http://cordis.europa.eu/project/rcn/195849_en.html
From 2015-04-01 to 2017-04-01, ongoing project
Phenotypic plasticity plays a key role at the onset of the speciation process, facilitating diversification though the induction of novel phenotypes in response to distinct environments. Via genetic accommodation and genetic assimilation, this influence may extend throughout the speciation process and beyond, into subsequent speciation events. While the epigenetic regulation of gene expression that mediates phenotypic plasticity has been extensively studied in lab-based model organisms, very little is known about epigenetic variation in natural populations. This project will be the first epigenetic study explicitly focused on the speciation process. Using cutting-edge techniques, the applicant will characterize DNA methylation variation within and among the sympatric species of a recently discovered endemic cichlid fish radiation in Lake Massoko, Tanzania. Specifically the applicant will test: if 1) newly formed species differ in the distributions of epigenetic marks across the genome, 2) genomic variants linked to phenotypic divergence among species are in genomic regions unusually high in DNA methylation, as expected under a hypothesis of epigenetic differences preceding fixed nucleotide differences during adaptive divergence, 3) genomic regions diverging in patterns of methylation among incipient species are also exhibiting high levels of methylation in populations of Astatotilapia calliptera, the ancestral, colonizing species. The results of this pioneering project will provide the first empirical evidence of the importance of epigenetic variation during the emergence of new species.
Tätä tutkimusta kannattaa seurata. Se keskittyy epigeneettisten muutosten vaikutusta lajiutumiseen.
Moderni geenitutkimus ja lajiutuminen
16
101
Vastaukset
- The_Bible_is.the_Truth
Korjaus: Se tutkii epigeneettisten muutosten vaikutusta lajiutumiseen.
- täh_häh
Onko joku väittänyt ettei vaikuttais?
- niinsevaanmenee
Moro, sinulta on edelleen kertomatta ketkä olivat ne 12 nobelistia, jotka kieltävät evoluution.
Oli muuten aika nolo se sinun avauksesi, jossa esittelit kreationistien vanhaa kusetusta: Listaa jossa on muka 101 tiedemiestä, jotka kieltävät evoluution.
Sellaista se on kreationistin epätoivo. Tiedät itsekin olevasi väärässä, mutta pitää yrittää valheilla todistaa kreationismin väitteiden olevan muka tosia.
Niin, kyllähän minä tiedän millä nikeillä olet aiemmin kirjoittanut ...
Ja kertoisitko vielä miten kuvittelet epigenetiikan todistavan edes jotain kreationismin väitteiden suhteen? Epigenetiikka on mahdollisesti vain yksi evoluutiota eteenpäin vievistä mekanismeista.- The_Bible_is.the_Truth
Kunhan opit keskustelemaan hieman asiallisempaan sävyyn, niin suostun ajatustenvaihtoon kanssasi.
- niinsevaanmenee
The_Bible_is.the_Truth kirjoitti:
Kunhan opit keskustelemaan hieman asiallisempaan sävyyn, niin suostun ajatustenvaihtoon kanssasi.
Minähän kommentoin täysin asiallisesti, rehellisesti ja totuuden mukaisesti. Viittaamani avauksesi oli nolo, koska siinä jälleen kerran esittelit kreationistien epärehellisyyttä.
On helppo väistää kiusallisia kysymyksiä väittämällä niitä "epäasiallisiksi". Vai mitä?
Tuttu taktiikka sinullekin. - niinsenytvaanon
The_Bible_is.the_Truth kirjoitti:
Kunhan opit keskustelemaan hieman asiallisempaan sävyyn, niin suostun ajatustenvaihtoon kanssasi.
Aloita vaikka rekisteröimällä nimimerkkisi.
- niinsevaanmenee
niinsenytvaanon kirjoitti:
Aloita vaikka rekisteröimällä nimimerkkisi.
Rekisteröi ensin omasi.
Osaatko kertoa miksi kreationistit valehtevat ja väistelevät kiusallisia kysymyksiä? En todellakaan jaksaisi elää noin epärehellistä elämää.
Jos olisit rehti sinulla ei olisi mitään vaikeuksia kertoa ne 12 nobelistia. Tai jos et löydä niitä niin rehdisti myöntää levittäneesi väärää tietoa.
Mutta ei - sinä olet kreationisti. Valehtelet mieluummin. - niinsevaanmenee
niinsevaanmenee kirjoitti:
Rekisteröi ensin omasi.
Osaatko kertoa miksi kreationistit valehtevat ja väistelevät kiusallisia kysymyksiä? En todellakaan jaksaisi elää noin epärehellistä elämää.
Jos olisit rehti sinulla ei olisi mitään vaikeuksia kertoa ne 12 nobelistia. Tai jos et löydä niitä niin rehdisti myöntää levittäneesi väärää tietoa.
Mutta ei - sinä olet kreationisti. Valehtelet mieluummin."Ensin"? Minä osoitin kehotukseni tuolle Bible-tyypille, en sinulle.
Tässä tämä asia todetaan selkeästi, josta kerroin sinulle edellisessä keskutelussa.
"While the epigenetic regulation of gene expression that mediates phenotypic plasticity has been extensively studied in lab-based model organisms, very little is known about epigenetic variation in natural populations."
Tämänkaltaiset tutkimukset ovat erittäin tärkeitä, jotta ymmärrämme lisää niistä mekanismeista, jotka mahdollistavat sopeutumisen, sopeutumislevittäytymisen ja lajiutumisen. Epigeneettiset tekijät eivät tule korvaamaan jo tunnettuja mekanismeja, kuten geneettisiä mutaatioita, vaan tulevat todennäköisesti olemaan rinnalla entistä merkittävämpänä mekanismina.
Kirjoahventen genomeja ja transkriptomeja on sekvensoitu jo useilta lajeilta, ja tiedämme, että sopeutumiseen ja lajiutumiseen on vaikuttanut lukuisat mekanismit.
"In addition to helping explain the complex genomic mechanisms that give rise to incredible diversity among cichlid fishes, the findings from these "natural mutants" shed new light on the molecular process of evolution in all vertebrate species."
"After analyzing the data, the researchers found a surprising number of genomic changes at play. Compared to the ancestral lineage, the East African cichlid genomes possess: an excess of gene duplications; alterations in regulatory, non-protein-coding elements in the genome; accelerated evolution of protein-coding elements, especially in genes for pigmentation; and other distinct features that affect gene expression, such as insertions of transposable elements and regulation by novel microRNAs."
http://phys.org/news/2014-09-sequencing-african-fishes-reveals-diverse.html
On siis jo täysin selvää, että lukuisat erilaiset mutaatiot ovat osallisena noissa prosesseissa. Hienoa, että kreationistit ovat ottaneet oikeaa tieteellistä tutkimusaineistoa repertuaariinsa, mutta ikävä kyllä tehdyt johtopäätökset niistä eivät edelleenkään kestä lähempää tarkastelua.- The_Bible_is.the_Truth
Ja missä kohden mielestäsi oli kyse geenisekvenssimutaatioista, jotka rikastuttaisivat tai lisäisivät eliön dna:n geneettistä informaatiota?
Väität, että geneettinen mutaatio on tunnettu mekanismi lajiutumisessa. Tarkoitat varmaan sitä, että tytärlajin geeniperimä on heikompi kuin kantalajinsa geeniperimä (geenipooli). Vai olisiko sinulla osoittaa havaintoja siitä, että jonkun eliön dna olisi geenisekvenssinsä osalta monimutkaisempi ja laajempi kuin kantalajinsa dna?
an excess of gene duplications; alterations in regulatory, non-protein-coding elements in the genome; accelerated evolution of protein-coding elements, especially in genes for pigmentation; and other distinct features that affect gene expression, such as insertions of transposable elements and regulation by novel microRNAs.
Noista mikään ei liity mutaatioihin. Excess of gene duplication saattaa viitata polyploidiaan, jota esiintyy useimmilla selkärankaisilla tumattomissa soluissa, mikäli ymmärsin oikein. The_Bible_is.the_Truth kirjoitti:
Ja missä kohden mielestäsi oli kyse geenisekvenssimutaatioista, jotka rikastuttaisivat tai lisäisivät eliön dna:n geneettistä informaatiota?
Väität, että geneettinen mutaatio on tunnettu mekanismi lajiutumisessa. Tarkoitat varmaan sitä, että tytärlajin geeniperimä on heikompi kuin kantalajinsa geeniperimä (geenipooli). Vai olisiko sinulla osoittaa havaintoja siitä, että jonkun eliön dna olisi geenisekvenssinsä osalta monimutkaisempi ja laajempi kuin kantalajinsa dna?
an excess of gene duplications; alterations in regulatory, non-protein-coding elements in the genome; accelerated evolution of protein-coding elements, especially in genes for pigmentation; and other distinct features that affect gene expression, such as insertions of transposable elements and regulation by novel microRNAs.
Noista mikään ei liity mutaatioihin. Excess of gene duplication saattaa viitata polyploidiaan, jota esiintyy useimmilla selkärankaisilla tumattomissa soluissa, mikäli ymmärsin oikein."Ja missä kohden mielestäsi oli kyse geenisekvenssimutaatioista, jotka rikastuttaisivat tai lisäisivät eliön dna:n geneettistä informaatiota?"
Eivätkö insertiot ja duplikaatiot ole sinun mielestäsi CNV-mutaatioita?
"Väität, että geneettinen mutaatio on tunnettu mekanismi lajiutumisessa."
Näin väitän.
"Tarkoitat varmaan sitä, että tytärlajin geeniperimä on heikompi kuin kantalajinsa geeniperimä (geenipooli)."
En tarkoita.
"Vai olisiko sinulla osoittaa havaintoja siitä, että jonkun eliön dna olisi geenisekvenssinsä osalta monimutkaisempi ja laajempi kuin kantalajinsa dna?"
Näin on esimerkiksi juuri kirjoahventen kohdalla suhteessa niiden kantamuotoihin.
"Gene duplication allows for subsequent divergent evolution of the resultant gene copies, enabling functional innovation of the proteins and/or expression patterns23. East African cichlids, including Oreochromis niloticus, possess an unexpectedly large number of gene duplicates. We find 280 duplications in the lineage leading to the common ancestor of the lake radiations and 148 events in the common ancestor of the haplochromines. When normalizing for branch lengths this corresponds to an approximately 4.5- to 6-fold increase in gene duplications that occurred in the common ancestor of the East African lake radiations relative to older clades, and an even higher duplication rate in the common ancestor of just the haplochromines."
"Noista mikään ei liity mutaatioihin. Excess of gene duplication saattaa viitata polyploidiaan, jota esiintyy useimmilla selkärankaisilla tumattomissa soluissa, mikäli ymmärsin oikein."
No et ymmärtänyt mitään oikein. Päästelet jo aivan pähkähulluja päätelmiä, koska et ymmärrä edes perusteita käsiteltävästä aiheesta. Joillain kaloilla ja sammakkoeläimillä polyploidia on ollut evoluutiota eteenpäin vienyt mekanismi, mutta esimerkiksi nisäkkäillä tämä ei enää toimi. Etkö edes sitä tajua, että tumattomissa soluissa, kuten ihmisen punasoluissa, ei ole kromosomeja, joten mitään polypoidiaa ei voi edes tapahtua?
Todellisuudessa, kuten jo kerroin, sopeutumisen ja lajiutumisen mekanismit ovat hyvin monimuotoiset.
"We provide evidence for accumulation of genetic variation under relaxed constraint preceding radiation and involving multiple evolutionary mechanisms, including accelerated evolution of regulatory and coding sequence, increased gene duplication, TE insertions, novel micoRNAs and retention of ancient polymorphisms, possibly including interspecific hybridization. In addition, our data on genomic divergence within the Lake Victoria species flock suggest that adaptive radiation within the lakes is associated with divergent selection on many regions in the genome, both coding and regulatory, often recruiting old alleles from standing variation."
http://www.nature.com/nature/journal/v513/n7518/full/nature13726.html
On hyvin huvittavaa, että henkilö, joka ei ymmärrä juuri mitään solubiologiasta ja molekyyligeneetikasta yrittää opettaa henkilöä, joka opiskelee solubiologiaa ja molekyyligenetiikkaa yliopistossa. Jo ennen alanvaihdosta olin hankkinut kohtalaisen laajan tietämyksen aiheesta, jollaista sinulla ei selvästi ole.- MythologyIsTheTruth
Juuri tämän vuoksi tätäkin palstaa tuleee seurattua.
Kerta toisensa jälkeen kretionistiset apologeetat ajautuvat samaan tilanteeseen;tulevat osoittaneeksi,etteivät ole ymmärtäneet edes kommentoimansa asian peruslähtökohtia.
Tällainen asiaintila tavallaan rinnastuu itse evoluution olemukseen.Kuten evolutiivisten efektien aikaskaala on useita kertaluokkia pidempi kuin yksilön,on tieteen aikaskaala samoin laaja.Vasta kolmatta tuhatta vuottahan tässä on laskettu piin likiarvoa. - The_Bible_is.the_Truth
solon1 kirjoitti:
"Ja missä kohden mielestäsi oli kyse geenisekvenssimutaatioista, jotka rikastuttaisivat tai lisäisivät eliön dna:n geneettistä informaatiota?"
Eivätkö insertiot ja duplikaatiot ole sinun mielestäsi CNV-mutaatioita?
"Väität, että geneettinen mutaatio on tunnettu mekanismi lajiutumisessa."
Näin väitän.
"Tarkoitat varmaan sitä, että tytärlajin geeniperimä on heikompi kuin kantalajinsa geeniperimä (geenipooli)."
En tarkoita.
"Vai olisiko sinulla osoittaa havaintoja siitä, että jonkun eliön dna olisi geenisekvenssinsä osalta monimutkaisempi ja laajempi kuin kantalajinsa dna?"
Näin on esimerkiksi juuri kirjoahventen kohdalla suhteessa niiden kantamuotoihin.
"Gene duplication allows for subsequent divergent evolution of the resultant gene copies, enabling functional innovation of the proteins and/or expression patterns23. East African cichlids, including Oreochromis niloticus, possess an unexpectedly large number of gene duplicates. We find 280 duplications in the lineage leading to the common ancestor of the lake radiations and 148 events in the common ancestor of the haplochromines. When normalizing for branch lengths this corresponds to an approximately 4.5- to 6-fold increase in gene duplications that occurred in the common ancestor of the East African lake radiations relative to older clades, and an even higher duplication rate in the common ancestor of just the haplochromines."
"Noista mikään ei liity mutaatioihin. Excess of gene duplication saattaa viitata polyploidiaan, jota esiintyy useimmilla selkärankaisilla tumattomissa soluissa, mikäli ymmärsin oikein."
No et ymmärtänyt mitään oikein. Päästelet jo aivan pähkähulluja päätelmiä, koska et ymmärrä edes perusteita käsiteltävästä aiheesta. Joillain kaloilla ja sammakkoeläimillä polyploidia on ollut evoluutiota eteenpäin vienyt mekanismi, mutta esimerkiksi nisäkkäillä tämä ei enää toimi. Etkö edes sitä tajua, että tumattomissa soluissa, kuten ihmisen punasoluissa, ei ole kromosomeja, joten mitään polypoidiaa ei voi edes tapahtua?
Todellisuudessa, kuten jo kerroin, sopeutumisen ja lajiutumisen mekanismit ovat hyvin monimuotoiset.
"We provide evidence for accumulation of genetic variation under relaxed constraint preceding radiation and involving multiple evolutionary mechanisms, including accelerated evolution of regulatory and coding sequence, increased gene duplication, TE insertions, novel micoRNAs and retention of ancient polymorphisms, possibly including interspecific hybridization. In addition, our data on genomic divergence within the Lake Victoria species flock suggest that adaptive radiation within the lakes is associated with divergent selection on many regions in the genome, both coding and regulatory, often recruiting old alleles from standing variation."
http://www.nature.com/nature/journal/v513/n7518/full/nature13726.html
On hyvin huvittavaa, että henkilö, joka ei ymmärrä juuri mitään solubiologiasta ja molekyyligeneetikasta yrittää opettaa henkilöä, joka opiskelee solubiologiaa ja molekyyligenetiikkaa yliopistossa. Jo ennen alanvaihdosta olin hankkinut kohtalaisen laajan tietämyksen aiheesta, jollaista sinulla ei selvästi ole.http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7316/edsumm/e101007-09.html
Minkähän oppilaitoksen molekyylibiologiaa olet opiskellut? Kyllä tämän tutkimuksen mukaan esim. polyploideissa maksasoluissa on sentään geenejä. The_Bible_is.the_Truth kirjoitti:
http://www.nature.com/nature/journal/v467/n7316/edsumm/e101007-09.html
Minkähän oppilaitoksen molekyylibiologiaa olet opiskellut? Kyllä tämän tutkimuksen mukaan esim. polyploideissa maksasoluissa on sentään geenejä.Minä puhuin sukusoluista, sinä selitit tumattomista soluista. Onko maksasolut tumattomia? No ei ole.
- The_Bible_is.the_Truth
"Eivätkö insertiot ja duplikaatiot ole sinun mielestäsi CNV-mutaatioita?"
After analyzing the data, the researchers found a surprising number of genomic changes at play. Compared to the ancestral lineage, the East African cichlid genomes possess: an excess of gene duplications; alterations in regulatory, non-protein-coding elements in the genome; accelerated evolution of protein-coding elements, especially in genes for pigmentation; and other distinct features that affect gene expression, such as insertions of transposable elements and regulation by novel microRNAs.
Eli insertiot vaikuttavat ko.tapauksessa geenisäätelyyn, ei CNV-mutaatioihin.
https://en.wikipedia.org/wiki/Polyploid
Polyploid cells and organisms are those containing more than two paired (homologous) sets of chromosomes.
Species whose cells do not have nuclei, that is, Prokaryotes, may be polyploid organisms, as seen in the large bacterium Epulopicium fishelsoni
Lajit, joiden soluissa ei ole tumaa, siis Prokaryootit, voivat olla polyploideja eliöitä, kuten nähdään kookkaassa bakteerissa Epulopicium fishelsoni:ssa.
"Ja missä kohden mielestäsi oli kyse geenisekvenssimutaatioista, jotka rikastuttaisivat tai lisäisivät eliön dna:n geneettistä informaatiota?"
Tähän et edelleenkään vastannut."Eli insertiot vaikuttavat ko.tapauksessa geenisäätelyyn, ei CNV-mutaatioihin."
Mitä sinä raukka selität? Tuossa liittyi transposoituvia elementtejä sellaisiin kromosomin kohtiin, joissa on proteiineja koodaavia geenejä. Transposoituvien elementtien säätelystä vastaavat sekä säätelygeenit että epigeneettiset säätelyjärjestelmät. Ymmärrätkö edes mikä CNV on?
"Copy-number variation (CNV) is a large category of structural variation, which includes insertions, deletions and duplications."
"Lajit, joiden soluissa ei ole tumaa, siis Prokaryootit, voivat olla polyploideja eliöitä, kuten nähdään kookkaassa bakteerissa Epulopicium fishelsoni:ssa."
Miten prokaryootit, joissa kromosomi on rengasmaisena rakenteena solulimassa liittyy millään tavalla väitteeseesi selkärankaisten tumattomien solujen polyploidiasta, joissa ei ole kromosomeja?
"Tähän et edelleenkään vastannut."
Sekä transposoituvien elementtien liittymiset että duplikaatiot lisäävät geneettistä informaatiota. Esimerkiksi pigmentaatioon vaikuttavat geenien duplikaatit ovat kokeneet pistemutaatioita, jotka lisäävät sitä entisestään.
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754307000882
Ketjusta on poistettu 0 sääntöjenvastaista viestiä.
Luetuimmat keskustelut
En tullut, koska käytit päätäsi.
Ja koska ihmiset pilaavat sillä mahdollisuudet, kaikki mikä toimii vaatii oman lähestymistapani. Kun levittää punaisia m372736Miten kaivattusi teki sinuun lähtemättömän vaikutuksen?
Minulla kävi niin, että hän laittoi ruokaa, kun olin nälkäinen. Tie miehen sydämeen käy vatsan kautta.891184Alkon myynti putosi kesäkuussa 10 prosenttia
Niin se hallitus tuhoaa valtion verokertymää ylisuurella alkoholiverolla, kun kansalaiset hankkivat juomansa ulkomailta.127979Oliko mies vetäytyminen
Toimiva veto? Miten meille kävi. Ei hyvin ja mahdottomalta tuntuu tilanne nyt.61967- 66907
Ulosotossa olevan tulisi saada itse päättää
Maksetaanko hänen ulosotossa olevia velkoja takaisin yksi kerrallaan vai ripotellen pikku summia sinne tänne, kuten ulos77881EU:lta tyly ratkaisu Temulle
On se hyvä, että EU on vihdoin ja viimein puuttunut noiden Kiinan krääsän kauppiaiden toimintaan. https://www.is.fi/ta101828Oon tässä pohtinut että se nainen
Ei sovi sulle. Ihmetyttää mitä näet hänessä. Mieheltä miehelle70815Nainen on ihana
ilta-päivää tosi söpölle naiselle 🤗😘☺ Jos saisin sinut nainen oisin onnellisin mies Etpäs tiedäkään keneltä tämä on?25718Hallinto-oikeus kumosi valtuuston päätöksiä
Teksti-tv kertoo, että valtuuston päätöksentekoon on osallistunut varavaltuutettu jolla ei ollut oikeutta osallistua. Mi30684