Miten on mahdollista DNAssa

DNA-juosteen selkäranka on fosfaattipohjainen - siellä on sitoutuneena fosfaattiryhmäksi fosforihappoa, joka liittää yhteen pentoosiskereita nimeltä deoksiriboosi, noihin sokerirenkaisiin puolestaan yhtyvät emäkset.


http://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/7/7d/DNA-labels.png
http://fi.wikipedia.org/wiki/DNA#Molekyylin_rakenne

Se runko on esteröitynyt sokeri, ei aktiivinen happo siis.
Ei nimi funktionaalista ryhmää tee.:)

Näissä fosfaattiryhmissä kolmas hydroksyyli törröttää ulos ja on solujen pH:ssa protolysoitunut eli DNA kaksoiskierre on negatiivisesti varautunut. Yksi asia mikä stabiloi kaksoiskierrettä on se, että nämä negatiivisesti varautuneet fosfaatit hylkivät toisiaan. Sen takia molekyyli pyrkii suoristumaan jolloin varaukset ovat mahdollisimman kaukana toisistaan. "Emäkset" taas ovat aika polaarittomia, minkä takia ne pyrkivät pois vedestä. Emästen välillä on mm. van der Waalsin vuorovaikutuksia minkä takia ne ikäänkuin pinoutuvat päällekkäin. Lisäksi tietenkin emäsparien vetysidokset lujittavat rakennetta.