti+kohta+kohdalta+käydä+lävitse,+koska+olen+niihin+jo+kymmeniä+kertoja+vastannut.
  2. ”MieIestäni+ROT+on+onnistunut+erinomaisesti+tieteellisen+kreationismin+puolestapuhujana+ja+myös+samalla+todistanut+solon1:n+valehtelijaksi.”Minua+ei+tässä+niinkään+haittaa+tai+kiinnosta+mitä+ROT+ja+JC+minusta+väittävät,+tai+se+onko+JC+edes+tosissaan,+mutta+nuo+psykologiset+manipulointiyritykset+ja+defenssimekanismien+aktivoituminen+näissä+keskuteluissa,+sekä+tällä+palstalla+että+globaalisti,+on+ilmiönä+hyvin+mielenkiintoinen.+Huolestuttavaa+on+se,+että+defenssit+ovat+hyvin+usein+patologisia+ja+kypsymätömiä+[1].[1]+https://en.wikipedia.org/wiki/Defence_mechanisms#Vaillant.27s_categorizationSe+on+tietenkin+selvää,+että+kognitiivisen+dissonassin+kokeminen+ja+emotionaalisesti+epämiellyttävät+kokemukset+sekä+maailmankuvaan+sopimattomat+representaatiot+pyritään+tiedostamatta+torjumaan,+mutta+silti+moni+asia+tässä+yhtälössä+näyttää+hyvin+uskomattomalta.+Toki+esim.+vahvistusvinouma,+ylivertaisuusvinouma+ja+muut+kognitiiviset+vinoumat+asiaa+selittävät,+mutta+silti+tuota+käytöstä+on+vaikeaa+ymmärtää.Kuvio+on+siis+hyvin+tuttu+evoluutio-kreationismi+depateista+aivan+maailmanlaajuisesti,+mutta+käytetään+nyt+Aaltoa+ja+JC:tä+esimerkkinä.+ROT+aloitti+hyvin+huterilla+biologian+perustiedoilla+lukea+James+Kohlin+kirjoituksia+muutama+vuosi+sitten,+jotka+tiedeyhteisö+on+pääpremisseiltään+todennut+yksimielisesti+virheellisiksi.+Kohlin+tekstien+inspiroimana+ROT+on+alkanut+etsiä+sitä+mallia+edes+näennäisesti+tukevia+artikkeleita,+joista+hän+on+rakentanut+hajanaisen+kuvan+solujen+ja+geenien+toiminnan+ja+säätelyn+yhteydestä+adaptoitumiseen.+Hänellä+ei+ole+käytännössä+juuri+mitään+käsitystä+esim.+ekologian+ja+evoluutiobiologian,+molekyylibiologian,+biokemian,+genetiikan,+kehitysbiologian+tai+ylipäätään+minkään+relevantin+tieteenalan+perusteista,+mutta+silti+hän+kuvittelee+olevansa+kyvykäs+liittämään+epigenetiikan+oikeaan+kontekstiin.+Todellisuudessahan+hän+käytännössä+romuttaa+koko+biologian+perustan+ja+keksii+omasta+päästänsä+pähkähulluja+mekanismeja+sille,+miten+epigeneettiset+mekanismit+muka+toimivat.+Asioista+edes+jollain+tasolla+perillä+olevalle+on+täysin+selvää,+ettei+hän+yksinkertaisesti+hallitse+mitään+kokonaisuuksia,+vaan+hänen+tietonsa+on+hyvin+hajanainen+ja+osin+virheellinen+kokoelma+erilaisia+tekijöitä+suppeasta+osasta+laajempaa+kokonaisuutta.+Itse+hän+ei+varmastikaan+tätä+ymmärrä.Ja+sitten+maailma+on+pullollaan+tällaisia+JC:n+kaltaisia+tapauksia,+jotka+eivät+itse+ymmärrä,+vaikka+toisin+kuvittelevat,+oikeastaan+mitään+käsiteltävistä+aiheista,+mutta+kokevat+silti+olevansa+päteviä+arvioimaan+toisen+”uskonveljen”+kirjoituksia+ja+näkemään+niiden+”oikeellisuus+ja+totuudellisuus”,+vaikka+niissä+ei+olisi+päätä+eikä+häntää.+He+eivät+itse+ymmärrä,+kuinka+koomiselta+tällainen+pukki+kaalimaan+vartijana+mentaliteetti+ulkopuolisille+näyttäytyy.
  3. ”Olet+jäänyt+kiinni+valehtelusta+eikä+sinulla+ole+ainuttakaan+todistetta+evoluutiosta.”Ei+niitä+sinun+unissasi+tapahtuneita+asioita+käsitellä+täällä.+Saat+toki+rauhassa+jatkaa+projisointia,+kun+se+on+varmastikin+hyväksi+estämään+psyykeesi+hajoamista.”Tiedät+varsin+hyvin,+että+kaikki+eliöissä+tapahtuvat+muutokset+perustuvat+pohjimmiltaan+olemassaolevan+biologisen+informaation+epigeneettiseen+säätelyyn+TAI+informaation+katoamiseen,+jolloin+eliön+solut+nerokkaasti+kytkevät+päälle+vaihtoehtoisia+biologisia+toimintareittejä+turvatakseen+välttämättömimmät+metaboliset+toiminnot.”Tiedän+varsin+hyvin+ettei+kirjoittamasi+ole+totta,+koska+sitä+ei+tue+mikään+objektiivinen+havainto.+Osa+muutoksista+tietenkin+perustuu+epigeneettisten+modifikaatioiden+periytymiseen+ja+geenien+häviämiseen,+mutta+ei+lähellekään+kaikki.”Ja+jos+nyt+rupeat+lässyttämään+jostakin+bakteerien+geenimutaatioista,+niin+ota+ainakin+ensin+selvää,+mitkä+epigeneettiset+tekijät+johtavat+geneettisen+materiaalin+muutoksiin.+Unohtamatta+tietenkään+HGT:tä.”ROT+hyvä,+kaikki+palstaa+enemmän+seuraavat+tietävät+ja+muistavat,+että+olen+antanut+esimerkkejä+adaptiivisista+geneettisistä+mutaatioista+yksisoluisista+organismeista+aina+ihmiseen+asti+suunnilleen+jokaisen+kunnan+pääjaksosta+ja+kaaresta,+ja+vieläpä+niillä+tiukoilla+reunaehdoilla,+joita+olet+kulloinkin+asettanut.+Sinulla+ei+ole+mitään+opetettavaa+minulle.”Miljoonat+vuodet!+Hahhah!+Ei+luolakalojen+silmien+passivoitumiseen+tarvita+miljoonia+vuosia!”Sen+aikaa+sokkotetroihin+johtanut+maantieteellinen+isolaatio+kiiltotetrapopulaatioiden+välillä+on+kestänyt.+Ei+se+tietenkään+tarkoita+sitä,+että+tuo+adaptoitumisaika+olisi+joku+vakio.”Ja+siitäkin+olen+kirjoittanut+tiedeartikkeliin+perustuvan+blogiartikkelin:”Euraasialaisten+kivennuolijapopulaatioiden+isolaatio+on+kestänyt+vähän+toistakymmentätuhatta+vuotta,+ja+adaptoituminen+luolaolosuhteisiin+on+vielä+kesken.+Vaikka+luolapopulaatioille+on+jo+useita+tyypillisiä+piirteitä+varsin+nopealla+aikavälillä+kehittynyt,+kuten+suomujen+puute+ja+osittainen+pigmentin+menetys,+niin+esim.+niiden+silmät+ovat+pienentyneet+vasta+n.+10%.+Lainaus:+”The+cavefish’s+eyes+are+about+10+per+cent+smaller+than+those+of+surface+stone+loaches,+and+their+barbels+are+longer.+They+also+lack+scales.+Most+obviously,+they+have+lost+the+dark+brown+blotches+typical+of+surface+stone+loaches.”+Pääsen+yliopiston+tunnuksilla+tietokantaan,+josta+löytyvät+myös+maksumuurin+takana+olevat+julkaisut,+mutta+en+ymmärrettävistä+syistä+johtuen+voi+sitä+kautta+haettuja+artikkeleita+tänne+linkittää.+Alustavissa+analyyseissä+muutosten+taustalla+oletetaan+olevan+sekä+geenejä+inaktivoivia+mutaatioita+että+muutoksia+geenien+ilmentymisen+säätelyssä,+ja+nämä+voivat+hyvin+olla+enimmäkseen+epigeneettisiä+metylaatioprofiilien+muutoksia.+Samoin+kuin+sokkotetrojenkin+kohdalla,+ei+tässäkään+tapauksessa+ole+vielä+kattavasti+selvitetty+kaikkia+mahdollisia+muutoksia+koko+adaptaatioketjun+osalta.Sopeutuminen+luolaolosuhteisiin+on+siis+noilla+kaloilla+paikasta+riippuen+kestänyt+n.+10+000-20+000+vuotta,+ja+se+on+vielä+monelta+osin+hyvin+keskeneräistä.+Miten+tämä+tukee+sinun+näkemystäsi+täydellisestä+silmien+menetyksestä+ja+regressiosta+muutamassa+sukupolvessa?
  4. "Ei+teihin+evoluutiouskovaisiin+nöyryys+auta,+vaan+tiukka+tieteellinen+fakta."Milloin+ajattelit+ensimmäisen+kerran+tarjota+niitä+tiukkoja+tieteellisiä+faktoja,+jotka+sopivat+yhteen+kirjoittamasi+kanssa?
  5. Etkö+huomaa,+että+soitat+koko+ajan+samaan+kohtaan+jumiutunutta+vanhaa+levyä?+No,+onpahan+ainakin+minulle+helpompaa,+kun+voin+vastata+vanhojen+vastausten+vähäisellä+muokkauksella.”Siksi+he+ovat+alkaneet+kutsua+koodaamattomia+RNA-molekyylejä+geeneiksi.+On+selvää,+että+RNA-molekyylit+välittävät+geenien+ekspressioon+tarvittavan+informaation+ja+luolakalojenkin+tapauksessa+RNA-molekyyleissä+luonnollisesti+tapahtuu+muutoksia,+jotka+johtavat+periytyviin+muutoksiin+kalan+genomissa.+Siksi+he+voivat+sanoa,+että+'mutaatiot+geeneissä+aiheuttavat+luolakalojen+adaptoitumisen'.+Tällaista+epärehellistä+ja+pseudotieteellistä+toimintaa+harrastaa+mm.+tämän+palstan+pahin+eksyttäjä+Solon1.”Oletko+todella+noin+epätoivoinen,+että+sinun+täytyy+jatkuvasti+valehdella+minun+väitteistäni,+vai+onko+asiat+niin+surkeasti+ettei+suomalainen+opettaja+ymmärrä+useankaan+lukukerran+jälkeen+lukemaansa?+RNA-molekyylit+eivät+tipahda+taivaasta,+vaan+useinmiten+ne+syntyvät+proteiineja+koodaamattomien+DNA-jaksojen+transkripteistä,+ja+noita+RNA-molekyylejä+synnyttäviä+DNA-jaksoja+nimitetään+RNA-geeneiksi,+mikä+on+tietenkin+täysin+looginen+nimitys+niille+eikä+se+liity+millään+tavalla+joidenkin+harhaisten+uskovaisten+fantasioihin.+Tietenkin+mutaatiot+noiden+DNA-jaksojen+alueella+muuttaa+myös+transkriptiotuotteina+syntyviä+ncRNA-molekyylejä,+joko+neutraalisti,+haitallisesti+tai+sitten+toisinaan+hyödyllisesti.Miksi+ketään+ylipäätään+pitäisi+kiinnostaa+tuo+ID-väen+pseudotieteellinen+roska-artikkeli,+kun+sama+aihe+käsiteltiin+täällä+n.+kuukausi+sitten?+Siinä+oikeassa+julkaistussa+artikkelissa+[1]+todettiin,+että+samoin+kuin+näkevillä+kiiltotetroilla+niin+myös+sokkotetroilla+alkaa+kehittyä+silmän+rakenteita+alkionkehityksessä,+mutta+DNA-metylaatioiden+vaikutuksesta+kehitys+pysähtyy+ja+rakenteet+surkastuvat,+eli+suoraan+geenejä+inaktivoivia+mutaatioita+ei+sokkotetran+tapauksessa+havaittu+tutkituissa+geeneissä.[1]+https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/10/05/199018.full.pdfTutkimuksessa+ei+kuitenkaan+lainkaan+selvitetty+esim.+sitä,+että+onko+metyyliryhmien+siirtoa+nukleotidin+emäksiin+hoitavien+DNA-metyylitranferaasientsyymien+tuotannosta+vastaavissa+DNMT-geeneissä+joitain+geneettisiä+muutoksia,+tai+onko+noiden+transferaasientsyymien+aktiivisuutta+katalysoivien+miRNA-molekyylien+synnyn+taustalla+olevissa+RNA-geeneissä+(DNA-jaksoja)+tapahtunut+mitään+muutoksia.+Samoin+ei+tutkittu+TET-geeniperheen+koodaavien-+tai+säätelyosien+mahdollisia+muutoksia+ja+niiden+vaikutusta+syntyviin+TET-entsyymeihin,+jotka+vastaavat+muista+sytosiinin+modifikaatioista+kutent+5-hydroksyylimetyylisytosiinista,+jolla+havaittiin+vaikutus+myös+sokkotetrojen+silmien+kehityksessä.Tutkimuksessa+kerrottiin+myös,+että+adaptoituminen+on+tapahtunut+miljoonien+vuosien+aikana.Lainaus:+”Blind+cave+fish+(CF)+morphs+of+Astyanax+mexicanus+evolved+from+surface+fish+(SF)+during+a+few+million+years+of+isolation+in+dark+Mexican+caves...””Opsinit+ovat+valoa+aistivia+reseptoreja+ja+niitä+on+kalan+suomupeitteen+alla,+silmissä+ja+aivoissa.+Ne+välittävät+informaatiota+kalan+aivoille,+ja+tämän+informaation+perusteella+kala+säätelee+geenien+aktiivisuutta.”Kerro+tarkemmin+lähteineen+miten+sokkotetrojen+fotoreseptorit+välittävät+signaaleja+aivoille,+jotka+prosessoituaan+informaation+käynnistävät+metyyliryhmien+siirron+oikeisiin+geeneihin+inaktivoidakseen+ne,+ja+miten+regressio+tapahtuu+muutamassa+sukupolvessa?+Olisi+kiva+lukea+tällaisesta+älykkäästä+teleologisesta+mekanismista+lisää.+Siitä+varmasti+löytyy+paljon+tutkimuksia,+ethän+sinä+sentään+omasta+päästäsi+kehtaisi+tällaista+esittää?+Jos+nyt+palataan+asiaan+hiukan+vakavammin,+niin+olen+tietenkin+tietoinen+ympäristötekijöiden+vaikutuksesta+epigeneettisiin+mekanismeihin,+mutta+se+ei+todellakaan+tapahdu+sillä+tavoin+kuin+sinä+selvästikin+kuvittelet.Miksi+toiset+luolakalat,+kuten+useat+Sinocyclocheilus-suvun+luolakalat+eivät+ole+kuitenkaan+halunneet+totella+sinun+”totuuttasi”,+vaan+ovat+kehdanneet+sopeutua+luolaelämään+ja+menettää+esim.+silmänsä+epigeneettisten+säätelymuutosten+lisäksi+useiden+geneettisten+muutosten+avulla+[2]?[2]+https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-015-0223-4Lainaus:+”We+carried+out+comparative+analyses+of+these+genomes+and+found+that+many+genetic+changes,+such+as+gene+loss+(e.g.+opsin+genes),+pseudogenes+(e.g.+crystallin+genes),+mutations+(e.g.+melanogenesis-related+genes),+deletions+(e.g.+scale-related+genes)+and+down-regulation+(e.g.+circadian+rhythm+pathway+genes),+are+possibly+associated+with+the+regressive+features+(such+as+eye+degeneration,+albinism,+rudimentary+scales+and+lack+of+circadian+rhythms)...”+Miksi+kaljurotat+eivät+ole+totelleet+sinua,+vaan+niidenkin+maan+alle+sopeutuminen+on+vaatinut+epigeneettisten+säätelymuutosten+lisäksi+esim.+geenejä+suoraan+inaktivoivia+mutaatioita+[3]?[3]+https://www.nature.com/articles/nature10533Miksi+tutkimuksista+ei+voisi+tehdä+sitä+selvää+johtopäätöstä,+että+adaptaatioiden+taustalla+voi+olla+erilaisia+mekanismeja+ja+niiden+yhdistelmiä?
  6. ”Koska+sotket+harhaanjohtamisessasi+ja+epärehellisyydessäsi+geeneiksi+myös+erilaiset+RNA-jaksot,+on+kanssasi+mahdoton+keskustella.”Ja+missä+näin+on+tapahtunut,+unissasiko?+Jossain+ketjussa+totesin+etteivät+geenit+eksplisiittisesti+rakennu+DNA:sta,+koska+joidenkin+virusten+genomit+ovat+kokonaisuudessaan+RNA:ta.+Saattoi+olla+sama+ketju,+jossa+kerroin+etteivät+geenit+eksplisiittisesti+koodaa+vain+proteiineja,+vaan+osa+koodaamattomasta+DNA:sta+transkriptoidaan+tominnallisiksi+RNA-molekyyleiksi,+ja+niitä+DNA-alueita+kutsutaan+RNA-geeneiksi.+On+aivan+oma+häpeäsi,+jos+et+ymmärrä+lukemaasi+tai+osaa+käyttää+molekyylibiologian+ja+genetiikan+sanastoa.”Vaihtoehtoinen+silmukointi+ei+muuta+DNA:ta.”Onko+joku+jossain+ikinä+koskaa+väittänyt,+että+DNA:n+muuttaminen+olisi+sen+tarkoitus?+Kaikki+ymmärtävät,+että+siinä+modifioidaan+transkriptiossa+DNA-templaatista+valmistettua+esi-mRNA:ta+ennen+varsinaista+proteiinisynteesiä.”Siksi+kaikki+eliöissä+tapahtuvat+muutokset+perustuvat+olemassaolevan+biologisen+informaation+epigeneettiseen+säätelyyn+TAI+informaation+häviämiseen.”Vaan+ei+todellisuudessa+perustu,+ja+on+aivan+käsittämätöntä+kuinka+sekaisin+päänsä+voi+uskomuksilla+saada.”Siksi+evoluutiota+ei+tapahdu.+DNA:ssa+tapahtuvaa+informaatiolisäystä,+joka+johtaisi+toiminnallisen+tai+rakenteellisen+monimutkaisuuden+kasvuun,+ei+ole+koskaan+havaittu+tapahtuvan.”Onko+kivaa+valehdella?+Antaako+Jumalasi+sen+anteeksi?+”Mutta+koska+solon+sotkee+geeneiksi+myös+RNA:t,+kuvittelee+hän+epätoivoisena,+että+geenit+(RNA)+duplikoituessaan+lisäävät+informaatiota.+Ovelaa,+mutta+niin+epärehellistä.”Olisit+vain+hiljaa,+niin+et+jatkuvasti+nolaisi+itseäsi,+aikuinen+ihminen.
  7. ”+4.+Vaihtoehtoinen+silmukointi+on+merkittävin+eliöiden+nopeaan+adaptoitumiseen+ja+varioitumiseen+liittyvä+mekanismi.+Sitä+tutkimalla+jokainen+ymmärtää,+etteivät+eliöissä+tapahtuvat+muutokset+johdu+satunnaisista+mutaatioista+ja+valinnasta+vaan+suunnitelluista+mekanismeista,+joita+ohjaavat+ravinto,+ilmasto,+stressitekijät+jne.”Eikö+geenien+aktiivisuuden+epigneettinen+säätely+ja+sen+vaikutukset+fenotyypin+plastisuuteen+olekaan+mielestäsi+enää+merkittävin+tekijä+adaptoitumisessa?+Ilmentymisen+säätelyllä+ei+katsos+välttämättä+ole+mitään+vaikutusta+post-transkriptionaaliseen+modifiointiin+vaihtoehtoisen+silmukoinnin+muodossa.+Tietenkin+vaihtoehtoinen+silmukointi+on+yksi+merkittävä+prosessi,+joka+mahdollistaa+proteiinien+diversiteetin,+mutta+taisit+unohtaa+ettei+se+ole+suunniteltu+mekanismi+[8].+Ja+kuinka+vaikea+sinun+on+tajuta+se,+että+vaikka+se+olisikin+suunniteltu+mekanismi,+niin+ei+se+poista+luonnonvalintaa?+Kuvitteletko,+että+Jumala+päättää+jokaisen+eliöyksilön+kohtalon?+Kun+kaikki+eliöyksilöt+eivät+selvästikään+tässä+todellisuudessa+ole+yhtä+sopeutuneita+ympäristöönsä,+niin+mikä+muu+kuin+luonnonvalinta+olisi+se,+joka+karsii+keskimääräisesti+enemmän+huonommin+sopeutuneita+ja+vastaavasti+runsastuttaa+niitä+paremmin+adaptoituneiden+ominaisuuksia+keskimääräisesti+enemmän?[8]+http://cshperspectives.cshlp.org/content/6/6/a016071.full”5.+DNA:n+virheet+(mutaatiot)+eivät+lisää+DNA:n+monitoiminnallisuutta,+vaan+heikentävät+sitä,+koska+mitä+enemmän+DNA:ssa+on+virheitä,+sitä+enemmän+siinä+on+viallisia+geenejä+ja+sitä+vähemmän+solu+kykenee+rakentamaan+geeneistä+toimivia+RNA-transkriptejä.”Hohhoijaa…+https://keskustelu.suomi24.fi/t/14779076/rakenteellinen-ja-toiminnallinen-monimutkaisuus”Ihmisen+genomissa+on+jo+yli+214000+sairautta+aiheuttavaa+geneettistä+virhettä.+Vuosikasvu+oli+yli+20000.+Genomimme+rappeutuu+erittäin+nopeasti.”Ihmislaji+pystyy+ainakin+vielä+toistaiseksi+elämään+vallan+mainiosti+tämän+kertyvän+kuorman+kanssa,+koska+vaikka+luonnonvalinta+koko+ajan+neutralisoituu+meidän+lajimme+kohdalla,+ei+se+ole+mihinkään+kokonaan+hävinnyt.+Haitallisten+mutaatioiden+osalta+tästä+pitää+huolen+esim.+negatiivinen+epistaasi,+jonka+luonne+on+synergistinen.+Kuorma+ei+pääse+populaatiotasolla+kasvamaan+liian+suureksi,+vaikka+lukumääräisesti+yhä+useammat+yksilöt+siitä+tulevatkin+jollain+tasolla+kärsimään+tulevissa+sukupolvissa.+”Ilmiö+on+globaali+ja+koskee+kaikkia+eliöryhmiä,+joskin+nisäkkäillä+geneettinen+rappeutuminen+tapahtuu+nopeammin+kuin+esim.+polyploideilla+eliöillä+(esim.+kasvit,+kalat,+matelijat,+hyönteiset+jne.)”Enää+ei+puutu+kuin+se,+että+todistat+rappeutumisen+olevan+globaali-ilmiö+kaikissa+eliöryhmissä?+Saa+suorittaa.+Todellisuudessa+esim.+vajaa+kuukausi+sitten+julkaistiin+tutkimus,+jossa+tutkittiin+yli+33+000+mutaatiota+bakteereilla+ja+havaitiin,+että+pitkäkestoinen+adaptoituminen+pysyvissäkin+olosuhteissa+on+dynaamisempaa+ja+kompleksisempaa+kuin+on+uskottukaan+eikä+mitään+loppua+evoluutiolle+ole+havaittavissa+[9].[9]+https://www.nature.com/articles/nature24287”Vaihtoehtoinen+silmukointi+selittää+eliöiden+huikean+muuntelupotentiaalin+sekä+sen,+että+biologinen+informaatio+on+pakattu+minimaalisen+pieneen+tilaan.”Se+selittää+osan+siitä,+ja+sinulle+on+esitelty+useita+muitakin+prosesseja+ja+tekijöitä,+mutta+et+uskonnollisista+syista+pysty+niitä+hyväksymään.+”Se+on+osoitus+Älykkäästä+Suunnittelusta+ja+Luomisesta.”Ei+ole+vaan+evoluutiosta,+kuten+ylempänä+jälleen+kerran+osoitin.”Kaikki+eliöissä+tapahtuva+muutos+perustuu+olemassaolevan+biologisen+informaation+epigeneettiseen+säätelyyn+TAI+informaation+katoamiseen,+jolloin+solu+etsii+vaihtoehtoisia+geneettisiä+kombinaatioita+turvatakseen+tärkeimmät+metaboliset+toiminnot.+Siksi+evoluutioteoria+on+aikamme+vakavin+harhaoppi.”Tämä+on+puhdasta+valehtelua+ilman+mitään+kestävää+logiikkaa.+Sinä+olet+palstan+vakavin+harhaoppi.
  8. ”On+olemassa+valtavat+määrät+vanhentuneita+ja+virheellisiä+tutkimuksia,+joissa+kerrotaan+geeniduplikaatioista+ja+geneettisistä+rekombinaatioista.+Vielä+nykyisinkin+löytyy+tutkijoita,+jotka+kuvittelevat+näiden+pre-mRNA:n+modifiointitapahtumien+johtuvan+geneettisistä+mutaatioista+ja+satunnaisista+muutoksista+DNA:ssa.”Huomautetaan+mahdollisille+uusille+lukijoille,+ettei+kyseisellä+kirjoittajalla+ole+minkäänlaista+kompetenssia+käsiteltävässä+aiheessa.+Kukaan+ei+kuvittele,+että+vaihtoehtoisen+silmukoinnin+mekanismin+toiminnasta+ja+säätelystä+vastaisivat+erilaiset+geneettiset+muutokset+DNA:ssa,+vaan+tämä+on+sinun+oma+olkiukkosi.+Geeniduplikaatiot+ovat+kuitenkin+yksi+merkittävä+prosessi+uusien+proteiini-isoformien+synnyssä,+ja+vaihtoehtoisella+silmukoinnilla+ja+geeniduplikaatiolla+on+täysin+selvä+evolutiivinen+yhteys,+jonka+ansiosta+mekin+olemme+kehittyneet+sellaisiksi+kuin+olemme+[3].+Geneettisellä+rekombinaatiolla+tarkoitetaan+eri+yksilöistä+peräisin+olevan+geneettisen+materiaalin+yhdistymistä+yhdessä+yksilössä,+joten+mietipä+nyt+itsekin+kuinka+idioottimaista+on+väittää,+että+jotkut+tutkijat+kuvittelisivat+tällaisen+tapahtuman+säätelevän+jatkuvasti+jokaisessa+solussa+tapahtuvaa+post-transkriptionaalista+modifiointia.[3]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5306129/”3.+Solun+mekanismeista+perillä+olevat+tiedemiehet+ymmärtävät,+että+vaihtoehtoista+silmukointimekanismia+ohjaavat+epigeneettiset+tekijät+ja+mekanismit,+joista+merkittävimmät+ovat+DNA:n+metylaatio,+microRNA-säätely+sekä+histonien+(kromatiinin+pakkaajaproteiinikompleksit)+epigeneettiset+markkerit,+jotka+muodostavat+eliön+biologisen+osoitetietokannan.”Tässä+pitää+taas+huomauttaa,+että+laajimmassa+merkityksessään+epigenetiikalla+tarkoitetaan+kaikkia+niitä+kromosomin+sisällä+tapahtuvia+geenien+aktiivisuuteen+ja+ilmentymiseen+liittyviä+tekijöitä,+jotka+eivät+suoraan+muuta+DNA-sekvenssin+emäsjärjestystä.+Standardimääritelmä+on+kuitenkin+se,+että+niiden+modifikaatioiden+tulee+olla+vähintään+seuraaville+solusukupolville+periytyviä,+eikä+tässäkään+ole+kenelläkään+mitään+ongelmaa,+vaikka+ROT+niin+kuvitteleekin.Ainoa+depatti+on+käyty+sen+kysymyksen+ympärillä,+että+mikä+merkitys+useiden+sukupolvien+yli+kestävillä+ituradan+sukusoluissa+periytyvillä+epigeneettisillä+modifikaatiolla+on+ollut+biodiversiteetin+kehittymisessä.+Todellisuudessa+vaihtoehtoisen+silmukoinnin+merkittävimmät+ohjaustekijät+ovat+cis-reaktiivisten+RNA-elementtien+ja+RNA-sitoutumisproteiinien+(esim.+PTBP1)+yhteistoiminta,+RNA-RNA+emäspariutuminen+ja+kromatiinin+rakennetta+muokkaavat+histonimodifikaatiot+[4,5].+Erilaisilla+miRNA-molekyyleillä+on+kuitenkin+lukuisia+säätelytoimintoja+vaihtoehtoisessa+silmukoinnissa,+joten+ei+tarvitse+kiikuttaa+kymmentä+väärin+ymmärtämääsi+tutkimusta+tähän.+Samoin+DNA-metylaatiolla+on+useita+säätelytoimintoja,+mutta+merkitys+ei+ole,+ainakaan+toistaiseksi,+samanlainen+kuin+esim.+histonimodifikaatioilla+[6,7].Lainaus:+”Two+different+mechanisms+convey+DNA+methylation+information+into+the+regulation+of+alternative+splicing...These+two+mechanisms,+however,+regulate+only+a+fraction+of+such+events,+implying+that+more+underlying+mechanisms+remain+to+be+found.”[4]+https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkx901/4372489[5]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4526142/pdf/nihms710140.pdf[6]+https://www.nature.com/articles/srep42790[7]+http://www.cell.com/trends/genetics/abstract/S0168-9525(15)00040-2”Epigeneettisten+markkereiden+paikalleenasettamisesta+huolehtivat+koodaamattomat+RNA-molekyylit,+jotka+välittävät+solulle+signaaleja+ympäröivästä+maailmasta+ja+muilta+soluilta.”Edelleenkin+tuota+siirtoa+katalysoivat+erilaiset+metyylitransferaasit+liittämällä+metyyliryhmiä.+Niiden+aktiivisuutta+voivat+katalysoida+erilaiset+pienet+ncRNA:t,+ja+esim.+lncRNA:lla+on+myös+tietyissä+tilanteissa+ohjaustehtävä,+kun+lncRNA-molekyyli+sitoutuu+transkriptiotekijän+sitoutumiskohdan+viereen+ja+ohjaa+DNA-metyylitransferaasin+suorittamaa+siirtoa.
  9. Onneksi+tämäkin+hoituu+hiukan+muokkaamalla+vanhoja+vastauksia.+”1.+Esim.+ihmisen+DNA:ssa+on+vain+n.+19600+proteiinien+koodaamiseen+käytettävää+geeniä,+mutta+erilaisten+proteiinien+määrä+kehossamme+on+jopa+yli+miljoona.+Solun+käyttämät+teknologiat+mahdollistavat+siis+sen,+että+geneettistä+materiaalia+hyödynnetään+maksimaalisen+tehokkaasti+=+Multifunctional+genes.”Ihmisten+parinkymmenen+tuhannen+koodaavan+geenin+teoreettinen+potentiaali+on+pari+miljoonaa+erilaista+proteiinia,+jos+lasketaan+se+maksimi,+jonka+vaihtoehtoinen+silmukointi,+vaihtoehtoiset+promoottorit+ja+vaihtoehtoiset+transkription+aloituskohdat+voisivat+erilaisia+variantteja+tuottaa,+mutta+todellisten+tapahtumien+kanssa+se+ei+näytä+suoraan+korreloivan.+Ihmiseltä+on+löydetty+tähän+mennessä+(2017)+n.+20+000+todennäköisesti+funktionaalista+proteiinia+[1],+niistä+n.+80+000+vaihtoehtoista+transkriptivarianttia+(isoformia)+ja+tämän+hetken+ennusteet+ovat+maksimissaan+n.+200+000+variantissa.+Näitä+transkriptien+variaatioita+on+kuitenkin+identifiotu+pääosin+RNA-sekvenssitutkimuksissa,+eikä+niinkään+proteomianalyysin+yhteydessä,+joissa+selvitetään+niiden+toiminnallisuutta+sekä+niiden+todellista+määrää+soluissa+että+evolutiivista+konservoitumista,+joiden+kautta+voidaan+päätellä+translaatioon+päätyneiden+transkriptien+määrää.Tällaiset+proteomianalyysit+ovat+osoittaneet,+että+solut+pyrkivät+käyttämään+tiettyä+proteiini-isoformia,+mutta+jotuvat+hyödyntämään+välillä+esim.+helpommin+laskostuvaa+muotoa.+Näyttääkin+siltä,+että+proteomin+kompleksisuus+ja+kudosten+erityispiirteet+ovat+ennemminkin,+ainakin+jossain+määrin,+seurausta+geenien+ilmentymisen+muista+vaiheista+ja+muusta+säätelystä,+kuin+erilaisten+vaihtoehtoisesti+prosessoitujen+proteiinivarianttien+määrästä+[2].+Tämän+vuoden+tammikuussa+(2017)+neXtProt:n+mukaan+HPP+on+edennyt+20+055+erilaiseen+proteiiniin,+joista+16+518+on+tähän+mennessä+identifioitu+toiminnalliseksi+proteiiniksi.+Muut+projektit+ovat+tällä+hetkellä+vielä+pienemmissä+luvuissa.+RefSeq:n+mukaan+funktionaalisia+silmukointivariantteja+(isoformia)+ei+todellisuudessa+olisi+kuin+pari/koodaava+geeni,+ja+GENCODE+(osa+ENCODE-projektia)+pysyttelee+nykyisissä+arvioissaan+muutamassa+toiminnallisessa+variantissa/geeni.+[1]+https://www.nature.com/articles/ncomms14271[2]+http://www.cell.com/trends/biochemical-sciences/fulltext/S0968-0004(16)30118-9”2.+Banaanikärpäsen+(Hedelmäkärpänen,+Drosophila+melanogaster)+Dscam+-geenissä+on+peräti+95+exonia,+joiden+poistamisen+kombinaatiot+mahdollistavat+peräti+38016+erilaisen+proteiinin+valmistamisen+yhdestä+ainoasta+geenistä.+Mekanismi,+vaihtoehtoinen+silmukointi,+on+ymmärretty+vasta+viitisentoista+vuotta+ja+siihen+vaikuttavia+säätely-+ja+ohjaustekijöitä+löydetään+nykyäänkin+lähes+päivittäin.”Tällaiset+havainnot,+joita+massaspektrometria+ja+RNA-sekvensointia+hyödyntäen+saatiin+aikaiseksi,+laukaisivat+hurjat+spekulaatiot+toiminnallisten+proteiinien+määrästä.+Aivan+parina+viime+vuotena+on+kuitenkin+kyetty+myös+analysoimaan+silmukointivarianttien+toiminnallisuutta,+määrää+ja+konservoitumista+soluissa,+ja+havaittu+että+suuri(n)+osa+transkripteistä+ei+päädy+translaatioon+ja+siten+toiminnalliseksi+proteiiniksi,+vaan+kyseessä+on+erilaiset+silmukointivirheet.+Käsityksesi,+että+vaihtoehtoinen+silmukointi+tapahtuisi+eksonien+poistamisen+kombinaatioilla+on+melko+vajaavainen,+koska+se+voi+tapahtua+eksonin+ohituksella,+intronin+säilyttämisellä,+vaihtoehtoisella+5´silmukointikohdalla,+vaihtoehtoisella+3´silmukointikohdalla+tai+vastavuoroisesti+toisensa+poissulkevien+eksonien+muodossa.+Vaihtoehtoinen+silmukointi+löydettiin+vuonna+1977,+ja+tuon+neljänkymmenen+vuoden+aikana+käsitys+mekanismin+evoluutiosta,++toiminnasta+ja+säätelystä+on+kasvanut+koko+ajan,+ja+se+tarkentuu+edelleen+jatkuvasti.
  10. On+hyvin+vaikeaa+käsittää,+että+kyseessä+on+uskovainen+yli+50-vuotias+perheellinen+opettaja,+eikä+mikään+piruuttaan+perseilevä+trolli.
  11. Lisätään+tähän+perään+se+ketju,+jossa+ROT+kaatoi+nappulat+ja+paskoi+laudalle+ja+josta+hän+lensi+tähän+avaukseen+kertomaan+sankaritarinaa+[1].[1]+https://keskustelu.suomi24.fi/t/15053629/epigeneettinen-metadata-on-osoitus-suunnittelusta#comment-91678763
  12. Poistin+osan+lainauksista,+kun+poistoautomaatti+on+mitä+on.”Promoottorit+ja+vahvistajat+(enhancers)+ovat+pääasiallisesti+CpG+-saarekkeita+tai+muita+metyloituvia+alueita.”Tällaiset+lauseet+juuri+paljastavat,+ettet+oikeasti+ymmärrä+aihetta.+Promoottorit+ovat+DNA-alueita,+jotka+mahdollistavat+RNA-polymeraasien+kiinnittymisen+DNA:han,+jotta+transkriptio+voi+alkaa.+Koska+avaus+koski+nisäkkäiden+transkriptionaalista+säätelyä,+niin+tärkein+ja+yleisin+polymeraasientsyymi+on+RNA-polymeraasi+II.+Sen+promoottorit+sisältävät+aina+tietyssä+kohdin+esim.+TATA-+ja+CAAT-sekvenssit,+ja+hiiren+tapauksessa+n.+60%+promoottoreista+löytyy+CpG-saarekkeita,+eikä+aktiivisesti+transkriptoitavia+geenejä+tietenkään+metyloida.Lainaus:+”CpG-dense+promoters+of+actively+transcribed+genes+are+never+methylated,+but+reciprocally+transcriptionally+silent+genes+do+not+necessarily+carry+a+methylated+promoter.+In+mouse+and+human,+around+60–70%+of+genes+have+a+CpG+island+in+their+promoter+region+and+most+of+these+CpG+islands+remain+unmethylated+independently+of+the+transcriptional+activity+of+the+gene,+in+both+differentiated+and+undifferentiated+cell+types.””Niitä+puolestaan+säädellään+koodaamattomien+RNA-molekyylien+ohjaamana.”Kyllä,+transkriptionaaliseen+säätelyyn+osallistuu+myös+promoottorien+toimintaan+yhdistyvät+pancRNA:t.+Mitä+sitten?+Sinua+ei+taida+kiinnostaa,+että+CG-vinoutuneet+rakenteet+genomissa+on+selitettävissä+nimenomaan+evolutiiviselta+kannalta+lisääntyvän+säätelypotentiaalin+kautta+[1]?+Mikään+valmiiksi+luotu+mekanismi+se+ei+ole.Lainaus:+”Taken+together,+these+findings+support+an+evolutionary+scenario+in+which+increases+in+the+frequencies+of+C-+or+G-skewed+motifs+in+promoter+regions+contribute+to+pancRNA+expression,+and+thereafter,+such+sequences+becomes+conserved+at+the+promoter+regions.”[1]+https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3662-1”Molemmat+ovat+epigeneettisiä+mekanismeja.”Mitä+ihmettä+tämä+oikein+tarkoittaa?+Joko+et+osaa+kirjoittaa,+tai+sitten+yrität+selittää+että+promoottorit+ja+vahvistajat+ovat+epigeneettisiä+mekanismeja.+Eivät+ole,+idiootti,+ne+ovat+DNA:sta+koostuvia+säätelysekvenssejä,+joiden+toimintaan+myös+epigeneettiset+tekijät+osallistuvat.+Ja+välillä+säätely+kulkee+toisinpäin+[2]Lainaus:+”However,+these+correlations+have+been+challenging+to+dissect+and+could+alternatively+result+from+processes+that+are+not+mediated+by+the+lncRNA+transcripts+themselves.+For+example,+some+gene+promoters+have+been+proposed+to+have+dual+functions+as+enhancers,+and+the+process+of+transcription+itself+may+contribute+to+gene+regulation+by+recruiting+activating+factors+or+remodelling+nucleosomes.”[2]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27783602”Mihin+ovat+kadonneet+solonin+väitteet+DNA:n+geenimutaatioiden+aiheuttamasta+evoluutiosta.”Jos+tässä+nyt+keskustellaan+nisäkkäiden+transkriptionaalisesta+säätelystä,+niin+miksi+minä+puhuisin+jostain+muusta?+Kysyn+tätä+varmaankin+jo+kymmenettä+kertaa,+että+kuvitteletko+todellakin+”evokkien”+luulevan+geenien+normaalien+toimintojen+ja+niiden+säätelyn+tapahtuvan+mutaatioiden+kautta?+Mutaatiot+ovat+tietenkin+syynä+niiden+mekanismien+taustalla,+jotka+tässäkin+tapauksessa+niitä+toimintoja+ja+säätelyä+ohjaavat+[1].[1]+https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-017-3662-1”Sellaista+kun+ei+tapahdu.”Miltä+se+uskovaisesta+ihmisestä+itsestä+tuntuu,+kun+joutuu+valehtelemaan?
  13. Niinpä+niin,+kun+argumentit+loppuvat+ja+paskat+tulee+housuun,+niin+siirrytään+sitten+uuteen+ketjuun+valehtelemaan+toisista+kirjoittajista+ja+turvaudutaan+Gish+Gallop+-harhautukseen.++Paljon+hienoja+sanoja+sotkettu+pääosin+sekavaan++paskanjauhantaan.+Eikä+ole+vaikea+ennustaa,+että+ROT+tulee+tähän+pullistelemaan+että+katokaa+nyt+kaikki,+militanttiateisti+ei+osaa+argumentoida+mitään.+Ei+kiinnosta+enää,+tämän+pulupaskojan+strategia+on+nähty+jo+tarpeeksi+monta+kertaa,+ja+siihen+on+vastattu+jo+liian+useasti.
  14. ”Solon+on+palstan+ärsyttävin+valehtelija+ja+eksyttäjä.+Hän+jakaa+väärää+ja+harhaanjohtavaa+tietoa.”Antaako+Jumalasi+anteeksi+väärän+todistuksen+lausumisen+lähimmäisestä?+Kysyn+edelleen,+millä+logiikalla+tutkimusten+referointi+sellaisenaan+kuin+ne+asian+esittävät+voi+olla+väärän+ja+harhaanjohtavan+tiedon+levittämistä?+Ja+millä+logiikalla+se,+että+sinä+asiaa+ymmärtämättä+teet+omia+tutkimusten+vastaisia+päätelmiä+olisi+sitten+oikean+tiedon+jakamista?”Mutta+voiko+muuta+odottaa+militantilta+ateistilta?”Aika+laimea+taistelija+taidan+olla+:)”DNA:n+metyylitransferaasia+ohjaavat+ja+säätelevät+koodaamattomat+RNA-molekyylit,+erityisesti+lncRNA:t,+microRNA:t,+siRNA:t+ja+piRNA:t.+Ne+toimivat+signaalinviejinä+ja+ohjaavat+metyyliryhmien+asettumista+oikeille+paikoilleen.+Ja+nekin+luetaan+epigeneettisiin+mekanismeihin.”Röyhkeydelläsi+ei+näytä+olevan+mitään+rajaa.+Sinun+väitteesi+on+ollut,+ketjusta+riippuen,+että+joko+lncRNA:t+tai+miRNA:t+suorittavat+epigeneettisten+markkereiden+asettamisen+oikeille+paikoille.+Minä+olen+toistuvasti+korjannut,+että+siirtoa+katalysoivat+DNA-metyylitransferaasit,+kuten+esim.+DNMT3a,+joiden+aktiivisuutta+puolestaan+katalyvoivat+erilaiset+pienet+ncRNA:t.+Olen+myös+itse+sinulle+kertonut,+että+lncRNA:lla+on+myös+tietyissä+tilanteissa+ohjaustehtävä,+kun+lncRNA-molekyyli+sitoutuu+transkriptiotekijän+sitoutumiskohdan+viereen+ja+ohjaa+DNA-metyylitransferaasin+suorittamaa+siirtoa.+Näin+myös+linkaamasi+tutkimukset+kertovat.+Minä,+ja+kaikki+näistä+asioista+jotain+ymmärtävät+tietävät,+että+kyseessä+on+pitkälle+epigeneettinen+säätely,+eikä+sitä+kukaan+ole+ikinä+missään+kiistänyt.+Oma+lähteesi:+”In+mammalian+cells,+DNA+(Cytosine-5-)-Methyltransferase+1+(DNMT1)+is+the+most+abundant+DNA+methyltransferase+to+transfer+a+methyl+group+to+DNA.”Et+harhakuvitelmissasi+enää+lainkaan+ymmärrä+sitä,+ettei+epigeneettistä+säätelyä+tai+sen+merkitystä+ole+kukaan+ikinä+kiistänyt,+vaan+eri+mieltä+on+oltu+sukupolvelta+toiselle+periytyvien+modifikaatioiden+merkityksestä+pitkän+aikavälin+evoluutiossa.”DNA:n+geenit+eivät+ohjaa+yhtään+mitään,+joten+lopeta+paskanjauhaminen,+solon!”Yksittäiset+geenit+eivät+tietenkään+pääsääntöisesti+ohjaa+mitään,+eikä+näin+kukaan+ole+väittänytkään.+Geenien+DNA:sta+koostuvat+geenien+säätelyalueet,+kuten+promoottorit+ja+vahvistajat,+kuitenkin+ohjaavat+RNA-polymeraasien+ja+transkriptiotekijöiden+avulla.+Niidenkin+aktiivisuutta+tietenkin+katalysoivat+DNA-metylaatiot+ja+erilaiset+histonimodifikaatiot,+mutta+onko+tätäkään+kukaan+ikinä+kiistänyt?+Minusta+näyttää+siltä,+ettet+ymmärrä+DNA:n+informaation+”ohjauskäskyn”+eroa+sen+aktiivisuuden+katalysoinnin+kontrollointiin.+Tunnut+toisaalta+olevan+myös+autuaan+tietämätön+esim.+hedgehog,+FGF,+TGFβ,+Sox9,+Wnt+ja+homeobox-geenien+kaltaisista+ohjausgeeneistä,+jotka+säätelevät+ja+ohjaavat+esim.+eri+rakenteiden+morfogeneesiä.+Tietenkin+noidenkin+ohjausgeenien+ilmentymistä+säädellään,+mutta+ei+pelkästään+epigeneettisten+tekijöiden+vaikutuksella+[1].Lainaus:+”Here,+we+examine+the+spectrum+of+molecular+mechanisms+controlling+Hox+gene+expression+in+model+vertebrates+and+invertebrates+and+find+that+a+diverse+range+of+mechanisms,+including+nuclear+dynamics,+RNA+processing,+microRNA+and+translational+regulation,+all+concur+to+control+Hox+gene+outputs.+We+propose+that+this+complex+multi-tiered+regulation+might+contribute+to+the+robustness+of+Hox+expression+during+development.”[1]+http://dev.biologists.org/content/140/19/3951.longSinulle+on+aiemminkin+esitetty+seuraava+vertaus,+mutta+kertaus+on+opintojen+äiti.+Mikä+seuraavista+lämmittää+huoneen,+lämpöpatteri+(geeni),+termostaatti+ja+venttiili+(geenin+säätelyalueet)+vai+termostaatin+säätönuppi+(esim.+epigeneettiset+tekijät)?+Kaikkia+tarvitaan+halutun+funktion+saavuttamiseksi,+mutta+lämmitys+ei+onnistu+vaikka+kuinka+säätönuppia+vääntelisi,+jos+esim.+patteriventiili+vuotaa.+Samoin+soluissa+epigeneettiset+tekijät+voivat+säädellä+ja+ohjata+vain+niissä+rajoissa,+jonka+geenit+ja+niiden+säätelyalueet+mahdollistavat.”Vain+tyhmä+ihminen+kehtaa+väittää,+että+säiliötyyppiset+ohjelmointiratkaisut+kehittyvät+itsekseen!”Mitäpä+jos+tekisit+niin+kuin+ehdotin+jo+edellisessä+viestissäni,+että+lukisit+mitä+siinä+tutkimuksessa+[2]+oikeasti+kerrotaan?+Edes+tuossa+uutisessa+ei+puhuta+säiliötyyppisestä+ohjelmoinnista,+vaan+Manzo+kertoo+DNA-metylaation+toimivan+säiliön+tavoin+varmistamalla+H3K27me3-histonimodifikaation+oikean+paikan.+Se+siis+”säilöö”+toisen+modifikaation+oikeaan+kohtaan.+Olet+täysin+harhainen.[2]+http://emboj.embopress.org/content/early/2017/10/26/embj.201797038
  15. Siis+CpG-saareke,+ei+GpC...
  16. Kirjoituksessasi+ei+perinteisesti+ole+järjen+hiventäkään+enkä+jaksa+siihen+kovin+syvällisesti+puuttua,+kun+et+kumminkaan+siihen+enää+mitenkään+reagoi.+Saanen+muistuttaa,+että+olen+kertonut+sinulle+varmastikin+kymmenissä+viesteissä+DNA-metyylitransferaaseista+(DNMT),+niiden+funktioista+ja+niiden+evoluutiosta.+Olen+myös+kertonut+DNA-metylaation+ja+histonimodifikaatioiden+välisestä+antagonisesta+säätelyvaikutuksesta,+kuten+myös+lukuisista+muistakin+tässä+yhteydessä+merkityksellisistä+tekijöistä,+mutta+sinä+olet+ne+ohittanut+olankohautuksella+tai+kieltäytynyt+uskomasta+minua.+Mikä+asiasta+tekee+nyt+erilaisen,+kun+DNMT3a1+isoformilla+havaittiin+uusi+antagonistinen+vaikutus+metyylisytosiinin+säilymiselle+GpC-saarekkeiden+yhteydessä?+Lue+nyt+vaan+se+oikea+tutkimus+[1]+äläkä+sekoile+yhden+uutisessa+esiintyneen+sanan+takia.+[1]+http://emboj.embopress.org/content/early/2017/10/26/embj.201797038Olen+lukuisia+kertoja+yrittänyt+korjata+sinua+ja+selittää+sinulle,+kuinka+DNA-metyylitranferaasientsyymit,+kuten+DNMT3a,++luovat+de+novo+metylaatiomalleja+hypermetyloimalla+DNA:ta+liittämällä+metyyliryhmiä+sytosiinirenkaisiin.+Et+ole+minua+uskonut,+vaan+olet+väittänyt+minua+valehtelijaksi+ja+itsepäisesti+jankuttanut+miRNA:n+hoitavan+tuon+työn.+Etkä+siihenkään+ole+reagoinut,+kun+olen+kertonut+miRNA:n+voivan+kyllä+toimia+katalyyttina+kyseisessä+tapahtumassa+muttei+vastaavan+liittämisestä.+Kun+yhdelle+DNMT-entsyymille+löydettiin+myös+sinua+miellyttävä+funktio,+niin+voisitko+korjata+myös+muut+funktiot+kohdilleen?Tärkein+oppitunti+sinulle+löytyy+omasta+lähteestäsi,+jossa+kerrotaan+seuraavaa.Lainaus:+”However,+the+program+that+determines+which+genes+are+switched+on+or+off+as+a+cell+develops+does+not+depend+solely+on+DNA,+but+is+also+determined+by epigenetic+marks.”Kuka+se+väittikään,+että+geenien+ilmentymisen+säätely+on+kokonaisuudessaan+epigeneettisten+tekijöiden+aikaansaama+prosessi,+ja+kuka+on+toisaalta++yrittänyt+takoa+kalloosi+että+epigeneettiset+tekijät+ovat+lopulta+vain+yksi+pieni,+mutta+toki+hyvin+merkittävä,+osa+tuota+ilmentymisen+säätelyä?+Voit+kerrata+asian+esim.+Wikipediasta+[2,3,4].[2]+https://en.wikipedia.org/wiki/Regulation_of_gene_expression[3]+https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_regulatory_network[4]+https://en.wikipedia.org/wiki/Gene_expression
  17. "Tavat,+joilla+AlphaGo+vähentää+kokeilujen+tarvetta+tähtitieteellisestä+maksimimäärästä+on+luultavasti+ohjelmoitu+ihmispelaajien+ajattelua+jäljitellen."Tässä+on+se+julkaistu+artikkeli,+josta+jokainen+voi+lukea+mitä+on+tehty+ja+miten.+[1][1]+https://www.nature.com/articles/nature24270.epdf?referrer_access_token=KdW9AZRkZYuEqgUzpC4LqNRgN0jAjWel9jnR3ZoTv0PVW4gB86EEpGqTRDtpIz-22SehS6IfIWP6NGb0V5cWu-EoVfAGki0u6km0LszOuzp5t4V7Cfz3E7s7jHnzbQ4qzuSk0MignCMZouLbzvn5mW4_ZI9kEVTtgqcdzq12Y3aiXmloMr_KNd0zP9S3BBjnRxy5bAZz-gQqAZcv9VtVIPwycBQ42ovN2jjn1FGJlkyGtJOoEZU6OqDrUhnsbq2O&tracking_referrer=www.theverge.com
  18. ”Lenskin+60+000+bakteerisukupolvea+todistavat+tieteellisesti,+ettei+evoluutiota+tapahdu.”Ai+niin+kuin+esim.+tämä+reilu+viikko+sitten+julkaistu+Lenskin+labran+tutkimus,+jossa+tutkittiin+yli+33+000+mutaatiota+ja+havaitiin,+että+pitkäkestoinen+adaptoituminen+pysyvissäkin+olosuhteissa+on+dynaamisempaa+ja+kompleksisempaa+kuin+on+uskottukaan+eikä+mitään+loppua+evoluutiolle+ole+havaittavissa?+[1][1]+https://www.nature.com/nature/journal/vaop/ncurrent/full/nature24287.htmlVai+tarkoitatko+kenties+tätä+parin+kuukauden+takaista+Lenskin+labran+tutkimusta,+jossa+havaittiin+eri+kehityslinjojen+yhteisten+”ydingeenien”+nopean+evoluution+taustalla+olevan+proteiinien+funktioita+hienosäätävien+hyödyllisten+mutaatioiden+sarjoja,+eikä+pelkästään+erilaisia+inaktivoivia+mutaatioita?+[2][2]+https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5406848/Jos+jossain+on+havaittavissa+selkeä+trendi+informaatiokadolle,+niin+oikea+paikka+on+kolibakteerien+genomien+sijaan+sinun+pääkoppasi+sisällä.
  19. "+LncRNA:t+asettavat+nämä+biologisen+tietokannan+merkinnät+paikoilleen+alkionkehityksen+alkuvaiheessa."Eivät+aseta.+Miksi+et+voi+lopettaa+tämän+väittämistä,+kun+olen+sen+korjannut+jo+vaikka+kuinka+monta+kertaa?+Miten+tällainen+yksityiskohta+voi+olla+niin+tärkeä,+ettet+voi+nostaa+kättä+virheen+merkiksi+ja+seistä+korjattuna?+Pelkäätkö+että+koko+uskottavuutesi+romahtaa,+jos+sen+teet?+Lohdutukseksi+voin+kertoa,+ettei+sinulla+mitään+uskottavuutta+ole+ikinä+ollutkaan,+joten+sillä+ei+olisi+siihen+mitään+vaikutusta.+Metyyliryhmien+siirrosta+paikoilleen+vastaavat+DNMT+metyylitransferaasientsyymit,+joiden+aktiivisuutta+katalysoivat+miRNA-molekyylit.++Muuhun+sontaan+en+jaksa+enää+koskea.
  20. Huoh…+Mitä+jos+vaikka+kerrankin+lukisit+mitä+tutkimuksessa+oikeasti+kerrotaan,+etkä+rakentelisi+onnettomia+kyhäelmiä+pelkkien+uutisten+pohjalta?+Tässä+on+tutkimuksen+esijulkaisu+[1].[1]+https://www.biorxiv.org/content/biorxiv/early/2017/08/08/152736.full.pdfLämpösokkivasteen+ja+sitä+välittävän+transkriptiotekijän+(HSF1)+evoluutio+tunnetaan,+syntyvien+lämpösokkiproteiini+kaperonien,+joita+sytoproteiini+geenit+koodaavat,+evoluutio+ja+funktiot+tunnetaan,+koko+mekanismia+transkriptiota+nopeuttamalla+säätelevän+neurovälittäjä+serotoniinin+(5-HT)+synteesin+evoluutio+tunnetaan,+olfaktorisen+järjestelmän+synty+C.+elegansin+kehon+mikrobien+vaikutuksesta+aineenvaihdunnan+kautta+signaalitransduktioon+tunnetaan+jne.Kaikissa+yllä+mainituissa+kohdissa+on+tapahtunut+cis-säätelyelementtien+tai+muiden+promoottorisekvenssin+osien+geeneettisiä+muutoksia,+geneettisiä+muutoksia+proteiineja+tai+ncRNA:ta+koodaavissa+geeneissä,+kuten+myös+muutoksia+epigeneettisessä+säätelyssä.+Suunnittelua+ei+taas+näy+missään,+koska+koko+systeemi+on+kompromissien+kautta+rakentunut+ja+jos+se+tehostuu+liian+hyväksi,+niin+se+alkaa+haitata+kudosten+homeostaasia.+Tämä+on+todettu+kokeellisesti+insertionaalisilla+mutageneeseillä.+Kuulostaako+evoluutiolta+ja+luonnonvalinnalta?+Tietoisen+teleologisen+toiminnan+näkeminen+kaikkialla+on+vain+aivotoimintasi+luoma+harha.
    21. 5 / 120
TietosuojaselosteKäyttöehdotEvästeasetuksetSäännöt