RNA-editointi osoittaa, ettei DNA sanele eliön ominaisuuksia

http://www.columbia.edu/cu/biology/courses/w3034/Dan/readings/RNAediting-maas.pdf

Lainaus: "It was generally believed that the DNA-encoded, exonic sequence information stored in the genome directly predicts the amino acid composition of the resulting gene products. However, this view had to be modified following the discovery of RNA editing, a process that enables a cell to recode genomic information in a systematic and regulated manner, selectively changing the readout of a gene at single nucleotide positions within the primary RNA transcript."

Oli siis yleisesti uskottu, että DNA-koodattu jakso informaatiota (DNA:n geenisekvenssi) suoraan ennakoisi ja sanelisi geenituotteiden aminohappojärjestyksen ja -koostumuksen. Toisin sanoen on pitkään luultu, että DNA-jaksot sanelisivat myös proteiinien laadun ja rakenteen. Kun vakavasti otettava tiede on tarkemmin perehtynyt mekanismeihin, jotka vaikuttavat proteiinien rakentumiseen, on tämä vanhentunut käsitys muuttunut. Samalla on selvinnyt, miten äärettömän monimutkaisia mekanismeja proteiinien monimuotoisuuden taustalla on.

RNA:n tasolla tapahtuvat hallitut muutokset ovat merkittävin proteiinien monimuotoisuuden syy. Vaihtoehtoinen silmukointi on oma lukunsa ja siitä olen kirjoittanut useita artikkeleita. Vaihtoehtoisen silmukoinnin aikaansaamat muutokset ovat sekvenssitasolla varsin laajoja verrattuna ns. RNA-editoinnin aikaansaamiin muutoksiin, jotka kohdistuvat yksittäisiin emäksiin. Yleisin RNA:n emästason editointitapahtuma on A-to-I -editointi, eli tietyt entsyymit (mm. ADAR ja APOBEC) kykenevät maskaamaan eli naamioimaan adeniiniemäksen inosiiniksi, jolloin kääntäjälle inosiini näyttää guaniinilta. Ihmisen genomissa on yli miljoona kohdetta, jotka käyvät läpi A-to-I -editoinnin. Muita jo tunnettuja RNA-editoinnin muotoja ovat G-to-A, C-to-U ja U-to-C -editointi. Myös yksittäisten emästen insertio ja deleetio onnistuu RNA-editointimekanismeilta.

RNA-editointimekanismien löytyminen ja niiden ymmärtäminen on aiheuttanut luonnollisesti sen, että vanhemmat tutkimukset, joissa on analysoitu cDNA:ta, eli RNA-molekyylejä, eivät ole sekvensointiosuudeltaan enää luotettavia tutkimuksia. Uudet tutkimukset tulevat merkittävästi muuttamaan myös ihmisen genomin SNP-tietokantaa. Myös käsitys mutaatioiden vaikutuksesta ihmisen genomiin tulee muuttumaan, koska moni mutaatio putoaa pois genomisesta DNA:sta. Tiede tulee korjaamaan itseään.

RNA-editointi on epigeneettisten mekanismien ja tekijöiden säätelemä prosessi. Tämä puolestaan korostaa DNA:n roolia passiivisena tietovarastona, jota tulee lukea ja lukudataa muokata, jotta solu saisi rakennettua valmiita lopputuotteita.

RNA-editoinnin kohdalla on kyse jo niin monimutkaisista muokkausproseduureista, että vaatisi todella paljon uskoa väittää tällaisten mekanismien syntyneen sattumalta. Paljon loogisempaa on uskoa, että monimutkaisten, ohjelmointia ja matemaattisia algoritmeja muistuttavien mekanismien takana on Suunnittelija ja Luoja.

https://sciencerefutesevolution.blogspot.com/2022/01/rna-editing-is-most-significant-reason.html