Yhteyttämisen välttämättömyys

Olen lukenut lukuisistakin maapallolta
löytyneistä "mikrobiosfääreistä", joiden on
väitetty toimivan ilman yhteyttämisestä saatavaa
energiaa. Jokohan väitteestä on luovuttu, vai
vieläkö näitä pääasiassa rikkibakteereihin
perustuvia ekosysteemejä väitetään autonomisiksi?
Itse arvelen, että kyseessä on väärinkäsitys ja
kaikki eliöt ovat maapallolla yhteyttämisestä
saadun energian varassa.
27944
Äänestä

Muut lukivat myös

Vastaukset 27

Vanhimmat

toimivia eliöyhteisöjä ja eliökuntia saattaa olla
maapallolla massallisesti jopa enemmän kuin
yhteyttämisestä riippuvaisia. Viime vuosina on
löydetty aivan ennen tuntematonta bakteerielämää
syvältä kallion sisältä. Se käyttää
energianlähteenään alkuaineiden (ainakin rauta ja
rikki) ja yhdisteiden (metaani) kemiallista
energiaa.

Äänestä
  • Tämä energiantuotantoreaktio minua just
    kiinnostaakin. Metaanista ja metallisesta
    (alkuaine)raudasta ei juuri energiaa irtoa
    hapettomissa oloissa. Näkemissäni jutuissa se
    reaktio on jätetty jotenki hämäräksi, mutta
    niissä missä on jotain kerrottu, vaikuttaisi
    olevan yhteyttämisestä saatu energia mukana.

    Äänestä

  • vierasM kirjoitti:

    Tämä energiantuotantoreaktio minua just
    kiinnostaakin. Metaanista ja metallisesta
    (alkuaine)raudasta ei juuri energiaa irtoa
    hapettomissa oloissa. Näkemissäni jutuissa se
    reaktio on jätetty jotenki hämäräksi, mutta
    niissä missä on jotain kerrottu, vaikuttaisi
    olevan yhteyttämisestä saatu energia mukana.

    Bakteerien energiatalous

    kemosyntetisoivat
    energia epäorgaanisten yhdisteiden hapetuksesta
    rikki-, typpi- ja rautabakteerit.

    Ja tuo tarvittava vapaa happi on yhteyttävän
    eliökunnan tuotantoa. Tässä muutama kaava:

    Fe2 1/4 O2 H  Fe3 1/2 H2O

    CuS 8 Fe3 4 H2O  Cu2 8 Fe2 SO42- 8H

    (tuo neliö oli lainaamassani tekstissä
    kysymysmerkki)

    ja sitten muutama bakteerilaji:

    Mesofiiliset bakteerit (optimikasvulämpötila 25-
    40C)

    Thiobacillus ferrooxidans, Leptospirillum
    ferrooxidans,
    Thiobacillus thiooxidans,


    Termofiiliset bakteerit (optimikasvulämpötila
    45-50C)

    Thiobacillus caldus, Sulfobacillus
    thermosulfidooxidans, Acidimicrobium ferrooxidans


    Termofiiliset arkit (optimikasvulämpötila 70-85C)

    Sulfolobulus acidocaldarius, Acidianus brierleyi

    Jos hallitset vieraita kieliä ja netissä hyppelyn
    sujuvasti, niin pari sivua, joilla on lisää
    bakteerien nimiä ja sopiva nimi hakusanana voi
    johdattaa bakteerin elintapojen jäljille:
    http://www.dsmz.de/species/strains.htm
    http://www.bacterio.cict.fr/corrections.pdf

    Muutama kiinnostava kirja alalta ihan suomeksi.
    Niissä kaivaudutaan niin pitkälle elämän alkuun,
    kuin nykyisin päästään:

    Rikkinen, Jouko : Leviä, sieniä ja leväsieniä

    Davies, Paul : Viides ihme

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Bakteerien energiatalous

    kemosyntetisoivat
    energia epäorgaanisten yhdisteiden hapetuksesta
    rikki-, typpi- ja rautabakteerit.

    Ja tuo tarvittava vapaa happi on yhteyttävän
    eliökunnan tuotantoa. Tässä muutama kaava:

    Fe2 1/4 O2 H  Fe3 1/2 H2O

    CuS 8 Fe3 4 H2O  Cu2 8 Fe2 SO42- 8H

    (tuo neliö oli lainaamassani tekstissä
    kysymysmerkki)

    ja sitten muutama bakteerilaji:

    Mesofiiliset bakteerit (optimikasvulämpötila 25-
    40C)

    Thiobacillus ferrooxidans, Leptospirillum
    ferrooxidans,
    Thiobacillus thiooxidans,


    Termofiiliset bakteerit (optimikasvulämpötila
    45-50C)

    Thiobacillus caldus, Sulfobacillus
    thermosulfidooxidans, Acidimicrobium ferrooxidans


    Termofiiliset arkit (optimikasvulämpötila 70-85C)

    Sulfolobulus acidocaldarius, Acidianus brierleyi

    Jos hallitset vieraita kieliä ja netissä hyppelyn
    sujuvasti, niin pari sivua, joilla on lisää
    bakteerien nimiä ja sopiva nimi hakusanana voi
    johdattaa bakteerin elintapojen jäljille:
    http://www.dsmz.de/species/strains.htm
    http://www.bacterio.cict.fr/corrections.pdf

    Muutama kiinnostava kirja alalta ihan suomeksi.
    Niissä kaivaudutaan niin pitkälle elämän alkuun,
    kuin nykyisin päästään:

    Rikkinen, Jouko : Leviä, sieniä ja leväsieniä

    Davies, Paul : Viides ihme

    "vapaa happi on yhteyttävän
    eliökunnan tuotantoa"
    Siis se energia on kotoisin yhteyttämisestä, jos
    ei nyt kokonaan, niin ainakin puoliksi.

    Yhteyttäminenhän kohottaa vesimolekyylissä olevan
    happen kemiallisen potentiaalin (kemiallisen
    energian) korkeammalle tasolle, vapaaksi
    hapeksi. Samalla myös hiilidioksidissa olevan
    hiilen potentiaalin kohoaa.
    T
    ämä happeen yhteyttämisessä sitoutunut energia
    unohdetaan yleensä aina, kun puhutaan
    kemosynteesistä. Kemosynteettisten eliöiden
    hiili ei ole kotoisin kasveista ravintoketjun
    kautta, mutta se on jo toinen juttu.

    Eli olemme yhtä mieltä (?) siitä, että ne
    lukuisat "tieteelliset" esitykset, joissa
    väitetään kemosynteettisten autotrofien saavan
    energiansa ilman auringon valoa tai
    yhteyttämistä, puhuvat vastoin tosiasioita.
    Oikeastaan olisin kiinnostunut tietämään, onko
    tiedossasi yhtään dokumenttia, missä asia
    esitettäisiin oikein? Netistä en löytänyt noin
    sadasta linkistä yhtään tässä suhteessa oikeaa
    tietoa sisältävää. Antamasi linkit eivät
    valaissseet energiakysymystä, pahoin pelkään,
    ettei mainitsemasi kirjatkaan.

    (-; se neliö kuuluisi olla reaktionuoli, vaan
    typografia tehnyt tepposen Murto-osakertoimet
    ovat vähän tyylittömiä. Kemiassa
    reaktioyhtälöitä kutsutaan reaktioyhtälöiksi, ei
    kaavoiksi. :)
    t

    Äänestä

  • vierasM kirjoitti:

    "vapaa happi on yhteyttävän
    eliökunnan tuotantoa"
    Siis se energia on kotoisin yhteyttämisestä, jos
    ei nyt kokonaan, niin ainakin puoliksi.

    Yhteyttäminenhän kohottaa vesimolekyylissä olevan
    happen kemiallisen potentiaalin (kemiallisen
    energian) korkeammalle tasolle, vapaaksi
    hapeksi. Samalla myös hiilidioksidissa olevan
    hiilen potentiaalin kohoaa.
    T
    ämä happeen yhteyttämisessä sitoutunut energia
    unohdetaan yleensä aina, kun puhutaan
    kemosynteesistä. Kemosynteettisten eliöiden
    hiili ei ole kotoisin kasveista ravintoketjun
    kautta, mutta se on jo toinen juttu.

    Eli olemme yhtä mieltä (?) siitä, että ne
    lukuisat "tieteelliset" esitykset, joissa
    väitetään kemosynteettisten autotrofien saavan
    energiansa ilman auringon valoa tai
    yhteyttämistä, puhuvat vastoin tosiasioita.
    Oikeastaan olisin kiinnostunut tietämään, onko
    tiedossasi yhtään dokumenttia, missä asia
    esitettäisiin oikein? Netistä en löytänyt noin
    sadasta linkistä yhtään tässä suhteessa oikeaa
    tietoa sisältävää. Antamasi linkit eivät
    valaissseet energiakysymystä, pahoin pelkään,
    ettei mainitsemasi kirjatkaan.

    (-; se neliö kuuluisi olla reaktionuoli, vaan
    typografia tehnyt tepposen Murto-osakertoimet
    ovat vähän tyylittömiä. Kemiassa
    reaktioyhtälöitä kutsutaan reaktioyhtälöiksi, ei
    kaavoiksi. :)
    t

    Siitä edellisessä antamassani linkistä löytyy
    riittävän syvälle kaivauduttaessa mm. seuraavia:
    (muitakin on)

    Name Pyrodictium abyssi (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, AV2. Black smoker at
    2011 m depth; Mexico, Gulf of California, Guaymas
    Basin (4167). Type strain. Taxonomy/description
    (3962, 4167). (Medium 508, 98°C, anaerobic).


    Name Pyrodictium brockii (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, S1. Submarine
    solfataric field; Italy, Vulcano island (2548).
    Type strain. Taxonomy/description (2548, 2728).
    (Medium 283, 85-105°C, anaerobic).

    Name Pyrodictium occultum (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, PL-19. Submarine
    solfataric field; Italy, Vulcano island (2548).
    Type strain. Taxonomy/description (2548, 2728).
    (2549, 2550). (Medium 283, 85-105°C, anaerobic).

    Name Pyrococcus furiosus 1986VP (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter and G. Fiala, Vc 1.
    Geothermally heated marine sediment; Italy,
    Vulcano island (3082). Type strain.
    Taxonomy/description (3017, 3082). Produces DNA
    polymerase Pfu (4571). High-density cultivation
    (7495). (Medium 377, 97-100°C, anaerobic)

    Name Pyrococcus horikoshii (Archaea)

    Information <- JCM <- C. Kato <- F. T. Robb; OT-
    3. Marine hydrothermal vent at 1395 m depth;
    Pacific Ocean, Okinawa Trough vents (7279). Type
    strain. Taxonomy/description (7279, 7573).
    (Medium 377 with pH 6.5 - 7.0, 95°C, anaerobic)

    Name Pyrococcus woesei (Archaea)

    Information <- W. Zillig, Vul4. Marine solfatara;
    Italy, Vulcano island (3092). Type strain.
    Taxonomy/description (3022, 3092). (Medium 377,
    97-100°C, anaerobic).

    Name Methanopyrus kandleri (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter and R. Huber, AV19.
    Geothermally heated deep sea sediment; Mexico,
    Gulf of California, Guaymas Basin (4178, 4179).
    Type strain. Taxonomy/description (4179, 4535).
    (Medium 511, 98°C, anaerobic).

    Nuo kaikki elävät kuumassa ja hapettomassa
    (anaerobinen) ympäristössä ja käyttävät rikkiä
    energiantuotannossaan:

    >>Thermococcus is remarkable because it is able
    to maintain chromosomal integrity at temperatures
    up to 103 C with very little accumulation of DNA
    breaks. It also is highly resistant to radiation
    and can withstand doses up to 1.5 kGy. These
    characteristics suggest there is a highly
    effective DNA repair systems in
    hyperthermophiles. These organisms also possess
    an array of highly thermostable enzymes that
    could prove to be important biocatalysts.
    Comparison of the DNA sequence of this organism
    with others may provide insight into these unique
    characteristics.

    These organisms grow by anaerobic sulfur
    respiration

    S organics ---> H2S CO2 <<

    Siinä on epäilyttävä termi tuo organics, että
    mitä pitää sisällään.

    Joten tutkimusmatka jatkunee

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Siitä edellisessä antamassani linkistä löytyy
    riittävän syvälle kaivauduttaessa mm. seuraavia:
    (muitakin on)

    Name Pyrodictium abyssi (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, AV2. Black smoker at
    2011 m depth; Mexico, Gulf of California, Guaymas
    Basin (4167). Type strain. Taxonomy/description
    (3962, 4167). (Medium 508, 98°C, anaerobic).


    Name Pyrodictium brockii (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, S1. Submarine
    solfataric field; Italy, Vulcano island (2548).
    Type strain. Taxonomy/description (2548, 2728).
    (Medium 283, 85-105°C, anaerobic).

    Name Pyrodictium occultum (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter, PL-19. Submarine
    solfataric field; Italy, Vulcano island (2548).
    Type strain. Taxonomy/description (2548, 2728).
    (2549, 2550). (Medium 283, 85-105°C, anaerobic).

    Name Pyrococcus furiosus 1986VP (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter and G. Fiala, Vc 1.
    Geothermally heated marine sediment; Italy,
    Vulcano island (3082). Type strain.
    Taxonomy/description (3017, 3082). Produces DNA
    polymerase Pfu (4571). High-density cultivation
    (7495). (Medium 377, 97-100°C, anaerobic)

    Name Pyrococcus horikoshii (Archaea)

    Information <- JCM <- C. Kato <- F. T. Robb; OT-
    3. Marine hydrothermal vent at 1395 m depth;
    Pacific Ocean, Okinawa Trough vents (7279). Type
    strain. Taxonomy/description (7279, 7573).
    (Medium 377 with pH 6.5 - 7.0, 95°C, anaerobic)

    Name Pyrococcus woesei (Archaea)

    Information <- W. Zillig, Vul4. Marine solfatara;
    Italy, Vulcano island (3092). Type strain.
    Taxonomy/description (3022, 3092). (Medium 377,
    97-100°C, anaerobic).

    Name Methanopyrus kandleri (Archaea)

    Information <- K.O. Stetter and R. Huber, AV19.
    Geothermally heated deep sea sediment; Mexico,
    Gulf of California, Guaymas Basin (4178, 4179).
    Type strain. Taxonomy/description (4179, 4535).
    (Medium 511, 98°C, anaerobic).

    Nuo kaikki elävät kuumassa ja hapettomassa
    (anaerobinen) ympäristössä ja käyttävät rikkiä
    energiantuotannossaan:

    >>Thermococcus is remarkable because it is able
    to maintain chromosomal integrity at temperatures
    up to 103 C with very little accumulation of DNA
    breaks. It also is highly resistant to radiation
    and can withstand doses up to 1.5 kGy. These
    characteristics suggest there is a highly
    effective DNA repair systems in
    hyperthermophiles. These organisms also possess
    an array of highly thermostable enzymes that
    could prove to be important biocatalysts.
    Comparison of the DNA sequence of this organism
    with others may provide insight into these unique
    characteristics.

    These organisms grow by anaerobic sulfur
    respiration

    S organics ---> H2S CO2 <<

    Siinä on epäilyttävä termi tuo organics, että
    mitä pitää sisällään.

    Joten tutkimusmatka jatkunee

    Monet eliöt käyttävät hapetus-
    pelkistysreaktioissa sulfaatteja tai nitraatteja
    hapettimena. Fe(III) taitaa olla myös käytössä.
    Näissäkin tilanteissa tuo hapetin on
    yhteyttämishapen tulosta.
    Ehkä ongelma on siinä, että ilman eliöitä,
    varsinkin yhteyttäviä kasveja, maapallon
    tasapainotila olisi ilmakehän osalta hyvin
    vähähappinen. Kiviperä on keskimäärin SiO2,
    eli "neutraali" verrattuna veteen ja
    hiilidioksidiin.
    Elämän pyörittäminen vaatii kohtalaista hapetus-
    pelkistyspotentiaalia (=kemiallista energiaa),
    mitä ei ilmeisesti tarjoudu riittävästi
    pelkästään maapallon kiviperästä.

    Ainoa antamasi reaktioyhtälö:

    S organics ---> H2S CO2

    on epätäydellinen. Joten ei voi oikein ottaa
    kantaa. Rikki siinä kuitenkin näyttäs
    pelkistyvän, eli rikkivetyä vahvempi pelkistin on
    käytössä. Happea ei näy mailla halmeilla, että
    siinä mielessä, jos tästä eliö saa energiansa,
    niin sehän olis sitten ilman yhteyttämisenergiaa
    pyörivä systeemi. Epäilen kovasti.

    Äänestä

  • vierasM kirjoitti:

    Monet eliöt käyttävät hapetus-
    pelkistysreaktioissa sulfaatteja tai nitraatteja
    hapettimena. Fe(III) taitaa olla myös käytössä.
    Näissäkin tilanteissa tuo hapetin on
    yhteyttämishapen tulosta.
    Ehkä ongelma on siinä, että ilman eliöitä,
    varsinkin yhteyttäviä kasveja, maapallon
    tasapainotila olisi ilmakehän osalta hyvin
    vähähappinen. Kiviperä on keskimäärin SiO2,
    eli "neutraali" verrattuna veteen ja
    hiilidioksidiin.
    Elämän pyörittäminen vaatii kohtalaista hapetus-
    pelkistyspotentiaalia (=kemiallista energiaa),
    mitä ei ilmeisesti tarjoudu riittävästi
    pelkästään maapallon kiviperästä.

    Ainoa antamasi reaktioyhtälö:

    S organics ---> H2S CO2

    on epätäydellinen. Joten ei voi oikein ottaa
    kantaa. Rikki siinä kuitenkin näyttäs
    pelkistyvän, eli rikkivetyä vahvempi pelkistin on
    käytössä. Happea ei näy mailla halmeilla, että
    siinä mielessä, jos tästä eliö saa energiansa,
    niin sehän olis sitten ilman yhteyttämisenergiaa
    pyörivä systeemi. Epäilen kovasti.

    Hyppelehtimisiä palstoilta toisille:
    >>Minusta meidän keskustelumme ei ole suoraan
    koskettanut ensimmäistä eliötä, vaan sitä, onko
    olemassa nykymaailmassa eliötä, joka ei tarvitse
    auringonvalosta yhteyttämällä tuotettua
    energiaa.<<

    Keskustelu lähti liikkeelle nykyisistä, mutta
    minä eksyin tavanomaista perusteellista omaa
    uteliaisuuttani hieman kauemmas menneisyyteen
    (noin neljän miljardin vuoden pähän suunnilleen)

    Silloin pallomme tila oli hyvin toinen kuin
    nykyisin. Ilmakehässä ei olut lainkaan vapaata
    happea, eikä maan päällä tai sisällä ollut yhtään
    orgaanisen elämän tuottamia yhdisteitä, joten
    ensimmäisten eliöiden ruokalistan on täytynyt
    koostua pelkästään epäorgaanisista
    (epäelämäperäisistä) aineista (epäkemistiltä
    saattaa tulla taas epätäsmällisiä termejä)
    (vaikkei tässä epä-ilijöitä ollakaan).

    Avaruuden syövereistä löytyy runsaasti
    hiilipohjaisia (orgaanisia?) yhdisteitä, joita
    päätyi maanpäällekin komeettojem mukana, joten
    ehkä sellaiset lienevät olleet ensimmäisten
    eliöiden rakenteessa ja ruokalistoilla.

    Tuo kaavassa esiintynyt "organics"
    (Response to your query
    Word: organics

    No words found )

    (Here are the results
    Database: enfin Key: organic

    biodynaaminen (noun)
    elimellinen (adje)
    elollinen (adje)
    eloperäinen (adje)
    orgaaninen (adje) ) .

    Eliökunnan alkuperää jäljittäessa, mielestäni
    kuvaavin on seuraavalla sivulla esiintyvä sukupuu
    nykyisin elävistä eliöistä:

    http://cc.oulu.fi/~genetwww/sekvens/arkit.jpg

    Siinä mielenkiintoisinta on violetilla
    paksummalla piirretyt oksat, eliöt jotka pystyvät
    elämään muuta eliökuntaa kuumemmissa
    ympäristöissä.

    Todennäköistä on, että maapallon ensieliöt ovat
    olleet näiden nykyisten hypertermofiilien
    (äärimmäisyyskuumaarakastavien) lajien esi-isiä,
    jotka ovat pärjäilleet maapallon "haadesvaiheen"
    kuumissa löylyissä ja näiden
    nykyisten "kuumakallein" ruokailutottumukset
    saattavat antaa vihjettä esi-isiensä
    pöytätavoista.

    Aikaisemmassa lainauksessani mainitsemistani
    Thermococcuksista (niitä on paljon:
    Thermococcus aggregans

    Thermococcus barophilus

    Thermococcus celer

    Thermococcus chitonophagus

    Thermococcus fumicolans

    Thermococcus gorgonarius

    Thermococcus guaymasensis

    Thermococcus litoralis

    Thermococcus pacificus

    Thermococcus peptonophilus

    Thermococcus profundus

    Thermococcus sibiricus

    Thermococcus siculi

    Thermococcus sp.

    Thermococcus stetteri

    Thermococcus zilligii

    useimmat elävät valtamerien pohjien mustissa
    savuttajissa 75-85 celsiusasteen lämpötiloissa.

    Methanococcuksista löytyy kallioperäasukkeja ja
    Methanopyrus elää syvänmeren geotermisissä
    sedimenteissä liki sadassa asteessa, missä
    samantyyppisissä oloissa elää bakteeripuolen
    Aquifex.

    Mielenkiintoista tuntuu olevan mielettömiä määriä
    http://www.dsmz.de/species/strains.htm
    -sivun arkkien ja bakteerien jatkosivuilla:
    http://www.dsmz.de/species/archaea.htm
    joista edelleen punaisia alleviivattuja nimiä
    klikkaamalla ja edelleen alalajin vastaavaa nimeä
    klikkaamalla ja edelleen alleviivattua numeroa
    klikkaamalla pääsee eliön elinoloihin kiinni
    informationissa ja klikkailemalla referencessä
    mahdollisiin lisätietoihin, joihin saatan
    uppoutua perusteellisemmin ja kirjoittelen, jos
    jotain erityismielenkiintoista löytyy.

    Niin että hyvää matkaa vain samoihin maisemiin
    kaikille muillekin kummallisista pieneliöistä
    kiinnostuneille.

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Hyppelehtimisiä palstoilta toisille:
    >>Minusta meidän keskustelumme ei ole suoraan
    koskettanut ensimmäistä eliötä, vaan sitä, onko
    olemassa nykymaailmassa eliötä, joka ei tarvitse
    auringonvalosta yhteyttämällä tuotettua
    energiaa.<<

    Keskustelu lähti liikkeelle nykyisistä, mutta
    minä eksyin tavanomaista perusteellista omaa
    uteliaisuuttani hieman kauemmas menneisyyteen
    (noin neljän miljardin vuoden pähän suunnilleen)

    Silloin pallomme tila oli hyvin toinen kuin
    nykyisin. Ilmakehässä ei olut lainkaan vapaata
    happea, eikä maan päällä tai sisällä ollut yhtään
    orgaanisen elämän tuottamia yhdisteitä, joten
    ensimmäisten eliöiden ruokalistan on täytynyt
    koostua pelkästään epäorgaanisista
    (epäelämäperäisistä) aineista (epäkemistiltä
    saattaa tulla taas epätäsmällisiä termejä)
    (vaikkei tässä epä-ilijöitä ollakaan).

    Avaruuden syövereistä löytyy runsaasti
    hiilipohjaisia (orgaanisia?) yhdisteitä, joita
    päätyi maanpäällekin komeettojem mukana, joten
    ehkä sellaiset lienevät olleet ensimmäisten
    eliöiden rakenteessa ja ruokalistoilla.

    Tuo kaavassa esiintynyt "organics"
    (Response to your query
    Word: organics

    No words found )

    (Here are the results
    Database: enfin Key: organic

    biodynaaminen (noun)
    elimellinen (adje)
    elollinen (adje)
    eloperäinen (adje)
    orgaaninen (adje) ) .

    Eliökunnan alkuperää jäljittäessa, mielestäni
    kuvaavin on seuraavalla sivulla esiintyvä sukupuu
    nykyisin elävistä eliöistä:

    http://cc.oulu.fi/~genetwww/sekvens/arkit.jpg

    Siinä mielenkiintoisinta on violetilla
    paksummalla piirretyt oksat, eliöt jotka pystyvät
    elämään muuta eliökuntaa kuumemmissa
    ympäristöissä.

    Todennäköistä on, että maapallon ensieliöt ovat
    olleet näiden nykyisten hypertermofiilien
    (äärimmäisyyskuumaarakastavien) lajien esi-isiä,
    jotka ovat pärjäilleet maapallon "haadesvaiheen"
    kuumissa löylyissä ja näiden
    nykyisten "kuumakallein" ruokailutottumukset
    saattavat antaa vihjettä esi-isiensä
    pöytätavoista.

    Aikaisemmassa lainauksessani mainitsemistani
    Thermococcuksista (niitä on paljon:
    Thermococcus aggregans

    Thermococcus barophilus

    Thermococcus celer

    Thermococcus chitonophagus

    Thermococcus fumicolans

    Thermococcus gorgonarius

    Thermococcus guaymasensis

    Thermococcus litoralis

    Thermococcus pacificus

    Thermococcus peptonophilus

    Thermococcus profundus

    Thermococcus sibiricus

    Thermococcus siculi

    Thermococcus sp.

    Thermococcus stetteri

    Thermococcus zilligii

    useimmat elävät valtamerien pohjien mustissa
    savuttajissa 75-85 celsiusasteen lämpötiloissa.

    Methanococcuksista löytyy kallioperäasukkeja ja
    Methanopyrus elää syvänmeren geotermisissä
    sedimenteissä liki sadassa asteessa, missä
    samantyyppisissä oloissa elää bakteeripuolen
    Aquifex.

    Mielenkiintoista tuntuu olevan mielettömiä määriä
    http://www.dsmz.de/species/strains.htm
    -sivun arkkien ja bakteerien jatkosivuilla:
    http://www.dsmz.de/species/archaea.htm
    joista edelleen punaisia alleviivattuja nimiä
    klikkaamalla ja edelleen alalajin vastaavaa nimeä
    klikkaamalla ja edelleen alleviivattua numeroa
    klikkaamalla pääsee eliön elinoloihin kiinni
    informationissa ja klikkailemalla referencessä
    mahdollisiin lisätietoihin, joihin saatan
    uppoutua perusteellisemmin ja kirjoittelen, jos
    jotain erityismielenkiintoista löytyy.

    Niin että hyvää matkaa vain samoihin maisemiin
    kaikille muillekin kummallisista pieneliöistä
    kiinnostuneille.

    Löytyi hyvä sivu. Se tosin on englanninkielinen. Voin
    ehkä suomennella siitä mielenkiintoisimpia kohtia.

    http://www.nationalacademies.org/ssb/nanopanel2stet
    ter.htm

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Hyppelehtimisiä palstoilta toisille:
    >>Minusta meidän keskustelumme ei ole suoraan
    koskettanut ensimmäistä eliötä, vaan sitä, onko
    olemassa nykymaailmassa eliötä, joka ei tarvitse
    auringonvalosta yhteyttämällä tuotettua
    energiaa.<<

    Keskustelu lähti liikkeelle nykyisistä, mutta
    minä eksyin tavanomaista perusteellista omaa
    uteliaisuuttani hieman kauemmas menneisyyteen
    (noin neljän miljardin vuoden pähän suunnilleen)

    Silloin pallomme tila oli hyvin toinen kuin
    nykyisin. Ilmakehässä ei olut lainkaan vapaata
    happea, eikä maan päällä tai sisällä ollut yhtään
    orgaanisen elämän tuottamia yhdisteitä, joten
    ensimmäisten eliöiden ruokalistan on täytynyt
    koostua pelkästään epäorgaanisista
    (epäelämäperäisistä) aineista (epäkemistiltä
    saattaa tulla taas epätäsmällisiä termejä)
    (vaikkei tässä epä-ilijöitä ollakaan).

    Avaruuden syövereistä löytyy runsaasti
    hiilipohjaisia (orgaanisia?) yhdisteitä, joita
    päätyi maanpäällekin komeettojem mukana, joten
    ehkä sellaiset lienevät olleet ensimmäisten
    eliöiden rakenteessa ja ruokalistoilla.

    Tuo kaavassa esiintynyt "organics"
    (Response to your query
    Word: organics

    No words found )

    (Here are the results
    Database: enfin Key: organic

    biodynaaminen (noun)
    elimellinen (adje)
    elollinen (adje)
    eloperäinen (adje)
    orgaaninen (adje) ) .

    Eliökunnan alkuperää jäljittäessa, mielestäni
    kuvaavin on seuraavalla sivulla esiintyvä sukupuu
    nykyisin elävistä eliöistä:

    http://cc.oulu.fi/~genetwww/sekvens/arkit.jpg

    Siinä mielenkiintoisinta on violetilla
    paksummalla piirretyt oksat, eliöt jotka pystyvät
    elämään muuta eliökuntaa kuumemmissa
    ympäristöissä.

    Todennäköistä on, että maapallon ensieliöt ovat
    olleet näiden nykyisten hypertermofiilien
    (äärimmäisyyskuumaarakastavien) lajien esi-isiä,
    jotka ovat pärjäilleet maapallon "haadesvaiheen"
    kuumissa löylyissä ja näiden
    nykyisten "kuumakallein" ruokailutottumukset
    saattavat antaa vihjettä esi-isiensä
    pöytätavoista.

    Aikaisemmassa lainauksessani mainitsemistani
    Thermococcuksista (niitä on paljon:
    Thermococcus aggregans

    Thermococcus barophilus

    Thermococcus celer

    Thermococcus chitonophagus

    Thermococcus fumicolans

    Thermococcus gorgonarius

    Thermococcus guaymasensis

    Thermococcus litoralis

    Thermococcus pacificus

    Thermococcus peptonophilus

    Thermococcus profundus

    Thermococcus sibiricus

    Thermococcus siculi

    Thermococcus sp.

    Thermococcus stetteri

    Thermococcus zilligii

    useimmat elävät valtamerien pohjien mustissa
    savuttajissa 75-85 celsiusasteen lämpötiloissa.

    Methanococcuksista löytyy kallioperäasukkeja ja
    Methanopyrus elää syvänmeren geotermisissä
    sedimenteissä liki sadassa asteessa, missä
    samantyyppisissä oloissa elää bakteeripuolen
    Aquifex.

    Mielenkiintoista tuntuu olevan mielettömiä määriä
    http://www.dsmz.de/species/strains.htm
    -sivun arkkien ja bakteerien jatkosivuilla:
    http://www.dsmz.de/species/archaea.htm
    joista edelleen punaisia alleviivattuja nimiä
    klikkaamalla ja edelleen alalajin vastaavaa nimeä
    klikkaamalla ja edelleen alleviivattua numeroa
    klikkaamalla pääsee eliön elinoloihin kiinni
    informationissa ja klikkailemalla referencessä
    mahdollisiin lisätietoihin, joihin saatan
    uppoutua perusteellisemmin ja kirjoittelen, jos
    jotain erityismielenkiintoista löytyy.

    Niin että hyvää matkaa vain samoihin maisemiin
    kaikille muillekin kummallisista pieneliöistä
    kiinnostuneille.

    DSMZ:n bakteerikatalogista löysin yhden
    epäilyttävän tapauksen: METHANOHALOPHILUS
    HALOPHILUS.
    Sen elatusliuoksessa: Medium 329, ei ole
    mainintaa merkittävistä sulfaattimääristä, minkä
    arvelen olevan monien anaerobisten eliöiden
    hapettimena energiaa tuottavassa hapetus-
    pelkistysreaktiossa.
    Koska liuoksessa ei näyttäisi olevan kemiallista
    energiaa, ei arkit? tietenkään voi siinä
    lisääntyäkään.
    Eliöthän ovat kemiallisesti vain katalyytteja,
    jotka "purkavat" kemiallista potentiaalia niin,
    että tuotteet ovat lähempänä lopullista
    kemiallista tasapainoa kuin lähtöaineet. Tämä
    pätee myös kasveihin, kun fotonin potentiaali
    huomioidaan.
    No, mitkä ovat vaihtoehdot? 1) Olen väärässä,
    kyseinen eliö on energiaa tuottava ikiliikkuja.
    2) Olen väärässä, liuoksessa on kemiallista
    energiaa, mutta en vaan hoksi sitä (tämä on
    minulle häpeällisin).
    3) Liuos 329:n reseptissä on kirjoitusvirhe,
    esim. K2SO4:n määrä onkin grammoissa eikä
    sadasosissa?
    Muutoin näyttäisi olevan selvää, että merenpohjan
    savuttajien ympärillä olevat eliöt saavat
    happensa yhteyttämisestä, joten niissä
    ravintoketjuissa ei ole yhtään auringonvaloa
    tarvitsemattomia eliöitä.

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Löytyi hyvä sivu. Se tosin on englanninkielinen. Voin
    ehkä suomennella siitä mielenkiintoisimpia kohtia.

    http://www.nationalacademies.org/ssb/nanopanel2stet
    ter.htm

    Sivuilta löytyi methanococcuksen
    energiareaktioyhtälö:
    4H2 CO2 ----> CH4 2H2O
    Tämän reaktion vapaa Gibsin energia (=
    kemiallinen energia) on luokkaa - 130 kJ/mol,
    mikä tarkoittaa että reaktio on spontaani.
    Nyt pelastun häpeältä vain sillä, että tuo H2,
    eli vety on aurinkoenergialla tuotettu (-;

    Nykyäänhän maaperässä ei liene epäorgaanisia tai
    orgaanisia vetylähteitä, että jää nähtäväksi,
    mistä se vety tulee näiden eliöiden käyttöön.
    Mitään vetyatmosfääriä ei mainittujen eliöiden
    elatusliuksessa ollut, joten lienee sitten se
    metyyliamiinihydrokloridi vedyn lähteenä?
    Jaahas, onkohan nyt sitten löydetty varma tapaus
    eliöstä, joka ei tarvitse yhteyttämisen tuottamaa
    energiaa?
    Vähän vielä epäilyttää, kun oli vain yksi laji
    näitä methanococcuksia, jolla ei elatusliuoksessa
    ollut niitä sulfaatteja. Miksi muilla oli?

    Äänestä

  • ½tuttuM kirjoitti:

    Sivuilta löytyi methanococcuksen
    energiareaktioyhtälö:
    4H2 CO2 ----> CH4 2H2O
    Tämän reaktion vapaa Gibsin energia (=
    kemiallinen energia) on luokkaa - 130 kJ/mol,
    mikä tarkoittaa että reaktio on spontaani.
    Nyt pelastun häpeältä vain sillä, että tuo H2,
    eli vety on aurinkoenergialla tuotettu (-;

    Nykyäänhän maaperässä ei liene epäorgaanisia tai
    orgaanisia vetylähteitä, että jää nähtäväksi,
    mistä se vety tulee näiden eliöiden käyttöön.
    Mitään vetyatmosfääriä ei mainittujen eliöiden
    elatusliuksessa ollut, joten lienee sitten se
    metyyliamiinihydrokloridi vedyn lähteenä?
    Jaahas, onkohan nyt sitten löydetty varma tapaus
    eliöstä, joka ei tarvitse yhteyttämisen tuottamaa
    energiaa?
    Vähän vielä epäilyttää, kun oli vain yksi laji
    näitä methanococcuksia, jolla ei elatusliuoksessa
    ollut niitä sulfaatteja. Miksi muilla oli?

    Löytyi lisää kaavoja. Kiinnostavin on tuo
    ensimmäinen jossa on vain rikkiä ja vetyä.

    Lainailin ne tuohon sellaisenaan, koska
    ilmeisesti tajuat kemiaa paljon enemmän kuin minä.

    Ne ovat kolmelta peräkkäiseltä oppitunnilta:
    http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/JWB/MB409/lecture/lec
    ture18/lecture18.html

    Crenarchaea

    a.k.a. sulfur-metabolizing thermophiles, a.k.a.
    thermoacidophiles

    These organisms oxidize &/or reduce sulfur and
    sulfur compounds by one of three biochemical
    processes:

    1. Sulfur reduction

    Sulfur H2 ---> H2S protons

    These organisms are autotrophic anaerobes that
    fix carbon from CO2. Hydrogen is the electron
    donor for electron transport and elemental sulfur
    (or sulfur compounds such as thiosulfate) is the
    terminal electron acceptor.

    2. Sulfur respiration

    Sulfur organics ---> CO2 H2S

    These organisms are heterotrophic anaerobes. Both
    carbon and energy are from organic compounds.
    Organics are the electron donor for electron
    transport and sulfur (or sulfur compounds) is the
    terminal electron acceptor. This process is much
    like 'regular' respiration, except that sulfur
    compounds take the place of O2.

    3. Sulfur oxidation

    Sulfur O2 ---> H2SO4

    These organisms can usually grow
    heterotrophically, getting fixed carbon from low
    concentrations of organics in the medium. Most
    can also be grown autotrophically, fixing carbon
    from CO2 via the reverse TCA cycle. All are
    aerobes, of course, since it is the terminal
    electron acceptor (sulfur is the electron donor)
    for electron transport



    Archaeglobus can be grown either of two ways. It
    can grow heterotrophically by a unique pathway -
    it uses the methanogenic pathway in reverse!

    lactate or acetate ---> H2 CO2

    It also grows autotrophically by sulfate
    reduction:

    H2 SO4= ---> H2S (carbon fixed from CO2)

    A particularly important genus in this group is
    Methanosarcina. These organisms are unique in
    that they can make methane from hydrogen and CO2
    or CO, like other methangens, or from acetate,
    methylamines, or methanol alone:

    acetate ---> CH4 CO2

    The methyl group serves as the electron acceptor
    and the carboxy group as the as electron donor.

    4(methanol) ---> 3(CH4) 1(CO2)

    Methanogenesis using methanol is a
    disproportionation reaction - some methanol is
    used as electron donor for the reduction of the
    rest. A similar reaction using mono-, di-, or tri-
    methylamine results in the generation of methane,
    CO2, and ammonia.

    methylamines ---> CH4 CO2 NH3


    Tuli vastaan sivu(ja), joille on samaan syssyyn
    koottu kaiketi koko elämänkirjo ja kemialliset
    kaavat. (jään tutkailemaan niitä 23 sivua)


    http://www.planetarybiology.com/biosynthesis/biosy
    nth19.htm

    Äänestä

  • ½tuttuM kirjoitti:

    DSMZ:n bakteerikatalogista löysin yhden
    epäilyttävän tapauksen: METHANOHALOPHILUS
    HALOPHILUS.
    Sen elatusliuoksessa: Medium 329, ei ole
    mainintaa merkittävistä sulfaattimääristä, minkä
    arvelen olevan monien anaerobisten eliöiden
    hapettimena energiaa tuottavassa hapetus-
    pelkistysreaktiossa.
    Koska liuoksessa ei näyttäisi olevan kemiallista
    energiaa, ei arkit? tietenkään voi siinä
    lisääntyäkään.
    Eliöthän ovat kemiallisesti vain katalyytteja,
    jotka "purkavat" kemiallista potentiaalia niin,
    että tuotteet ovat lähempänä lopullista
    kemiallista tasapainoa kuin lähtöaineet. Tämä
    pätee myös kasveihin, kun fotonin potentiaali
    huomioidaan.
    No, mitkä ovat vaihtoehdot? 1) Olen väärässä,
    kyseinen eliö on energiaa tuottava ikiliikkuja.
    2) Olen väärässä, liuoksessa on kemiallista
    energiaa, mutta en vaan hoksi sitä (tämä on
    minulle häpeällisin).
    3) Liuos 329:n reseptissä on kirjoitusvirhe,
    esim. K2SO4:n määrä onkin grammoissa eikä
    sadasosissa?
    Muutoin näyttäisi olevan selvää, että merenpohjan
    savuttajien ympärillä olevat eliöt saavat
    happensa yhteyttämisestä, joten niissä
    ravintoketjuissa ei ole yhtään auringonvaloa
    tarvitsemattomia eliöitä.

    on niin että olipa ensimmäinen bakteeri
    millainen hyvänsä, se ei voinut muodostua
    kemiallisista prosesseista.
    Ja miten se muuttui toisenlaiseksi
    bakteeriksi??? vai syntyikö erilaisia bakteereja
    eri kehitysprosessien kautta? Itse en usko siihen.
    Ja miten alkoi monisoluinen ja suvullinen elämä?
    kertokaa sekin...tunnutte tietävän paljon.

    entä DNA- proteiini- paradoksi??

    Äänestä

  • vasta alussa oleva kirjoitti:

    on niin että olipa ensimmäinen bakteeri
    millainen hyvänsä, se ei voinut muodostua
    kemiallisista prosesseista.
    Ja miten se muuttui toisenlaiseksi
    bakteeriksi??? vai syntyikö erilaisia bakteereja
    eri kehitysprosessien kautta? Itse en usko siihen.
    Ja miten alkoi monisoluinen ja suvullinen elämä?
    kertokaa sekin...tunnutte tietävän paljon.

    entä DNA- proteiini- paradoksi??

    Hei, nyt haetaan nykymaaimasta eliötä, joka
    selviää ilman yhteyttämisestä kotoisin olevaa
    energiaa. Miltei kaikki käyttävät joko
    yhteyttämishapen tai yhteyttämissokerin
    muodostamaa potentiaalia. Jälkimmmäistä voi
    käyttää joko anaerobisesti (siis ilman hapen
    potentiaalia) tai aerobisesti, jolloin saadaan
    käyttöön koko yhtettyämisessä muodostunut
    kemiallinen energia (= potentiaali).
    Metaanibakteerit tai mitkä lie arkit näyttäsivät
    tietojen mukaan käyttävän energian lähteenään
    hiilidioksidin pelkistämistä vedyllä, mikä on
    sinänsä täysin epäorgaaninen ja
    yhteyttämisenergiasta riippumaton reaktio.
    Kysymys onkin nyt vain siitä, mikä on tuo vedyn
    lähde, kun maapallon luonnossa sitä ei nykyään
    juurikaan esiinny. Jos vety tai vedyn lähde
    syntyy yhteyttämisenergialla niin sitten ei ole
    vielä löydetty (tai siis minä en ole löytänyt :)
    ensimmäistäkään eliötä nykyisestä biosfääristä,
    joka toimii loputtomasti ilman auringon energiaa.

    Tämän ongelman ratkaisu antaa vain viitteitä
    ensimmäisen eliön ongelmaan. Ts. jos kaikki eliöt
    on nyt auringosta riippuvaisia, on ehkä niin
    ollut aina. Jos taas auringosta riippumattomia
    useita erilaisia, niin on voinut olla
    ensimmäisetkin. Jäljelle jää toki paljon
    ongelmia ja ehkä nousee uusiakin. Esim, miksei
    nykyaikanakin voi suljetuissa steriileissä
    tiloissa syntyä uusia elämänmuotoja? Miksi DNA -
    koodeja ei ole useampia erilaisia? Olisihan
    luultavaa, että eristetyissä paikoissa
    olisi "alkusyntynyt" eri koodikantoja.
    Eristyksestä johtuen erilaiset DNA-koodit eivät
    olisi koskaan joutuneet kilpailutilanteeseen
    keskenään.

    Äänestä

  • vierasM kirjoitti:

    Monet eliöt käyttävät hapetus-
    pelkistysreaktioissa sulfaatteja tai nitraatteja
    hapettimena. Fe(III) taitaa olla myös käytössä.
    Näissäkin tilanteissa tuo hapetin on
    yhteyttämishapen tulosta.
    Ehkä ongelma on siinä, että ilman eliöitä,
    varsinkin yhteyttäviä kasveja, maapallon
    tasapainotila olisi ilmakehän osalta hyvin
    vähähappinen. Kiviperä on keskimäärin SiO2,
    eli "neutraali" verrattuna veteen ja
    hiilidioksidiin.
    Elämän pyörittäminen vaatii kohtalaista hapetus-
    pelkistyspotentiaalia (=kemiallista energiaa),
    mitä ei ilmeisesti tarjoudu riittävästi
    pelkästään maapallon kiviperästä.

    Ainoa antamasi reaktioyhtälö:

    S organics ---> H2S CO2

    on epätäydellinen. Joten ei voi oikein ottaa
    kantaa. Rikki siinä kuitenkin näyttäs
    pelkistyvän, eli rikkivetyä vahvempi pelkistin on
    käytössä. Happea ei näy mailla halmeilla, että
    siinä mielessä, jos tästä eliö saa energiansa,
    niin sehän olis sitten ilman yhteyttämisenergiaa
    pyörivä systeemi. Epäilen kovasti.

    Toi organics meinaa tod. näk. yhteyttämisestä
    saatuja sokereita tai vastaavia, eli ei pyöri
    tämä ilman aurinkoa.

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Löytyi lisää kaavoja. Kiinnostavin on tuo
    ensimmäinen jossa on vain rikkiä ja vetyä.

    Lainailin ne tuohon sellaisenaan, koska
    ilmeisesti tajuat kemiaa paljon enemmän kuin minä.

    Ne ovat kolmelta peräkkäiseltä oppitunnilta:
    http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/JWB/MB409/lecture/lec
    ture18/lecture18.html

    Crenarchaea

    a.k.a. sulfur-metabolizing thermophiles, a.k.a.
    thermoacidophiles

    These organisms oxidize &/or reduce sulfur and
    sulfur compounds by one of three biochemical
    processes:

    1. Sulfur reduction

    Sulfur H2 ---> H2S protons

    These organisms are autotrophic anaerobes that
    fix carbon from CO2. Hydrogen is the electron
    donor for electron transport and elemental sulfur
    (or sulfur compounds such as thiosulfate) is the
    terminal electron acceptor.

    2. Sulfur respiration

    Sulfur organics ---> CO2 H2S

    These organisms are heterotrophic anaerobes. Both
    carbon and energy are from organic compounds.
    Organics are the electron donor for electron
    transport and sulfur (or sulfur compounds) is the
    terminal electron acceptor. This process is much
    like 'regular' respiration, except that sulfur
    compounds take the place of O2.

    3. Sulfur oxidation

    Sulfur O2 ---> H2SO4

    These organisms can usually grow
    heterotrophically, getting fixed carbon from low
    concentrations of organics in the medium. Most
    can also be grown autotrophically, fixing carbon
    from CO2 via the reverse TCA cycle. All are
    aerobes, of course, since it is the terminal
    electron acceptor (sulfur is the electron donor)
    for electron transport



    Archaeglobus can be grown either of two ways. It
    can grow heterotrophically by a unique pathway -
    it uses the methanogenic pathway in reverse!

    lactate or acetate ---> H2 CO2

    It also grows autotrophically by sulfate
    reduction:

    H2 SO4= ---> H2S (carbon fixed from CO2)

    A particularly important genus in this group is
    Methanosarcina. These organisms are unique in
    that they can make methane from hydrogen and CO2
    or CO, like other methangens, or from acetate,
    methylamines, or methanol alone:

    acetate ---> CH4 CO2

    The methyl group serves as the electron acceptor
    and the carboxy group as the as electron donor.

    4(methanol) ---> 3(CH4) 1(CO2)

    Methanogenesis using methanol is a
    disproportionation reaction - some methanol is
    used as electron donor for the reduction of the
    rest. A similar reaction using mono-, di-, or tri-
    methylamine results in the generation of methane,
    CO2, and ammonia.

    methylamines ---> CH4 CO2 NH3


    Tuli vastaan sivu(ja), joille on samaan syssyyn
    koottu kaiketi koko elämänkirjo ja kemialliset
    kaavat. (jään tutkailemaan niitä 23 sivua)


    http://www.planetarybiology.com/biosynthesis/biosy
    nth19.htm

    Rektioiden
    H2 S -----> H2S
    tai
    4H2 CO2 -----> CH4 2H2O

    Gibbsin energia käy kyllä "valottomiksi" energian
    lähteeksi. Nyt on enää epäselvää toi vedyn
    lähde. Jos sekin on epäorgaaninen, näihin
    reaktioihin perustuva biosfääri on
    energiataloudellisestikin itsenäinen auringon
    valosta.
    Näitä reaktioita alun alkaen kaipasin.

    Äänestä

  • ½tuttuM kirjoitti:

    Rektioiden
    H2 S -----> H2S
    tai
    4H2 CO2 -----> CH4 2H2O

    Gibbsin energia käy kyllä "valottomiksi" energian
    lähteeksi. Nyt on enää epäselvää toi vedyn
    lähde. Jos sekin on epäorgaaninen, näihin
    reaktioihin perustuva biosfääri on
    energiataloudellisestikin itsenäinen auringon
    valosta.
    Näitä reaktioita alun alkaen kaipasin.

    Jos biokemian puolelta loppui reaktiokaavat,
    pitääkö lähteä seikkailemaan geokemian sivuille
    etsimään sitä vedyn alkuperää, vai kuuluneeko se
    peräti ydinfysiikan puolelle?

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Jos biokemian puolelta loppui reaktiokaavat,
    pitääkö lähteä seikkailemaan geokemian sivuille
    etsimään sitä vedyn alkuperää, vai kuuluneeko se
    peräti ydinfysiikan puolelle?

    Siinä yhdessä elatuslitkussa (329?) vedyn lähde
    ehkä oli metyyliamiiniHCl, mutta sen lähde taas
    jää mysteeriks (mulle toistaiseks), eikä sille
    nyt osunut sitä reaktioyhtälöäkään, että montako
    metyyliamiinia tarvitaan yhden H2-molekyylin
    tuottamiseen.
    Tämmösen löysin:
    http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/JWB/MB409/lecture/lec
    ture20/lecture20.html
    Missä sanotaan, että vety tulee vetyä
    kehittäviltä bakteereilta.
    "Neither of these organisms could persist in the
    environment alone, but together they are
    successful."
    Vetyä kehittävät bakteerit taas käyttää
    orgaanista materiaalia?, että kyllä se
    yhteyttämisenergialta näyttää.
    Heh, eipä tarvinnut ihan hirveesti vielä ruveta
    häppeemään, vaikka pieniä vihreitä sattuukin.
    Esim, etten tajunnut metyyliamiinin ja
    hiilidioksidin riittävän energian tuotantoon.

    Noniin, siis pidän alkuperäisen väitteeni yhä
    voimassa. YKSIKÄÄN eliölaji ei lisäänny ilman
    auringonvaloa ja yhteyttämistä maapallolla. Tää
    on aika hämmästyttävää, kun vertaa tätä moniin
    päinvastaisiin väitteisiin. Saiskohan tästä
    julkaisun?

    Äänestä

  • ½tuttuM kirjoitti:

    Rektioiden
    H2 S -----> H2S
    tai
    4H2 CO2 -----> CH4 2H2O

    Gibbsin energia käy kyllä "valottomiksi" energian
    lähteeksi. Nyt on enää epäselvää toi vedyn
    lähde. Jos sekin on epäorgaaninen, näihin
    reaktioihin perustuva biosfääri on
    energiataloudellisestikin itsenäinen auringon
    valosta.
    Näitä reaktioita alun alkaen kaipasin.

    Tämänpäiväisissä tiedeuutisissa oli lyhyesti arkkieliöstä, joka on löydetty parinsadan metrin syvyydestä kuuman lähteen alta. Se hajottaa veden ja ottaa siten saamansa vedyn käyttöönsä ja yhdistää hiilidioksidiin ja tuottaa metaania.

    Ei ollut tiedon lähdettä eikä arkin nimeä, mutta ilmeisesti ensimmäinen kyseisenkaltainen eliö.

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Tämänpäiväisissä tiedeuutisissa oli lyhyesti arkkieliöstä, joka on löydetty parinsadan metrin syvyydestä kuuman lähteen alta. Se hajottaa veden ja ottaa siten saamansa vedyn käyttöönsä ja yhdistää hiilidioksidiin ja tuottaa metaania.

    Ei ollut tiedon lähdettä eikä arkin nimeä, mutta ilmeisesti ensimmäinen kyseisenkaltainen eliö.

    Veden hajoittaminen on hyvin energiaa kysyvä prosessi. Mikähän mahtaa olla energialähde?

    Äänestä

  • tuttuM kirjoitti:

    Veden hajoittaminen on hyvin energiaa kysyvä prosessi. Mikähän mahtaa olla energialähde?

    Mikä kyseinen eliö on nimeltään ja mistä se nappaa vedenhajoitusenergian. Tiedeuutiset ovat vain viikon ajan kuunneltavissa netissä, joten ei löytyne enää tarkennuksia. Mahdollista voisi olla jäljitys tuota päivää (23.01) edeltävistä tiedelehdista (Nature?) tai kysymällä suoraan tiedetoimitukselta (saattoi olla Maija Typpi):

    http://www.yle.fi/radioylenykkonen/puhe/tiedejaopetus/

    Äänestä

  • ½tuttuM kirjoitti:

    Siinä yhdessä elatuslitkussa (329?) vedyn lähde
    ehkä oli metyyliamiiniHCl, mutta sen lähde taas
    jää mysteeriks (mulle toistaiseks), eikä sille
    nyt osunut sitä reaktioyhtälöäkään, että montako
    metyyliamiinia tarvitaan yhden H2-molekyylin
    tuottamiseen.
    Tämmösen löysin:
    http://jwbrown.mbio.ncsu.edu/JWB/MB409/lecture/lec
    ture20/lecture20.html
    Missä sanotaan, että vety tulee vetyä
    kehittäviltä bakteereilta.
    "Neither of these organisms could persist in the
    environment alone, but together they are
    successful."
    Vetyä kehittävät bakteerit taas käyttää
    orgaanista materiaalia?, että kyllä se
    yhteyttämisenergialta näyttää.
    Heh, eipä tarvinnut ihan hirveesti vielä ruveta
    häppeemään, vaikka pieniä vihreitä sattuukin.
    Esim, etten tajunnut metyyliamiinin ja
    hiilidioksidin riittävän energian tuotantoon.

    Noniin, siis pidän alkuperäisen väitteeni yhä
    voimassa. YKSIKÄÄN eliölaji ei lisäänny ilman
    auringonvaloa ja yhteyttämistä maapallolla. Tää
    on aika hämmästyttävää, kun vertaa tätä moniin
    päinvastaisiin väitteisiin. Saiskohan tästä
    julkaisun?

    Seuraava on lainaus Avaruus-netti sivulta, jossa on koottuja käännettyjä avaruuteen vivahtavia tiedeuutisia.

    >>Vetyä syöviä mikrobeja
    NASAn Ames tutkimuskeskuksen tutkijat ovat havainneet runsaasti mikrobeja jotka käyttävät ravinnokseen vetyä. Tutkijoiden mukaan näiden mikrobien massa voi ylittää kaiken muun elollisen massan.

    Vetyä erottuu vedestä kallion sisällä. ei pelkästään kalliossa olevissa halkeamissa vaan myös kiven sisällä sillä kiven muodostuessa, sen molekyyleihin on sitoutunut kidevettä joka aioonien kuluessa reagoi kiviaineksen kanssa ja hajoaa vedyksi ja OH-radikaaliksi. Vety liukenee kivien huokosien kautta veteen josta se sitten on mikrobien käytettävissä jotka elävät pienissä kallioperän halkeamissa. Tutkijoiden mukaan mikrobeja voi esiintyä jopa 5 - 10 km syvyyteen asti jotka saavat vetyä ravinnokseen jopa 20 km syvyydestä.>April 3 Hydrogen-fed Bacteria May Exist Beyond Earth
    Primitive bacteria exist in huge numbers deep in the Earth, living on hydrogen gas produced in rocks, a NASA scientist reports in the spring issue of the journal Astrobiology. Recent studies suggest that the mass of bacteria existing below ground may be larger than the mass of all living things at the Earth’s surface, according to recent studies cited by the paper's lead author, Friedemann Freund, who works at NASA Ames Research Center in California's Silicon Valley. Similar hydrogen-consuming microbes may some day be discovered on Mars, raising new prospects for the possible existence of life beyond Earth, Freund added.>
    April 3, 2002

    John Bluck

    NASA Ames Research Center, Moffett Field, Calif.

    Phone: 650/604-5026 or 604-9000

    [email protected]


    --------------------------------------------------------------------------------

    RELEASE: 02-37AR

    HYDROGEN-FED BACTERIA MAY EXIST BEYOND EARTH

    Primitive bacteria exist in huge numbers deep in the Earth, living on hydrogen gas produced in rocks, a NASA scientist reports in the spring issue of the journal Astrobiology.

    Recent studies suggest that the mass of bacteria existing below ground may be larger than the mass of all living things at the Earth’s surface, according to recent studies cited by the paper's lead author, Friedemann Freund, who works at NASA Ames Research Center in California's Silicon Valley. Similar hydrogen-consuming microbes may some day be discovered on Mars, raising new prospects for the possible existence of life beyond Earth, Freund added.

    "The hydrogen that could feed bacteria in the depth of the Earth comes from a subtle chemical reaction that occurs within rocks that were once hot or even molten. In the top 20 kilometers (12.4 miles) of Earth's crust," Freund said, "the conditions are right to produce a nearly inexhaustible supply of hydrogen. In the top 5 to10 kilometers (about 3 to 6 miles) all fissures and cracks in the rocks are probably filled with water. Hydrogen molecules will seep out of the mineral grains, enter the intergranular space and saturate the water. Microorganisms that live in these water films can be expected to use this hydrogen as their vital energy source."

    Many of the microorganisms in the ‘deep biosphere' do not live off the sunlight-derived energy that green plants trap during photosynthesis, but live on chemically derived energy sources such as hydrogen, according to Freund. "If deep microbial communities are to thrive over long periods of time, they need a steady supply of hydrogen," he said.

    It has long been known that hydrogen gas is produced when water reaches freshly formed cracks in many common rocks, but Freund's paper describes a different hydrogen-producing reaction that occurs inside the minerals that make up such rocks. This reaction does not require rocks to crack — a necessarily episodic event. Instead, it occurs in the entire rock volume during its gradual cooling as continents slowly age over millions of years. Because the Earth's crust contains a huge quantity of rock, even a small amount of hydrogen produced in each small section of rock results in a large volume of gas.

    To understand the details of this hydrogen-producing reaction, Freund said, requires some insight into the structure of minerals where silicon, oxygen and metals have combined to form a dense pack of atoms and ions. When these minerals crystallize at high temperatures, water is always present, and some water molecules are trapped in the atomic structure of the minerals, said Freund. These water molecules are ripped apart and change into hydroxyl anions, each of which is negatively charged and has one oxygen ion with a proton attached.


    "During cooling, at temperatures below 400 to 500 degrees C (752 to 932 degrees F), a strange reaction takes place. Pairs of these hydroxyl anions rearrange their electrons in such a way that hydrogen gas molecules are formed," Freund said.


    What is unusual and still not fully understood, said Freund, is that the electrons needed to make the hydrogen molecules are taken away from negatively charged oxygen anions. "Suddenly, some oxygen anions, which everybody thought only existed in a doubly charged negative state, convert to singly charged negative ions," he said. "These single negative oxygen anions join in pairs. In this form, they are innocuous and can stay inactive over geological times."

    The hydrogen molecules, however, wander around inside the mineral structure and can squeeze into the narrow spaces between the mineral grains. If the intergranular space is filled with water, the hydrogen molecules will dissolve in the water. If microbes live in the intergranular water films, one can imagine, said Freund, that these bacteria extract the dissolved hydrogen from the water and use this hydrogen as an energy source, not unlike fish that extract oxygen dissolved in the water of rivers, lakes and the sea to respire.

    "What is potentially important," Freund said, "is that, if and when microorganisms in the deep underground use this hydrogen dissolved in the intergranular water films, the rocks around them will replenish the hydrogen supply - indefinitely, over eons of time."


    The paper by Freund and his coworkers also may help answer non-biological questions related to the commercial viability of tapping hydrogen reserves deep in the rocks and to questions of mine safety. For example, sometimes, during mining and drilling operations, enough hydrogen seeps out of wall rocks that explosive gas mixtures can be produced, according to some reports.

    "Since old, old times, the mining industry has had its share of mine explosions in which hydrogen played a role," Freund said, "but hydrogen gas could also be used as an energy source and fuel in today’s or tomorrow’s society. For years, pipelines have been distributing hydrogen gas between different industrial partners in the Ruhr Valley in Germany, and the experts say it can be handled about as safely as natural gas."

    -end-

    Äänestä

Osoitteessa (kiitos nimim. Yazz0):
http://www.spaceref.com/redirect.html?id=0&url=www.sciencenews.org/sn_arc97/3_29_97/bob1.htm
on maininta:
"Relying only on hydrogen, water, and carbon dioxide -- all of which are products of Earth's interior -- these microbes are unique among the vast array of living species. All other organisms depend to some extent on the sun's energy, which is harnessed through photosynthesis and creates food for surface life. Even organisms living near seafloor vents rely indirectly on the oxygen supplied by photosynthesis, says Todd O. Stevens of Battelle."
Mikäli vety on tosiaan geologista alkuperää, nämä syvällä kivissä elävät arkit?/bakteerit? olisivat ihan oikeasti meidän biosfäärimme ulkopuolisia olentoja. Geologian tietoni eivät riitä, vaan ei missään näyttäs olevan vetykaasulähteitä, niinkuin maakaasulähteitä on.

Äänestä
  • Katsoin kivikirjasta mineraaleissa esiintyvän vedyn.Vain stauroliitissa on vetyä. Monissa mineraaleissa on OH-ryhmiä ja kidevettä. Stauroliitti kovana mineraalinana vastustelee tehokkaasti kulumista, hajoamisesta en tiedä mitään. Kemian/geologian tiedot eivät riitä siihen, mitä OH-ryhmille voi tapahtua ja missä oloissa. Missähän lämpötilassa vesi hajoaa alkutekijöihinsä? Voisikohan tulivuorten purkausten yhteydessä vesi hajota?

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Katsoin kivikirjasta mineraaleissa esiintyvän vedyn.Vain stauroliitissa on vetyä. Monissa mineraaleissa on OH-ryhmiä ja kidevettä. Stauroliitti kovana mineraalinana vastustelee tehokkaasti kulumista, hajoamisesta en tiedä mitään. Kemian/geologian tiedot eivät riitä siihen, mitä OH-ryhmille voi tapahtua ja missä oloissa. Missähän lämpötilassa vesi hajoaa alkutekijöihinsä? Voisikohan tulivuorten purkausten yhteydessä vesi hajota?

    Vesi hajoaa lämmöllä vasta jossain yli 1300 K:n lämpötiloissa muistaakseni. Palautuu esim. liekeissä sitten takaisin vedeksi nopsaan vähän viileämmässä osassa liekkiä.
    Hehkuva hiili riittäisi veden hajottamiseen niin että vetyä vapautuu. Vaan ei taida olla aidosti epäorgaanista hiiltäkään maaperässä.
    Sula rautakin vois ehkä toimia riittävänä pelkistimenä. Sitäkään ei taida liiemmin olla luonnossa.

    Äänestä

  • tuttuM kirjoitti:

    Vesi hajoaa lämmöllä vasta jossain yli 1300 K:n lämpötiloissa muistaakseni. Palautuu esim. liekeissä sitten takaisin vedeksi nopsaan vähän viileämmässä osassa liekkiä.
    Hehkuva hiili riittäisi veden hajottamiseen niin että vetyä vapautuu. Vaan ei taida olla aidosti epäorgaanista hiiltäkään maaperässä.
    Sula rautakin vois ehkä toimia riittävänä pelkistimenä. Sitäkään ei taida liiemmin olla luonnossa.

    vety olekkaan maailman yleisin alkuaine, lisäksi suurin osa siitä ollee sitoutumattomana. Timantti ja grafiitti ovat molemmat puhdasta hiiltä eikä kumpikaan ole organista alkuperää.
    Joten How do your that selittää?

    Äänestä

  • ?? kirjoitti:

    vety olekkaan maailman yleisin alkuaine, lisäksi suurin osa siitä ollee sitoutumattomana. Timantti ja grafiitti ovat molemmat puhdasta hiiltä eikä kumpikaan ole organista alkuperää.
    Joten How do your that selittää?

    Vedyn suhteen puhe on ollut meidän omasta maaplaneetastamme, missä vety esiintyy sitoutuneena.
    Geologian tietoni ovat puutteelliset.
    Esim. seuraavassa viitteessä puhutaan kokeellisesta tutkimuksesta, millä osoitettaisiin grafiitin syntyminen orgaanisesta (fotosynteettisestä materiaalista):
    http://www.uni-geophys.gwdg.de/~josto/carbon3.pdf
    Kenties voi kertoa, mihin perustuu tietosi vain epäorgaanisesta grafiitista maapallolla? Ja millä voi erottaa epäorgaanisen grafiitin orgaanisesta?
    Jokatapauksessa hehkuvaa grafiittiakin veden hajoittamiseen lienee harvassa paikassa.

    Magmakaasuissa esiintyy vetyä:

    http://volcanoes.usgs.gov/Hazards/What/VolGas/volgas.html
    Voikohan se olla epäorgaanista?

    Myös mikrobiologiset tietoni ovat sen verran puutteelliset, etten tiedä, miksi laboratorioissa "vetybakteereja" ei ilmeisesti kasvateta vetyatmosfäärissä? Vedyn lähteenä toimii orgaaninen yhdiste.

    Äänestä

  • poikanen kirjoitti:

    Katsoin kivikirjasta mineraaleissa esiintyvän vedyn.Vain stauroliitissa on vetyä. Monissa mineraaleissa on OH-ryhmiä ja kidevettä. Stauroliitti kovana mineraalinana vastustelee tehokkaasti kulumista, hajoamisesta en tiedä mitään. Kemian/geologian tiedot eivät riitä siihen, mitä OH-ryhmille voi tapahtua ja missä oloissa. Missähän lämpötilassa vesi hajoaa alkutekijöihinsä? Voisikohan tulivuorten purkausten yhteydessä vesi hajota?

    Taitaapa olla tietämättömyys ja laiskuus veljeksiä (-;
    No, nyt netistä löytyi tuommoinen ilmiö kuin serpentinization, mitähän olis suomeksi, serpentiinisaatio?

    6[(Mg1.5 Fe0.5)SiO4] 7 H2O ---> 3[Mg3Si2O5(OH)4] Fe3O4 H2
    Tuommoinen olis reaktioyhtälö, missä syntyy vetyä raudan hapettuessa.
    Eikä kyllä näyttäs olevan fotosynteettistä (-;

    Vapaan vedyn vähäisyyden syyksi näytettiin sanottavan sen reaktiivisuutta.

    Äänestä

Kommentoi aloitusta


vierasM kirjoitti:

Olen lukenut lukuisistakin maapallolta
löytyneistä "mikrobiosfääreistä", joiden on
väitetty toimivan ilman yhteyttämisestä saatavaa
energiaa. Jokohan väitteestä on luovuttu, vai
vieläkö näitä pääasiassa rikkibakteereihin
perustuvia ekosysteemejä väitetään autonomisiksi?
Itse arvelen, että kyseessä on väärinkäsitys ja
kaikki eliöt ovat maapallolla yhteyttämisestä
saadun energian varassa.

Anonyymi
5000

Ilmoita asiaton sisältö

  • Sisältää materiaalia, joka on loukkaavaa, herjaavaa, rasistista, uhkailevaa tai ahdistelevaa.

  • Materiaali sisältää nimiä, yhteystietoja tai muita henkilökohtaisia tietoja. Julkisuuden henkilöistä, julkisissa viroissa toimivista ihmisistä sekä yritysten vastuuhenkilöistä saa keskustella työhön liittyen. Myös yksityiselämään liittyvistä asioista voi keskustella siltä osin, kuin niistä on julkisesti kerrottu.

  • Sisältää lapsille haitallista tai heiltä kiellettyä materiaalia. Seksuaalinen sisältö on sallittua aiheeseen tarkoitetuilla palstoilla, joiden ikäraja on 18 vuotta.

  • Lainvastaista sisältöä voi olla mm. yksityiselämää loukkaavan tiedon levitys, kiihottaminen kansanryhmää vastaan, laiton uhkaaminen, alaikäisiin liittyvä seksuaalinen sisältö/grooming, petokset, identiteettivarkaudet, kunnianloukkaukset ja tekijänoikeusrikkomukset.

  • Sisältö ei liity palstan tai keskusteluketjun aiheeseen.

  • Viesti ei ole suomea tai ruotsia (pl. International Forums), se sisältää mainontaa, se sisältää tekijänoikeuksin suojattua materiaalia, se on massapostitus tai jokin muu syy.

Jaa keskustelu