Vapaa kuvaus

Aloituksia

725

Kommenttia

3861

  1. Tuon+DNA-jakson+variaatioilla+on+selkeä+yhteys+48+sairaus-fenotyyppiin.+Eli+jälleen+autoit+todistamaan,+että+geenimuutokset+aiheuttavat+sairauksia+eli+rappeuttavat+genomia.+Kiitos+avusta!https://www.ensembl.org/Homo_sapiens/Gene/Phenotype?db=core;g=ENSG00000132170;r=3:12287368-12434356
  2. Tässä+listaa+rappeutumisen+mekanismeista+ja+tieteellistä+tutkimusaineistoa+niihin+liittyen.https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC6541967/"Many+studies+have+reported+that+CpG-SNPs+are+associated+with+different+diseases,+such+as+type+2+diabetes,+breast+cancer,+coronary+heart+disease,+and+psychosis+which+show+a+clear+interaction+between+genetic+(SNPs)+and+epigenetic+(DNA+methylation)+regulation."https://www.nature.com/articles/modpathol2009130"Loss+of+expression+of+the+O6-methylguanine+DNA+methyltransferase+(MGMT)+protein+is+a+frequent+occurrence+in+many+types+of+cancer,+including+30–46%+of+sporadic+colorectal+cancers.9,+10,+11,+12,+13+This+is+almost+invariably+associated+with+methylation+of+the+MGMT+promoter.9+MGMT+is+a+ubiquitously+expressed+DNA+repair+protein+that+protects+against+mutagenesis+by+repairing+mutagenic+O6-methylguanines+within+DNA.+By+direct+cleavage+of+the+methyl+adducts,+the+enzyme+can+restore+the+affected+guanine++nucleotides+to+normal.14+If+this+fails+to+occur,+O6-methylguanines+can+pair+erroneously+with+thymine+during+DNA+replication,+resulting+in+G:C>A:T+transitions+in+the+DNA,+which+can+be+important+in+neoplastic+transformation.""Recently,+MGMT+methylation+was+found+to+be+closely+associated+with+the+C>T+SNP+(rs16906252)+within+the+first+exon+of+MGMT+in+colorectal+cancer."https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1004585"Surprisingly,+hydroxymethylated+sites+are+consistently+associated+with+elevated+C+to+G+transversion+rates+at+the+level+of+segregating+polymorphisms,+fixed+substitutions,+and+somatic+mutations+in+tumors."https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5578878/"DNA+hypomethylation+promotes+genomic+instability+4,+in+many+cases+leading+to+an+increased+mutational+load+and+activation+of+proto-oncogenes."https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4930698/"DNA+methylation+has+been+linked+to+mismatch+repair+(MMR)+deficiency+and+genomic+instability+in+multiple+contexts,+in+both+cell+lines+and+in+disease.+In+the+HCT116+colorectal+cancer+cell+line,+ablation+of+catalytically+active+DNMT1+causes+cell+cycle+arrest+and+apoptosis+due+to+increased+chromosomal+instability.+In+mouse+ES+cells,+loss+of+Dnmt1+also+causes+global+hypomethylation+and+increased+mutation+rates."https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/20846930"If+we+assume+that+CpHpG+methylation+also+occurs+in+the+germline,+and+that+5mC+deamination+can+occur+within+a+CpHpG+context,+then+we+might+surmise+that+methylated+CpHpG+sites+could+also+constitute+mutation+hotspots+causing+human+genetic+disease.+To+testthis+postulate,+54,625+missense+and+nonsense+mutations+from+2,113+genes+causing+inherited+disease+were+retrieved+from+the+Human+Gene+Mutation+Database+(http://www.hgmd.org).+Some+18.2+per+cent+of+these+pathological+lesions+were+found+to+be+C+→+T+and+G+→+A+transitions+located+in+CpG+dinucleotides+(compatible+with+a+model+of+methylation-mediated+deamination+of+5mC),+an+approximately+ten-fold+higher+proportion+than+would+have+been+expected+by+chance+alone."https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC33658/"Altered+DNA+methylation+and+genome+instability:+A+new+pathway+to cancer?"http://www.biochemist.org/bio/03905/0012/039050012.pdf"This+increased+genome+instability+is+characterized+by+increased+occurrences+of+mutations,+cells+with+incorrect+chromosome+number,+loss+of+heterochromatin+and+mistakes+in+transcription."https://www.intechopen.com/online-first/a-hypothesis-to-explain-how-the-dna-of-elderly-people-is-prone-to-damage-genome-wide-hypomethylation"A+reduction+in+DNA+methylation+leads+to+genomic+instability,+accumulation+of+endogenous+DNA+damage,+and+sensitivity+to+DNA-damaging+agents."https://jcs.biologists.org/content/112/24/4513"CpG+methylation+reduces+genomic+instability."https://pdfs.semanticscholar.org/d685/909cc287511ce7ab88368a72de1f09e988b8.pdf"As+well,+DNA+methylation+is+thought+to+be+a+major+contributor+of+point+mutations+leading+to+human+genetic+disease,+when+it+precedes+deamination+of+5-methylcytosine+(m5C)+present+within+CpG+dinucleotides.+CpG+dinucleotides+are+hypothesized+to+be+a+hotspot+for+mutations+in+a+variety+of+genes,+where+a+substantial+proportion+of+intragenic+single+base-pair+mutations+(35%)+occur+in+CpG+dinucleotides+and+are+the+result+of+C>T+or+G>A+transitions.+Consequently,+the+rate+of+transitions+at+CpGs+is+suggested+to+be+20-fold+higher+than+transitions+at+non-CpG+sites."https://www.atdbio.com/content/56/Epigenetics#Role-of-base-flipping-in-DNA-methylation"When+cytosine+is+mutated+to+uracil+by+spontaneous+deamination,+the+DNA+glycosylase+enzyme+UDG+(uracil+DNA+glycosylase)+reverses+the+damage,+in+a+base+excision+repair+mechanism.+When+the+equivalent+deamination+reaction+occurs+on+5-methylcytosine,+however,+the+product,+thymine,+is+not+repaired+by+DNA+repair+enzymes."
  3. Tuo+evolution.berkeley+-sivusto+on+ikivanha+ja+TÄYNNÄ+väärää+ja+vanhentunutta+pseudotiedettä.+Törmään+tuohon+sivustoon+viikottain+eri+FB-ryhmissä+kun+ateistit+epätoivoisesti+yrittävät+todistaa+kuolevaa+evoluutioteoriaansa.+Olen+selittänyt+lajiutumisen+mekanismit+käyttäen+apunani+tuoreinta+tieteellistä+tutkimustietoa.+Sen+mukaan+lajiutumisen+pääsääntöinen+mekanismi+on+epigeneettinen+säätely.+Kun+tätä+tapahtuu+paljon,+kohdistuu+genomiin+virheitä,+jotka+nopeuttavat+lajiutumista.+Epigeneettinen+säätely+tai+informaatiokato+eivät+kumpikaan+ole+evoluutiota,+koska+uutta+luovaa+informaatiota+ei+soluun+synny.DNA:n+variaatio+johtuu+genomiin+kohdistuneista+geneettisistä+virheistä,+kuten+SNP:istä+eli+yksittäisistä+pistemutaatioista.+Näitä+on+jokaisella+ihmisellä+useita+miljoonia,+mutta+tiede+ei+ole+löytänyt+ainuttakaan+täysin+hyödyllistä+geenivirhettä.+Sairauksia+aiheuttavia+virheitä+tunnetaan+yli+600000.+Missäs+se+teidän+evoluutionne+on?Agnoskepolle+tiedoksi,+että+polyploidit+eliöt+voivat+kokea+osittaisia+tai+täydellisiä+genomin+duplikaatiotapahtumia.+Nämä+perustuvat+myös+RNA-+ja+histonimarkkeriohjattuihin+mekanismeihin.+Genomiduplikaatioissa+on+kyse+olemassaolevan+informaation+kopioinnista.+Uutta+informaatiota+ei+siis+genomiin+synny.Polyploidien+eliöiden+elinkaari+on+lyhyt+ja+ne+lisääntyvät+usein+ja+nopeasti.+Geneettinen+rappeutuminen+etenee+suunnilleen+tasatahtia+koko+luomakunnassa+juuri+sen+vuoksi,+että+polyploideilla+eliöillä+on+kyky+genomiduplikaatioihin.Evoluutiolle+ei+edelleenkään+ole+mekanismia.+Jos+olisi,+emme+kävisi+tätä+joutavanpäiväistä+väittelyä.+Jos+todisteita+olisi,+en+minäkään+niitä+kieltäisi,+koska+rakastan+vakavasti+otettavaa+tiedettä.+Mutta+koska+niitä+ei+ole,+kerron+ihmisille,+miksi+eliöt+muuttuvat+ja+mihin+muutos+johtaa.